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        一株枯草芽孢桿菌對芘的降解特性及代謝途徑的研究

        2014-03-21 06:26:20靳競男
        化學(xué)與生物工程 2014年5期
        關(guān)鍵詞:生長環(huán)境

        姚 俊,喻 嬋,靳競男

        (北京科技大學(xué)土木與環(huán)境工程學(xué)院環(huán)境與能源國際合作基地,北京100083)

        多環(huán)芳烴(polycyclic aromatic hydrocarbons,PAHs)是常見的一類環(huán)境污染物[1-2],廣泛分布于水體、空氣及土壤中。由于其在環(huán)境中的半衰期較長和致癌、致畸、致突變的性質(zhì)而日益受到人們的重視[3]。PAHs具有較低的水溶性[4],高分子量的PAHs在環(huán)境中的存留時(shí)間較長,導(dǎo)致這類化合物在環(huán)境中很難被去除[5]。美國環(huán)保局在20世紀(jì)80年代初將16種未帶分支的PAHs確定為環(huán)境中的優(yōu)先控制污染物[6]。利用微生物去除環(huán)境中的PAHs因費(fèi)用低、易操作及不造成二次污染而逐漸成為研究熱點(diǎn)[7]。

        作者從大港油田原油樣品中篩選獲得1株可以以芘(代表性PAHs)作為唯一碳源和能源進(jìn)行生長的菌株,對其降解特性和降解產(chǎn)物進(jìn)行了測定,進(jìn)一步提出了該菌株對芘的降解代謝途徑。

        1 實(shí)驗(yàn)

        1.1 樣品及培養(yǎng)基

        原油樣品取自大港油田港西區(qū)塊58-8-3#油井。

        無機(jī)鹽培養(yǎng)基(g·L-1)[8]:(NH4)2SO43,KH2PO40.5,Na2HPO4·12H2O 1.26,MgSO4· 7H2O 0.54,F(xiàn)eCl3·6H2O 0.05,F(xiàn)eSO4·7H2O 0.03,MnSO4·H2O 0.015,ZnSO4·7H2O 0.024,CoCl2· 6H2O 0.366,調(diào)節(jié)pH值至7.2~7.4。固體培養(yǎng)基中添加2%的瓊脂,121℃滅菌30min。

        LB培養(yǎng)基(g·L-1):胰蛋白胨10,酵母粉5,NaCl 10,調(diào)節(jié)pH值至7.0。固體培養(yǎng)基中添加2%的瓊脂,121℃滅菌30min。

        1.2 菌種篩選

        將樣品以2%的接種量接種于以芘為唯一碳源的無機(jī)鹽培養(yǎng)基中,好氧條件下于28℃、180r·min-1搖床培養(yǎng)7d,相同條件下轉(zhuǎn)接1次。采用稀釋涂平板法涂于以芘為唯一碳源的無機(jī)鹽固體培養(yǎng)基上,于28℃恒溫?fù)u床培養(yǎng)7d形成單菌落。挑取生長迅速、邊緣整齊的菌落接入無機(jī)鹽培養(yǎng)基中,搖瓶復(fù)篩,得到目的菌株。

        1.3 芘降解菌株的鑒定

        將目的菌株在28℃LB培養(yǎng)基中振蕩培養(yǎng)至對數(shù)生長期,取1.5mL培養(yǎng)液以12 000r·min-1離心,收集菌體。采用OMEGA公司提供的細(xì)菌基因組DNA小量快速提取試劑盒提取該菌株的總DNA,將其置于-20℃保存,備用。

        以總DNA為模板,采用引物27F(5′-AGAGTT TGATCCTGGCTCAG-3′)和1492R(5′-GGTTACCTTGTTACGACTT-3′)[9]進(jìn)行PCR擴(kuò)增。反應(yīng)體系20μL,其中PCR mix 10μL,總DNA 0.5μL,正、反引物各0.4μL,ddH2O 8.7μL。PCR擴(kuò)增程序?yàn)椋?4℃預(yù)變性5min;94℃變性30s,56℃退火30s,72℃延伸90s,35個(gè)循環(huán);最后72℃延伸10min。PCR產(chǎn)物經(jīng)過純化后,進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳。

        16SrDNA序列由華大基因公司測定。測定結(jié)果在GenBank上與已知種屬的16SrDNA序列進(jìn)行Blast比對[10],利用Mega4對獲得的同源性序列進(jìn)行分析并構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹。

        1.4 菌株生長曲線的測定

        目的菌株經(jīng)LB液體培養(yǎng)基活化后,取1mL菌液接種于芘濃度為100mg·L-1的50mL無機(jī)鹽培養(yǎng)基中進(jìn)行培養(yǎng),待OD600≈0.25時(shí),以2%的接種量接入以芘為唯一碳源的無機(jī)鹽培養(yǎng)基中,于28℃、180r ·min-1進(jìn)行培養(yǎng),每個(gè)樣品做3個(gè)平行,以未接菌株的無機(jī)鹽培養(yǎng)基為空白,每2d測1次OD600。

        1.5 芘降解率的測定

        活化菌株在芘濃度為100mg·L-1的培養(yǎng)基中進(jìn)行培養(yǎng),待OD600≈0.25時(shí),以2%的接種量接入以芘為唯一碳源的無機(jī)鹽培養(yǎng)基中,于28℃、180r· min-1進(jìn)行培養(yǎng)。取5mL正己烷與5mL菌液混合,超聲數(shù)分鐘后,靜置約10min分層。收集上層有機(jī)相和下層水相。重復(fù)此操作2次,合并有機(jī)相,棄下層水相。將有機(jī)相過無水硫酸鈉柱除去水分,蒸發(fā)濃縮至2mL,進(jìn)行GC-MS分析。

        1.6 芘降解代謝產(chǎn)物的測定

        GC-MS條件:進(jìn)樣口無分流模式,溫度250℃,HP-5彈性石英毛細(xì)管色譜柱(30m×0.25mm,0.25 μm),柱子流量為1.1mL·min-1,爐溫60℃保持1 min,以15℃·min-1升到150℃保留1min,再以6℃·min-1升到320℃保留10min。進(jìn)樣口和檢測器的溫度分別為250℃和300℃。載氣(氦氣)流速為1.1mL·min-1。空白樣品為未接菌的樣品。

        2 結(jié)果與討論

        2.1 菌株的鑒定

        經(jīng)過富集、馴化及純化,篩選得到1株芘降解菌株,命名為USTB-Y。菌體形態(tài)為桿狀,菌落呈圓形,邊緣呈鋸齒狀,中間凸起,乳黃色,表面光滑,濕潤。

        將測得的16SrDNA序列在GenBank中進(jìn)行Blast比對,獲得的同源性序列均為Bacillus屬,其中與Bacillus amyloliquefaciens strain BC7的同源性高達(dá)97%。進(jìn)一步構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹,確定該菌株在所屬種屬中的親緣關(guān)系,如圖1所示。

        圖1 芘降解菌USTB-Y的系統(tǒng)進(jìn)化樹Fig.1 Phylogenetic positions of USTB-Y on 16SrDNA analysis

        從圖1可以看出,USTB-Y和Bacillus amyloliquefaciens strain BC7的親緣關(guān)系最近,可以推斷此菌株屬于芽孢桿菌屬。

        2.2 菌株USTB-Y對芘的降解特性(圖2)

        圖2 菌株USTB-Y的生長曲線及芘降解率隨時(shí)間變化曲線Fig.2 The growth curve of strain USTB-Y and the variation curve of pyrene degradation rate with time

        從圖2可以看出,菌株USTB-Y在以芘為唯一碳源的無機(jī)鹽培養(yǎng)基中生長經(jīng)歷延遲期、對數(shù)期、穩(wěn)定期及衰亡期這4個(gè)時(shí)期,在第8d時(shí)生長速率達(dá)到最快,OD600值為0.206,較以LB為培養(yǎng)基時(shí)的生長速率慢,可能是由于無機(jī)鹽培養(yǎng)基是一種缺陷型培養(yǎng)基,細(xì)菌在此培養(yǎng)基中生長能力較差。

        從圖2還可以看出,菌株USTB-Y逐漸降解芘,在16d時(shí)對芘的降解率高達(dá)約56%,由于此時(shí)培養(yǎng)基中的菌株大部分處于衰亡期,所以基本認(rèn)為測定的降解率為最高。表明,USTB-Y是1株能夠有效降解芘的菌株。

        2.3 芘降解代謝產(chǎn)物的測定

        通過GC-MS分析,檢測到菌株USTB-Y對芘的降解過程中產(chǎn)生的一系列代謝產(chǎn)物,如圖3所示。

        從圖3可以看出,檢測到的代謝產(chǎn)物有1-羥基芘、芘酮、鄰苯二甲酸酯和1-羥基苯。

        根據(jù)所檢測到的代謝產(chǎn)物,參考Bacillus amyloliquefaciens strain BC7,推測菌株USTB-Y降解芘可能存在的代謝途徑,如圖4所示。

        圖3 菌株USTB-Y降解芘的代謝產(chǎn)物Fig.3 The metabolites formed from pyrene utilization by strain USTB-Y

        圖4 菌株USTB-Y降解芘的可能代謝途徑Fig.4 Proposed pathway for the degradation of pyrene by strain USTB-Y

        從圖4可以看出,菌株USTB-Y以芘為唯一碳源和能源進(jìn)行生長的過程中,芘的芳香環(huán)上4位的碳首先受到單加氧酶或雙加氧酶的攻擊,形成水二醇;進(jìn)一步轉(zhuǎn)化為1-羥基芘,接著轉(zhuǎn)化為芘酮或其它代謝產(chǎn)物;再進(jìn)一步降解形成鄰苯二甲酸酯,轉(zhuǎn)化為鄰苯二甲酸,最終進(jìn)入三羧酸循環(huán)被完全降解。

        3 結(jié)論

        自大港油田港西區(qū)塊58-8-3#油井原油樣品中篩選得到1株能以芘為唯一碳源和能源生長的菌株USTB-Y。形態(tài)鑒定及16SrDNA鑒定表明,此菌株屬于芽孢桿菌屬,與Bacillus amyloliquefaciens strain BC7的同源性高達(dá)97%。對其生長曲線及對芘的降解率測定表明,在以芘為唯一碳源的無機(jī)鹽培養(yǎng)基中培養(yǎng)16d后,芘的降解率高達(dá)56%,被認(rèn)為是對芘具有高效降解效果的菌株。進(jìn)一步對菌株USTB-Y降解芘的代謝產(chǎn)物進(jìn)行測定,提出了該菌株降解芘的可能代謝途徑。

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