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        皖北地區(qū)Leber遺傳性視神經(jīng)病一家系線粒體突變位點

        2014-09-12 10:03:06鮑明升王愛蓮吳守偉
        中國老年學雜志 2014年11期
        關鍵詞:家系線粒體變異

        劉 輝 王 力 鮑明升 王愛蓮 吳守偉 趙 莉

        (蚌埠醫(yī)學院生物科學系,安徽 蚌埠 233030)

        Leber遺傳性視神經(jīng)病變(LHON)目前認為是受母親遺傳的一種視神經(jīng)病,發(fā)病多為年輕男性,其臨床癥狀主要表現(xiàn)為急性或亞急性雙眼中心視力下降,通常不伴有眼球疼痛;視野以中心或偏中心暗點居多,通常暗點較大并可向周邊擴展,更易向上方延伸或連接包繞生理盲點;視力大多穩(wěn)定在0.1以下,雖有全盲者但罕見〔1~4〕。本研究探索皖北地區(qū)該病是否有突變位點。

        1 病例與方法

        1.1病例來源 該病家系來源于皖泗縣地區(qū),經(jīng)蚌埠醫(yī)學院附屬醫(yī)院診斷為LHON,患者為15歲女性,其母親為攜帶者,表型正常。舅舅45歲,亦為患者。

        1.2基因組DNA提取 在患者及其家屬簽署知情同意書后,對患者抽取靜脈血2~3 ml,并對其家系進行走訪,并抽取其母親和舅舅外周血進行研究。使用全血基因組抽提試劑盒(天根生化科技,北京)提取外周血基因組DNA。為避免外源DNA污染,總DNA提取采用無菌濾紙代替血液樣品作陰性對照,提取方法與其他樣品完全一樣。

        1.3引物設計 根據(jù)人類線粒體全序列(GenBank登錄號:JQ031816)分別設計ND1基因、ND4基因和ND6基因引物。

        設計引物對FP(L3202)和RP(L4424),擴增產(chǎn)物長度為1 242 bp,涵蓋全部ND1基因956 bp;由于ND4基因較長,設計兩個引物對FP(L10664)和RP(L11489)、FP(L11416)和RP(L12225),擴增產(chǎn)物長度分別為849 bp和834 bp,拼接后可包含全部ND4基因1 378 bp;設計引物對FP(L14041)和RP(L14837) 擴增產(chǎn)物長度為816 bp,涵蓋全部ND6基因525 bp。見表1。

        表1 引物名稱及序列

        1.4ND1,ND4和ND6基因擴增及測序 PCR擴增使用Long Taq DNA聚合酶試劑盒(天根生化科技,北京),擴增線粒體ND1基因、ND4基因和ND6基因;PCR體系為25 μl,含0.5 μg 模板DNA,上、下游引物各0.5 μl(濃度為10 μmol/L),Long Taq DNA 聚合酶(2.5 U/μl)0.5 μl,10×Long Taq Buffer 12.5 μl,dNTP Mixture(2.5 mmol/L)2 μl,最后用ddH2O補充體積至25 μl。每個反應包含30循環(huán),循環(huán)參數(shù)為:94℃變性40 s,55℃退火45 s,72℃延伸50 s,首次循環(huán)前95℃預變性5 min,最后一個循環(huán)后72℃再延伸10 min。PCR反應在PTC-200 Thermo Cycler (MJ Research公司)上進行。PCR擴增采用無菌濾紙的提取結果替代模板作陰性對照。擴增結果在1%瓊脂糖凝膠中電泳檢測,并用紫外凝膠成像系統(tǒng)(BioRad公司)拍照分析。擴增得到的ND1基因、ND4基因和ND6基因產(chǎn)物直接送上海Invitrogen公司測序。

        1.5BLAST及數(shù)據(jù)分析 測序結果在NCBI網(wǎng)站進行BLAST比對,以確定所測得序列的正確性。然后用CLUSTAL X軟件與正常人對應位點的DNA片段進行比對,以尋找是否有新的突變位點,并用MEGA 2.0軟件對所測DNA序列進行蛋白質的氨基酸序列進行預測,并探索突變位點是否會引起氨基酸殘基的改變。

        2 結 果

        2.1突變位點分析 發(fā)現(xiàn)2個新的突變位點,且具有家系遺傳特點:第一個突變位點,位于ND4基因內(nèi)線粒體全序列第11 196位,由T突變?yōu)镃(圖1,圖2);第二個突變位點,位于ND4基因內(nèi)線粒體全序列第11 770位,由G突變?yōu)锳(圖3,圖4)。

        2.2突變位點對應預測氨基酸的分析 所測線粒體DNA序列用MEGA2.0軟件預測氨基酸序列,密碼子表選用verteabrate mitochondria,來判斷所測線粒體DNA序列中所發(fā)生的變異位點是否會造成氨基酸序列的改變,從而探討與LHON的關系。發(fā)現(xiàn)ND1,ND4和ND6基因中,兩個變異位點所對應的氨基酸位點均發(fā)生了改變。在ND4基因中,對應的氨基酸由苯丙氨酸(F)變?yōu)榱涟彼?L);精氨酸(R)變?yōu)榻M氨酸(H)(圖5)這兩個變異的位點在這個家族的三個成員中均出現(xiàn),但是否由于這兩個變異位點引起的疾病尚不能下結論,還需深入研究。

        方框內(nèi)示突變位點;ND4、DN4 NPH2和DN4 NP183:正常人線粒體序列,1-ND4和3-ND4為該家系中患者線粒體序列,2-DN4,為該家系中攜帶者線粒體序列;*正常位點

        圖2 該家系線粒體ND4基因中第一個突變位點處測序圖譜(無亂峰,信號可信)

        方框內(nèi)示突變位點;ND42、DN42 NP183和DN42 NPH2:正常人線粒體序列,1-ND42和3-ND42為該家系中患者線粒體序列,2-DN42,為該家系中攜帶者線粒體序列;*正常位點

        圖4 該家系線粒體ND4基因中第2個突變位點處測序圖譜(無亂峰,信號可信)

        圖5 突變位點對應氨基酸變化

        3 討 論

        LHON是一種比較少見的遺傳性視神經(jīng)病,有明顯家族史,但遺傳方式頗為特殊,與孟德爾定律不符,多數(shù)患者為男性,僅通過女性傳遞。在20世紀80年代以前,對于該疾病的發(fā)病原因有多種解釋,直到近年來,各國學者才普遍認為是由于線粒體的某些基因的位點突變引起的。目前的研究發(fā)現(xiàn)該病的主要突變位點發(fā)生在編碼線粒體呼吸鏈上的NADH脫氫酶(或復合物Ⅰ)的亞基中〔5,6〕,從而導致呼吸鏈上的復合物發(fā)生改變而引起LHON的發(fā)生。目前已知有3個不同的mtDNA原發(fā)性突變,分別發(fā)生在線粒體核苷酸序列的3460A/ND1,11778A/ND4和14484C/ND63個位點,這3個原發(fā)性突變位點被認為是引起LHON的較強的風險因素〔2,7〕,但是,越來越多的研究發(fā)現(xiàn)一些新的線粒體序列點突變對于該病的發(fā)生也起到一定至關重要的作用〔8~11〕。

        自Wallace等〔5〕首先發(fā)現(xiàn)LHON可因線粒體DNA核苷酸位點突變引起以來,越來越多的研究人員發(fā)現(xiàn)各種不同的mtDNA點突變與本病有密切關系。ND基因在線粒體的研究中越來越受到重視,本研究發(fā)現(xiàn),皖北地區(qū)該家系的患者在常見的3個突變位點3460A/ND1、11778A/ND4和14484C/ND6并未發(fā)生點突變,而是有兩個新的突變位點:第一個突變位點,位于ND4基因內(nèi)線粒體全序列第11 196位,為T11196C;第二個突變位點位于ND4基因內(nèi)線粒體全序列第11 770位,為G11770A。變異位點對應的氨基酸殘基也隨之發(fā)生改變,說明該位點的變異是有意義的,可能是與該疾病的發(fā)生有關。目前為止,國內(nèi)相關研究報道有涉及T14484C 和T14502C〔12〕,G3460A〔13〕,還有ND基因以外其他基因的突變,例如tRNAThr A15951G〔10〕。

        本研究發(fā)現(xiàn)的新的變異位點只能推測與該疾病的發(fā)生有一定的關系,如果要證明某個變異位點與該疾病的發(fā)生有因果關系,還需要更多的病例和深入的研究。對于新的變異位點是否是突變,還要排除基因多態(tài)性方面的可能,目前還沒有可靠的標準,只能參照已知的多態(tài)性位點。通過我們的研究,認為在臨床上檢測,可以通過位點特異性PCR對常見的3個突變位點3460A/ND1、11778A/ND4和14484C/ND6以及T11196C和G11770A進行篩查。

        4 參考文獻

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