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        一種新型解脲脲原體核酸檢測(cè)試劑盒的臨床應(yīng)用初步評(píng)價(jià)

        2014-12-31 00:00:00黃宏君李勃鄧中平吳白平
        醫(yī)學(xué)信息 2014年17期

        摘要:目的通過(guò)對(duì)比實(shí)驗(yàn),對(duì)新型解脲脲原體(Ureaplasma urealyticum,UU)核酸檢測(cè)試劑(采用一步法處理樣本,以下簡(jiǎn)稱(chēng)\"一步法\")的臨床使用進(jìn)行評(píng)價(jià)。方法用一步法試劑與煮沸法試劑對(duì)176例臨床收集的樣本進(jìn)行UU DNA檢測(cè)并對(duì)比其結(jié)果,同時(shí),將兩種試劑的檢測(cè)結(jié)果分別與培養(yǎng)法結(jié)果進(jìn)行對(duì)比。結(jié)果新型解脲脲原體核酸檢測(cè)試劑與煮沸法試劑的陽(yáng)性一致性百分比為99.00%,陰性一致性百分比為96.05%,總一致性百分比為97.73%;對(duì)4例不符樣本進(jìn)行測(cè)序復(fù)核,并對(duì)復(fù)核后的結(jié)果進(jìn)行Kappa檢驗(yàn)一致性分析,結(jié)果Kappa值=1.000,表明新型試劑的檢測(cè)結(jié)果與煮沸法試劑及復(fù)核檢測(cè)的結(jié)果具有很好的一致性。在與金標(biāo)準(zhǔn)培養(yǎng)法檢測(cè)結(jié)果的對(duì)比中,兩種試劑均表現(xiàn)出較好的準(zhǔn)確性。結(jié)論新型解脲脲原體核酸檢測(cè)試劑與已上市煮沸法試劑的檢測(cè)結(jié)果陰陽(yáng)性一致性較好,操作簡(jiǎn)單快速,減少污染環(huán)節(jié),并具有內(nèi)標(biāo)控制假陰性,靈敏度更高,結(jié)果準(zhǔn)確,符合臨床檢測(cè)要求,具有較高的臨床應(yīng)用價(jià)值。

        關(guān)鍵詞:解脲脲原體;UU DNA;熒光定量PCR;一步法;煮沸法解脲脲原體(Ureaplasma urealyticum,UU)是一類(lèi)原核細(xì)胞微生物,體積介于細(xì)菌與病毒之間,是引起泌尿生殖道感染的常見(jiàn)病原體[1]。UU感染不僅引起非淋菌性尿道炎(nongonococcal urethritis,NGU),也可引起多種泌尿生殖道疾病,如前列腺炎、附睪炎等,還被認(rèn)為是引起女性原因不明的不孕、流產(chǎn)以及死胎等的原因之一。由于UU感染臨床表現(xiàn)無(wú)特異性,常易漏診,因此,快速、靈敏、特異的診斷方法是預(yù)防UU感染的關(guān)鍵[2]。目前解脲脲原體的實(shí)驗(yàn)室診斷方法主要有分離培養(yǎng)法、免疫學(xué)方法、基于核酸檢測(cè)的分子生物方法等。分離培養(yǎng)法的特異性和敏感性高,但其具有臨床檢測(cè)時(shí)間過(guò)長(zhǎng)(至少需要24~48 h,甚至更長(zhǎng)時(shí)間),過(guò)程繁瑣,需要使用特殊的培養(yǎng)介質(zhì)以及易受雜菌影響等缺陷,不適用于大范圍檢測(cè)。免疫學(xué)法具有快速、簡(jiǎn)便、靈敏度高等優(yōu)勢(shì),但受多種因素的影響,目前國(guó)內(nèi)也沒(méi)有商品化的試劑盒(僅有一個(gè)蛋白芯片檢測(cè)系統(tǒng)獲得批準(zhǔn)認(rèn)證)。近年來(lái),聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)法漸漸顯現(xiàn)了其在檢測(cè)上的優(yōu)勢(shì),熒光PCR技術(shù)是基于傳統(tǒng)PCR技術(shù)并結(jié)合光譜技術(shù)而發(fā)展起來(lái)的一種更靈敏,更特異,更精確的核酸檢測(cè)技術(shù)。檢測(cè)結(jié)果準(zhǔn)確,重復(fù)性高,能動(dòng)態(tài)反映患者治療前、后病原體變化及與臨床的關(guān)系,且整個(gè)過(guò)程中避免了傳統(tǒng)PCR需后處理的問(wèn)題,減少了污染[3]。但目前國(guó)內(nèi)同類(lèi)試劑一般采用煮沸法提取核酸,費(fèi)時(shí)費(fèi)力,在操作過(guò)程中容易導(dǎo)致污染,而且大部分試劑沒(méi)有預(yù)防假陰性的內(nèi)標(biāo)控制和抗污染系統(tǒng),影響檢測(cè)結(jié)果的重復(fù)性和穩(wěn)定性。最近,新出現(xiàn)了一種一步法UU 核酸檢測(cè)試劑,它完全免去了核酸提取過(guò)程。根據(jù)其說(shuō)明,UU核酸經(jīng)常溫裂解后全部釋放參與到PCR反應(yīng)中,整個(gè)過(guò)程無(wú)污染、操作極其簡(jiǎn)單、迅速。本研究擬通過(guò)檢測(cè)臨床樣本,將其與市場(chǎng)上的煮沸試劑進(jìn)行比對(duì),來(lái)評(píng)估這一新方法的準(zhǔn)確性及特異性。

        1資料與方法

        1.1一般資料 本次研究共檢測(cè)生殖道分泌物樣本176例,其中男性病例87例(49.4%),女性病例89(50.6%),-20℃冰箱保存。

        1.2主要試劑和儀器 新型UU核酸檢測(cè)試劑購(gòu)自湖南圣湘生物科技有限公司,采用一步法技術(shù)處理樣本(以下簡(jiǎn)稱(chēng)\"新型試劑\"或\"一步法試劑\"),具有內(nèi)標(biāo)監(jiān)控假陰性,最低檢測(cè)限為400 copies/mL;同時(shí),選擇一種臨床使用客戶(hù)較多的國(guó)產(chǎn)UU核酸檢測(cè)試劑,采用煮沸法提取樣本核酸,沒(méi)有內(nèi)標(biāo)監(jiān)控,作為對(duì)照試劑,最低檢測(cè)限為500 copies/mL。核酸擴(kuò)增儀采用美國(guó)Stratagene公司的Mx3000P實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀。

        1.3方法 分別采用兩種熒光定量PCR檢測(cè)試劑對(duì)176例臨床樣本(每例樣本一分為三,保留一份樣本作為復(fù)檢)進(jìn)行檢測(cè),方法如下。

        1.3.1煮沸法 取200 μL臨床樣本,12000 rpm離心5 min,去上清;向沉淀中加滅菌生理鹽水500 μL混勻,12000 rpm離心5 min,去上清;向沉淀中加入50 μL DNA提取液充分混勻,100℃恒溫處理10 min,12000 rpm離心5 min備用;取2 μL作為PCR反應(yīng)的模板,加入分裝有PCR反應(yīng)液的反應(yīng)管中上機(jī)檢測(cè)。

        1.3.2一步法 PCR反應(yīng)管中加入5 μL\"核酸釋放劑\",加入5 μL標(biāo)準(zhǔn)品、待檢樣本,吸打混勻,加入40 μL PCR反應(yīng)液,吸打混勻上機(jī)檢測(cè)即可。

        1.4統(tǒng)計(jì)學(xué)分析 數(shù)據(jù)進(jìn)行陰陽(yáng)性一致性分析,靈敏度、特異度分析和kappa檢驗(yàn)一致性分析。

        2結(jié)果

        2.1擴(kuò)增曲線(xiàn)對(duì)比,見(jiàn)圖1~3。

        2.2根據(jù)煮沸法試劑檢測(cè)結(jié)果將臨床樣本分為陽(yáng)性組和陰性組,見(jiàn)表1。

        2.3新型一步法試劑與煮沸法試劑檢測(cè)結(jié)果的一致性性分析:

        陽(yáng)性一致性百分比=A/(A+C)×100%=99 /(99+1)×100%=99.00%;

        陰性一致性百分比= D/(B+D)×100%=73 /(3+73)×100%=96.05%;

        總一致性百分比=(A+D)/(A+B+C+D) =(99+73)/176×100%=97.73%

        2.4新型一步法試劑與金標(biāo)準(zhǔn)培養(yǎng)法檢測(cè)結(jié)果的統(tǒng)計(jì)分析,見(jiàn)表2。

        靈敏度Se=TP/(TP+FN)×100%=97/(97+1)×100%=98.98%

        特異度Sp=TN/(FP+TN)×100%=73/(5+73)×100%=93.59%

        靈敏度Se+特異度Sp=98.98%+93.59%=192.57%>100%

        2.5煮沸法試劑與金標(biāo)準(zhǔn)培養(yǎng)法檢測(cè)結(jié)果的統(tǒng)計(jì)分析,見(jiàn)表3。

        靈敏度Se=TP/(TP+FN)×100%=97(97+1)×100%=98.98%

        特異度Sp=TN/(FP+TN)×100%=75/(3+75)×100%=96.15%

        靈敏度Se+特異度Sp=98.98%+96.15%=195.13%>100%

        2.6不符樣本的復(fù)核結(jié)果及其分析 根據(jù)結(jié)果,有4例樣本新型一步法試劑與煮沸法試劑檢測(cè)結(jié)果不符:其中3例煮沸法試劑檢測(cè)為陰性(檢測(cè)濃度處于400~1000 copies/mL且樣本性狀相對(duì)復(fù)雜),而新型一步法試劑檢測(cè)為陽(yáng)性(檢測(cè)濃度>400 copies/mL);另1例煮沸法試劑檢測(cè)為陽(yáng)性,而新型一步法試劑檢測(cè)為陰性。在兩個(gè)試劑盒的靶基因擴(kuò)增區(qū)域外圍序列,設(shè)計(jì)引物對(duì),對(duì)這4例樣本進(jìn)行PCR擴(kuò)增,克隆測(cè)序復(fù)核,結(jié)果:3例新型試劑檢測(cè)為陽(yáng)性的樣本測(cè)序結(jié)果均包含UU-DNA序列,可能其靈敏度較之煮沸法試劑更高或抗干擾能力更強(qiáng);而煮沸法試劑檢測(cè)為陽(yáng)性的1例樣本無(wú)PCR擴(kuò)增片段,懷疑為交叉污染所致。測(cè)序復(fù)核后的統(tǒng)計(jì)結(jié)果,見(jiàn)表4。

        應(yīng)用Kappa評(píng)價(jià)方法對(duì)新型試劑和對(duì)照及復(fù)核檢測(cè)結(jié)果進(jìn)行診斷一致性分析,檢驗(yàn)水準(zhǔn)為α=0.05。對(duì)Kappa值的參考評(píng)價(jià)原則如下:0.75<κ≤1時(shí),診斷一致性好;0.4<κ≤0.75時(shí),診斷一致性一般;0≤κ≤0.4時(shí),診斷一致性差。經(jīng)SPSS15.0軟件Kappa檢驗(yàn)的輸出結(jié)果,見(jiàn)表5。

        由以上輸出結(jié)果可知,Kappa值=1.000,P=0.000。α=0.05檢驗(yàn)水準(zhǔn)下,新型一步法試劑與煮沸法試劑及復(fù)核檢測(cè)結(jié)果的一致性有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,診斷一致性好。

        3討論

        目前國(guó)內(nèi)臨床上主要采用煮沸法對(duì)解脲脲原體的核酸進(jìn)行提取,具體是先將分泌物樣本濃縮、洗滌、再加裂解液、煮沸、高速離心、取上清為模板;該方法核酸提取過(guò)程較復(fù)雜,樣本處理耗時(shí)長(zhǎng),且在處理樣本時(shí),經(jīng)過(guò)煮沸裂解、高速離心富集DNA等多個(gè)步驟,樣本中的DNA存在損耗,同時(shí)由于采用了水浴或金屬浴的高溫加熱步驟,容易造成氣溶膠污。

        本研究對(duì)一種新型的免核酸提取的解脲脲原體熒光定量PCR檢測(cè)方法(一步法)與常規(guī)的煮沸法進(jìn)行對(duì)比研究。整個(gè)臨床試驗(yàn)過(guò)程均在嚴(yán)格控制下進(jìn)行,由經(jīng)專(zhuān)門(mén)培訓(xùn)的測(cè)試人員進(jìn)行檢測(cè)分析。用一步法檢測(cè),每個(gè)病例只需取少量生理鹽水洗脫樣本,處理簡(jiǎn)單,無(wú)需加熱、轉(zhuǎn)移上清等操作,可大大減少污染的發(fā)生,擴(kuò)增和熒光檢測(cè)均由儀器自動(dòng)進(jìn)行,通過(guò)查看樣本的Ct值判斷陰陽(yáng)性。

        本次研究共檢測(cè)樣本176例,根據(jù)煮沸法試劑檢測(cè)結(jié)果分為兩組:其中陽(yáng)性組100例,陰性組76例。新型解脲脲原體核酸檢測(cè)試劑與煮沸法試劑的陽(yáng)性一致性百分比為99.00%,陰性一致性百分比為96.05%,總一致性百分比為97.73%;對(duì)4例不符樣本的復(fù)核結(jié)果表明:4例樣本的測(cè)序結(jié)果均與新型試劑相符。對(duì)復(fù)核后的結(jié)果進(jìn)行Kappa檢驗(yàn)一致性分析:結(jié)果Kappa值=1.000,表明新型試劑與煮沸法試劑及復(fù)核檢測(cè)的結(jié)果具有很好的一致性。在與金標(biāo)準(zhǔn)培養(yǎng)法檢測(cè)結(jié)果的對(duì)比中,兩種試劑均表現(xiàn)出較好的準(zhǔn)確性。

        研究中發(fā)現(xiàn):一步法的樣本處理和檢驗(yàn)過(guò)程在一個(gè)PCR反應(yīng)管中即可完成,樣本中的核酸在核酸釋放劑的作用下全部釋放并參與到PCR反應(yīng)過(guò)程中,同時(shí)無(wú)需離心、振蕩、更換離心管等一系列繁瑣操作,既簡(jiǎn)化了操作步驟,又節(jié)省了耗材成本,而且無(wú)需加熱、開(kāi)/關(guān)管蓋、移液等可能導(dǎo)致核酸丟失與污染的操作,抗污染能力強(qiáng),實(shí)驗(yàn)結(jié)果的重復(fù)性大大提高,對(duì)操作人員的技術(shù)要求較低。一步法節(jié)省檢驗(yàn)時(shí)間,減少污染環(huán)節(jié),有內(nèi)標(biāo)監(jiān)控假陰性,結(jié)果準(zhǔn)確,保證臨床醫(yī)生及患者及早得到診斷結(jié)果,避免等待試驗(yàn)結(jié)果的焦慮,具有較高的臨床應(yīng)用價(jià)值。

        參考文獻(xiàn):

        [1]曹玉璞,葉元康.支原體與支原體病[M].北京人民衛(wèi)生出版社,2000.

        [2]汪寧,賀曉新,等.解脲脲原體分子流行病學(xué)研究[J].中國(guó)性病艾滋病防治,1999,5(4).

        [3]任秀柳,鞠曉紅.解脲脲原體檢測(cè)方法研究進(jìn)展[J].吉林醫(yī)藥學(xué)院學(xué)報(bào),2008,29(3):174-176.

        編輯/肖慧

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