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        鵝副黏病毒F基因的克隆和序列分析

        2014-09-02 05:05:31吳民
        江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué) 2014年7期
        關(guān)鍵詞:序列分析克隆

        摘要:為了深入研究鵝副黏病毒(goose paramyxovirus,GPMV)F基因的功能,利用PCR方法克隆了鵝副黏病毒HN株的F基因,將其與pMD18-T載體連接后轉(zhuǎn)化到感受態(tài)大腸桿菌DH5α中,經(jīng)PCR鑒定后,對(duì)插入片段進(jìn)行序列測(cè)定及分析。結(jié)果表明:鵝副黏病毒HN株的F基因全長(zhǎng)均為1 662 bp,編碼553個(gè)氨基酸,其裂解位點(diǎn)的氨基酸序列為112-Arg-Arg-Gln-Lys-Arg-Phe-117,與已公布的強(qiáng)毒株裂解位點(diǎn)的氨基酸序列相符。

        關(guān)鍵詞:鵝副黏病毒;F基因;克??;序列分析

        中圖分類號(hào): Q785;S858.335.3 文獻(xiàn)標(biāo)志碼: A 文章編號(hào):1002-1302(2014)07-0035-02

        收稿日期:2013-09-27

        作者簡(jiǎn)介:吳民(1964—),男,海南??谌耍F醫(yī)師,主要從事畜牧獸醫(yī)學(xué)方面研究。E-mail:WM8398@163.com。鵝副黏病毒(goose paramyxovirus,GPMV)是影響?zhàn)B禽業(yè)發(fā)展的主要病原之一,它可引起鵝腸道糠麩樣潰瘍、胰腺腫脹且表面有灰白色壞死灶、脾臟腫大并有大小不等的灰白色壞死灶。近年來(lái),該病在我國(guó)呈上升趨勢(shì),且感染宿主范圍不斷擴(kuò)大,已有鵝、丹頂鶴、鴿等感染該病毒的報(bào)道[1-3]。本研究對(duì)以前分離的GPMV的F基因進(jìn)行克隆,并與國(guó)內(nèi)外分離株進(jìn)行序列比對(duì)和分析,以期為進(jìn)一步研究該病毒的F基因功能和GPMV分子診斷以及基因工程疫苗奠定基礎(chǔ)。

        1材料與方法

        1.1試驗(yàn)材料

        從疑似感染GPMV的病死鵝中分離到鵝副黏病毒HN株,經(jīng)過(guò)凍干后,于海南省動(dòng)物疫病預(yù)防控制中心獸醫(yī)診斷檢驗(yàn)科-70 ℃凍存。

        1.2病毒增殖

        將病毒適當(dāng)稀釋后,經(jīng)尿囊腔接種9~11 d非免疫雞胚,0.2 mL/枚,于37 ℃恒溫箱孵育48 h,棄去24 h內(nèi)死亡胚,無(wú)菌收獲尿囊液,于-70 ℃保存?zhèn)溆谩?/p>

        1.3引物設(shè)計(jì)與合成

        根據(jù)GenBank中的GPMV全基因組核苷酸序列,經(jīng) Lasergene 7.10軟件比對(duì)和Primer 5.0軟件分析后,設(shè)計(jì)1對(duì)引物擴(kuò)增F基因,上游P1:5′-TAGTTCGCCTGTCTATCAAA-3′,下游P2:5′-GTGATGCGGTAGAACGGAT3-3′;由上海英濰捷基生物技術(shù)有限公司合成。

        1.4RT-PCR反應(yīng)

        將含有GPMV的尿囊液按照Invitrogen公司提供的RNA抽提操作說(shuō)明書(shū)進(jìn)行RNA模板的提取。反轉(zhuǎn)錄按照寶生物工程(大連)有限公司提供的Reverse Transcriptase XL(AMV)反轉(zhuǎn)錄酶使用說(shuō)明書(shū)進(jìn)行。PCR反應(yīng)體系為:2 μL模板,各50 pmol上、下游引物,各200 μmol/L 4種dNTP,0.5 μL Ex Taq DNA聚合酶,加水至50 μL。PCR反應(yīng)條件為:97 ℃ 0.5 min,53 ℃ 1 min,72 ℃ 2 min,30個(gè)循環(huán);72 ℃延伸 7 min。PCR產(chǎn)物經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳進(jìn)行鑒定。

        1.5F基因的克隆及鑒定

        將新擴(kuò)增PCR產(chǎn)物按一定比例與pMD18-T載體連接,連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化入DH5α感受態(tài)細(xì)胞,陽(yáng)性菌液經(jīng)PCR鑒定后擴(kuò)大培養(yǎng)并抽提質(zhì)粒,重組質(zhì)粒置于-40 ℃冰箱保存?zhèn)溆谩?/p>

        1.6序列分析

        將鑒定的陽(yáng)性重組質(zhì)粒,送上海英濰捷基生物技術(shù)有限公司進(jìn)行測(cè)序。用Lasergene 7.10軟件將所測(cè)序列和與國(guó)內(nèi)外病毒分離株的F基因序列進(jìn)行相似性比對(duì)。

        2結(jié)果與分析

        2.1PCR擴(kuò)增產(chǎn)物

        利用設(shè)計(jì)的P1/P2引物對(duì)GPMV HN株的F基因進(jìn)行RT-PCR擴(kuò)增,結(jié)果獲得大小約為2.1 kb的特異性條帶,與預(yù)計(jì)產(chǎn)物大小相符(圖1)。

        2.2重組質(zhì)粒的鑒定

        菌液PCR產(chǎn)物經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳鑒定,獲得大小約為2.1 kb的片段。

        2.3序列分析

        由序列測(cè)定結(jié)果可知,GPMV HN株的F基因全長(zhǎng)為 1 662 bp,編碼553個(gè)氨基酸。將GPMV HN株的F基因與國(guó)內(nèi)外分離株的F基因序列進(jìn)行比對(duì),結(jié)果表明:GPMV HN株和國(guó)內(nèi)已分離的GPMV的F蛋白核苷酸序列相似性在963%~97.3%之間,與傳統(tǒng)疫苗株LaSota的核苷酸序列相似性為82.7%,與國(guó)外分離株的F蛋白核苷酸序列相似性在34.8%~38.7%之間(表1);從F基因進(jìn)化樹(shù)來(lái)看,GPMV HN株與國(guó)內(nèi)分離株處于同一分支,而與國(guó)外分離株處于不同分支(圖2)。

        3結(jié)論與討論

        GPMV HN株的分離鑒定再次證明水禽不再僅是禽Ⅰ型副黏病毒的宿主,而且已成為禽Ⅰ型副黏病毒自然感染發(fā)病、死亡的易感禽類。這可能與禽Ⅰ型副黏病毒發(fā)生變異、逐漸適應(yīng)鵝體有關(guān)[4]。宿主范圍的不斷擴(kuò)大,給禽Ⅰ型副黏病毒的綜合防控提出了新的挑戰(zhàn)。

        國(guó)內(nèi)外研究表明,禽Ⅰ型副黏病毒F蛋白的變異主要發(fā)生于F蛋白N末端信號(hào)肽區(qū)(1~32aa)和裂解位點(diǎn)區(qū)(112~117aa),其他部位的氨基酸較保守,且裂解位點(diǎn)區(qū)氨基酸的組成是構(gòu)成副黏病毒毒力的分子基礎(chǔ)[5]。GPMV HN株的裂解位點(diǎn)區(qū)的氨基酸序列為112-Arg-Arg-Gln-Lys-Arg-Phe-117,與國(guó)外發(fā)表的強(qiáng)毒株序列112-Arg/Lys-Arg-Gln-Lys/Arg-Arg-Phe-117相符,表明所分離的GPMV HN株為強(qiáng)毒株?;蛐蛄蟹治霭l(fā)現(xiàn)該分離株的F基因與GenBank登錄號(hào)為AF162714株系的F基因核苷酸相似性為97.1%,氨基酸相似性為97.7%,二者的相似性較高。進(jìn)化樹(shù)分析表明兩者處于同一分支,具有較近的親緣關(guān)系,且同屬于強(qiáng)毒株。GPMV HN株與傳統(tǒng)疫苗株LaSota的核苷酸相似性為82.7%,氨基酸相似性為87.4%,二者的相似性較低,進(jìn)化樹(shù)上雖屬于同一大分支,但親緣關(guān)系相對(duì)較遠(yuǎn),說(shuō)明HN株與傳統(tǒng)的疫苗株LaSota相比已發(fā)生一定的變異,這可能是造成水禽長(zhǎng)期使用傳統(tǒng)的新城疫病毒疫苗后仍暴發(fā)副黏病毒病的重要原因之一。

        參考文獻(xiàn):

        [1]秦衛(wèi)紅. 種鵝感染新城疫病毒的診斷[J]. 中國(guó)家禽,2012,34(23):55.

        [2]李靜姬,李福軍,梁玉嬉. 丹頂鶴非典型新城疫與大腸桿菌混合感染的診治[J]. 中國(guó)畜牧獸醫(yī),2013,40(2):211-213.

        [3]趙揚(yáng),郭明萍,鄒年莉,等. 兩株鴿源新城疫病毒的分離鑒定及F基因序列分析[J]. 中國(guó)家禽,2012,34(23):10-13.

        [4]張偉,刁有祥,徐福亮,等. 鵝副黏病毒LS-1株的分離鑒定及F基因分析[J]. 西南大學(xué)學(xué)報(bào):自然科學(xué)版,2011,33(4):31-35.

        [5]董國(guó)英,丁 壯. 鵝副黏病毒F基因的克隆及遺傳變異分析[J]. 中國(guó)獸醫(yī)學(xué)報(bào),2007,27(2):176-179.

        摘要:為了深入研究鵝副黏病毒(goose paramyxovirus,GPMV)F基因的功能,利用PCR方法克隆了鵝副黏病毒HN株的F基因,將其與pMD18-T載體連接后轉(zhuǎn)化到感受態(tài)大腸桿菌DH5α中,經(jīng)PCR鑒定后,對(duì)插入片段進(jìn)行序列測(cè)定及分析。結(jié)果表明:鵝副黏病毒HN株的F基因全長(zhǎng)均為1 662 bp,編碼553個(gè)氨基酸,其裂解位點(diǎn)的氨基酸序列為112-Arg-Arg-Gln-Lys-Arg-Phe-117,與已公布的強(qiáng)毒株裂解位點(diǎn)的氨基酸序列相符。

        關(guān)鍵詞:鵝副黏病毒;F基因;克?。恍蛄蟹治?/p>

        中圖分類號(hào): Q785;S858.335.3 文獻(xiàn)標(biāo)志碼: A 文章編號(hào):1002-1302(2014)07-0035-02

        收稿日期:2013-09-27

        作者簡(jiǎn)介:吳民(1964—),男,海南??谌?,獸醫(yī)師,主要從事畜牧獸醫(yī)學(xué)方面研究。E-mail:WM8398@163.com。鵝副黏病毒(goose paramyxovirus,GPMV)是影響?zhàn)B禽業(yè)發(fā)展的主要病原之一,它可引起鵝腸道糠麩樣潰瘍、胰腺腫脹且表面有灰白色壞死灶、脾臟腫大并有大小不等的灰白色壞死灶。近年來(lái),該病在我國(guó)呈上升趨勢(shì),且感染宿主范圍不斷擴(kuò)大,已有鵝、丹頂鶴、鴿等感染該病毒的報(bào)道[1-3]。本研究對(duì)以前分離的GPMV的F基因進(jìn)行克隆,并與國(guó)內(nèi)外分離株進(jìn)行序列比對(duì)和分析,以期為進(jìn)一步研究該病毒的F基因功能和GPMV分子診斷以及基因工程疫苗奠定基礎(chǔ)。

        1材料與方法

        1.1試驗(yàn)材料

        從疑似感染GPMV的病死鵝中分離到鵝副黏病毒HN株,經(jīng)過(guò)凍干后,于海南省動(dòng)物疫病預(yù)防控制中心獸醫(yī)診斷檢驗(yàn)科-70 ℃凍存。

        1.2病毒增殖

        將病毒適當(dāng)稀釋后,經(jīng)尿囊腔接種9~11 d非免疫雞胚,0.2 mL/枚,于37 ℃恒溫箱孵育48 h,棄去24 h內(nèi)死亡胚,無(wú)菌收獲尿囊液,于-70 ℃保存?zhèn)溆谩?/p>

        1.3引物設(shè)計(jì)與合成

        根據(jù)GenBank中的GPMV全基因組核苷酸序列,經(jīng) Lasergene 7.10軟件比對(duì)和Primer 5.0軟件分析后,設(shè)計(jì)1對(duì)引物擴(kuò)增F基因,上游P1:5′-TAGTTCGCCTGTCTATCAAA-3′,下游P2:5′-GTGATGCGGTAGAACGGAT3-3′;由上海英濰捷基生物技術(shù)有限公司合成。

        1.4RT-PCR反應(yīng)

        將含有GPMV的尿囊液按照Invitrogen公司提供的RNA抽提操作說(shuō)明書(shū)進(jìn)行RNA模板的提取。反轉(zhuǎn)錄按照寶生物工程(大連)有限公司提供的Reverse Transcriptase XL(AMV)反轉(zhuǎn)錄酶使用說(shuō)明書(shū)進(jìn)行。PCR反應(yīng)體系為:2 μL模板,各50 pmol上、下游引物,各200 μmol/L 4種dNTP,0.5 μL Ex Taq DNA聚合酶,加水至50 μL。PCR反應(yīng)條件為:97 ℃ 0.5 min,53 ℃ 1 min,72 ℃ 2 min,30個(gè)循環(huán);72 ℃延伸 7 min。PCR產(chǎn)物經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳進(jìn)行鑒定。

        1.5F基因的克隆及鑒定

        將新擴(kuò)增PCR產(chǎn)物按一定比例與pMD18-T載體連接,連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化入DH5α感受態(tài)細(xì)胞,陽(yáng)性菌液經(jīng)PCR鑒定后擴(kuò)大培養(yǎng)并抽提質(zhì)粒,重組質(zhì)粒置于-40 ℃冰箱保存?zhèn)溆谩?/p>

        1.6序列分析

        將鑒定的陽(yáng)性重組質(zhì)粒,送上海英濰捷基生物技術(shù)有限公司進(jìn)行測(cè)序。用Lasergene 7.10軟件將所測(cè)序列和與國(guó)內(nèi)外病毒分離株的F基因序列進(jìn)行相似性比對(duì)。

        2結(jié)果與分析

        2.1PCR擴(kuò)增產(chǎn)物

        利用設(shè)計(jì)的P1/P2引物對(duì)GPMV HN株的F基因進(jìn)行RT-PCR擴(kuò)增,結(jié)果獲得大小約為2.1 kb的特異性條帶,與預(yù)計(jì)產(chǎn)物大小相符(圖1)。

        2.2重組質(zhì)粒的鑒定

        菌液PCR產(chǎn)物經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳鑒定,獲得大小約為2.1 kb的片段。

        2.3序列分析

        由序列測(cè)定結(jié)果可知,GPMV HN株的F基因全長(zhǎng)為 1 662 bp,編碼553個(gè)氨基酸。將GPMV HN株的F基因與國(guó)內(nèi)外分離株的F基因序列進(jìn)行比對(duì),結(jié)果表明:GPMV HN株和國(guó)內(nèi)已分離的GPMV的F蛋白核苷酸序列相似性在963%~97.3%之間,與傳統(tǒng)疫苗株LaSota的核苷酸序列相似性為82.7%,與國(guó)外分離株的F蛋白核苷酸序列相似性在34.8%~38.7%之間(表1);從F基因進(jìn)化樹(shù)來(lái)看,GPMV HN株與國(guó)內(nèi)分離株處于同一分支,而與國(guó)外分離株處于不同分支(圖2)。

        3結(jié)論與討論

        GPMV HN株的分離鑒定再次證明水禽不再僅是禽Ⅰ型副黏病毒的宿主,而且已成為禽Ⅰ型副黏病毒自然感染發(fā)病、死亡的易感禽類。這可能與禽Ⅰ型副黏病毒發(fā)生變異、逐漸適應(yīng)鵝體有關(guān)[4]。宿主范圍的不斷擴(kuò)大,給禽Ⅰ型副黏病毒的綜合防控提出了新的挑戰(zhàn)。

        國(guó)內(nèi)外研究表明,禽Ⅰ型副黏病毒F蛋白的變異主要發(fā)生于F蛋白N末端信號(hào)肽區(qū)(1~32aa)和裂解位點(diǎn)區(qū)(112~117aa),其他部位的氨基酸較保守,且裂解位點(diǎn)區(qū)氨基酸的組成是構(gòu)成副黏病毒毒力的分子基礎(chǔ)[5]。GPMV HN株的裂解位點(diǎn)區(qū)的氨基酸序列為112-Arg-Arg-Gln-Lys-Arg-Phe-117,與國(guó)外發(fā)表的強(qiáng)毒株序列112-Arg/Lys-Arg-Gln-Lys/Arg-Arg-Phe-117相符,表明所分離的GPMV HN株為強(qiáng)毒株。基因序列分析發(fā)現(xiàn)該分離株的F基因與GenBank登錄號(hào)為AF162714株系的F基因核苷酸相似性為97.1%,氨基酸相似性為97.7%,二者的相似性較高。進(jìn)化樹(shù)分析表明兩者處于同一分支,具有較近的親緣關(guān)系,且同屬于強(qiáng)毒株。GPMV HN株與傳統(tǒng)疫苗株LaSota的核苷酸相似性為82.7%,氨基酸相似性為87.4%,二者的相似性較低,進(jìn)化樹(shù)上雖屬于同一大分支,但親緣關(guān)系相對(duì)較遠(yuǎn),說(shuō)明HN株與傳統(tǒng)的疫苗株LaSota相比已發(fā)生一定的變異,這可能是造成水禽長(zhǎng)期使用傳統(tǒng)的新城疫病毒疫苗后仍暴發(fā)副黏病毒病的重要原因之一。

        參考文獻(xiàn):

        [1]秦衛(wèi)紅. 種鵝感染新城疫病毒的診斷[J]. 中國(guó)家禽,2012,34(23):55.

        [2]李靜姬,李福軍,梁玉嬉. 丹頂鶴非典型新城疫與大腸桿菌混合感染的診治[J]. 中國(guó)畜牧獸醫(yī),2013,40(2):211-213.

        [3]趙揚(yáng),郭明萍,鄒年莉,等. 兩株鴿源新城疫病毒的分離鑒定及F基因序列分析[J]. 中國(guó)家禽,2012,34(23):10-13.

        [4]張偉,刁有祥,徐福亮,等. 鵝副黏病毒LS-1株的分離鑒定及F基因分析[J]. 西南大學(xué)學(xué)報(bào):自然科學(xué)版,2011,33(4):31-35.

        [5]董國(guó)英,丁 壯. 鵝副黏病毒F基因的克隆及遺傳變異分析[J]. 中國(guó)獸醫(yī)學(xué)報(bào),2007,27(2):176-179.

        摘要:為了深入研究鵝副黏病毒(goose paramyxovirus,GPMV)F基因的功能,利用PCR方法克隆了鵝副黏病毒HN株的F基因,將其與pMD18-T載體連接后轉(zhuǎn)化到感受態(tài)大腸桿菌DH5α中,經(jīng)PCR鑒定后,對(duì)插入片段進(jìn)行序列測(cè)定及分析。結(jié)果表明:鵝副黏病毒HN株的F基因全長(zhǎng)均為1 662 bp,編碼553個(gè)氨基酸,其裂解位點(diǎn)的氨基酸序列為112-Arg-Arg-Gln-Lys-Arg-Phe-117,與已公布的強(qiáng)毒株裂解位點(diǎn)的氨基酸序列相符。

        關(guān)鍵詞:鵝副黏病毒;F基因;克隆;序列分析

        中圖分類號(hào): Q785;S858.335.3 文獻(xiàn)標(biāo)志碼: A 文章編號(hào):1002-1302(2014)07-0035-02

        收稿日期:2013-09-27

        作者簡(jiǎn)介:吳民(1964—),男,海南??谌?,獸醫(yī)師,主要從事畜牧獸醫(yī)學(xué)方面研究。E-mail:WM8398@163.com。鵝副黏病毒(goose paramyxovirus,GPMV)是影響?zhàn)B禽業(yè)發(fā)展的主要病原之一,它可引起鵝腸道糠麩樣潰瘍、胰腺腫脹且表面有灰白色壞死灶、脾臟腫大并有大小不等的灰白色壞死灶。近年來(lái),該病在我國(guó)呈上升趨勢(shì),且感染宿主范圍不斷擴(kuò)大,已有鵝、丹頂鶴、鴿等感染該病毒的報(bào)道[1-3]。本研究對(duì)以前分離的GPMV的F基因進(jìn)行克隆,并與國(guó)內(nèi)外分離株進(jìn)行序列比對(duì)和分析,以期為進(jìn)一步研究該病毒的F基因功能和GPMV分子診斷以及基因工程疫苗奠定基礎(chǔ)。

        1材料與方法

        1.1試驗(yàn)材料

        從疑似感染GPMV的病死鵝中分離到鵝副黏病毒HN株,經(jīng)過(guò)凍干后,于海南省動(dòng)物疫病預(yù)防控制中心獸醫(yī)診斷檢驗(yàn)科-70 ℃凍存。

        1.2病毒增殖

        將病毒適當(dāng)稀釋后,經(jīng)尿囊腔接種9~11 d非免疫雞胚,0.2 mL/枚,于37 ℃恒溫箱孵育48 h,棄去24 h內(nèi)死亡胚,無(wú)菌收獲尿囊液,于-70 ℃保存?zhèn)溆谩?/p>

        1.3引物設(shè)計(jì)與合成

        根據(jù)GenBank中的GPMV全基因組核苷酸序列,經(jīng) Lasergene 7.10軟件比對(duì)和Primer 5.0軟件分析后,設(shè)計(jì)1對(duì)引物擴(kuò)增F基因,上游P1:5′-TAGTTCGCCTGTCTATCAAA-3′,下游P2:5′-GTGATGCGGTAGAACGGAT3-3′;由上海英濰捷基生物技術(shù)有限公司合成。

        1.4RT-PCR反應(yīng)

        將含有GPMV的尿囊液按照Invitrogen公司提供的RNA抽提操作說(shuō)明書(shū)進(jìn)行RNA模板的提取。反轉(zhuǎn)錄按照寶生物工程(大連)有限公司提供的Reverse Transcriptase XL(AMV)反轉(zhuǎn)錄酶使用說(shuō)明書(shū)進(jìn)行。PCR反應(yīng)體系為:2 μL模板,各50 pmol上、下游引物,各200 μmol/L 4種dNTP,0.5 μL Ex Taq DNA聚合酶,加水至50 μL。PCR反應(yīng)條件為:97 ℃ 0.5 min,53 ℃ 1 min,72 ℃ 2 min,30個(gè)循環(huán);72 ℃延伸 7 min。PCR產(chǎn)物經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳進(jìn)行鑒定。

        1.5F基因的克隆及鑒定

        將新擴(kuò)增PCR產(chǎn)物按一定比例與pMD18-T載體連接,連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化入DH5α感受態(tài)細(xì)胞,陽(yáng)性菌液經(jīng)PCR鑒定后擴(kuò)大培養(yǎng)并抽提質(zhì)粒,重組質(zhì)粒置于-40 ℃冰箱保存?zhèn)溆谩?/p>

        1.6序列分析

        將鑒定的陽(yáng)性重組質(zhì)粒,送上海英濰捷基生物技術(shù)有限公司進(jìn)行測(cè)序。用Lasergene 7.10軟件將所測(cè)序列和與國(guó)內(nèi)外病毒分離株的F基因序列進(jìn)行相似性比對(duì)。

        2結(jié)果與分析

        2.1PCR擴(kuò)增產(chǎn)物

        利用設(shè)計(jì)的P1/P2引物對(duì)GPMV HN株的F基因進(jìn)行RT-PCR擴(kuò)增,結(jié)果獲得大小約為2.1 kb的特異性條帶,與預(yù)計(jì)產(chǎn)物大小相符(圖1)。

        2.2重組質(zhì)粒的鑒定

        菌液PCR產(chǎn)物經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳鑒定,獲得大小約為2.1 kb的片段。

        2.3序列分析

        由序列測(cè)定結(jié)果可知,GPMV HN株的F基因全長(zhǎng)為 1 662 bp,編碼553個(gè)氨基酸。將GPMV HN株的F基因與國(guó)內(nèi)外分離株的F基因序列進(jìn)行比對(duì),結(jié)果表明:GPMV HN株和國(guó)內(nèi)已分離的GPMV的F蛋白核苷酸序列相似性在963%~97.3%之間,與傳統(tǒng)疫苗株LaSota的核苷酸序列相似性為82.7%,與國(guó)外分離株的F蛋白核苷酸序列相似性在34.8%~38.7%之間(表1);從F基因進(jìn)化樹(shù)來(lái)看,GPMV HN株與國(guó)內(nèi)分離株處于同一分支,而與國(guó)外分離株處于不同分支(圖2)。

        3結(jié)論與討論

        GPMV HN株的分離鑒定再次證明水禽不再僅是禽Ⅰ型副黏病毒的宿主,而且已成為禽Ⅰ型副黏病毒自然感染發(fā)病、死亡的易感禽類。這可能與禽Ⅰ型副黏病毒發(fā)生變異、逐漸適應(yīng)鵝體有關(guān)[4]。宿主范圍的不斷擴(kuò)大,給禽Ⅰ型副黏病毒的綜合防控提出了新的挑戰(zhàn)。

        國(guó)內(nèi)外研究表明,禽Ⅰ型副黏病毒F蛋白的變異主要發(fā)生于F蛋白N末端信號(hào)肽區(qū)(1~32aa)和裂解位點(diǎn)區(qū)(112~117aa),其他部位的氨基酸較保守,且裂解位點(diǎn)區(qū)氨基酸的組成是構(gòu)成副黏病毒毒力的分子基礎(chǔ)[5]。GPMV HN株的裂解位點(diǎn)區(qū)的氨基酸序列為112-Arg-Arg-Gln-Lys-Arg-Phe-117,與國(guó)外發(fā)表的強(qiáng)毒株序列112-Arg/Lys-Arg-Gln-Lys/Arg-Arg-Phe-117相符,表明所分離的GPMV HN株為強(qiáng)毒株。基因序列分析發(fā)現(xiàn)該分離株的F基因與GenBank登錄號(hào)為AF162714株系的F基因核苷酸相似性為97.1%,氨基酸相似性為97.7%,二者的相似性較高。進(jìn)化樹(shù)分析表明兩者處于同一分支,具有較近的親緣關(guān)系,且同屬于強(qiáng)毒株。GPMV HN株與傳統(tǒng)疫苗株LaSota的核苷酸相似性為82.7%,氨基酸相似性為87.4%,二者的相似性較低,進(jìn)化樹(shù)上雖屬于同一大分支,但親緣關(guān)系相對(duì)較遠(yuǎn),說(shuō)明HN株與傳統(tǒng)的疫苗株LaSota相比已發(fā)生一定的變異,這可能是造成水禽長(zhǎng)期使用傳統(tǒng)的新城疫病毒疫苗后仍暴發(fā)副黏病毒病的重要原因之一。

        參考文獻(xiàn):

        [1]秦衛(wèi)紅. 種鵝感染新城疫病毒的診斷[J]. 中國(guó)家禽,2012,34(23):55.

        [2]李靜姬,李福軍,梁玉嬉. 丹頂鶴非典型新城疫與大腸桿菌混合感染的診治[J]. 中國(guó)畜牧獸醫(yī),2013,40(2):211-213.

        [3]趙揚(yáng),郭明萍,鄒年莉,等. 兩株鴿源新城疫病毒的分離鑒定及F基因序列分析[J]. 中國(guó)家禽,2012,34(23):10-13.

        [4]張偉,刁有祥,徐福亮,等. 鵝副黏病毒LS-1株的分離鑒定及F基因分析[J]. 西南大學(xué)學(xué)報(bào):自然科學(xué)版,2011,33(4):31-35.

        [5]董國(guó)英,丁 壯. 鵝副黏病毒F基因的克隆及遺傳變異分析[J]. 中國(guó)獸醫(yī)學(xué)報(bào),2007,27(2):176-179.

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