溫映紅+龐傳明+李小平
摘 要:該文在查閱大量文獻(xiàn)資料的基礎(chǔ)上,綜述了DNA分子標(biāo)記技術(shù)及其在果樹品種鑒定、種質(zhì)資源保存、果樹基因標(biāo)記、分子遺傳圖譜構(gòu)建、多樣性檢測(cè)等方面的應(yīng)用,并對(duì)其現(xiàn)階段存在問題和今后的發(fā)展前景進(jìn)行了分析討論。
關(guān)鍵詞:DNA分子標(biāo)記技術(shù);果樹;研究;應(yīng)用
中圖分類號(hào) S66 文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼 A 文章編號(hào) 1007-7731(2014)20-27-02
DNA Molecular Markers and its Application on the Research of Fruit Trees
Wen Yinghong et al.
(Pomology Institute,Shanxi Academy of Agricultural Sciences,Taigu 030815,China)
Abstract:In this paper,the application of DNA molecular markers in fruit trees was reviewed from following aspects: cultivars identification,germplasm resource research,genetic diversity detection,molecular genetic mapping construction,genetic marker were research,its problems and development in the future were also discussed.
Key words:DNA molecular markers;Fruit tree;Research;Application
作為一種重要的栽培作物,果樹在我國乃至全世界的農(nóng)業(yè)生產(chǎn)中都扮演著十分重要的角色。DNA分子標(biāo)記技術(shù)的發(fā)展,為果樹品種的鑒定、親緣關(guān)系的分析、種質(zhì)資源的保存、分子遺傳圖譜的構(gòu)建、控制重要農(nóng)藝性狀基因的標(biāo)記定位等方面的研究提供了理論依據(jù)和技術(shù)指導(dǎo)[1-2]。
1 DNA分子標(biāo)記技術(shù)概述
DNA分子標(biāo)記技術(shù)是隨著生物技術(shù)的發(fā)展而出現(xiàn)的一類重要的遺傳標(biāo)記技術(shù),它有著不受材料來源的影響和環(huán)境條件的限制、多態(tài)性高、遺傳穩(wěn)定好、標(biāo)記位點(diǎn)多、共顯性、選擇中性、重復(fù)性好、檢測(cè)迅速、操作簡(jiǎn)便等優(yōu)勢(shì),因而被視為理想的遺傳標(biāo)記技術(shù),迅速得到發(fā)展。
隨著分子生物學(xué)、遺傳學(xué)、生物化學(xué)等學(xué)科理論研究的不斷深入和實(shí)踐應(yīng)用的不斷成功,DNA分子標(biāo)記技術(shù)已被廣泛的應(yīng)用于遺傳育種、種質(zhì)資源鑒定、植物抗病基因定位、植物分類等諸多研究領(lǐng)域。DNA分子標(biāo)記技術(shù)主要分為3類:第一類以Southern雜交為基礎(chǔ),RFLP (Restriction Fragment Length Polymorphism)為代表;第二類以PCR技術(shù)為基礎(chǔ),RAPD(Randomly Amplified Polymorphic DNA)、STS(Sequence Tagged Site)、SCAR(Sequence Characterized Amplified Region)和AFLP(Amplified Fragment Length Polymorphism)為代表;第三類以重復(fù)序列為基礎(chǔ),SSR(Smiple Sequence Repeat)為代表。經(jīng)常應(yīng)用于果樹研究的DNA分子標(biāo)記有RFLP、RAPD、AFLP、SSR和SCAR等。
2 DNA分子標(biāo)記技術(shù)在果樹研究中應(yīng)用
2.1 品種鑒定 果樹栽培歷史悠久,新老品種繁多,繁殖方式多以無性繁殖為主,加上不同地域間頻繁的種質(zhì)交流,導(dǎo)致同名異種和同種異名的現(xiàn)象嚴(yán)重。因此,進(jìn)行準(zhǔn)確、可靠的品種鑒定,對(duì)于避免果樹品種混亂、保護(hù)果樹種質(zhì)資源以及育種工作者的知識(shí)產(chǎn)權(quán)等方面都具有著極為重要的作用[1]。DNA分子標(biāo)記技術(shù)直接從DNA分子水平上對(duì)果樹品種、品系進(jìn)行分類鑒定,準(zhǔn)確、高效、信息量大,近幾年來已得到了廣泛的應(yīng)用[3]。
前人在果樹品種鑒定方面取得了很好的成績(jī)。例如:Koller等應(yīng)用引物P2(5′ACGAGGGACT3′)成功區(qū)分了11個(gè)蘋果品種;Tancred等將澳大利亞選育的特早熟品種GB-63-43與其余3個(gè)相似品種區(qū)分開;祝軍等應(yīng)用RAPD技術(shù)區(qū)分了16個(gè)蘋果品種,應(yīng)用AFLP技術(shù)區(qū)分了25個(gè)蘋果品種[4];彭建營(yíng)等應(yīng)用RAPD技術(shù)對(duì)幾個(gè)棗品種的親緣演化關(guān)系進(jìn)行了研究,認(rèn)為山東龍棗與河北龍棗為同一品種[5];徐碧玉等應(yīng)用RAPD技術(shù)利用同一引物可以初步區(qū)分出10個(gè)芒果品種;于曉英等對(duì)35份香蕉種質(zhì)材料進(jìn)行了AFLP分子標(biāo)記,結(jié)果表明幾內(nèi)亞、蘋果以及陽江矮3份香蕉種質(zhì)材料實(shí)際為一個(gè)品種[6]。此外,龍眼、越桔、柿等樹種也已經(jīng)開展了這方面的研究工作。
2.2 果樹種質(zhì)資源的保存 種質(zhì)資源是人類寶貴的財(cái)富,果樹種質(zhì)資源是選育優(yōu)良果樹新品種和改良現(xiàn)有果樹品種的物質(zhì)基礎(chǔ)。DNA分子標(biāo)記技術(shù)可以避免果樹種質(zhì)資源保存中常常發(fā)生的混淆和重復(fù)問題,為果樹種質(zhì)資源的分類鑒定和保存提供了全新的技術(shù)方法[7]。用DNA分子標(biāo)記技術(shù)建立“核心種質(zhì)”的效果較好,只占全部種質(zhì)資源10%左右的“核心種質(zhì)”能夠最大限度地代表種質(zhì)資源的遺傳多樣性,因此建立“核心種質(zhì)”是提高果樹種質(zhì)資源管理質(zhì)量和效率的重要途徑[8-10]。
2.3 果樹基因標(biāo)記 果樹基因標(biāo)記的目標(biāo)基因主要是控制其重要農(nóng)藝性狀的遺傳基因,篩選與這些目標(biāo)基因連鎖的相關(guān)遺傳基因,是構(gòu)建果樹分子遺傳圖譜以及基因定位和克隆的基礎(chǔ),也是果樹分子輔助育種的前提。目前,已經(jīng)有大量的與果樹重要農(nóng)藝性狀相關(guān)的基因被標(biāo)記并且廣泛地應(yīng)用。遺傳圖譜的構(gòu)建為果樹基因標(biāo)記的研究奠定了一定的基礎(chǔ),大多數(shù)控制果樹重要農(nóng)藝性狀的基因都表現(xiàn)為數(shù)量遺傳的特點(diǎn),如產(chǎn)量高低、品質(zhì)優(yōu)劣和成熟期等等;也有許多農(nóng)藝性狀表現(xiàn)為質(zhì)量遺傳的特點(diǎn),如抗病性和抗蟲性等[1]。endprint
2.4 分子遺傳圖譜構(gòu)建 DNA分子標(biāo)記是構(gòu)建遺傳圖譜的主要標(biāo)記,前人已經(jīng)應(yīng)用分子標(biāo)記技術(shù)為蘋果、桃、葡萄、櫻桃、杏等樹種構(gòu)建了遺傳圖譜。近些年來,隨著DNA分子標(biāo)記技術(shù)的發(fā)展,果樹分子遺傳圖譜的研究進(jìn)展相對(duì)較快,果樹遺傳圖譜己經(jīng)達(dá)到了一定的密集度,構(gòu)建高密度的遺傳圖譜不僅在很大程度上提高了果樹育種工作的預(yù)見性,還可以為基因搜集的量化和種質(zhì)資源的保存提供較為科學(xué)的依據(jù)[5]。
2.5 遺傳多樣性檢測(cè) 遺傳多樣性是生命系統(tǒng)的基本特征,它能夠反映某物種適應(yīng)環(huán)境的能力以及該物種可能被改造和利用的潛力。DNA分子標(biāo)記技術(shù)是檢測(cè)果樹種質(zhì)資源遺傳多樣性的有效工具。例如,Warburton等對(duì)130多個(gè)桃品種的遺傳多樣性進(jìn)行RAPD分析,認(rèn)為亞洲供試品種的遺傳多樣性比較多樣,而美國的品種比較單一;Bower等應(yīng)用RFLP技術(shù)研究了33個(gè)釀酒葡萄品種的遺傳多樣性;張開春等在DNA分子水平上對(duì)我國蘋果屬無融合生殖種質(zhì)資源平邑甜茶的遺傳多樣性進(jìn)行了RAPD分析[7]。
3 問題與展望
雖然果樹的DNA分子標(biāo)記技術(shù)起步相對(duì)晚、基礎(chǔ)薄弱、發(fā)展緩慢,但也取得了不錯(cuò)的成績(jī)?,F(xiàn)階段,果樹DNA分子標(biāo)記技術(shù)發(fā)展中存在的主要問題是:對(duì)控制果樹重要農(nóng)藝性狀的基因研究較少,遺傳圖譜標(biāo)記間的距離較大,現(xiàn)有標(biāo)記不能很好地與生產(chǎn)實(shí)踐相結(jié)合等。因此,在今后的工作中應(yīng)更加注重與果樹農(nóng)藝性狀尤其是重要經(jīng)濟(jì)性狀相關(guān)的數(shù)量性狀分子標(biāo)記,多種標(biāo)記技術(shù)相結(jié)合加強(qiáng)QTL作圖,增加圖譜的飽和度,傳統(tǒng)育種方法與分子標(biāo)記相結(jié)合,降低育種成本、提高育種效率。隨著分子生物學(xué)技術(shù)的進(jìn)步和相關(guān)學(xué)科的發(fā)展,針對(duì)果樹特有性狀和綜合習(xí)性的分子標(biāo)記技術(shù)將會(huì)得到不斷地完善,而且還會(huì)有更多新的DNA分子標(biāo)記技術(shù)被創(chuàng)造。相信隨著DNA分子標(biāo)記技術(shù)的完善、發(fā)展和應(yīng)用,必將有力地推動(dòng)果樹產(chǎn)業(yè)的發(fā)展[11-12]。
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