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        非小細(xì)胞肺癌患者腫瘤和癌旁組織p14ARF的甲基化狀態(tài)檢測(cè)及臨床意義

        2014-09-17 06:08:48胡志亮田凱華
        關(guān)鍵詞:鱗癌甲基化腺癌

        胡志亮 沈 毅 田凱華△ 李 論 李 瑋

        (1青島大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬醫(yī)院,山東 青島 266003;2濟(jì)寧市第二人民醫(yī)院,山東 濟(jì)寧 272049)

        肺癌是人類最常見的呼吸系統(tǒng)惡性腫瘤,發(fā)病率日益提高, 80%左右的肺癌患者不能得到早期診斷而失去手術(shù)治療的時(shí)機(jī)[1]。因此,肺癌的早期診斷和治療是困擾醫(yī)療人員的主要問題。肺癌的產(chǎn)生涉及多種因素[2]。肺癌抑癌基因甲基化的異常升高在肺癌的發(fā)病過程中起了重要作用,啟動(dòng)子區(qū)異常甲基化作為p14ARF基因失活的重要形式可能參與了肺癌的發(fā)生[3]。我們檢測(cè)了非小細(xì)胞肺癌癌患者腫瘤和癌旁組織中p14ARF啟動(dòng)子區(qū)甲基化情況,并對(duì)它們的臨床病理意義進(jìn)行了分析。

        1 材料與方法

        1.1 材料

        107例肺癌組織及相應(yīng)癌旁正常組織取自青島大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬醫(yī)院胸外科新鮮手術(shù)標(biāo)本,均經(jīng)術(shù)后病理學(xué)確診。男性81例,女性26例;年齡35~77歲,中位年齡為58.2歲。其中鱗癌43例,腺癌56例,其他8例;根據(jù)1997年UICC修訂的肺癌分期標(biāo)準(zhǔn):Ⅰ期37例,Ⅱ期31例,Ⅲ期29例;余參見表1。取其癌旁(距腫瘤邊緣>10cm)正常組織107例。所有標(biāo)本均無壞死組織,術(shù)前未進(jìn)行化療、放療。

        表1 107例非小細(xì)胞肺癌患者p14ARF啟動(dòng)子的甲基化狀態(tài)分布(n,%)

        1.2 方法

        1.2.1DNA抽提 DNA抽提按照《分子克隆》常規(guī)進(jìn)行。

        1.2.2p14ARF甲基化檢測(cè) 巢氏甲基化特異性PCR(NMSP):1)基因組DNA的亞硫酸氫鹽修飾:目的使未甲基化的胞嘧啶經(jīng)脫氨基變?yōu)槟蜞奏ぁ?) PCR為基礎(chǔ)的甲基化分析:分別設(shè)計(jì)針對(duì)啟動(dòng)子區(qū)甲基化和非甲基化DNA的引物。

        1.3 結(jié)果判定

        檢測(cè)甲基化特異性引物擴(kuò)增產(chǎn)物存在為甲基化陽性;反之,不存在即為甲基化陰性,而且需非甲基化特異性引物擴(kuò)增產(chǎn)物同時(shí)存在才可判定甲基化陰性。

        1.4 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法

        用SPSS18.0統(tǒng)計(jì)軟件對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)Pearson χ2檢驗(yàn)和Spearman相關(guān)分析。

        2 結(jié) 果

        2.1 p14ARF啟動(dòng)子通過巢氏甲基化技術(shù)的表達(dá)結(jié)果

        p14ARF基因啟動(dòng)子的甲基化在原發(fā)性肺癌腫檢測(cè)瘤組織和癌旁組織分別是33.6%,12.1%。在腫瘤組織和癌旁組織中的p14ARF啟動(dòng)子的甲基化有顯著的差異(χ2= 12.811 ,P<0.001)。我們證明它們的Pearson相關(guān)性分析呈負(fù)相關(guān), 見表2。

        表2 兩組間甲基化分布及相關(guān)性比較(n,%)

        2.2 臨床特征和p14ARF啟動(dòng)子甲基化之間的關(guān)系

        p14ARF啟動(dòng)子甲基化陽性、陰性在性別、年齡、TNM分期和腫瘤大小方面無明顯差異。而在吸煙和不吸煙之間有顯著性差異。吸煙的明顯高于不吸煙的(χ2=4.378,P=0.023)。如表1。

        54例腺癌中25例p14ARF啟動(dòng)子發(fā)生甲基化,43例鱗癌中甲基化有9例,腺癌的p14ARF啟動(dòng)子甲基化明顯高于鱗癌的(t=5.059,P=0.019),如表3所示。

        表3 不同組織類型組間p14ARF啟動(dòng)子發(fā)生甲基化的比較(n)

        2.3 p14ARF啟動(dòng)子甲基化電泳結(jié)果

        107例患者中,腫瘤組織發(fā)現(xiàn)36條甲基化帶,而在癌旁組織中只有13條甲基化帶,顯示p14ARF啟動(dòng)子甲基化在腫瘤組織中的甲基化頻率顯著高于相應(yīng)癌旁組織。在所有分組中,第13例患者最具有代表性,如圖1。

        MA:DNA分子量標(biāo)記物 M:啟動(dòng)子p14ARF的甲基化 U:啟動(dòng)子p14ARF的非甲基化 TT:腫瘤組織;DC:癌旁組織

        圖1 第13例患者p14ARF啟動(dòng)子甲基化特異性PCR電泳結(jié)果

        該例肺癌病人中癌組織中存在明顯甲基化擴(kuò)增條帶(132bp),而在癌旁組織中沒有甲基化條帶出現(xiàn)。

        3 討論

        隨著對(duì)腫瘤發(fā)生發(fā)展機(jī)制的研究不斷深入,人們發(fā)現(xiàn)基因突變并非腫瘤發(fā)生的唯一原因。甲基和一些核苷酸序列或組蛋白結(jié)合會(huì)改變“核酸-蛋白復(fù)合物”的形態(tài),一些基因的表達(dá)發(fā)生改變。因此在未改變DNA的序列的情況下,這些變化仍然能夠影響細(xì)胞的功能,被稱為“表觀遺傳學(xué)”。表觀遺傳學(xué)在腫瘤發(fā)生中扮演重要角色,由此可以解釋當(dāng)人體遇到外界條件變化,諸如致癌物質(zhì)、環(huán)境變化、精神打擊等情況時(shí),機(jī)體DNA序列并未發(fā)生實(shí)質(zhì)的改變,但表觀遺傳卻會(huì)發(fā)生了變化,導(dǎo)致細(xì)胞癌變。DNA甲基化被認(rèn)為是表觀遺傳學(xué)的主要機(jī)制之一,對(duì)其研究最早也最為清晰的表觀遺傳修飾方式[4]。抑癌基因以及相關(guān)基因啟動(dòng)子區(qū)的甲基化會(huì)導(dǎo)致基因的失活,從而引發(fā)組織癌變和促進(jìn)腫瘤形成[5]。p14ARF啟動(dòng)子區(qū)的異常甲基化同樣被認(rèn)為在肺癌的發(fā)生發(fā)展過程發(fā)揮了重要作用。

        基因的突變、純合型缺失、雜合型缺失和啟動(dòng)子區(qū)異常甲基化等是p14ARF基因的主要失活機(jī)制。p14ARF啟動(dòng)子區(qū)甲基化在多種人類腫瘤中均有報(bào)道。Esteller等在一組結(jié)直腸癌的研究中發(fā)現(xiàn)p14ARF啟動(dòng)子區(qū)甲基化陽性率為31%[6]。Weihnauch等檢測(cè)了19例原發(fā)性肝血管肉瘤中啟動(dòng)子區(qū)甲基化狀態(tài),報(bào)告甲基化陽性率是26%,曾經(jīng)指出CpG啟動(dòng)子區(qū)發(fā)生甲基化是p14ARF基因失活的重要方式[7]。近來,Kim等針對(duì)p14ARF啟動(dòng)子區(qū)甲基化情況是否吸煙的因素有關(guān)系做了檢測(cè),其結(jié)果甲基化陽性率為9%[8]。

        資料顯示I期肺癌患者的5年生存率約為60%,Ⅱ-Ⅳ期臨床肺癌的5年生存率從40%到5%之間[9]。這主要?dú)w咎于缺乏可靠有效的早期發(fā)現(xiàn)和診斷的手段。p14ARF基因啟動(dòng)子區(qū)的異常甲基化在肺癌發(fā)生發(fā)展過程中扮演了重要角色,是一個(gè)早期事件,同時(shí)被認(rèn)為是可以用MSP技術(shù)檢測(cè)到的潛在的早期診斷標(biāo)志物[10],可以作為癌癥早期診斷的一種輔助方法,并對(duì)其預(yù)后具有一定預(yù)測(cè)價(jià)值[11]。通過Spearman相關(guān)分析,p14ARF啟動(dòng)子的甲基化情況在腫瘤組織中和相應(yīng)癌旁組織中相關(guān)性極差。如果我們還可以進(jìn)一步檢測(cè)在血液中p14ARF啟動(dòng)子的甲基化狀況與腫瘤的關(guān)系,這將對(duì)我們?cè)缙谠\斷肺癌提供一個(gè)血液學(xué)標(biāo)準(zhǔn)。

        由于在標(biāo)本中DNA比較稀少,我們進(jìn)行了更敏感的改良巢甲基化特異性RCR檢測(cè)方法,為肺癌的早期診斷提供依據(jù)。我們的研究與以往報(bào)告的結(jié)果幾乎一致。我們發(fā)現(xiàn)p14ARF啟動(dòng)子的甲基化在吸煙和不吸煙患者之間有顯著差異(χ2=4.378,P=0.023)。目前的研究結(jié)果已經(jīng)證明,吸煙是肺癌的主要促發(fā)因素,如表1所示,在單因素分析中,我們也證明吸煙是一個(gè)重要的危險(xiǎn)因素。

        我們的研究同樣顯示腺癌中的p14ARF啟動(dòng)子甲基化明顯高于鱗癌。腺癌比鱗癌在應(yīng)用靶向藥物治療方面更有價(jià)值、更加敏感及突出優(yōu)勢(shì),臨床研究也顯示化療的敏感性鱗癌明顯優(yōu)于腺癌。表觀遺傳學(xué)改變可以干擾化療敏感性,p14ARF啟動(dòng)子的甲基化可能使肺癌腺癌的化療的敏感性下調(diào)。這提示改變p14ARF啟動(dòng)子甲基化狀態(tài)可以提高化療的敏感性。

        在本文中,TNM分期是最危險(xiǎn)的因素,p14ARF啟動(dòng)子甲基化危險(xiǎn)性排名僅次于吸煙,位于第三。在先前的研究中,還沒有直接的證據(jù)可以證明p14ARF啟動(dòng)子甲基化作為診斷依據(jù),但目前的研究結(jié)果為今后的臨床和基礎(chǔ)研究提供了一種特殊的方法。并且我們今后的研究中正在考慮通過p14ARF啟動(dòng)子去甲基化來提高化療及放療的敏感性,去治療非小細(xì)胞肺癌病人。

        在本文中存在以下幾個(gè)限制:首先,p14ARF啟動(dòng)子甲基化需要獲得組織標(biāo)本,然而對(duì)早期患者則非常困難;其次,作為前瞻性研究,對(duì)臨床特征評(píng)價(jià)不夠精確地;再次,收集的病例數(shù)偏少,分離組織中的DNA也是不完美,特別是存放已久的組織標(biāo)本。因此,我們的數(shù)據(jù)的確認(rèn)需要進(jìn)一步驗(yàn)證,通過的多中心、大樣本的測(cè)試方法。

        通過檢測(cè)p14ARF基因啟動(dòng)子甲基化在非小細(xì)胞肺癌腫瘤及癌旁組織中的表達(dá)情況,研究p14ARF啟動(dòng)子區(qū)甲基化在肺癌發(fā)生發(fā)展中的機(jī)制,我們認(rèn)為檢測(cè)p14ARF基因甲基化狀態(tài)可作為肺癌早期診斷或判斷預(yù)后的一個(gè)有價(jià)值的生物學(xué)標(biāo)志。在將來的研究中,我們有可能尋找合適的去甲基化試劑,恢復(fù)抑癌基因的活性,為抗腫瘤治療及基因干擾治療提供一種思路和理論基礎(chǔ)。

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