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        櫻桃CBF基因的克隆及序列分析

        2014-11-22 11:06:08張建朋陳新徐麗
        山東農(nóng)業(yè)科學(xué) 2014年10期
        關(guān)鍵詞:序列分析櫻桃克隆

        張建朋 陳新 徐麗 等

        摘要:CBF(CRT/DRE-binding factor)基因是一種低溫響應(yīng)轉(zhuǎn)錄因子基因,CBF蛋白能夠與很多低溫相關(guān)基因的啟動(dòng)子結(jié)合,使其表達(dá),從而增強(qiáng)植物抗冷能力。本研究利用已經(jīng)公布的CBF序列的保守區(qū)設(shè)計(jì)特異引物,對(duì)櫻桃砧木吉塞拉6號(hào)的cDNA進(jìn)行擴(kuò)增,成功獲得CBF的全長(zhǎng)序列。序列分析結(jié)果表明,其開(kāi)放閱讀框?yàn)?23 bp,編碼240個(gè)氨基酸,具有典型的AP2結(jié)構(gòu)域及CBF特有的兩段短肽序列。氨基酸序列同源性分析表明,該CBF與薔薇科植物同源性較高,與其他科屬植物同源性較差。

        關(guān)鍵詞:櫻桃;CBF基因;克隆;序列分析

        中圖分類號(hào):S662.503.4文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)號(hào):A文章編號(hào):1001-4942(2014)10-0012-04

        3結(jié)論

        植物CBF/DREB類基因在非生物逆境響應(yīng)

        過(guò)程中具有重要功能。本研究成功克隆了櫻桃砧木吉塞拉6號(hào)CBF基因的全長(zhǎng),并對(duì)其進(jìn)行序列和遺傳進(jìn)化分析。該試驗(yàn)結(jié)果為進(jìn)一步研究櫻桃CBF基因的功能及冷誘導(dǎo)途徑奠定了基礎(chǔ),也為該種櫻桃的抗寒能力研究和抗冷系育種提供了理論依據(jù)。

        參考文獻(xiàn):

        [1]孔旭.中國(guó)果樹(shù)栽培學(xué)[M]. 北京: 農(nóng)業(yè)出版社,1987: 558-559.

        [2]俞德浚.落葉果樹(shù)分類學(xué)[M].上海:上??茖W(xué)技術(shù)出版社,1984:114-125.

        [3]于亞軍,代漢萍,李寶江,等. 世界櫻桃育種進(jìn)展[J]. 果樹(shù)學(xué)報(bào),2003,20(2):135-139.

        [4]王洋, 胡吉吉, 王崇英. 擬南芥CBF/DREB 途徑的研究進(jìn)展及其在植物基因工程中的應(yīng)用[J]. 生物物理學(xué)報(bào), 2007,23(2): 101-108.

        [5]郭喜英,韋正乙,邢少辰,等.轉(zhuǎn)錄激活因子CBF與植物的抗脅迫能力[J].分子植物育種,2006,4(3):419-424.

        [6]陳新,王貴禧,梁麗松,等. 平榛冷適應(yīng)相關(guān)基因CBF的克隆及時(shí)空表達(dá)特性分析[J]. 林業(yè)科學(xué),2012,48(1):167-172.

        [7]張建朋,張士剛,陳新,等.麻核桃CBF基因的克隆與生物信息學(xué)分析[J].山東農(nóng)業(yè)科學(xué),2013,45(11):7-11.

        [8]Champ K I,F(xiàn)ebres V J,Moore B D. The role of CBF transcriptional activators in two Citrus species (Poncirus and Citrus) with contrasting levels of freezing tolerance[J]. Physiologia Plantarum,2007,129(3):529-541.

        [9]Benedict C,Skinner J S,Meng R,et al. The CBF1-dependent low temperature signalling pathway,regulon and increase in freeze tolerance are conserved in Populus spp. [J]. Plant Cell Environ., 2006,29(7):1259-1272.

        [10]Gilmour S J,Zarka D G,Stockinger E J,et al. Low temperature regulation of the Arabidopsis CBF family of AP2 transcriptional activators as an early step in cold-induced COR gene expression[J]. The Plant Journal,1998,16(4):433-442.

        [11]Okamuo J K,Caster B,Villarroel R,et al. The AP2 domain of APETALA2 defines a large new family of DNA binding proteins in Arabidopsis[J]. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1997,94(13):7076-7081.

        [12]李利斌,劉立鋒,王殿峰,等.大白菜CBF4基因的克隆和遺傳進(jìn)化分析[J]. 山東農(nóng)業(yè)科學(xué),2009(4):1-4.

        [13]Jaglo-Ottosen K R,Kleff S,Amundsen K L,et al. Components of the Arabidopsis C-repeat /dehydration -responsive element binding factor cold-response pathway are conserved in Brassica napus and other plant species[J]. Plant Physiology,2001,127(3):910-917.

        摘要:CBF(CRT/DRE-binding factor)基因是一種低溫響應(yīng)轉(zhuǎn)錄因子基因,CBF蛋白能夠與很多低溫相關(guān)基因的啟動(dòng)子結(jié)合,使其表達(dá),從而增強(qiáng)植物抗冷能力。本研究利用已經(jīng)公布的CBF序列的保守區(qū)設(shè)計(jì)特異引物,對(duì)櫻桃砧木吉塞拉6號(hào)的cDNA進(jìn)行擴(kuò)增,成功獲得CBF的全長(zhǎng)序列。序列分析結(jié)果表明,其開(kāi)放閱讀框?yàn)?23 bp,編碼240個(gè)氨基酸,具有典型的AP2結(jié)構(gòu)域及CBF特有的兩段短肽序列。氨基酸序列同源性分析表明,該CBF與薔薇科植物同源性較高,與其他科屬植物同源性較差。

        關(guān)鍵詞:櫻桃;CBF基因;克?。恍蛄蟹治?/p>

        中圖分類號(hào):S662.503.4文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)號(hào):A文章編號(hào):1001-4942(2014)10-0012-04

        3結(jié)論

        植物CBF/DREB類基因在非生物逆境響應(yīng)

        過(guò)程中具有重要功能。本研究成功克隆了櫻桃砧木吉塞拉6號(hào)CBF基因的全長(zhǎng),并對(duì)其進(jìn)行序列和遺傳進(jìn)化分析。該試驗(yàn)結(jié)果為進(jìn)一步研究櫻桃CBF基因的功能及冷誘導(dǎo)途徑奠定了基礎(chǔ),也為該種櫻桃的抗寒能力研究和抗冷系育種提供了理論依據(jù)。

        參考文獻(xiàn):

        [1]孔旭.中國(guó)果樹(shù)栽培學(xué)[M]. 北京: 農(nóng)業(yè)出版社,1987: 558-559.

        [2]俞德浚.落葉果樹(shù)分類學(xué)[M].上海:上海科學(xué)技術(shù)出版社,1984:114-125.

        [3]于亞軍,代漢萍,李寶江,等. 世界櫻桃育種進(jìn)展[J]. 果樹(shù)學(xué)報(bào),2003,20(2):135-139.

        [4]王洋, 胡吉吉, 王崇英. 擬南芥CBF/DREB 途徑的研究進(jìn)展及其在植物基因工程中的應(yīng)用[J]. 生物物理學(xué)報(bào), 2007,23(2): 101-108.

        [5]郭喜英,韋正乙,邢少辰,等.轉(zhuǎn)錄激活因子CBF與植物的抗脅迫能力[J].分子植物育種,2006,4(3):419-424.

        [6]陳新,王貴禧,梁麗松,等. 平榛冷適應(yīng)相關(guān)基因CBF的克隆及時(shí)空表達(dá)特性分析[J]. 林業(yè)科學(xué),2012,48(1):167-172.

        [7]張建朋,張士剛,陳新,等.麻核桃CBF基因的克隆與生物信息學(xué)分析[J].山東農(nóng)業(yè)科學(xué),2013,45(11):7-11.

        [8]Champ K I,F(xiàn)ebres V J,Moore B D. The role of CBF transcriptional activators in two Citrus species (Poncirus and Citrus) with contrasting levels of freezing tolerance[J]. Physiologia Plantarum,2007,129(3):529-541.

        [9]Benedict C,Skinner J S,Meng R,et al. The CBF1-dependent low temperature signalling pathway,regulon and increase in freeze tolerance are conserved in Populus spp. [J]. Plant Cell Environ., 2006,29(7):1259-1272.

        [10]Gilmour S J,Zarka D G,Stockinger E J,et al. Low temperature regulation of the Arabidopsis CBF family of AP2 transcriptional activators as an early step in cold-induced COR gene expression[J]. The Plant Journal,1998,16(4):433-442.

        [11]Okamuo J K,Caster B,Villarroel R,et al. The AP2 domain of APETALA2 defines a large new family of DNA binding proteins in Arabidopsis[J]. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1997,94(13):7076-7081.

        [12]李利斌,劉立鋒,王殿峰,等.大白菜CBF4基因的克隆和遺傳進(jìn)化分析[J]. 山東農(nóng)業(yè)科學(xué),2009(4):1-4.

        [13]Jaglo-Ottosen K R,Kleff S,Amundsen K L,et al. Components of the Arabidopsis C-repeat /dehydration -responsive element binding factor cold-response pathway are conserved in Brassica napus and other plant species[J]. Plant Physiology,2001,127(3):910-917.

        摘要:CBF(CRT/DRE-binding factor)基因是一種低溫響應(yīng)轉(zhuǎn)錄因子基因,CBF蛋白能夠與很多低溫相關(guān)基因的啟動(dòng)子結(jié)合,使其表達(dá),從而增強(qiáng)植物抗冷能力。本研究利用已經(jīng)公布的CBF序列的保守區(qū)設(shè)計(jì)特異引物,對(duì)櫻桃砧木吉塞拉6號(hào)的cDNA進(jìn)行擴(kuò)增,成功獲得CBF的全長(zhǎng)序列。序列分析結(jié)果表明,其開(kāi)放閱讀框?yàn)?23 bp,編碼240個(gè)氨基酸,具有典型的AP2結(jié)構(gòu)域及CBF特有的兩段短肽序列。氨基酸序列同源性分析表明,該CBF與薔薇科植物同源性較高,與其他科屬植物同源性較差。

        關(guān)鍵詞:櫻桃;CBF基因;克??;序列分析

        中圖分類號(hào):S662.503.4文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)號(hào):A文章編號(hào):1001-4942(2014)10-0012-04

        3結(jié)論

        植物CBF/DREB類基因在非生物逆境響應(yīng)

        過(guò)程中具有重要功能。本研究成功克隆了櫻桃砧木吉塞拉6號(hào)CBF基因的全長(zhǎng),并對(duì)其進(jìn)行序列和遺傳進(jìn)化分析。該試驗(yàn)結(jié)果為進(jìn)一步研究櫻桃CBF基因的功能及冷誘導(dǎo)途徑奠定了基礎(chǔ),也為該種櫻桃的抗寒能力研究和抗冷系育種提供了理論依據(jù)。

        參考文獻(xiàn):

        [1]孔旭.中國(guó)果樹(shù)栽培學(xué)[M]. 北京: 農(nóng)業(yè)出版社,1987: 558-559.

        [2]俞德浚.落葉果樹(shù)分類學(xué)[M].上海:上??茖W(xué)技術(shù)出版社,1984:114-125.

        [3]于亞軍,代漢萍,李寶江,等. 世界櫻桃育種進(jìn)展[J]. 果樹(shù)學(xué)報(bào),2003,20(2):135-139.

        [4]王洋, 胡吉吉, 王崇英. 擬南芥CBF/DREB 途徑的研究進(jìn)展及其在植物基因工程中的應(yīng)用[J]. 生物物理學(xué)報(bào), 2007,23(2): 101-108.

        [5]郭喜英,韋正乙,邢少辰,等.轉(zhuǎn)錄激活因子CBF與植物的抗脅迫能力[J].分子植物育種,2006,4(3):419-424.

        [6]陳新,王貴禧,梁麗松,等. 平榛冷適應(yīng)相關(guān)基因CBF的克隆及時(shí)空表達(dá)特性分析[J]. 林業(yè)科學(xué),2012,48(1):167-172.

        [7]張建朋,張士剛,陳新,等.麻核桃CBF基因的克隆與生物信息學(xué)分析[J].山東農(nóng)業(yè)科學(xué),2013,45(11):7-11.

        [8]Champ K I,F(xiàn)ebres V J,Moore B D. The role of CBF transcriptional activators in two Citrus species (Poncirus and Citrus) with contrasting levels of freezing tolerance[J]. Physiologia Plantarum,2007,129(3):529-541.

        [9]Benedict C,Skinner J S,Meng R,et al. The CBF1-dependent low temperature signalling pathway,regulon and increase in freeze tolerance are conserved in Populus spp. [J]. Plant Cell Environ., 2006,29(7):1259-1272.

        [10]Gilmour S J,Zarka D G,Stockinger E J,et al. Low temperature regulation of the Arabidopsis CBF family of AP2 transcriptional activators as an early step in cold-induced COR gene expression[J]. The Plant Journal,1998,16(4):433-442.

        [11]Okamuo J K,Caster B,Villarroel R,et al. The AP2 domain of APETALA2 defines a large new family of DNA binding proteins in Arabidopsis[J]. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1997,94(13):7076-7081.

        [12]李利斌,劉立鋒,王殿峰,等.大白菜CBF4基因的克隆和遺傳進(jìn)化分析[J]. 山東農(nóng)業(yè)科學(xué),2009(4):1-4.

        [13]Jaglo-Ottosen K R,Kleff S,Amundsen K L,et al. Components of the Arabidopsis C-repeat /dehydration -responsive element binding factor cold-response pathway are conserved in Brassica napus and other plant species[J]. Plant Physiology,2001,127(3):910-917.

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