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        rs2233678和rs2233679多態(tài)性與福建漢族人群肺癌易感性及臨床病理學(xué)特征的關(guān)系

        2014-11-18 10:14:34黃建新黃建平張旸張黎仙楊坤榮
        中國(guó)當(dāng)代醫(yī)藥 2014年30期
        關(guān)鍵詞:易感性多態(tài)性基因型

        黃建新+黃建平+張旸+張黎仙+楊坤榮+陳清泉

        [摘要] 目的 了解福建漢族人群肽酰脯氨?;?lè)串悩?gòu)酶1(Pin1)基因rs2233678(-842G/C)和rs2233679(-667T/C)多態(tài)性分布規(guī)律及其與肺癌發(fā)生、發(fā)展的關(guān)系。 方法 采用聚合酶鏈反應(yīng)(PCR)技術(shù),對(duì)80例漢族肺癌患者和135例健康對(duì)照的Pin1基因啟動(dòng)子進(jìn)行擴(kuò)增并對(duì)PCR產(chǎn)物直接測(cè)序,分析Pin1基因啟動(dòng)子多態(tài)性與肺癌易感性及其臨床病理學(xué)特征的關(guān)系。 結(jié)果 rs2233678位點(diǎn)只檢測(cè)到GG和GC兩種基因型,沒(méi)有檢測(cè)到CC基因型。rs2233678和rs2233679位點(diǎn)的等位基因和基因型分布在肺癌組和健康對(duì)照組中比較差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05);其組成的單體型C-C、G-C和G-T均與肺癌發(fā)生風(fēng)險(xiǎn)無(wú)相關(guān)性(P>0.05),rs2233678的基因型分布與肺癌的臨床病理學(xué)特征無(wú)相關(guān)性(P>0.05),rs2233679的基因型分布與肺癌病理類型呈弱相關(guān)(r=0.285,P=0.010)。 結(jié)論 rs2233678和rs2233679多態(tài)性可能與福建漢族人群肺癌易感性無(wú)關(guān),rs2233679的基因型分布與肺癌病理類型有一定的相關(guān)性。

        [關(guān)鍵詞] 肺癌;肽酰脯氨?;?lè)串悩?gòu)酶1;多態(tài)性;易感性

        [中圖分類號(hào)] R734.2 [文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼] A [文章編號(hào)] 1674-4721(2014)10(c)-0004-04

        肽酰脯氨?;?lè)串悩?gòu)酶1(peptidyl-prolyl cis-trans isomerase NIMA-interacting 1,Pin1)是一種高度保守、特異的肽脯氨酰基順?lè)串悩?gòu)酶,能特異性地催化磷酸化絲/蘇-脯氨酸基序發(fā)生順?lè)串悩?gòu),影響許多癌基因信號(hào)通路中β-catenin[1]、NF-кB[2]等關(guān)鍵蛋白的活性和穩(wěn)定性,在細(xì)胞增殖和腫瘤發(fā)生、發(fā)展中起重要作用[3],被認(rèn)為是一種新的腫瘤預(yù)后因子和抗癌治療的靶標(biāo)[3-6]。Pin1基因多態(tài)性的研究主要集中在啟動(dòng)子區(qū)的-842G/C(rs2233678)和-667T/C(rs2233679)兩個(gè)多態(tài)性位點(diǎn)上。流行病學(xué)研究顯示,Pin1基因多態(tài)性與乳腺癌、肝癌、肺癌、食管癌、頭頸部鱗癌及喉部鱗癌等多種腫瘤易感性密切相關(guān),但研究結(jié)果存在明顯的分歧:有些研究者認(rèn)為,-842G/C的C基因變異是腫瘤發(fā)生的保護(hù)因子,可以降低亞洲人和白種人群頭頸部鱗癌、肺癌和乳腺癌的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)[7-11];有些研究顯示,-667T基因可以明顯降低亞洲人群的腫瘤易感性[8];還有研究認(rèn)為-842G/C[12]和-667T/C[7,10-12]與腫瘤的易感性無(wú)關(guān)。至今仍未見Pin1基因多態(tài)性與福建地區(qū)漢族人群肺癌易感性的報(bào)道,因此,為明確Pin1基因多態(tài)性與肺癌易感性和臨床病理特征的關(guān)系,本研究對(duì)福建漢族肺癌患者Pin1基因的rs2233678(-842G/C)和rs2233679(-667T/C)多態(tài)性位點(diǎn)進(jìn)行分析。

        1 資料與方法

        1.1 一般資料

        收集2013年7~12月在本院住院并手術(shù)確診的80例肺癌患者作為肺癌組,其中男性52例(65.0%),女性28例(35.0%);平均年齡為(59.1±11.8)歲;腺癌54例(67.5%),鱗癌17例(21.3%),其他類型肺癌9例(11.2%)。同時(shí)選取同期135例體檢正常者作為健康對(duì)照組,其中男性79例(58.5%),女性56例(41.5%);平均年齡為(57.6±11.3)歲。兩組的年齡、性別比較差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05),具有可比性。所有研究對(duì)象均為出生并長(zhǎng)期生活在福建地區(qū)的漢族人。

        1.2 檢測(cè)方法

        1.2.1 基因組DNA抽提 知情同意后,取患者及健康對(duì)照外周靜脈血2 ml,EDTA抗凝。所有標(biāo)本置入-20℃保存?zhèn)溆没蛄⒓窗丛噭┖胁僮鞑襟E進(jìn)行DNA提取。全血基因組DNA抽提試劑盒由北京康為世紀(jì)生物科技有限公司提供。

        1.2.2 PCR引物及PCR反應(yīng) 應(yīng)用Primer 5.0軟件自行設(shè)計(jì)引物,上游引物:5′-AGGGTTCTATGCTAGGTGAACTG-3′;下游引物:5′-TATTGGCTAGACGCGCTCTG-3′(生工生物工程上海股份有限公司合成),該引物擴(kuò)增產(chǎn)物為919 bp,包含Pin1基因啟動(dòng)子區(qū)-842G/C(rs2233678)和-667T/C(rs2233679)區(qū)域。根據(jù)文獻(xiàn)[13]配制PCR反應(yīng)體系,在ABI 2720型PCR儀上95℃預(yù)變性5 min后,進(jìn)行95℃ 30 s→55℃ 30 s→72℃ 1 min,循環(huán)35次,72℃再延伸10 min。1.5%的瓊脂糖凝膠電泳觀察結(jié)果。

        1.2.3 PCR產(chǎn)物純化和回收 使用普通瓊脂糖凝膠DNA回收試劑盒(天根生化科技有限公司),按使用說(shuō)明操作,進(jìn)行PCR產(chǎn)物的純化和回收。

        1.2.4 測(cè)序 純化后的PCR產(chǎn)物用全自動(dòng)測(cè)序儀(ABI377型,Applied Biosystems公司)進(jìn)行測(cè)序。

        1.2.5 臨床病理資料收集 收集所有肺癌患者的病理組織類型及TNM分期等資料,并記錄所有研究對(duì)象的年齡、性別等一般資料。

        1.3 統(tǒng)計(jì)學(xué)處理

        采用SPSS 18.0統(tǒng)計(jì)軟件對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行分析和處理,計(jì)量資料以x±s表示,采用t檢驗(yàn),計(jì)數(shù)資料采用χ2檢驗(yàn),相關(guān)性強(qiáng)度采用Spearman相關(guān)分析,以P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

        2 結(jié)果

        2.1 Pin1基因rs2233678和rs2233679位點(diǎn)的各基因型

        對(duì)80例肺癌組和135例健康對(duì)照組的Pin1基因rs2233678和rs2233679位點(diǎn)進(jìn)行測(cè)序分析,rs2233678位點(diǎn)只檢測(cè)到GG和GC兩種基因型,未檢測(cè)到CC基因型;rs2233679位點(diǎn)TT、TC和TT三種基因型均可檢測(cè)到。rs2233678和rs2233679位點(diǎn)的各基因型見圖1。

        2.2 Pin1基因rs2233678和rs2233679基因型頻率、單體型頻率及其與肺癌易感性的關(guān)系

        肺癌組和健康對(duì)照組中Pin1基因rs2233678和rs2233679位點(diǎn)基因型頻率分布符合Hardy-Weinberg遺傳平衡定律;rs2233678和rs2233679等位基因、基因型和單體型頻率在肺癌組和健康對(duì)照組中比較差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)(表1)。

        2.3 Pin1基因rs2233678和rs2233679基因型與肺癌臨床病理學(xué)特征的關(guān)系

        Pin1基因rs2233678基因型頻率與病理類型、TNM分期無(wú)關(guān)(P>0.05);rs2233679基因型頻率與病理類型呈弱相關(guān)(r=0.285,P=0.010)(表2、表3)。

        3 討論

        Pin1基因定位于19p13,編碼含163個(gè)氨基酸殘基的核蛋白Pin1,相對(duì)分子量為18,包含兩個(gè)功能結(jié)構(gòu)域:N端的WW區(qū)和C端的肽基脯氨酰異構(gòu)酶活性區(qū)[3]。Pin1在許多腫瘤中高表達(dá)[14-15],不僅可以引起多條腫瘤信號(hào)通路關(guān)鍵蛋白的構(gòu)象變化[2],而且影響DNA的損傷修復(fù)[16],在腫瘤的發(fā)生、發(fā)展中起重要作用。

        本研究首次描述了福建漢族人群Pin1基因rs2233678和rs2233679位點(diǎn)的多態(tài)性分布規(guī)律,發(fā)現(xiàn)rs2233678和rs2233679位點(diǎn)的等位基因、基因型分布及其單體型均與肺癌風(fēng)險(xiǎn)無(wú)關(guān),rs2233679基因型分布與肺癌的病理類型僅呈弱相關(guān),與Naidu等[12]對(duì)乳腺癌的研究基本一致。與本研究結(jié)果不一致的是Lu等[11]發(fā)現(xiàn)rs2233678的C基因變異明顯降低患肺癌的風(fēng)險(xiǎn),進(jìn)一步的功能研究發(fā)現(xiàn)C基因變異可以降低轉(zhuǎn)錄活性;Zhu等[8]發(fā)現(xiàn)rs2233679的T基因型明顯降低亞洲人的患癌易感性。相關(guān)研究發(fā)現(xiàn)rs2233679多態(tài)性與患癌風(fēng)險(xiǎn)無(wú)關(guān)[7,11]。研究結(jié)果不一致,一方面可能是樣本量的大小不同所致,另一方面可能是不同地區(qū)的患者可能有不同的種族或遺傳背景所致[11,17]。這些差異可能會(huì)改變多態(tài)性位點(diǎn)的等位基因和基因型頻率在病例組和對(duì)照組中的分布,進(jìn)而影響多態(tài)性位點(diǎn)與患癌風(fēng)險(xiǎn)的統(tǒng)計(jì)效力,因此,有必要進(jìn)行多地區(qū)、多種族的大樣本量研究來(lái)進(jìn)一步證實(shí)Pin1基因多態(tài)性與肺癌易感性的關(guān)系。

        綜上所述,Pin1基因rs2233678和rs2233679位點(diǎn)多態(tài)性可能與福建漢族肺癌風(fēng)險(xiǎn)無(wú)關(guān),rs2233679的基因型分布與肺癌病理類型有一定的相關(guān)性,這為Pin1多態(tài)性與腫瘤易感性的研究豐富了數(shù)據(jù),也為無(wú)法手術(shù)的肺癌患者的病理類型推測(cè)提供了思路。當(dāng)然,由于本研究的樣本量有限,也沒(méi)有進(jìn)行rs2233678和rs2233679基因型與Pin1表達(dá)量及活性的研究,因此,有關(guān)Pin1基因多態(tài)性與肺癌易感性仍有待于進(jìn)一步深入研究。

        [參考文獻(xiàn)]

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        (收稿日期:2014-08-11 本文編輯:李亞聰)

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        (收稿日期:2014-08-11 本文編輯:李亞聰)

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