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        萬水千山總是藥

        2014-04-29 00:00:00胡雯雯
        南都周刊 2014年5期

        從智利出發(fā),在太平洋上進(jìn)行150公里長(zhǎng)途旅行是一點(diǎn)也不浪漫的:整日整夜的顛簸、潮濕悶熱的氣候、厄爾尼諾海流和拉尼娜現(xiàn)象的交替上演,就連最老練的水手也會(huì)膽怯。然而,一旦這支由南美海員和英國(guó)打撈工程師組成的探險(xiǎn)隊(duì)到達(dá)目的地,迎接他們的將是平靜的海面。

        在這里,他們可以借助引擎將船只固定下來,然后開始打撈。用錨來固定船顯然是不可能的,因?yàn)榇路降拇笱蟮撞可钸_(dá)8公里。下面躺著全長(zhǎng)5900公里的秘魯-智利海溝,幽暗神秘,科考隊(duì)員們希望從里面打撈出挽救人類生命的東西。

        秘魯-智利海溝只是第一站。英國(guó)阿伯丁大學(xué)的化學(xué)家馬塞爾·杰斯帕(Marcel Jaspars)正準(zhǔn)備帶領(lǐng)這支國(guó)際特別行動(dòng)隊(duì),探索各處陰暗未知的海域,試圖帶回能對(duì)抗人類各種死敵——從癌癥到抗藥性細(xì)菌——新藥。在他看來,我們已經(jīng)時(shí)日無多了,抗生素的失效正將人類拖向末日。

        大自然一直是人類藥箱最大的供應(yīng)商。市面上超過一半的藥物都來自植物、動(dòng)物或是細(xì)菌。比如,阿司匹林是從楊柳的樹皮提取的,青霉素來自一種真菌,許多抗生素的誕生則要感謝土壤細(xì)菌。

        有些藥物的誕生純屬意外驚喜,而一些制藥公司會(huì)依靠生物勘探(Bioprospecting)給自己帶來更多驚喜。他們將科考隊(duì)員送去荒蠻遙遠(yuǎn)的地方,確實(shí)找回過一些寶物,比如長(zhǎng)春花堿(Vinblastine)。這種能治療霍奇金淋巴瘤的化療藥物,就是從馬達(dá)加斯加的紫長(zhǎng)春花屬植物(rosy periwinkle)上分離出來的。

        而在另一方面,病菌的威力也變得日益強(qiáng)大。淋病、結(jié)核病和耐甲氧西林金黃色葡萄球菌(MRSA)的抗藥性細(xì)菌,就連最新的抗生素都可能對(duì)付不了。英國(guó)伯明翰大學(xué)的微生物學(xué)家勞拉·皮多克(Laura Piddock)認(rèn)為,不出二十年,這些疾病的耐藥菌就會(huì)對(duì)所有主要抗生素產(chǎn)生耐藥性,一次簡(jiǎn)單的感染,足以讓人致命。“但我們手頭卻沒有多少培養(yǎng)新藥的有機(jī)體?!?/p>

        盡管制藥廠可以不斷合成新的抗生素類似物,但人工合成怎比得上大自然幾十億年演化出來的多樣性呢?適合人類居住的區(qū)域,只是這個(gè)星球生物圈的一小塊。在那荒蕪的沙漠中、厚厚的冰層下、深深的地底……有無數(shù)生物在極端“惡劣”的環(huán)境中生存,并茁壯成長(zhǎng)著。

        喝毒水,住冰湖

        40多年前,美國(guó)華盛頓大學(xué)的微生物學(xué)家托馬斯·布洛克(Thmomas Brock)回實(shí)驗(yàn)室的時(shí)候,開車穿過了黃石公園。里面密布的熱池和間歇泉上演著讓人驚嘆的表演,讓他忍不住停下觀賞,并取了些水樣帶回去。在這些近乎沸騰的液體中,他驚奇地發(fā)現(xiàn)了一群活躍的生命,從此開始了長(zhǎng)達(dá)十幾年的研究。

        水生棲熱菌(Thermus Aquaticus)是這些喜愛高溫的居民中的一種,它們?cè)跓崴鳌⒑四軓S的廢水排放口也存活著。水生棲熱菌能制造一種名為(Taq polymerase)的聚合酶,它的絕活是讓少量DNA大量擴(kuò)增,從而將這項(xiàng)復(fù)雜繁瑣的工作大大簡(jiǎn)化,因此成了全世界分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室的好助手,也推動(dòng)了基因?qū)W的革命。

        直到幾年前人們才意識(shí)到,這些杰出的環(huán)境適應(yīng)分子,同樣可以對(duì)付醫(yī)藥上最棘手的敵人。位于美國(guó)新墨西哥州的龍舌蘭洞穴(Lechuguilla Cave),被稱為全世界最深和最美的洞穴之一。里面遍布著晶瑩剔透的生石膏晶體,清澈見底的地巖層湖水,全是由地下水、硫酸和巖石反應(yīng)而成。這里的湖水酸性極強(qiáng),以至于人們游覽洞穴時(shí),鼻子和皮膚會(huì)感覺進(jìn)入了化工廠的反應(yīng)車間。但在這本應(yīng)腐蝕一些生物的湖水中,生活著一種強(qiáng)悍的青霉菌(Penicillium),它制造的化合物能夠抑制肺癌細(xì)胞的生長(zhǎng)。

        另一個(gè)發(fā)現(xiàn)來自柏克利礦(Berkeley Pit)。這是美國(guó)蒙大拿理工學(xué)院附近的一座荒廢露天礦坑,里面有片流淌著毒液,深達(dá)四五百米的湖泊。高度酸性的湖水飽含重金屬,卻長(zhǎng)滿了奇異的微生物。2006年,蒙大拿理工學(xué)院的唐·斯蒂爾勒(Donald B Stierle)和安德里亞·斯蒂爾勒(Andrea A Stierle)從毒水中提取出一種微生物,發(fā)現(xiàn)它能讓卵巢癌細(xì)胞的生長(zhǎng)速度降低50%(Journal of Organic Chemistry, vol 71,p5357),這種微生物后來就取名叫柏克利酸(Berkelic Acid)。

        英國(guó)肯特大學(xué)的微生物學(xué)家阿蘭·布爾(Alan Bull)曾在世界上海拔最高的沙漠中搜尋類似的生命體。智利的阿塔卡馬(Atacama)沙漠面積有兩個(gè)意大利那么大,是地球上最干燥的地方。全年烈日高照,有云彩的日子不超過二十天,每十年下的雨量只能用毫米來度量,某些地區(qū)甚至幾百年都沒見過雨水。美國(guó)航空航天局NASA把這片貧瘠強(qiáng)酸的沙漠當(dāng)作火星模擬場(chǎng)。布爾卻希望在這兒找到放線菌(actinobacteria)。這是他夢(mèng)寐以求的一種生物,它富含可以穿過人體防御系統(tǒng)的微小分子,是理想的藥物原料。

        布爾原本覺得,能在這兒收獲幾個(gè)碩果僅存的物種就不錯(cuò)了,結(jié)果最后一數(shù),他們收集到足足一千來種。這些菌群有些是我們熟悉的品種,有些則聽都沒聽過。它們培養(yǎng)出的化合物,有的能消炎,有的能抗癌,有的是抗生素。“里面很多都是醫(yī)藥界從沒接觸過的潛力分子?!辈紶枬M懷希望地說。

        沙漠并不是唯一提供希望的地方。南極洲,這片巨大的未知區(qū)域,已經(jīng)向生物勘探開放了,而這一切都?xì)w功于氣候變暖。英國(guó)諾桑比亞大學(xué)大衛(wèi)·皮爾斯(David Pearce)一直在研究霍奇森湖(Hodgson lake)打撈上來的樣本。這片湖原本被壓在厚厚的冰層下,隨著氣候暖化,冰川逐漸消失,科考隊(duì)得以把埋在湖里十幾萬年的沉積物打撈出來。在這些淤泥中,皮爾斯找到的生物數(shù)量比想像中豐富得多。“也許物競(jìng)天擇的力量并沒有我們想象那么嚴(yán)苛,大自然對(duì)生命還是很寬容的?!?/p>

        更重要的是,通過基因組的研究,他們發(fā)現(xiàn)南極洲湖中生物不僅量多,物種多樣性也很豐富。其中超過四分之一的湖中生物,跟已知物種的DNA序列是完全不匹配的?!拔覀?cè)詾檫@種環(huán)境生存的有機(jī)體應(yīng)該高度相似,”皮爾斯很驚訝,“沒想到,里面有淡水生物,有海洋生物,有極端微生物(Extremophilic,能在如高溫、高鹽、高酸、高壓等極端環(huán)境中正常生長(zhǎng)的微生物),還有些是世界公民?!?/p>

        另一個(gè)人們?cè)詾椴淮嬖谏牡胤?,就在我們腳下,埋在深深的巖石中。地底深處是一片廣闊的生態(tài)系統(tǒng),就像未開發(fā)的南極洲一樣,但它跨越了幾乎整個(gè)地球。

        暗無天日

        在我們對(duì)深海生物不斷取得新發(fā)現(xiàn)的時(shí)候,大洋中的海溝,仍是等待開發(fā)的處女地。按美國(guó)伍茲霍爾海洋研究所(Woods Hole Oceanographic Institute)深海生物學(xué)家蒂姆·申克(Tim Shank)的說法:“海溝中有著地球上最大的未探索生物群落?!?/p>

        “在海溝里,我們通常稱為超深淵帶(hadal zone)的地方,同時(shí)結(jié)合了好幾種極端條件:極大的壓力、完全的黑暗、接近2攝氏度的溫度。這種溫度雖然不是極寒,卻能扼殺大部分細(xì)菌的生長(zhǎng)?!庇?guó)阿伯丁大學(xué)的馬塞爾·杰斯帕介紹。除了這些極端條件,海溝本身也是個(gè)獨(dú)立的生態(tài)系統(tǒng),就像在海底的桃花源,與世隔絕,里面的生物肯定有著不同尋常的特性。

        去年,杰斯帕的推測(cè)得到了證實(shí)。微生物學(xué)家羅尼·格魯?shù)拢≧onnie Glud)和南丹麥大學(xué)的同事對(duì)挑戰(zhàn)者深淵(Challenger Deep)底部提取的樣本做了分析,發(fā)現(xiàn)在這片深達(dá)11公里,相當(dāng)于從北太平洋水面往下潛一又四分之一座珠穆朗瑪峰的地方,大概一塊方糖大小的泥里就生存著一千萬種生物,這個(gè)數(shù)量是海溝頂部泥土中的十倍。

        為什么這種永不見天日的地方生物如此多?格魯?shù)抡J(rèn)為,海溝也許是收集食物養(yǎng)分的理想場(chǎng)所。它們遼闊、陡峭的斜坡就像漏斗一樣,將有機(jī)物源源不斷地往下輸送。在海溝底部生長(zhǎng)的細(xì)菌,只要張著嘴等吃就行了。

        那么,這些種類豐富的微生物里能不能找出新藥來呢?杰斯帕和布爾的合作首先取得了成果。在日本遙控潛水艇從馬里亞納海溝拖出的樣品中,他們分離出一種名為深海容壓放線細(xì)菌(Dermacoccus abyss)的種群。這是一種從未見過的生化家族,它們產(chǎn)生的Dermacozines細(xì)胞毒素,是引發(fā)昏睡病的寄生蟲的克星(International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, vol 56, p1233)。

        杰斯帕希望在秘魯-智利海溝中也有同樣的發(fā)現(xiàn)。“迄今為止,人們只從那里提取過兩三次樣本,而且菌類也不是樣本提取的目標(biāo)?!敝暗目瓶既藛T感興趣的是蠕蟲和其他小的有機(jī)體,他們確實(shí)也找到了獨(dú)特的物種。“所以,我覺得我們成功的幾率很大?!?/p>

        手握歐盟950萬英鎊(約等于9500萬人民幣)的資助,杰斯帕開始了這項(xiàng)命名為PharmaSea的大探險(xiǎn)。他仔細(xì)地挑選了所有隊(duì)員,他們來自13個(gè)國(guó)家、25家科研和商業(yè)機(jī)構(gòu),各有所長(zhǎng),是個(gè)全明星夢(mèng)之隊(duì)。英國(guó)的打撈公司Deep Tek專門開發(fā)了一種新型繩索絞盤組合,希望幫他們擺脫專業(yè)科考船,從而將取樣的成本降低十個(gè)點(diǎn)。

        但他們還需要跨越最后一關(guān)。

        對(duì)于極限地區(qū)的生物來說,人類生存的環(huán)境就像它們的家對(duì)人類來說一樣,是個(gè)死亡之地。伍茲霍爾海洋研究所的崔西·曼瑟(Tracy Mincer)舉例:“海溝底的生物通常是嗜壓生物(piezophiles),只有在強(qiáng)大的壓力中才能生存。所以,光是把它們從溝底帶到水面的這段路程,都可能是致命的?!币虼耍麄?cè)O(shè)計(jì)了各種復(fù)雜的加壓艙,模擬海底不同深度的壓力,盡量讓這些敏感的小生物賓至如歸。

        新藥試驗(yàn)

        把樣本挖出來,在確保其存活的情況下,千里迢迢帶回實(shí)驗(yàn)室,這才給尋找新藥之旅開了個(gè)頭。PharmaSea團(tuán)隊(duì)希望在2016年項(xiàng)目結(jié)束時(shí),選出幾種可能制成新藥的成分,用來做動(dòng)物實(shí)驗(yàn)。

        首先,他們會(huì)把有用的菌種分離出來,培養(yǎng)壯大。然后,他們會(huì)把這些細(xì)菌制造的幾百種化合物和感染了不同疾病的細(xì)胞匹配?!叭绻膫€(gè)化合物針對(duì)某種疾病有反應(yīng),我們就提純它,直到找出到底是什么物質(zhì)產(chǎn)生了效果,接著進(jìn)一步做實(shí)驗(yàn)?!苯芩古两榻B。

        可想而知,這是一項(xiàng)復(fù)雜繁瑣的工程。幸運(yùn)的是,一些最前沿的技術(shù)可以讓實(shí)驗(yàn)簡(jiǎn)化。比如,比利時(shí)魯汶天主教大學(xué)(Catholic University of Leuven)的研究員開發(fā)出了一種用斑馬魚做實(shí)驗(yàn)的方法。他們發(fā)現(xiàn),斑馬魚就和小白鼠一樣,是個(gè)理想的實(shí)驗(yàn)對(duì)象。它們和人類擁有高度類似的基因、生理學(xué)和藥理學(xué)特性。更重要的是,用斑馬魚來做實(shí)驗(yàn),篩查的速度要快得多,而且只需少量樣本就可以了。杰斯帕已經(jīng)招募了該大學(xué)的研究員,準(zhǔn)備讓他們測(cè)試治療神經(jīng)系統(tǒng)疾病的藥物。

        一旦某種藥物有了效果,醫(yī)藥公司便可以大規(guī)模量產(chǎn),這次生物勘探也有了完美的收?qǐng)?。但?duì)于杰斯帕來說,還有更多勘探目的地在向他招手,比如新西蘭的克馬蒂克群島(Kermadec)海域,西太平洋的馬里亞納海溝(Mariana),還有日本的伊豆-小笠原海溝(Izu-Bonin)。

        當(dāng)然,他們需要先完成秘魯-智利海溝的探索??瓶即€有幾星期就出發(fā)了,到達(dá)目的地海域后,Deep Tek公司的打撈工程師會(huì)拋下一米長(zhǎng)的取樣儀器。4到6個(gè)小時(shí)之后,這些儀器將沉到海床上,開始挖掘,直到把自己埋進(jìn)深深的淤泥中。工作完成后,馬達(dá)會(huì)推動(dòng)它們回到海面上。整個(gè)取樣過程會(huì)持續(xù)十天,所有人二十四小時(shí)輪班工作。每個(gè)人都希望這些帶回的寶貝能在醫(yī)藥界力挽狂瀾,把埋藏了幾百萬年的生命力釋放出來。

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