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        DNA計算機(jī)算法對于Ramsey數(shù)的求解研究

        2014-11-19 09:50:32徐智杰
        電子技術(shù)與軟件工程 2014年20期
        關(guān)鍵詞:下界遺傳算法定理

        摘 要 Ramsey作為計算機(jī)中常見的一種數(shù)學(xué)組合理論依據(jù),其主要是由龐大的組合數(shù)學(xué)而構(gòu)成,隨著計算機(jī)信息技術(shù)的推廣,它在代數(shù)學(xué)、邏輯學(xué)以及分析學(xué)等方面的應(yīng)用也越來越廣泛。Ramsey求解是一個相對比較困難的部分,到目前為止,由關(guān)于這方面的研究,只能求出9個Ramsey數(shù)的準(zhǔn)確值。而本文研究的主要目的是探討Ramsey數(shù)字求解在DNA生物分子超級計算模型中的求解可能性,通過具體數(shù)據(jù)模型的計算,以證明其應(yīng)用的可靠性。希望通過本文的分析能實(shí)現(xiàn)提Ramsey的推廣和普及。

        【關(guān)鍵詞】DNA計算機(jī)算法 Ramsey數(shù)的求解

        Ramsey定理最早由英國Ramsey提出,發(fā)表論文中的組合數(shù)字定理證明之后引起了數(shù)學(xué)家們的注意。任意給出的兩個正整數(shù)k與l,一定能找到最小數(shù)n。Ramsey的研究在數(shù)學(xué)技術(shù)有重要意義,它采用了很多技術(shù),目前,求解大的Ramsey數(shù)還很難實(shí)現(xiàn)。隨著計算機(jī)越來越快速發(fā)展,以往通過圖解的方式,也開始由計算機(jī)所取代,其中DNA遺傳算法等被很快應(yīng)用其中。它的優(yōu)點(diǎn)很多,例如步驟少,可行性很高,并且錯誤率比一般算法相比低很多等。

        1 Ramsey數(shù)的研究發(fā)展與意義

        1.1 Ramsey的由來

        Ramsey定理最早由數(shù)學(xué)家F.R.Ramsey提出,發(fā)表于他的“On a problem of fomal logic”論文中,這篇論文里證明了Ramsey定理,是一個組合數(shù)字定理。起初的Ramsey默默無聞,直到一篇題為“A combinatorial problem in geometry”論文的橫空出世,Ramsey定理才開始聲名鵲起。7973年為慶祝論文其中一名作者P.Eraos的生日召開的組合數(shù)字會議,最終成為Ramsey的里程碑,更多的數(shù)學(xué)家涌入這一理論的研究,不斷用新的理論和方法來豐富Ramsey定理。

        1.2 Ramsey的發(fā)展和應(yīng)用

        現(xiàn)在Ramsey已經(jīng)涉及到多個學(xué)科,其中包括數(shù)學(xué)、數(shù)論、數(shù)理邏輯、計算數(shù)學(xué)、圖論、泛函分析等各種方面,更有甚者將數(shù)學(xué)歸納法與Ramsey相提并論,這已經(jīng)證明了Ramsey理論研究的重要意義。而Ramsey理論也蘊(yùn)含著一個深刻的哲學(xué)思想,就是當(dāng)量到達(dá)一種程度時會出現(xiàn)某種結(jié)構(gòu),這種結(jié)構(gòu)必然是有序的,其中必定出現(xiàn)某種量的最小值就是Ramsey數(shù)。

        Ramsey理論的研究被廣泛應(yīng)用,它的結(jié)果也被越來越多的領(lǐng)域利用做其他方面的研究,例如1998年Fields獎的獲得者W.T.Gowers就把Ramsey理論應(yīng)用到泛函分析,在Banach空間以及極值組合論做出了重大貢獻(xiàn)。

        2 DNA計算機(jī)算法對于Ramsey數(shù)的求解模理論建立分析

        2.1 課題研究意義

        傳統(tǒng)Ramsey研究方法如尋找循環(huán)圖和Cayley圖等方式通常都無法得到較大的的Ramsey精確值,只能得到它的上下界。因?yàn)檫@種傳統(tǒng)計算方式的局限性,還有Ramsey本身研究的困難性,計算機(jī)研究Ramsey數(shù)的方法理所當(dāng)然的產(chǎn)生。模擬退火算法、DNA遺傳算法都是比較常用的Ramsey數(shù)研究辦法,而本文主要講述DNA計算機(jī)算法對于Ramsey數(shù)的求解研究分析。

        2.2 計算方法

        DNA遺傳算法這種新型的計算方法,主要以DNA與一些相關(guān)生物酶等元素做基本材料,是基于生化反應(yīng)的原理得出的分子生物計算方式。現(xiàn)在,已經(jīng)有很多學(xué)者投入這一研究領(lǐng)域。最早的DNA算法于1994年由Adleman開創(chuàng)。1995年Lipton,1997年Ouyang,2006年Li等人相繼提出更多問題的DNA算法研究。

        不論哪種DNA計算方式,通常第一步會生成一個包含正確和不正確解的初始數(shù)據(jù)池,使用對應(yīng)的DNA計算法來去除不正確的,然后檢測出正確的解,就是DNA操作中所得到的問題的解。只是這種方式受到各種規(guī)模限制,而且會導(dǎo)致DNA指數(shù)上漲?,F(xiàn)今,用計算機(jī)求解Ramsey成為了一種趨勢,但是在求解較大Ramsey數(shù)方面,仍然是非常復(fù)雜的,需要的時間也很久。

        3 Ramsey數(shù)的DNA計算機(jī)算法問題及思想

        3.1 Ramsey數(shù)的計算原理

        以數(shù)學(xué)上原本存在的公式可以得出R(m,n)上下界,從下界到上界的過程中產(chǎn)生的解空間,除去部分的鏈,檢測最終試管,如果初始空間DNA鏈都被刪除,當(dāng)前值就可以確定為要求的Ramsey數(shù)??梢杂眠@種方法驗(yàn)證上下界間的每一個數(shù),得出具體R(m,n)。

        3.2 關(guān)鍵環(huán)節(jié)

        找到一種好的選邊策略是快速計算的關(guān)鍵。Ramsey問題可以歸結(jié)成為一個NP完全問題,最終轉(zhuǎn)化為圖著色問題,也就是多頂點(diǎn)便之間的雙染色問題,以非解4(3,3)的排除驗(yàn)證為例,即證明任意4個人中要么至少3個人認(rèn)識,要么至少3個不認(rèn)識,此命題明顯是不正確的。

        現(xiàn)已確定R(5,5)是43-49之間的某一個數(shù)字。假設(shè)我們要用此算法驗(yàn)證 43(5,5)是否為正解,則可以將所有5邊形看作頂點(diǎn)設(shè)計Origami,所有的C43共903條邊都設(shè)計成2種顏色。之后將盡量多的點(diǎn)和邊混合到一起,相當(dāng)于搜索邊中每一個可能的解。頂點(diǎn)處進(jìn)行Origami熒光特異性設(shè)計,只能連接指定的邊并且當(dāng)N個邊的顏色相同時便呈現(xiàn)熒光。這樣若43為非解時,便會出現(xiàn)大片不顯熒光的組合,即可排除結(jié)論。

        4 結(jié)論

        本文主要運(yùn)用理論知識與小規(guī)模排除為例,簡單說明了DNA計算機(jī)算法在Ramsey數(shù)理論上的運(yùn)用和意義。為Ramsey數(shù)的求解提供創(chuàng)新的思路,但由于現(xiàn)有技術(shù)的局限性,該算法上可解的Ramsey數(shù)仍然有限,隨著各方面條件的成熟,DNA計算機(jī)算法對于Ramsey數(shù)的求解一定會更加完善。

        參考文獻(xiàn)

        [1]宋智超.一種基于DNA折紙術(shù)求解Ramsey數(shù)的算法[J].電源技術(shù)應(yīng)用,2013(7).

        [2]郭里.若干圖論問題的DNA計算機(jī)算法研究[D].湖南大學(xué),2009.

        作者簡介

        徐智杰(1985-),男,大學(xué)本科學(xué)歷。現(xiàn)為山西金融職業(yè)學(xué)院助教。研究方向?yàn)橛嬎銠C(jī)科學(xué)與技術(shù)。

        作者單位

        山西金融職業(yè)學(xué)院 山西省太原市 030008endprint

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