姜艷芝,張連峰
(鄭州大學第一附屬醫(yī)院消化內科 河南鄭州 450052)
長鏈非編碼RNA(long non-coding RNA,lncRNA)是一類長度超過200 nt的非編碼RNA分子,在基因組印記、轉錄和轉錄后水平發(fā)揮重要的調控作用。人母系表達基因(Maternally Expressed Gene 3,MEG-3)是一種母系印記基因編碼的lncRNA,近年研究發(fā)現其在多種人類腫瘤中發(fā)揮抑癌作用,進一步的研究證實其發(fā)揮抑癌作用與DNA甲基化、p53基因表達、Rb途徑、cAMP途徑以及影響血管生成有關。本文總結了近年來國內外關于MEG-3的研究報道,對其在腫瘤中的抑癌作用做一綜述,希望為lncRNA在腫瘤中的診斷及治療提供新的思路。
最新的全基因組調查及高通量轉錄組分析發(fā)現,人類基因組只包括大約20 000個蛋白編碼基因,僅占總基因組的1%~2%,剩余可以穩(wěn)定轉錄的部分稱為非編碼RNA,包括管家非編碼RNA(如tRNA、rRNA及snoRNA等)和調節(jié)性非編碼RNA[1]。調節(jié)性非編碼RNA按其長度可分為短鏈非編碼RNA和lncRNA。近年來關于短鏈非編碼RNA的研究較多,如miRNA、siRNA、piRNA廣泛參與到許多生命過程,包括胚胎發(fā)育,機體新陳代謝,細胞增殖、分化、凋亡等,并與腫瘤的發(fā)生、發(fā)展和轉移密切相關[1-2]。而lncRNA的研究相對起步較晚。
lncRNA是一類轉錄長度超過200 nt的非編碼RNA分子,由于缺乏開放讀碼框而不能編碼蛋白質。越來越多的研究表明,lncRNA廣泛參與到不同的細胞生理過程,通過多種機制參與X染色體沉默、基因組印記、染色質修飾、轉錄激活、轉錄干擾以及核內運輸等[3]。另外,lncRNA還在細胞發(fā)育和分化中扮演重要的角色,并參與調節(jié)腫瘤的增殖和侵襲以及重組誘導多能干細胞[4-5]。失調的lncRNA已被證明參與多種腫瘤的形成及發(fā)展,如乳腺癌[4]、肝細胞癌[6]、膀胱癌[7]、胰腺癌[8]、肺癌[9]、腦膜瘤[10]等。其中 lncRNA HOTAIR已被確認與乳腺癌、肝癌、胰腺癌患者的預后密切相關,并影響乳腺癌的轉移[4,6,8]。近期的研究結果提示,lncRNA在腫瘤的形成中發(fā)揮原癌基因(如ANRIL)和抑癌基因(如 MEG-3)的作用[11-12]。
MEG-3是小鼠母系印記基因Gtl2的人類同系物,首次識別于小鼠12號染色體末端[13]。有研究表明,Gtl2的表達和調控在胚胎發(fā)育和出生后的生長發(fā)育中發(fā)揮重要作用[14]。MEG-3定位于人類染色體14q32.3,長約 1.6 kb,只在母源性基因上表達,基因組結構分析發(fā)現MEG-3/Gtl2由10個外顯子組成[15],可通過可變剪切形成多種mRNA亞型。
研究發(fā)現,MEG-3在人類多種正常組織高表達,如垂體和腦組織;在胎盤、腎上腺、胰腺、卵巢中也有表達[16]。近期研究表明,MEG-3 在胃癌[17-18]、肝癌[19]、膀胱癌[7]、肺癌[9]、腦膜瘤[10]和非功能性垂體腺瘤[16]中表達下調,并與腫瘤的發(fā)生和發(fā)展有關。MEG-3的啟動子區(qū)域富含CpG核苷酸,有資料表明,差異甲基化區(qū)域的高甲基化與腫瘤發(fā)生中的MEG-3沉默關系密切[10]。這些數據表明,MEG-3可能在一個特定的腫瘤發(fā)病機制中扮演重要的角色,但其發(fā)揮抑癌作用的具體機制仍在探索中。近年的研究發(fā)現,MEG-3發(fā)揮抑癌作用與DNA甲基化、p53基因表達調控、Rb途徑、cAMP途徑以及血管生成相關,通過多種途徑共同調節(jié),參與到抗腫瘤細胞的增殖及轉移過程中。
近年來,研究者在MEG-3的功能方面做了大量的研究。Zhao等[16]發(fā)現在無功能性垂體腺瘤中MEG-3表達缺失,進一步的檢測發(fā)現在MEG-3第一外顯子上游區(qū)域啟動子的甲基化水平較正常垂體明顯升高,而經甲基化抑制劑處理后,MEG-3的表達可以恢復,研究者由此推測MEG-3的表達與甲基化水平相關。Lu等[9]發(fā)現MEG-3在非小細胞肺癌組織和細胞系中表達下調,上調MEG-3后p53基因活性增高,提示MEG-3可能通過p53途徑抑制非小細胞肺癌細胞的增殖,并促進其凋亡。Braconi等[19]發(fā)現,MEG-3可作為miR-29的靶分子調控肝癌細胞的生長。胃癌相關研究發(fā)現,MEG-3下調與不良預后和促進細胞增生有關,還發(fā)現miR-148a可以通過甲基化調控MEG-3,進而影響胃癌的進展[17-18]。另外,在膀胱癌[7]、無功能性垂體腺瘤[16]、急性白血病和多發(fā)性骨髓瘤[20]等方面均做了大量研究,研究結果顯示,MEG-3可通過多種途徑在眾多人類腫瘤中發(fā)揮抑癌作用。
3.1 MEG-3與甲基化狀態(tài) 甲基化是表觀遺傳學的一種重要調控形式,目前已經證實,DNA甲基化與腫瘤發(fā)生密切相關。MEG-3在多種人類腫瘤中表達缺失,與MEG-3啟動子區(qū)域的高甲基化以及基因間的差異甲基化區(qū)域(DMR)關系密切[6,9]。Zhao 等[16]發(fā)現MEG-3在人類垂體無功能性腺瘤中表達缺失,然而其基因組未發(fā)現明顯異常。經檢測發(fā)現,MEG-3基因5’端富含CpG二核苷酸,其中大量DNA發(fā)生甲基化,提示甲基化在MEG-3表觀遺傳調控中可能發(fā)揮重要作用。進一步的研究顯示,將腫瘤細胞暴露于去甲基化藥物后發(fā)現MEG-3恢復表達,提示MEG-3基因功能區(qū)域的DNA甲基化與其在垂體無功能性腺瘤中的表達缺失有關。Benetatos等[20]也證實,在急性髓系白血病(AML)患者和骨髓增生異常綜合征(MDS)患者中,MEG-3差異甲基化區(qū)域的CpG島甲基化與沒有發(fā)生甲基化的對照組相比,總體生存率明顯下降,但對AML患者的影響更為顯著。此外,繼發(fā)于 MDS的AML患者中約有50%發(fā)生MEG-3甲基化,而MDS患者僅有34.9%。這些發(fā)現表明,MEG-3異常甲基化可能與疾病的進展有關[20]。
3.2 MEG-3與p53途徑 抑癌基因p53在腫瘤抑制中起著核心作用,并且能夠介導許多其他抑癌因子的功能。p53蛋白是一個不穩(wěn)定的小分子蛋白,主要在核內發(fā)揮作用,可誘導細胞周期停滯、復制性衰老及凋亡[21]。小鼠雙微基因2(MDM2)是細胞內調節(jié)p53蛋白濃度及活性的重要基因,MDM2和E3泛素連接酶的調節(jié)作用可促進p53降解[21]。Zhou等[21]利用結腸癌細胞系和骨肉瘤細胞系的研究發(fā)現轉染MEG-3及其亞型結構后p53蛋白的表達水平顯著增加,同時可以刺激p53應答的啟動子轉錄。進一步的研究發(fā)現,MEG-3可以通過促進p53與生長轉化因子(Growth differentiation factor,GDF)基因啟動子的結合刺激GDF15的表達。然而MEG-3對P21CIP1的表達無明顯影響,提示 MEG-3能調節(jié) p53特定的轉錄活性。p53的降解主要由 MDM2介導,通過細胞轉染上調MEG-3的表達后MDM2的水平下降,提示MDM2至少部分介導了MEG-3對p53的調節(jié)作用。研究還發(fā)現,MEG-3在 p53缺失時仍可以抑制細胞增生,說明MEG-3作為一個抑癌因子,其發(fā)揮作用除了可通過p53依賴途徑外,還存在其他的調節(jié)途徑。
3.3 MEG-3與Rb途徑 視網膜母細胞瘤Rb基因是一個經典的腫瘤抑制基因,位于染色體13q14.2,主要參與細胞周期調控、細胞分化、衰老和凋亡[22]。這個基因的產物核磷酸化蛋白pRb可以控制細胞G期進入S期,導致細胞G1期停滯[22]。pRb的功能隨磷酸化水平的變化呈周期性改變,pRb是否具有功能取決于其磷酸化的水平,低磷酸化是其活化狀態(tài)[22]。已有研究證明MEG-3可以抑制腫瘤細胞的增生。Zhang等[23]發(fā)現,在抑癌基因p53缺失時,Rb16在MEG-3介導的抑制腫瘤細胞增生中發(fā)揮著重要的作用。MEG-3可通過直接靶向作用于Rb以及通過調控Rb的正性調控因子p16-INK4影響Rb的磷酸化水平,進而發(fā)揮其抑制腫瘤細胞增生的作用。由此看來,MEG-3除通過p53依賴和非p53依賴途徑外,也可能通過Rb相關的其它途徑發(fā)揮抑癌作用。
3.4 MEG-3與cAMP 環(huán)磷酸腺苷(cyclic AMP,cAMP)是一個普遍存在的第二信使,通過cAMP依賴的蛋白激酶激活能力增加各種靶蛋白的磷酸化水平,進而調節(jié)細胞的生長、分化和凋亡[24]。研究結果顯示,經cAMP處理的人類成纖維細胞HS-27的MEG-3 mRNA水平與未處理組相比大幅增高,這個結論表明MEG-3抑制細胞增生的功能可能與cAMP有關[25]?;蛉笔Ш屯蛔兎治鼋Y果表明,在MEG-3啟動子區(qū)域的近端-69~-49之間存在一個 cAMP反應元件(CREB)結合位點,在MEG-3的啟動子活化過程中發(fā)揮著重要的作用[25]。另外,Northern blot分析證明在人類成纖維細胞系中提高cAMP的表達水平可以刺激MEG-3的表達。進一步的研究發(fā)現,凝膠轉移、芯片分析以及共轉染試驗證明,CREB可以直接結合于CRE位點并刺激 MEG-3啟動子的活性[25]。由此說明,MEG-3是cAMP的一個下游靶基因。另一方面,啟動子高甲基化可以阻止cAMP反應元件結合蛋白家族與其結合,最終抑制MEG-3的轉錄[25]。綜合分析發(fā)現,MEG-3可能通過cAMP依賴的途徑參與調節(jié)細胞增殖以及其他cAMP相關的功能調節(jié)。
3.5 MEG-3與血管生成 腫瘤新生血管形成是腫瘤進展的重要因素之一,近期的研究發(fā)現lncRNA通過缺氧誘導因子(HIF)、VEGF/VEGFR、Ang/tie和Notch信號參與血管生成[26]。Gordon 等[26]研究證實,MEG-3可促進腦血管的形成。研究者通過對比MEG-3敲除型小鼠和MEG-3野生型小鼠的基因表達譜,發(fā)現在MEG-3敲除型小鼠中,血管內皮生長因子(VEGF)信號通路中的Vegfa、Vegfr1、Iqgap1和Was1上調明顯,同時Notch信號通路Hes1和Dll4的表達也明顯增高。既往研究已經證實,VEGF信號通路可調控血管內皮細胞的增殖、存活和遷移,Notch信號通路能夠增加新生血管的穩(wěn)定性,調控細胞的分化和遷移。敲除MEG-3后解除了MEG-3對VEGF和Notch的抑制作用后腦血管生成增加,說明MEG-3對腫瘤血管生成的潛在抑制作用是其抑制腫瘤發(fā)生和發(fā)展的機制之一。
總之,在過去的幾年中,研究者在MEG-3的功能方面做了大量的研究。在非小細胞肺癌[9]、肝癌[19]、胃癌[17-18]、膀胱癌[7]、無功能性垂體腺瘤[16]以及急性白血病和多發(fā)性骨髓瘤[20]等多個人類腫瘤中均發(fā)現MEG-3的表達異常。對于MEG-3的深入研究進一步揭示了lncRNA在生物學方面的作用及機制,關于lncRNA和miRNA調控關系的研究也為探索非編碼RNA的調控網絡提供了新的方向。綜合目前的研究,對于MEG-3在多種疾病中的功能已經做出了較為廣泛的研究,然而其作用的具體機制以及與其他轉錄因子、非編碼RNA等的轉錄調控關系的研究還不夠深入。另外,已經發(fā)現MEG-3對腫瘤的生物學特性有明確的影響,那么其在腫瘤的治療中又有怎樣的價值,值得我們深思及進行更深一層的研究。
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