陳 珊,華 梅,劉 迪,趙書博,李 凡,劉東波,夏紅梅
(東北師范大學(xué) 生命科學(xué)學(xué)院,吉林 長(zhǎng)春130024)
纖維素是由吡喃型D-葡萄糖以β-1,4-糖苷鍵連接而成的直鏈大分子,是自然界中最廣泛存在的一類碳水化合物,也是地球上最豐富的再生資源。利用生物技術(shù)對(duì)植物纖維素進(jìn)行生物轉(zhuǎn)化以生成人類急需的能源和化工原料等,將對(duì)緩解人類社會(huì)環(huán)境污染、食物短缺和能源危機(jī)等具有重大意義[1]。微生物所產(chǎn)生的纖維素酶的降解作用是纖維素資源開發(fā)利用的有效途徑,這些纖維素酶主要包括:內(nèi)切葡聚糖酶(endo-l,4-β-D-glucanase,EC3.2.l.4)、外切葡聚糖酶[纖維二糖水解酶(l,4-β-D-glucan cellobiohydrolase,EC3.2.l.9l)和纖維糊精酶(cellodextrinase,EC3.2.l.74)]及β-葡萄糖苷酶(β-glucosidase,EC3.2.1.21)[2]。
產(chǎn)纖維素酶的微生物廣泛分布于真菌、細(xì)菌、放線菌等菌屬中,之前的研究多集中在木霉屬和青霉屬等真菌方面,但研究結(jié)果顯示雖然這些真菌產(chǎn)生的纖維素酶種類較多,活力較高,但仍然不能滿足實(shí)際生產(chǎn)的需求,特別是真菌在降解纖維素時(shí)還具有培養(yǎng)周期長(zhǎng)、易染菌、耐堿性差、難以實(shí)現(xiàn)大工業(yè)生產(chǎn)等不足。近年來,陸續(xù)出現(xiàn)了細(xì)菌降解纖維素的報(bào)道,產(chǎn)芽孢細(xì)菌因具有特化的芽孢,在耐酸堿、耐高溫等方面顯現(xiàn)了獨(dú)特的優(yōu)勢(shì)[3],更利于實(shí)際操作和工業(yè)生產(chǎn),因此成為目前纖維素降解微生物研究的重要方向。
本文從長(zhǎng)白山森林土壤中篩選到了一株產(chǎn)纖維素酶的地衣芽孢桿菌,對(duì)其進(jìn)行了分類鑒定,并研究了菌株產(chǎn)纖維素酶的最佳條件,為該菌的進(jìn)一步應(yīng)用及對(duì)纖維素的有效轉(zhuǎn)化提供實(shí)驗(yàn)依據(jù)。
1.1.1 富集培養(yǎng)基
羧甲基纖維素鈉(CMC-Na),1%;Mandels 無機(jī)營(yíng)養(yǎng)鹽液[4];蛋白胨,1%;瓊脂粉,1.5%;自然pH。
1.1.2 篩選培養(yǎng)基
CMC-Na,1%;Mandels 無機(jī)營(yíng)養(yǎng)鹽液;瓊脂粉,1.5%;自然pH。
1.1.3 產(chǎn)酶發(fā)酵培養(yǎng)基
CMC-Na,1%;NaCl,0.5%;KH2PO4,0.1%;MgSO4,0.02%;蛋白胨,1%;pH 7.2。
采集長(zhǎng)白山森林土壤,置于無菌水中振蕩,打散后取上層水樣接入富集培養(yǎng)基中,連續(xù)富集培養(yǎng)3 次后,將上清液梯度稀釋涂布或劃線于篩選培養(yǎng)基平板上30℃培養(yǎng)至菌落長(zhǎng)出,經(jīng)剛果紅染色、NaCl 脫色后,觀察菌落周圍是否有透明圈生成,并測(cè)定透明圈直徑與菌落直徑的比值,選取比值較大的菌株接種到產(chǎn)酶培養(yǎng)基中,測(cè)定發(fā)酵液的酶活性。
取1.5 mL 0.05mol/ L 緩沖液配制的1.0% CMC 溶液,加入0.5mL 適當(dāng)稀釋的酶液,50℃反應(yīng)30min 后用DNS 法測(cè)定酶解產(chǎn)生的還原糖量,酶活單位采用國(guó)際單位(International Unit,IU),即在實(shí)驗(yàn)條件下1 mL 酶液1 min 產(chǎn)生1?mol 還原糖的酶量作為1 個(gè)酶活單位U[5]。
形態(tài)學(xué)鑒定參考《常見細(xì)菌系統(tǒng)鑒定手冊(cè)》[6]進(jìn)行。分子生物學(xué)鑒定及進(jìn)化分析依據(jù)該菌株的16S rDNA 序列,具體方法為首先提取菌株的基因組DNA[7],以該基因組為模板擴(kuò)增菌株的16S rDNA。所用PCR 引物為細(xì)菌鑒定通用引物:27F 5'-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3',1492R 5'-ACGGCTACCTTGTTACGACT-3'。PCR 反應(yīng)程序:94℃4 min;94℃1min,55 ℃30 s,72℃2min,30 個(gè)循環(huán);72℃10min。PCR產(chǎn)物進(jìn)行1% 瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè),目的條帶回收后與PMD-18T 載體連接送長(zhǎng)春庫美測(cè)序公司測(cè)序,測(cè)序結(jié)果在NCBI 進(jìn)行BLAST 分析,以ClustalX 進(jìn)行多序列比對(duì)后,采用MEGA4.0 的Neighbor-Joining 法構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹。
將2ml 種子液接入產(chǎn)酶培養(yǎng)基中,分別置于25℃、30℃、37℃、40℃和45℃搖床中振蕩培養(yǎng),間隔12h取樣。將發(fā)酵液樣品在8000rpm 條件下離心10min,所得上清液即為粗酶液。測(cè)定不同粗酶液樣品的CMC 降解活性,選取不同溫度下達(dá)到產(chǎn)酶高峰時(shí)的酶活性做比較,以最高活性為100%,其余活性換算為相對(duì)活性作圖,研究不同發(fā)酵溫度對(duì)菌株產(chǎn)酶的影響。
配制初始pH 分別為5、6、7、8、9 的產(chǎn)酶培養(yǎng)基,接種后在測(cè)得的最適培養(yǎng)溫度下振蕩培養(yǎng),間隔12h取樣。將發(fā)酵液樣品在8000rpm 條件下離心10min,測(cè)定上清液的CMC 降解活性,選取不同初始pH 培養(yǎng)基中達(dá)到產(chǎn)酶高峰時(shí)的酶活性做比較,以最高活性為100%,其余活性換算為相對(duì)活性作圖,研究培養(yǎng)基不同初始pH 對(duì)菌株產(chǎn)酶的影響。
改變產(chǎn)酶培養(yǎng)基中的碳源種類,濃度均采用1%,接入2ml 種子液后置于最適培養(yǎng)溫度下?lián)u床振蕩培養(yǎng),達(dá)到產(chǎn)酶高峰后測(cè)定不同碳源條件下粗酶液的CMC 降解活性,研究不同碳源對(duì)菌株產(chǎn)酶的影響。
分別選取典型的有機(jī)氮和無機(jī)氮作為產(chǎn)酶培養(yǎng)基中的氮源,濃度均采用1%,接入2ml 種子液后置于最適培養(yǎng)溫度下?lián)u床振蕩培養(yǎng),達(dá)到產(chǎn)酶高峰后測(cè)定不同氮源條件下粗酶液的CMC 降解活性,研究不同氮源對(duì)菌株產(chǎn)酶的影響。
以CMC-Na 為唯一碳源進(jìn)行菌種篩選,待細(xì)菌在平板上生長(zhǎng)后,用0.1%的剛果紅水溶浸染15min,再用1M 的NaCl 水溶液脫色。剛果紅可將CMC-Na 染成紅色,而纖維素降解菌株周圍由于分泌的纖維素酶使CMC 降解為小分子糖不著色,因此可以明顯的觀察到透明圈的存在(圖1)。應(yīng)用本方法成功的從長(zhǎng)白山森林土壤中篩選到了多株對(duì)CMC 具有降解活性的菌株,選擇其中的芽孢桿菌DS1309 做為進(jìn)一步的研究對(duì)象。
圖1 剛果紅染色后菌株周圍形成的透明圈
菌株DS1309 在CMC 培養(yǎng)基及普通細(xì)菌培養(yǎng)基上生長(zhǎng)菌落呈污白色,干燥,粗糙,不透明,中間凸起。菌體在顯微鏡油鏡下觀察呈桿狀,產(chǎn)芽孢,革蘭氏染色為陽性,顯微形態(tài)圖見圖2。
在形態(tài)學(xué)觀察的同時(shí)對(duì)菌株進(jìn)行了分子生物學(xué)鑒定。菌株16S rDNA 序列分析結(jié)果表明,該菌株的16S rDNA 序列與地衣芽孢桿菌(Bacillus licheniformis)16S rDNA 序列的同源性高達(dá)99%,將相關(guān)序列通過ClustalX 進(jìn)行多序列比對(duì)后,利用MEGA4.0 軟件構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹,結(jié)果顯示在系統(tǒng)發(fā)育上菌株DS1309與地衣芽孢桿菌屬于同一分支。根據(jù)形態(tài)學(xué)觀察和分子生物學(xué)鑒定結(jié)果,確定該菌株為地衣芽孢桿菌(Bacillus licheniformis)。
2.3.1 培養(yǎng)溫度對(duì)菌株產(chǎn)酶的影響
將2ml 種子發(fā)酵液接種于產(chǎn)酶培養(yǎng)基中,置于不同溫度下振蕩培養(yǎng),間隔12h 取樣測(cè)定上清液的酶活性。結(jié)果顯示在30℃左右菌體生長(zhǎng)旺盛,發(fā)酵液酶活力最高(圖3),因此確定菌株DS1309 產(chǎn)纖維素酶的最適發(fā)酵溫度為30℃。
圖2 菌株DS1309 的顯微形態(tài)圖
圖3 培養(yǎng)溫度對(duì)菌株產(chǎn)酶的影響
2.3.2 培養(yǎng)基初始pH 對(duì)菌株產(chǎn)酶的影響
制備產(chǎn)酶培養(yǎng)基分裝至三角瓶中,分別調(diào)節(jié)培養(yǎng)基的pH 為5、6、7、8 和9,接入2ml 種子液后,置于最適溫度30℃下培養(yǎng),間隔12h 取樣測(cè)定上清液的酶活性,選取達(dá)到產(chǎn)酶高峰時(shí)的酶活性作圖。由圖4可知,初始發(fā)酵pH 對(duì)菌株產(chǎn)酶的影響比較明顯,在pH6.0 范圍內(nèi),隨著初始pH 的升高,CMC 降解酶活力增強(qiáng),pH 為6.0 時(shí)菌株所產(chǎn)酶活力最高;pH 進(jìn)一步升高后,發(fā)酵液酶活力迅速降低,在pH7.0 時(shí)酶活力僅為pH6.0 培養(yǎng)基中活力的40%,說明菌株DS1309 產(chǎn)纖維素酶的最適發(fā)酵初始pH 為6.0。
圖4 培養(yǎng)基初始pH 對(duì)菌株產(chǎn)酶的影響
2.3.3 不同碳源對(duì)菌株產(chǎn)酶的影響
分別選取CMC-Na、葡萄糖、蔗糖、麩皮和玉米秸稈作為產(chǎn)酶培養(yǎng)基中的碳源,研究不同碳源對(duì)菌株產(chǎn)酶的影響。結(jié)果(圖5)表明菌株DS1309 對(duì)碳源利用廣泛,除了能夠以CMC-Na 為碳源外,還能夠利用單糖、雙糖及麩皮、玉米秸稈等天然纖維素。碳源對(duì)菌株產(chǎn)纖維素酶的影響順序?yàn)槠咸烟牵菊崽牵钧熎ぃ居衩捉斩挘綜MC-Na,最佳利用碳源為葡萄糖。同時(shí)研究也顯示出,以葡萄糖和蔗糖為碳源時(shí),產(chǎn)酶高峰出現(xiàn)較晚,推測(cè)當(dāng)培養(yǎng)基中單糖和雙糖濃度較高時(shí),有利于菌株的生長(zhǎng),但是對(duì)菌株產(chǎn)酶有產(chǎn)物抑制作用;隨著碳源的利用,糖濃度降低,抑制作用解除,纖維素酶產(chǎn)量迅速提高。
2.3.4 不同氮源對(duì)菌株產(chǎn)酶的影響
分別選取有機(jī)氮蛋白胨、酵母粉,無機(jī)氮NH4NO3、(NH4)2SO4 以及提供無極氮形式的有機(jī)物尿素作為氮源,研究不同氮源對(duì)菌株產(chǎn)酶的影響。結(jié)果(圖6)表明有機(jī)氮作為氮源的條件下,菌株發(fā)酵液的酶活力較高,最佳的氮源為酵母粉。同時(shí)結(jié)果還表明菌株能夠利用硝酸鹽生長(zhǎng)并產(chǎn)酶,但對(duì)于銨鹽形式的無機(jī)氮源利用較差。
圖5 碳源對(duì)菌株產(chǎn)酶的影響
圖6 氮源對(duì)菌株產(chǎn)酶的影響
本文采用唯一碳源法從長(zhǎng)白山森林土壤中篩選到了一株具有纖維素降解酶活力的芽孢桿菌DS1309,根據(jù)菌株的形態(tài)學(xué)觀察結(jié)果和16SrDNA 的系統(tǒng)發(fā)育分析,鑒定該菌株為地衣芽孢桿菌(Bacillus licheniformis)。采用液體振蕩培養(yǎng)的方法,優(yōu)化了菌株DS1309 產(chǎn)CMCase 的發(fā)酵條件,結(jié)果顯示,菌株產(chǎn)酶的最適培養(yǎng)溫度是30℃,培養(yǎng)基最適初始pH 為6.0,產(chǎn)酶的最適碳源為葡萄糖,最適氮源為酵母粉,在最優(yōu)條件下發(fā)酵48h 后酶活可達(dá)到1.82 IU/mL。
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