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        快速DNA提取環(huán)介導(dǎo)等溫擴增技術(shù)檢測結(jié)核分枝桿菌的成本分析

        2014-03-23 03:32:46歐喜超夏輝李強逄宇趙冰張治英李俊晨章建康池俊英趙雁林
        中國防癆雜志 2014年7期
        關(guān)鍵詞:耗材試劑結(jié)核病

        歐喜超 夏輝 李強 逄宇 趙冰 張治英 李俊晨 章建康 池俊英 趙雁林

        結(jié)核病的早期診斷,對于很好地控制結(jié)核病的傳播具有十分重要的意義。固體培養(yǎng)具有很高的診斷價值,但耗時較長,至少需要6~8周的時間。近年來涌現(xiàn)出很多新的技術(shù)和方法用于結(jié)核分枝桿菌的快速診斷及鑒定[1-2]。然而除了檢測效能,檢測成本也是制約各種技術(shù)或方法能否推廣的決定性因素之一。結(jié)核分枝桿菌快速DNA提取環(huán)介導(dǎo)等溫擴增檢測技術(shù)(procedure for ultra rapid extraction of loop-mediated isothermal amplification, PURE-LAMP;Eiken Chemical,日本)是一種基于分子生物學(xué)原理的快速檢測試劑盒,整個試劑盒采用封閉的反應(yīng)體系,在反應(yīng)體系內(nèi)加入2條內(nèi)引物和2條外引物,67 ℃等溫擴增40 min,然后通過紫外線照射觀察熒光強度進行結(jié)果判斷[3]。國內(nèi)外的相關(guān)研究表明,PURE-LAMP檢測操作簡單、檢測準確性高,非常適合在實驗室條件不足或技術(shù)力量薄弱的結(jié)核病高負擔(dān)地區(qū)應(yīng)用[4]。目前尚缺乏關(guān)于PURE-LAMP檢測成本的相關(guān)報道,本研究通過對比傳統(tǒng)固體培養(yǎng)法和PURE-LAMP檢測的成本,從成本角度出發(fā),評估PURE-LAMP檢測在我國縣(區(qū))級實驗室應(yīng)用的可行性。

        材料和方法

        一、研究資料的來源

        選取項目指定的河南省新鄉(xiāng)市結(jié)核病防治(簡稱“結(jié)防”)所、獲嘉縣CDC以及河南省CDC作為研究現(xiàn)場。2011年3月至2012年2月,新鄉(xiāng)市結(jié)防所和獲嘉縣CDC共連續(xù)納入1378例臨床初診肺結(jié)核可疑患者,新鄉(xiāng)市923例,獲嘉縣455例。實驗室對每份納入患者痰標本同時進行固體培養(yǎng)和PURE-LAMP檢測,培養(yǎng)陽性的菌株4 ℃冰箱保存,每月送至河南省CDC完成對硝基苯甲酸(PNB)菌群鑒定。為保證鑒定結(jié)果的準確性,每批固體培養(yǎng)陽性菌株在鑒定前需要進行傳代復(fù)蘇。

        二、研究方法

        每例納入患者留取3份痰標本(即時痰、夜間痰和晨痰),實驗室工作人員對晨痰和夜間痰進行固體培養(yǎng)試驗和PURE-LAMP檢測,培養(yǎng)陽性菌株送至河南省CDC,對每例患者選取生長狀態(tài)最好的1管陽性菌株進行傳代培養(yǎng)和菌群鑒定試驗。

        1. 結(jié)核分枝桿菌的傳統(tǒng)固體培養(yǎng):遵照《分枝桿菌分離培養(yǎng)標準化操作程序及質(zhì)量保證手冊》[5]中的標準化操作程序,將每份處理后痰標本接種到2支商品化固體改良羅氏培養(yǎng)管中,培養(yǎng)基購自珠海貝索生物技術(shù)有限公司。

        2. 菌群鑒定:采取PNB法進行菌群鑒定,具體操作參照《結(jié)核病診斷實驗室檢驗規(guī)程》[6]中的標準化操作程序執(zhí)行。接種后3 d 觀察結(jié)果,以后每周觀察1次,直至孵育4周,同時記錄PNB培養(yǎng)基和中性改良羅氏培養(yǎng)基上菌落生長情況。在PNB培養(yǎng)基上未見菌落生長即為結(jié)核分枝桿菌復(fù)合群感染,生長則為非結(jié)核分枝桿菌感染。

        3. PURE-LAMP檢測:使用PURE-LAMP法熒光檢測試劑盒,按照日本榮研化學(xué)公司提供的標準化操作手冊進行操作[7]。

        4.“要素法”成本分析:收集檢測整個過程(從實驗室接收標本到報告結(jié)果和廢棄物處理等)所有直接和間接成本[8],涉及以下幾方面要素:(1)管理費:維持實驗室正常運轉(zhuǎn)的基本費用,如水、電、辦公費、清潔、廢棄物和垃圾處理、安保等;(2)建筑費:實驗室建筑、改造及維修費用;(3)設(shè)備費:儀器設(shè)備的購買、維修、維護費用;(4)人員費:從事檢測相關(guān)人員工資、福利、津貼費用;(5)試劑費:檢測相關(guān)試劑費用;(6)耗材費:耗材及個人防護相關(guān)費用。

        為了有效核算相關(guān)成本,需要針對實驗室檢測的所有步驟和程序分別收集相關(guān)數(shù)據(jù),進行評估。固體培養(yǎng)試驗包括試劑準備、標本收集登記、培養(yǎng)操作、培養(yǎng)結(jié)果觀察登記和廢棄物處理等步驟。PNB菌群鑒定試驗包括試驗試劑耗材準備、鑒定試驗操作、結(jié)果觀察登記、廢棄物處理等步驟;PURE-LAMP試驗包括試劑準備、前處理及核酸擴增檢測幾個過程。

        實驗人員按照要求在3個不同工作日,分別記錄3次高、中和低不同工作量情況下傳統(tǒng)固體培養(yǎng)、PURE-LAMP檢測和PNB菌群鑒定試驗全過程中的資源使用情況,各要素的成本以試驗過程中使用的各要素的數(shù)量乘以各要素的單位價格。其中資本性費用如實驗室空間、建筑物和設(shè)備等,其單位價格根據(jù)其采購價格和預(yù)計的使用年限按照年度折算;管理費用的計算是根據(jù)實驗室工作人員數(shù)量、人員工作時間和其他與該系統(tǒng)相關(guān)的基礎(chǔ)設(shè)施、建筑物的使用狀況,將相關(guān)費用分配到各次檢測中。PURE-LAMP檢測試劑的價格采用項目采購價格106元計算,固體培養(yǎng)和菌群鑒定相關(guān)耗材的價格采用目前市場采購價格。

        結(jié) 果

        一、每份痰標本固體培養(yǎng)和PURE-LAMP檢測成本分析

        固體培養(yǎng)和PURE-LAMP檢測的單位檢測平均成本分別為51.10和120.90元,均以試劑費和耗材費所占比例較高,新鄉(xiāng)市固體培養(yǎng)檢測成本略高于獲嘉縣,主要是由于新鄉(xiāng)市的管理成本、人員費和耗材費用較高,新鄉(xiāng)市和獲嘉縣PURE-LAMP檢測平均建筑費分別為0.0042和0.0027元(表1)。

        二、每例菌株傳代和菌群鑒定試驗成本分析

        菌株傳代和PNB菌群鑒定的單位檢測成本分別為21.37和56.68元(表2)。

        三、每例患者傳統(tǒng)方法檢測和PURE-LAMP檢測成本分析

        傳統(tǒng)方法檢測每例患者是否感染結(jié)核分枝桿菌(2份培養(yǎng),1份傳代,1份PNB鑒定試驗)需要180.25元,PURE-LAMP檢測每例患者是否感染結(jié)核分枝桿菌需要120.90元,比傳統(tǒng)方法低59.35元。

        四、不同檢測準確度及患病流行率不同時, PURE-LAMP檢出每例結(jié)核病患者的成本

        計算在不同結(jié)核病患病流行率的可疑人群中,與固體培養(yǎng)試驗相比,不同敏感度和特異度的PURE-LAMP檢出1例結(jié)核病患者的平均成本,平均成本=PURE-LAMP檢測成本/[(1-流行率)×(1-特異度)+流行率×敏感度)]。可疑人群中結(jié)核病流行率越高,應(yīng)用固體培養(yǎng)和PURE-LAMP檢測檢出1例結(jié)核病患者的單位成本越低。當PURE-LAMP檢測特異度為95%時,只要敏感度高于60%,在結(jié)核病患病率低于50%的人群中,PURE-LAMP檢出1例結(jié)核病患者的平均成本均低于傳統(tǒng)方法(固體培養(yǎng)和PNB菌群鑒定試驗)(圖1)。

        五、PURE-LAMP檢測設(shè)備和試劑耗材價格變化時對單位檢測成本的影響

        由于PURE-LAMP檢測設(shè)備和試劑價格在整個成本中占有較大比重,并且對于將來市場推廣具有一定影響,因此在項目使用的設(shè)備及試劑價格基礎(chǔ)上,調(diào)整了50%、80%、100%、120%、150%和200%,分析價格變化對檢測成本的影響。結(jié)果顯示,當LAMP檢測設(shè)備價格分別調(diào)整為現(xiàn)有價格的50%時,單位檢測成本僅下降了0.17元,而當設(shè)備價格為現(xiàn)價格的200%時,單位檢測成本較現(xiàn)有價格僅上升了0.38元,設(shè)備價格的變化對單位檢測的成本影響不大;但是,當調(diào)整檢測試劑為現(xiàn)價格的200%時,單位檢測成本將增加108.86元,達到229.76元,單位檢測成本隨試劑價格的變化幅度比較大。

        討 論

        本研究采用“要素法”成本分析比較了在我國縣(區(qū))級結(jié)核病實驗室固體培養(yǎng)和PURE-LAMP檢測分別用于結(jié)核病診斷的成本。整個研究從衛(wèi)生服務(wù)的角度出發(fā),分析與固體培養(yǎng)和PURE-LAMP檢測相關(guān)的直接和間接的貨幣成本。研究發(fā)現(xiàn)固體培養(yǎng)管理費、建筑費和耗材費均顯著高于PURE-LAMP檢測,但是PURE-LAMP檢測設(shè)備和試劑價格較高,導(dǎo)致PURE-LAMP檢測單位成本費用高于固體培養(yǎng)。目前,我國縣(區(qū))級實驗室不具備開展菌群鑒定和藥物敏感性試驗(簡稱“藥敏試驗”)的能力,固體培養(yǎng)陽性菌株需要送到省參比實驗室完成菌群鑒定,導(dǎo)致檢測時間和檢測成本均顯著增加。之前有研究表明,取患者1份痰標本進行PURE-LAMP檢測即可達到很好的檢測效能[7]。因此,本研究中每例患者PURE-LAMP檢測成本按照1份痰標本檢測進行計算。綜合考慮每例結(jié)核病患者的實際診斷情況,PURE-LAMP檢測成本低于固體培養(yǎng)。

        一、固體培養(yǎng)和PURE-LAMP檢測成本影響因素分析

        通過此次研究,筆者發(fā)現(xiàn)諸多因素可能會影響到固體培養(yǎng)和PURE-LAMP檢測的成本。首先,PURE-LAMP檢測的診斷周期為2 h,而固體培養(yǎng)需要4~8周,這將導(dǎo)致固體培養(yǎng)與時間相關(guān)的成本包括管理費、人員費、儀器費等成本顯著上升;其次,兩個實驗室不同檢測成本也呈現(xiàn)出地域差異,其中新鄉(xiāng)市工作人員工資水平更高,這使得新鄉(xiāng)市的人員成本顯著高于獲嘉縣。此外,兩個項目點管理費用差別也較大,實驗所用耗材為當?shù)刈孕胁少?,因此,在耗材方面兩個實驗室之間也表現(xiàn)出一定的差異。

        表1 不同地區(qū)每份痰標本固體培養(yǎng)和PURE-LAMP檢測的單位檢測成本(人民幣:元)

        表2 河南省CDC進行傳代和PNB菌群鑒定的單位檢測成本(人民幣:元)

        Se:敏感度;Sp:特異度

        二、固體培養(yǎng)和PURE-LAMP檢測成本效益比較

        除了更低的價格,PURE-LAMP檢測比傳統(tǒng)固體培養(yǎng)還有諸多優(yōu)勢。首先,PURE-LAMP檢測用時更短。其次,PURE-LAMP檢測采用封閉的反應(yīng)體系,擴增產(chǎn)物無需開蓋通過肉眼觀察就可判讀結(jié)果,降低了污染發(fā)生的可能性。其三,PURE-LAMP檢測更符合生物安全要求;PURE-LAMP檢測是一種基于核酸檢測的方法,因此其安全性優(yōu)于傳統(tǒng)的涂片鏡檢和固體培養(yǎng)。綜合考慮其成本和這些相關(guān)因素,PURE-LAMP檢測是一種更符合成本-效益的結(jié)核分枝桿菌檢測方法。

        三、研究局限性

        本研究中存在幾個明顯的不足。首先,本研究雖然分析了兩種檢測方法的成本,但由于后期效益(包括患者發(fā)現(xiàn)后治療及傳播風(fēng)險等因素)沒有加以考慮,因此本研究進行的成本-效益分析不夠全面;其次,在分析單個結(jié)核病患者的發(fā)現(xiàn)費用時,僅從成本角度考慮,但在實際臨床檢測中,當敏感度低于50%的檢測方法無實際使用價值。因此,后續(xù)深入研究將圍繞如何建立模型評估快速診斷的社會經(jīng)濟效益等方面展開。

        總之,本研究表明在目前現(xiàn)有情況下,PURE-LAMP檢測是一種比傳統(tǒng)固體培養(yǎng)試驗更經(jīng)濟更快速的結(jié)核分枝桿菌檢測方法。如果生產(chǎn)廠商在未來能夠降低市場價格并優(yōu)化產(chǎn)品性能,將更有利于PURE-LAMP檢測在縣(區(qū))級結(jié)核病診斷實驗室的推廣。

        志謝河南省CDC、新鄉(xiāng)市結(jié)防所和獲嘉縣CDC工作人員在數(shù)據(jù)收集過程中給予了支持和配合。美國帕斯適宜衛(wèi)生科技組織在數(shù)據(jù)分析和撰寫過程中給予了幫助。Hojoon Sohn在方案設(shè)計中給予了大力幫助

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