亚洲免费av电影一区二区三区,日韩爱爱视频,51精品视频一区二区三区,91视频爱爱,日韩欧美在线播放视频,中文字幕少妇AV,亚洲电影中文字幕,久久久久亚洲av成人网址,久久综合视频网站,国产在线不卡免费播放

        ?

        WspR在大腸桿菌中的表達及其對c-di-GMP合成的影響*

        2014-11-23 05:52:46凡責(zé)艷木佳毛自朝官會林
        關(guān)鍵詞:離心管結(jié)構(gòu)域質(zhì)粒

        凡責(zé)艷, 木佳, 毛自朝, 官會林

        (1.云南師范大學(xué) 能源與環(huán)境科學(xué)學(xué)院,云南 昆明650092;2.云南農(nóng)業(yè)大學(xué) 農(nóng)業(yè)與生物技術(shù)學(xué)院,云南 昆明650201)

        可得膠(curdlan),又稱熱凝膠,是農(nóng)桿菌ATCC31749菌株所產(chǎn)生的一種胞外多糖,由400~500個D-葡萄糖以β-(1→3)糖苷鍵線性連接而成的一類葡聚糖[1-2];由于其具有凝膠強度高、熱成型后不可逆、無色、無味和保水力強等特性,已被廣泛應(yīng)用于農(nóng)業(yè)、建筑及化工行業(yè)等多個領(lǐng)域,在食品、化妝品等中用為添加劑;其抗HIV、抗腫瘤、提高免疫力活性等特性使其具有廣闊的醫(yī)用前景[3-4].目前全球可得膠產(chǎn)品約有60億美元的市場份額,并預(yù)計以每年10%左右的需求速度增長.相關(guān)研究發(fā)現(xiàn),大多數(shù)細菌胞外多糖的合成受控于新近發(fā)現(xiàn)環(huán)二鳥苷酸(c-di-GMP),該c-di-GMP是細菌中參與各種生理功能調(diào)節(jié)的第二信使[5-7],其合成及分解涉及三個蛋白質(zhì)域,其中GGDEF結(jié)構(gòu)域為c-di-GMP合成中的二鳥核苷酸環(huán)化酶,而 EAL 和 HD-GYP域是c-di-GMP分解中的磷酸二酯酶[5,8-9].細菌中廣泛分布有 這三個結(jié)構(gòu)域[5-6,9],具有GGDEF、EAL、及HDGYP結(jié)構(gòu)域的蛋白質(zhì)參與到細菌纖維素生物合成、移動性、附著性、生物膜形成、毒力因子生產(chǎn)和致病 性[7-8,10-12].作為細菌中的第二信使,c-di-GMP除具有上述功能外,還能夠刺激胞外多糖的生物合成[13].大量研究表明,從綠膿桿菌(P.aeruginosa)中得到的類超化系統(tǒng)蛋白WspR具有GGDFE結(jié)構(gòu)域,有DGC活性,可促進c-di-GMP的合成[14-17].生物信息學(xué)分析發(fā)現(xiàn),土壤農(nóng)桿菌ATCC31749含有十幾個GGDEF保守結(jié)構(gòu)域[18].因此,如能在 ATCC31749中提高 WspR的表達活性,就能提高c-di-GMP的產(chǎn)生,從而促進胞外多糖可得膠的合成.本實驗將ATCC31749的WspR克隆到pQE81L,并轉(zhuǎn)入大腸桿菌,以確定WspR的表達是否可促進c-di-GMP的合成,下一步探究WspR在ATCC31749中作用及其對可得膠的合成調(diào)控研究提供基礎(chǔ).

        1 材料與方法

        1.1 材料

        1.1.1 菌種、質(zhì)粒

        土壤農(nóng)桿菌 ATCC31749、WspR cDNA模板,大腸桿菌BL21(DE3),質(zhì)粒載體pQE81L,均由云南農(nóng)業(yè)大學(xué)生物化學(xué)與分子生物學(xué)實驗室提供.

        1.1.2 酶和試劑

        限制性內(nèi)切酶(SalI,BamHI)和 T4DNA連接酶購自Promega公司;Tap DNA聚合酶和dNTP購自TakaRa公司;血紅素、吖啶黃、ABTS(2,2-聯(lián)氮-二(3-乙基-苯并噻唑-6-磺酸)二銨鹽)、30%過氧化氫購買于sigma公司,其他試劑均為分析純.

        1.2 方法

        1.2.1 引物設(shè)計與合成

        根據(jù)GenBank中報道的pQE81L-WspR基因序列,設(shè)計合成含有相關(guān)酶切位點的上下游引物,并由上海生工生物工程有限公司合成.

        1.2.2 目的基因的PCR擴增

        根據(jù)pQE81L-WspR基因序列設(shè)計引物,上游引物:5′-GCGGATAACAATTTCACAC-3′;下游引物:5′-GCAGCACCAGGTTAGTTTCC-3′.PCR反應(yīng)體系為:WspR 的cDNA 模板2.5 μL,10×PCR buffer 5 μL(含 Mg2+),2.5 mmol/L的dNTP 4μL,50μmol/L的上下游引物各1μL,5U/μL的Tap DNA聚合酶0.5μL,加去離子水至總體積為50μL.PCR反應(yīng)程序:94℃ 預(yù)變性5min;94℃變性30s,55℃退火30 s,72℃延伸45s,共30個循環(huán);72℃延伸5 min.結(jié)束反應(yīng),PCR產(chǎn)物放置于4℃冰箱,留待電泳檢測.PCR產(chǎn)物的檢測:配制1%(w/v)的瓊脂糖凝膠,取5μL的PCR產(chǎn)物pQE81L-WspR同1μL的6×Loading buffer(1mL 6×Loading buffer混有25μL的花青素)混勻上樣,所用Marker為250bp-I DNA ladder.上樣后,凝膠于1×TAE緩沖液中,120V,電泳45min.電泳結(jié)束后使用IQuant capture凝膠成像分析系統(tǒng)拍照分析.

        1.2.3 WspR蛋白表達的初步檢測

        1.2.3.1 WspR蛋白的誘導(dǎo)表達

        將凍存的含有pQE81L-WspR的重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)入BL21菌株中,在LB含卡那霉素抗性固體平板上劃線活化,37℃溫箱倒置培養(yǎng)12~16h.挑取單菌落接種于LB液體培養(yǎng)基中,于37℃恒溫搖床中200rpm振蕩過夜培養(yǎng).次日,按1∶100的比例,將種子液接種于LB液體培養(yǎng)基中,200 rpm,37 ℃振蕩培養(yǎng).待OD600達到0.5~1.0時,加入0.1mol/L的IPTG至終濃度為1mmol/L,之后低溫30℃,200rpm振蕩培養(yǎng).并在培養(yǎng)0,2,4,6h后分別取樣1mL,留作SDS-PAGE電泳檢測.

        1.2.3.2 WspR誘導(dǎo)表達后粗蛋白樣品的處理

        將誘導(dǎo)時所取的樣品12 000rpm離心5min,棄去上清液.用無菌去離子水清洗細胞沉淀,同樣12 000rpm離心,棄上清,并重復(fù)1次.按照0.2g/mL的比例加2×Loading Buffer(其中含5%的巰基乙醇),混勻.混勻后的樣品于沸水中煮15min,之后液氮速凍,如此重復(fù)3次.解凍后,12 000rpm 離心3min.留待SDS-PAGE檢測.

        1.2.4 c-di-GMP的粗提取

        將菌株BL21pQE81L-WspR、BL21 pQE81L分別用接種環(huán)蘸取一定量在已倒好的LB固體培養(yǎng)基上劃板培養(yǎng),37 ℃恒溫搖床中180rpm培養(yǎng)12h,然后分別在兩菌株平板上挑取一個單菌落接于5mL LB液體培養(yǎng)基中(培養(yǎng)菌株BL21pQE81L-WspR的培養(yǎng)基加入Amp抗生素,培養(yǎng)菌株BL21pQE81L的培養(yǎng)基加入Amp和Kan抗生素),37℃恒溫搖床中180rpm振蕩培養(yǎng)過夜;取1mL上述菌液接種于50mL LB培養(yǎng)基中,37℃恒溫搖床中180rpm振蕩培養(yǎng)4~6h,至 OD600值為0.4~0.6左右,停止培養(yǎng);在超菌臺上往培養(yǎng)基中加入0.1M的IPTG 250μL(最終濃度為0.5M)誘導(dǎo),28℃搖床,180 rpm培養(yǎng)4h.

        把上述誘導(dǎo)好的菌液分別用兩個50mL的離心管平均分裝成兩管(每管25mL),高速離心機4℃,12 000rpm離心15分鐘;倒掉上清液,沉淀用25mL的雙蒸水洗滌一次,4 ℃,12 000 rpm離心10分鐘后,再重復(fù)一次;倒掉上清液,用1mL 10mM Tris-HCl (pH 8.0,含100mM NaCl)溶液進行重懸;向懸浮液中加入25μL的25mg/mL的溶菌酶;將懸浮液用細胞破碎儀破碎細胞(2mm超聲探頭,50%功率)每次3s,間隙3s,30min,使外膜破裂,溶菌酶進入細胞壁;向溶液中加入60%的HClO4,至終濃度為20%,使懸浮液的大分子物質(zhì)沉淀;將懸浮液放置于冰上10min,用約1.5mL 3MKOH(含0.4M Tris和2MKCl)溶液中和至PH=7.0;再次用高速離心機12 000r/min,4℃離心10min;取上清液,用0.2μm濾膜的細菌過濾器進行過濾,即得到c-di-GMP粗提取品,將濾液用2mL的離心管保存在-80℃冰箱備用.

        1.2.5 c-di-GMP的初步檢測

        本過程分成對照組和實驗組:對照組加入菌株BL21pQE81Lc-di-GMP的粗提取物,實驗組加菌 株 BL21pQE81L-WspR 的 c-di-GMP 粗提物.

        取四個無菌2.5mL的離心管,其中兩管里加入23ul的pQE81L,另外兩管兩管里加入23 μL的pQE81L-WspR,然后往四個離心管里各加入50mM Tris-HCl(pH 8.0,含100mM KCl)550μL,血紅素32.6μL混勻,放入水浴鍋中加熱至95℃,并保持5min;冷卻上述混合液至常溫,保持15min,分別往四個離心管里加入2.6 μL的吖啶黃,放入4 ℃冰箱12h;從冰箱里取出,分別往里面加入109.8μL ABTS,并放入16℃冰箱15min;然后加入5μL的30%的過氧化氫混勻,觀察各管內(nèi)顏色變化,即可檢測出c-di-GMP合成酶基因WspR在大腸桿菌中的表達情況.

        2 結(jié)果與分析

        2.1 質(zhì)粒pQE81L-WspR的構(gòu)建

        將質(zhì)粒載體pQE81L和目的基因片段WspR進行雙酶切,然后用T4DNA連接酶將載體和目的基因片段連接,轉(zhuǎn)化大腸桿菌BL21(DE3)得到重組質(zhì)粒,如圖1所示.

        圖1 pQE81L-WspR質(zhì)粒構(gòu)建流程Fig.1 The process of building plasmid pQE81L-WspR

        2.2 PCR擴增檢測攜帶pQE81L-WspR的陽性轉(zhuǎn)化子

        轉(zhuǎn)入大腸桿菌中的質(zhì)粒pQE81L-WspR,經(jīng)菌落PCR擴增檢測呈陽性的克隆提取質(zhì)粒進行PCR鑒定,1%瓊脂糖凝膠電泳檢測圖譜中呈現(xiàn)588bp左右的目的基因條帶,與預(yù)期結(jié)果一致,說明大腸桿菌BL21PQE81L已攜帶WspR的陽性轉(zhuǎn)化子,如圖2所示.

        圖2 pQE81L-WspR的鑒定Fig.2 The identification of pQE81L-WspR

        2.3 蛋白表達結(jié)果

        通過SDS-PAGE凝膠電泳,可以初步確定蛋白表達圖譜上增加了一條40kD左右的條帶,為WspR蛋白,如圖3所示.

        圖3 pQE81L-WspR在E.coli BL21菌株中的表達Fig.3 The expression of pQE81L-WspR in E.coli

        2.4 c-di-GMP存在性檢測

        根據(jù) c-di-GMP的檢測步驟,當(dāng)加入血紅素時,pQE81L系列為無色,pQE81L-WspR系列為淺淺的紅綠色,如圖4所示;再加入吖啶黃時,pQE81L系列為淺淺的黃色,pQE81L-WspR系列為深黃色,如圖5所示;所有藥品加完時pQE81L系列為淺綠色,pQE81L-WspR系列為深綠色,如圖6所示.

        上述實驗經(jīng)多次反復(fù)操作,顏色變化保持一致,表明大腸桿菌BL21pQE81L-WspR參與合成了 c-di-GMP,并且c-di-GMP氧化ABTS 為ABTS+離子,是整個溶液表現(xiàn)出ABTS+離子的顏色,即綠色.而大腸桿菌BL21pQE81L雖然也合成了c-di-GMP,使溶液表現(xiàn)淡淡的淺綠色,但相比WspR基因存在下合成的量卻很少.

        綜上所述,WspR受體蛋白能促進大腸桿菌合成第二信使c-di-GMP,并且大大加速了c-di-GMP的合成量.

        圖4 加入血紅素后的顏色變化Fig.4 The colour change after adding hemin

        圖5 加入吖啶黃后的顏色變化 Fig.5 The colour change after adding acriflavine

        圖6 加完ABTS和H2O2之后的顏色變化 Fig.6 The colour change after adding ABTS and H2O2

        3 討 論

        作為一個廣泛存在的第二信使-環(huán)二鳥苷酸(c-di-GMP),國內(nèi)外在有關(guān)代謝調(diào)控、細胞功能和信號傳導(dǎo)的作用等方面取得了重要的進展[19-23].但是目前對土壤農(nóng)桿菌 ATCC31749中c-di-GMP的調(diào)控機制目前還不清楚,而我們通過研究驗證WspR能在大腸桿菌中表達,并促進cdi-GMP大量表達,這為下一步研究 WspR在土壤農(nóng)桿菌ATCC31749中促進c-di-GMP合成提供基礎(chǔ),進而為可得膠合成提供一定的依據(jù).

        雖然我們初步證實了WspR受體蛋白能在大腸桿菌中促進c-di-GMP大量表達,但相關(guān)研究還有許多問題尚待解決:①合成c-di-GMP的影響因素、最佳條件、調(diào)控機制;②WspR能否在土壤農(nóng)桿菌ATCC31749中合成c-di-GMP并表達大量的胞外多糖可得膠;③尋找菌體內(nèi)c-di-GMP作用的靶點,但是還有許多細菌并不含有GEMM RNA,那么這些細菌中c-di-GMP第二信使傳導(dǎo)通路是否存在其他調(diào)節(jié)機制有待于進一步研究.未來的研究中,鑒定新的c-di-GMP調(diào)控是我們迫切需要解決的問題.

        4 結(jié) 論

        綠膿桿菌中得到的類趨化系統(tǒng)蛋白 WspR在大腸桿菌BL21中順利促進合成c-di-GMP,并且合成量能大大增加.而大腸桿菌是大量高效表達純化蛋白質(zhì)的模式菌株,這就為后期研究WspR受體蛋白在土壤農(nóng)桿菌ATCC31749中促進合成c-di-GMP,進而合成胞外多糖可得膠提供了確切可行的依據(jù).

        [1]叢峰松,張洪斌,張維杰.可得膠及其在食品和醫(yī)藥領(lǐng)域上的應(yīng)用[J].食品科學(xué),2004,25(11):432-435.

        [2]ZHANG H,NISHINARI K,WILLIAMS M A K,et al.A molecular description of the gelation mechanism of curdlan[J].Mol Microbiol,2002,30(1):7-16.

        [3]LAROCHE1C,MICHAUD P.New developments and prospective applications forβ(1,3)glucans[J].Recent Patents on Biotechnology,2007,1(1):59-73.

        [4]GOODRIDGE H S,WOLF A J,UNDERHILL D M.β-glucan recognition by the innate immune system[J].Immunol Rev,2009,230(1):38-50.

        [5]JENAL U,MALONE J.Mechanisms of cyclic-di-GMP signaling in bacteria[J].Annu Rev Genet,2006,40(2):385-407.

        [6]R?MLING U,AMIKAM D.Cyclic di-GMP as a second messenger[J].Curr Opin Microbiol,2006,9(2):218-228.

        [7]RYAN R P,F(xiàn)OUHY Y,LUCEY J F,AND DOW J M.Cyclic di-GMP signaling in bacteria:recent advances and new puzzles[J].Nat Rev Microbiol,2007,188(24):8327-8344.

        [8]TAMAYO R,TISCHLER A D,AND CAMILLI A.The EAL domain protein VieA is a cyclic diguanylate phosphodiesterase[J].Nat Rev Microbiol,2005,280(39):33324-33330.

        [9]DOW J M,CROSSMAN L,F(xiàn)INDLAY K,et al.Biofilm dispersal in Xanthomonas campestris is controlled by cell-cell signaling and is required for full virulence to plants[J].Proc Natl Acad Sci USA,100(19):10995-11000.

        [10]ROSS P,WEINHOUSE H,ALONI Y,et al.Regulation of cellulose synthesis in Acetobacter xyli-num by cyclic diguanylate[J].Nature,1987,325(6101):279-281.

        [11]SIMM R,MORR M,KADER A,et al.GGDEF and EAL domains inversely regulate cyclic di-GMP levels and transition from sessility to motility[J].Mol Microbiol,2004,53(4):1123-1134.

        [12]Hengge R.Principles of c-di-GMP signalling in bacteria[J].Nat Rev Microbiol,2009,7(4):263-273.

        [13]吳林.Shewanella oneidensis鞭毛組裝的分子特性及其非運動褶皺表型的形成機理[D].杭州:浙江大學(xué),2011.

        [14]JENNIFER R,CONNOR O,NATHAN J K,et al.Surface sensing and lateral subcellular localization of WspA,the receptor in a chemosensory-like system leading to c-di-GMP[J].Mol Microbiol,2012,86(3):720-729.

        [15]HICKMAN J W,HARWOOD C.dentification of FleQ from Pseudomonas aeruginosa as a c-di-GMP-responsive transcription factor[J].Mol Microbiol,2008,69(2):376-389.

        [16]KARATAN E,WATNICK P.Signals,regulatory networks,and materials that build and break bacterial biofilms[J].Microbio Mol Biol Rev,2009,73(2):310-347.

        [17]KRASTEVA P V,F(xiàn)ONG J C,SHIKUMA N J,et al.Vibrio cholerae VpsT regulates matrix production and motility by directly sensing cyclic di-GMP[J].Science,2010,327(5967):866-868.

        [18]于麗珺.土壤桿菌ATCC31749合成熱凝膠的氨調(diào)控機理及高產(chǎn)策略研究[D].南京:江南大學(xué),2011.

        [19]NAKHAMCHIK A,WILDE C,ROWE-MAGNUS D A.Cyclic-di-GMP regulates extracellular polysaccharide production,biofilm formation,and rugose colony development by Vibrio vulnificus[J].Appl Environ Microbiol,2008,74(13):4199-4209.

        [20]NAKAYAMA S,ROELOFS K,LEE V T,et al.A c-di-GMP-proflavine-h(huán)emin supramolecular complex has peroxidase activity-implication for a simple colorimetric detection[J].Molecular BioSystems,2012,8(3):726-729.

        [21]SUNDRIYAL A,MASSA C,SAMORAY D,et.al.Inherent regulation of EAL domain-catalyzed hydrolysis of second messenger c-di-GMP[J].J Biol.Chem,2014,289(18):6978-6990.

        [22]HENGGE R.Novel tricks played by the second messenger c-di-GMP in bacterial biofilm formation[J].EMBO J,2013,32(3):322-323.

        [23]LINDENBERG S,KLAUCK G,PESAVENTO C.The EAL domain protein YciR acts as a trigger enzyme in a c-di-GMP signalling cascade in E.coli biofilm control[J].EMBO J,2013,32(14):2001-2014.

        猜你喜歡
        離心管結(jié)構(gòu)域質(zhì)粒
        魔方型離心管架的設(shè)計及研發(fā)
        科技視界(2020年26期)2020-09-24 03:25:06
        離心管架研究現(xiàn)狀及魔尺型離心管架的設(shè)計
        科技視界(2020年17期)2020-07-30 14:03:27
        蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域劃分方法及在線服務(wù)綜述
        短乳桿菌天然質(zhì)粒分類
        燃燒條件演示實驗的新設(shè)計
        重組綠豆BBI(6-33)結(jié)構(gòu)域的抗腫瘤作用分析
        組蛋白甲基化酶Set2片段調(diào)控SET結(jié)構(gòu)域催化活性的探討
        重組質(zhì)粒rAd-EGF構(gòu)建并轉(zhuǎn)染hDPSCs對其增殖的影響
        Survivin-siRNA重組質(zhì)粒對人神經(jīng)母細胞瘤細胞SH-SY5Y的作用
        泛素結(jié)合結(jié)構(gòu)域與泛素化信號的識別
        国产性自爱拍偷在在线播放| 人妻少妇人人丰满视频网站| 日韩精品少妇专区人妻系列| 国产亚洲精品久久情侣| 手机福利视频| 亚洲性无码av在线| 无码国产精品一区二区免费式芒果| 蜜臀av一区二区三区| 又大又粗欧美黑人aaaaa片| 亚洲国产精品无码久久一线| 精产国品一二三产品蜜桃| 精品少妇大屁股白浆无码| 成人短篇在线视频夫妻刺激自拍| 亚洲视频高清一区二区| 成年无码av片在线| 久久国产亚洲高清观看5388| 精品蜜桃在线观看一区二区三区| 一区二区三区中文字幕p站| 国产精品特级毛片一区二区三区 | 18禁黄网站禁片免费观看| 99热成人精品国产免| 最新日本女优中文字幕视频| 亚洲视频免费一区二区| 久久不见久久见中文字幕免费 | 亚洲国产精品综合久久20| 久久精品亚洲国产av网站| 国产在线高清理伦片a| 国产产区一二三产区区别在线| 男女男在线精品网站免费观看 | 少妇粉嫩小泬喷水视频| 国产人妖视频一区二区| 亚洲一区二区av偷偷| 亚洲av日韩av卡二| 午夜不卡av免费| 亚洲AV无码资源在线观看| 亚洲国产av午夜福利精品一区| 成熟了的熟妇毛茸茸| 蜜桃av噜噜一区二区三区| 秋霞国产av一区二区三区| 极品尤物人妻堕落沉沦| 欲色天天网综合久久|