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        鴨腸炎病毒囊膜糖蛋白gE基因序列分析及真核表達載體的構(gòu)建

        2014-05-29 10:16:22文晶亮李啟紅李俊平楊承槐李慧姣夏業(yè)才
        中國獸藥雜志 2014年5期
        關(guān)鍵詞:信號肽真核質(zhì)粒

        文晶亮,李啟紅,李俊平,劉 丹,李 嶺,楊承槐,李慧姣,夏業(yè)才

        (中國獸醫(yī)藥品監(jiān)察所,北京100081)

        gE蛋白是皰疹病毒家族中較為重要的糖蛋白之一,由位于US區(qū)的US8基因編碼。據(jù)報道皰疹病毒gE基因是皰疹病毒從視網(wǎng)膜、嗅覺上皮細胞、三叉神經(jīng)節(jié)侵入中樞神經(jīng)組織所必須的毒力基因,對皰疹病毒在體內(nèi)毒力表達、侵襲神經(jīng)核沿著神經(jīng)傳遞起著決定性的作用,另外還能促進病毒在細胞之間擴散[1-4]。 目前對人皰疹病毒、偽狂犬病毒、牛皰疹病毒等皰疹病毒糖蛋白gE基因及其編碼蛋白已有大量研究[5-7],而對鴨瘟病毒 gE基因及其編碼蛋白尚未有深入的報道。因此,本研究PCR擴增了DEV的gE基因完整開放閱讀框(gE)和去信號肽的gE基因(gE’),分別克隆至真核表達載體pCDNA3.1,轉(zhuǎn)染 vero細胞,并應(yīng)用 RT-PCR 和間接免疫熒光檢測gE、gE’蛋白在vero細胞中的轉(zhuǎn)錄、表達,旨在探討gE蛋白在真核細胞中的表達,為gE蛋白的功能研究、鴨瘟抗體檢測奠定基礎(chǔ),為深入了解鴨瘟病毒感染的發(fā)病機理提供科學(xué)數(shù)據(jù)。

        1 材料與方法

        1.1 材料

        1.1.1 病毒與細胞 鴨腸炎病毒AV1221株,由中國獸醫(yī)藥品監(jiān)察所菌種保藏中心提供;vero細胞,由本實驗室保存;E.coli DH5α感受態(tài)細胞,購于天根生化科技有限公司。

        1.1.2 主要試劑 真核表達載體 pCDNA3.1,由本實驗室保存;pMD18-T載體、Ex Taq DNA聚合酶、dNTPs、EcoRⅠ、XhoⅠ、MarkerⅣ、T4 DNA 連接酶,均購自大連寶生物工程有限公司;Lipofectamine 2000,購自 Invitrogen 公司;OPTI-MEM?I培養(yǎng)液,購自gibco?公司;FITC標(biāo)記的兔抗雞熒光二抗,購自美國sigma-aldrich公司;DMEM高糖細胞培養(yǎng)液、TBD標(biāo)準(zhǔn)胎牛血清購于賽墨飛世爾生物化學(xué)制品有限公司。

        1.1.3 試劑盒 高純度質(zhì)粒小提中量試劑盒、瓊脂糖凝膠DNA回收試劑盒購于天根生化科技有限公司。

        1.1.4 血清 雞抗DEV陽性血清,由本實驗室制備;TBD標(biāo)準(zhǔn)胎牛血清,購于賽墨飛世爾生物化學(xué)制品有限公司。

        1.2 方法

        1.2.1 引物設(shè)計與合成 根據(jù)已發(fā)表的基因組序列,設(shè)計擴增鴨腸炎病毒AV1221株的gE基因完整ORF序列(gE)和去信號肽的gE基因(gE’)引物,由invitrogen公司合成。

        針對gE的引物:

        P1: 5’ -AAGAATTC ATGATGGTTACTTTTAT-3’,下劃線部分為酶切位點EcoR I;

        P2:5’-AACTCGAGTCAGATGCGGAAACTAGA-3’,下劃線部分為酶切位點Xho I;

        針對gE’的引物:

        P11: 5’-AAGAATTCGACTATCATCAAGTGATT-3’,下劃線部分為酶切位點EcoR I;

        P22: 5’-AACTCGAGTCAGATGCGGAAACTAGA-3’,下劃線部分為酶切位點Xho I;

        1.2.2 DNA 模板提取 按參考文獻[8]進行。

        1.2.3 gE基因的克隆 PCR反應(yīng)體系:病毒DNA 2 μL,dNTPs 2 μL,上游引物 P11 μL,下游引物 P21 μL,10×Ex Taq buffer 2.5 μL,Ex Taq DNA 聚合酶0.125 μL,ddH2O 16.375 μL,總體積 25 μL。

        反應(yīng)條件:94℃預(yù)變性3 min,94℃變性40 s,46.2 ℃退火 40 s,72 ℃ 延伸 1 min 30 s,30 個循環(huán)后,72℃延伸10 min。反應(yīng)結(jié)束后,取3 μL PCR產(chǎn)物進行0.8%瓊脂糖凝膠電泳鑒定。

        1.2.4 去信號肽 gE 基因(gE’)序列的克隆 PCR

        反應(yīng)體系:病毒 DNA 2 μL,dNTPs 2 μL,上游引物P111 μL,下游引物 P221 μL,10 ×Ex Taq buffer 2.5 μL,Ex Taq DNA 聚 合 酶 0.125 μL, ddH2O 16.375 μL,總體積 25 μL。

        反應(yīng)條件:94℃預(yù)變性3 min,94℃變性40 s,47℃退火1 min,72℃延伸1 min 30 s,30個循環(huán)后,72℃延伸10 min。 反應(yīng)結(jié)束后,取3 μL PCR產(chǎn)物進行0.8%瓊脂糖凝膠電泳鑒定。

        1.2.5 gE基因測序及序列分析 PCR產(chǎn)物用膠回收試劑盒回收后,分別連接到pMD18-T載體,轉(zhuǎn)化DH5α,獲得重組質(zhì)粒 pMD18T-gE、pMD18T- gE’。將酶切及PCR鑒定正確的重組質(zhì)粒pMD18T-gE、pMD18T-gE’送Invitrogen公司測序,并用生物信息學(xué)軟件對測序正確的gE基因進行分析,預(yù)測gE基因編碼蛋白的功能。

        1.2.6 真核表達載體的構(gòu)建 gE基因測序正確后,用限制性內(nèi)切酶EcoRⅠ和XhoⅠ分別雙酶切克隆質(zhì)粒 pMD18-gE、pMD18-gE’和載體 pCDNA3.1?;厥?、純化雙酶切g(shù)E、gE’基因和pCDNA3.1線性質(zhì)粒,并用T4 DNA連接酶使雙酶切g(shù)E、gE’基因分別與 pCDNA3.1線性質(zhì)粒連接,轉(zhuǎn)化 E.coli DH5α 感受態(tài)細胞,挑取陽性克隆,提取質(zhì)粒pCDNA3.1-gE、pCDNA3.1-gE’,進行酶切及 PCR 鑒定。

        1.2.7 重組表達質(zhì)粒轉(zhuǎn)染vero細胞 在轉(zhuǎn)染前20 h,消化vero細胞,轉(zhuǎn)入6孔細胞板,每孔6×105個細胞,待細胞鋪板密度在75%時進行轉(zhuǎn)染。

        Lipofectamine 2000/DNA復(fù)合物的制備:分別將 0.8 μg pCDNA3.1- gE、pCDNA3.1- gE’質(zhì)粒分別稀釋于不含血清和抗生素的opti-DMEM中,使混合液的終體積均為 50 μL,室溫孵育 5 min;2 μL Lipofectamine 2000分別稀釋于不含血清和抗生素的opti-DMEM中,使混合液的終體積均為50 μL,輕輕混勻,室溫孵育5 min;將50 μL Lipofectamine 2000稀釋液分別滴加到50 μL質(zhì)粒稀釋液中,邊加邊混勻;室溫孵育20 min。

        轉(zhuǎn)染 vero細胞:分別將 100 μL Lipofectamine 2000/DNA復(fù)合物加入到6孔板中,輕輕搖動使其均勻混合,置37℃培養(yǎng)4 h,棄去上清,加入10%胎牛血清的M199培養(yǎng)基,置37℃培養(yǎng)24 h后,用1%胎牛血清的M199培養(yǎng)基換液,置37℃培養(yǎng)24 h。

        1.2.8 mRNA檢測 參照試劑盒操作說明,提取轉(zhuǎn)染后的細胞總RNA,將RNA反轉(zhuǎn)錄成cDNA,參照Invitrogen M-MLV反轉(zhuǎn)錄酶的說明書操作:模板RNA 5 μL,反轉(zhuǎn)錄引物 1 μL,dNTP(10 mmol/L)1 μL,DEPC 水補加至 12 μL,100℃ 水浴 5 min,馬上冰淬滅 1 min;短暫離心后加入 5×buffer 4 μL,DTT(0.1mol/L)2 μL,RNA 酶抑制劑 1 μL,輕輕混勻后 50℃水浴5 min;加入 M-MLV反轉(zhuǎn)錄酶1 μL,50 ℃水浴 50 min;70 ℃水浴15 min,冰淬滅;加入1 μL RNaseH,馬上進行PCR反應(yīng)。PCR反應(yīng)參照 1.2.3 和 1.2.4。

        1.2.9 表達產(chǎn)物的檢測 應(yīng)用間接免疫熒光法檢測表達蛋白,方法如下:取出6孔細胞板,用pH為7.2的PBST溶液漂洗細胞1次,加入0.5 mL預(yù)冷的甲醇溶液,固定15 min;棄去甲醇溶液,室溫放置2~5 min自然晾干;用PBST洗1次;加入100倍稀釋的雞抗DEV陽性血清,37℃孵育1 h,棄去DEV陽性血清,每孔用含0.05%吐溫-20的PBST洗3次后,用PBST液洗2次;加500倍稀釋的兔抗雞熒光抗體,37℃溫箱中避光孵育1 h,每孔用含0.05%吐溫-20的PBST洗3次后,用PBST洗2次,在熒光顯微鏡下觀察并照相。

        2 結(jié) 果

        2.1 gE基因的 PCR擴增 分別以 gE基因的P1/P2為引物、gE’基因的 P11/P22為引物,病毒 DNA為模板PCR擴增gE、gE’基因,擴增產(chǎn)物經(jīng)0.8%瓊脂糖凝膠電泳分析,可見約1400 bp的DNA片段,與預(yù)期片段大小相符(圖1)。

        圖1 gE和gE’基因的PCR擴增結(jié)果

        2.2 gE及gE’基因的克隆及酶切鑒定 回收純化后的gE、gE’PCR產(chǎn)物與pMD18-T連接,分別構(gòu)建克隆質(zhì)粒 pMD18T-gE、pMD18T-gE’,酶切、PCR 結(jié)果說明所克隆序列與目的片段大小相近(圖2、圖 3)。

        圖2 重組質(zhì)粒pMD18T-gE酶切及PCR鑒定結(jié)果

        圖3 重組質(zhì)粒pMD18T-gE’酶切及PCR鑒定結(jié)果

        2.3 gE基因序列分析及編碼蛋白的功能預(yù)測

        2.3.1 同源性分析結(jié)果 用NCBI網(wǎng)站的在線程序BLASTN對鴨瘟AV1221株gE基因序列與國內(nèi)分離強毒 CHv 株 (GenBank:EU071044.1)、 國 內(nèi) 疫 苗 株(GenBank:EU082088.2)和德國分離強毒 2085 株(GenBank:JF999965.1)基因序列進行比對,結(jié)果表明:鴨瘟AV1221株gE基因序列與國內(nèi)分離強毒CHv株、國內(nèi)疫苗株同源性均為100%,與德國分離強毒2085株同源性為99%,143位堿基變異(T-C),導(dǎo)致第48位氨基酸由蘇氨酸(T)變成了異亮氨酸(I),此外,412位(G-A)和1351位(C-T)堿基同義突變。

        2.3.2 信號肽預(yù)測結(jié)果 用CBS網(wǎng)站的在線程序SignalP4.1對gE氨基酸序列進行信號肽預(yù)測,結(jié)果顯示:gE蛋白序列中預(yù)測到的C值、S值或Y值都大于臨界值,推測gE蛋白第1~22位氨基酸為信號肽(圖4)。

        2.3.3 跨膜區(qū)的預(yù)測結(jié)果 本研究利用 TMHMM 2.0預(yù)測鴨瘟AV1221株gE蛋白的跨膜區(qū),其結(jié)果顯示:gE蛋白在397~419位氨基酸有一個跨膜區(qū),1~396位氨基酸位于胞膜外(胞外區(qū)),420~490位氨基酸位于胞膜內(nèi)(胞質(zhì)區(qū))(圖5)。

        圖4 gE氨基酸序列推倒肽鏈信號肽預(yù)測結(jié)果

        圖5 gE氨基酸序列推倒肽鏈跨膜區(qū)預(yù)測結(jié)果

        2.4 真核表達質(zhì)粒的構(gòu)建及鑒定 重組質(zhì)粒pCDNA3.1-gE、pCDNA3.1-gE’經(jīng) EcoRⅠ及 XhoⅠ雙酶切后分別得到約1400 bp和5400 bp的條帶,PCR鑒定結(jié)果也獲得了約1400 bp的條帶,說明成功構(gòu)建了重組真核表達質(zhì)粒 pCDNA3.1-gE、pCDNA3.1-gE’(圖 6)。

        圖6 重組質(zhì)粒 pcDNA3.1-gE、pcDNA3.1-gE’酶切及PCR鑒定結(jié)果

        2.5 PCR 鑒定轉(zhuǎn)染結(jié)果 提取 pCDNA3.1-gE、pCDNA3.1-gE’轉(zhuǎn)染后的 vero 細胞總 RNA,并以提取的細胞總RNA為模板,分別以gE基因的P1/P2、gE’基因的 P11/P22為引物進行 RT-PCR 擴增,得到了相應(yīng)大小DNA片段(圖7),而以提取的空載體pCDNA3.1轉(zhuǎn)染的 vero細胞總 RNA為模板RT-PCR擴增后則未見相應(yīng)條帶,從轉(zhuǎn)錄水平上說明gE和gE’基因均在vero細胞獲得表達。

        圖7 pCDNA3.1-gE、pCDNA3.1-gE’和 pCDNA3.1轉(zhuǎn)染vero細胞RT-PCR結(jié)果

        2.6 表達產(chǎn)物的免疫熒光鑒定 轉(zhuǎn)染48h后,經(jīng)用熒光顯微鏡觀察,只有重組質(zhì)粒pCDNA3.1-gE’轉(zhuǎn)染的 vero細胞可見綠色熒光(圖 8 A),而pCDNA3.1-gE、pCDNA3.1 轉(zhuǎn)染的 vero 細胞中未見明顯熒光(圖8B,C),結(jié)果表明gE’基因在vero細胞中獲得了正確表達,具有免疫原性,能與抗體結(jié)合。

        圖8 真核表達載體轉(zhuǎn)染vero細胞后間接免疫熒光檢測結(jié)果

        3 討論與小結(jié)

        本研究結(jié)果表明,鴨腸炎病毒AV1221株 gE基因完整的開放閱讀框長為1473 bp,共編碼490個氨基酸,其中第1~22位氨基酸為信號肽序列。其基因序列與國內(nèi)分離強毒CHv株[9]、國內(nèi)疫苗株[10]和德國分離強毒 2085 株[11]均具有較高同源性,說明鴨腸炎病毒AV1221株gE比較保守。而軟件TMHMM 2.0預(yù)測表明gE蛋白是典型的囊膜糖蛋白,包括較長的胞外區(qū)(396個氨基酸)、跨膜區(qū)(23個氨基酸)和胞質(zhì)區(qū)(71個氨基酸),這與常華[12]結(jié)果一致。

        皰疹病毒gE蛋白表達載體的構(gòu)建及表達是其功能研究的重要方面,Zhu等[13]將VZV gE構(gòu)建在真核表達質(zhì)粒pSVK3上,轉(zhuǎn)染COS-7細胞,用間接免疫熒光方法檢測到VZV gE蛋白在COS-7細胞中表達并定位于COS-7細胞的高爾基體。常華[12]利用間接免疫熒光方法檢測到DEV gE蛋白可在感染鴨胚成纖維細胞的胞漿中表達。在本研究中,含信號肽的表達載體pCDNA3.1-gE在vero細胞內(nèi)完成了轉(zhuǎn)錄過程,但卻未能在vero細胞內(nèi)檢測到熒光,與上述研究結(jié)果并不一致,推測可能與所用毒株、宿主細胞不同以及存在信號肽有關(guān)。因此又構(gòu)建了去信號肽的真核表達載體pCDNA3.1-gE’,轉(zhuǎn)染vero細胞后完成了轉(zhuǎn)錄過程,并進行了表達,證實gE自身所具有的信號肽序列可以有效誘導(dǎo)gE蛋白分泌到細胞外,與軟件TMHMM 2.0預(yù)測結(jié)果一致。實驗表明,在真核表達體系中,信號肽的有無對gE蛋白的表達具有顯著的影響。

        本研究通過酶切和PCR方法證實,成功構(gòu)建了真核表達質(zhì)粒 pCDNA3.1-gE 和 pCDNA3.1-gE’,并在轉(zhuǎn)錄水平和蛋白水平上檢測了pCDNA3.1-gE、pCDNA3.1-gE’在 vero細胞中的表達,下一步將通過G418抗生素篩選穩(wěn)定表達gE的vero細胞系,為gE蛋白的體外表達、功能研究、鴨瘟抗體檢測試劑盒的開發(fā)奠定了基礎(chǔ)。

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