何鐵光等
摘 要:用辣椒耐熱自交系A(chǔ)11和熱敏自交系B22配置雜交組合,通過高溫脅迫處理鑒定其F2代分離群體的耐熱性。從123對(duì)Taq I/Ase I引物組合中篩選出6對(duì)多態(tài)性好的引物對(duì)F2代耐熱、熱敏植株進(jìn)行AFLP分析,共擴(kuò)增出約11 400條清晰條帶,其中2條為穩(wěn)定的差異,初步獲得了2個(gè)與辣椒耐熱性狀相關(guān)的AFLP分子標(biāo)記。研究有助于開展辣椒耐熱基因的分子標(biāo)記輔助選擇工作,提高辣椒育種效率和水平,并為分離和克隆辣椒耐熱相關(guān)功能基因奠定基礎(chǔ)。
關(guān)鍵詞:辣椒;耐熱基因;AFLP分析
中圖分類號(hào):Q785;S641.3 文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼:A 文章編號(hào):1001-3547(2014)04-0024-03
辣椒(Capsicum annuum L.)原產(chǎn)于中南美洲,屬于茄科(Solanaceac)辣椒屬(Capsicum)。辣椒是重要蔬菜作物,在世界各地廣泛栽培,因其營(yíng)養(yǎng)豐富、富含維生素C等營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)而深受人們喜愛[1]。我國(guó)是世界辣椒種植面積最大的國(guó)家,國(guó)內(nèi)的種植面積僅次于大白菜,屬于第二大蔬菜作物。近年來(lái),辣椒在華南地區(qū)也有了較大的種植面積,但廣西、海南等省份地處熱帶、亞熱帶地區(qū),四季高溫多雨,對(duì)辣椒的生長(zhǎng)發(fā)育造成了極大的影響,當(dāng)氣溫高于35℃時(shí),辣椒開花及結(jié)實(shí)均受到了明顯的影響,大大降低了辣椒的品質(zhì)和產(chǎn)量。近10多a來(lái),已有不少學(xué)者對(duì)高溫脅迫下辣椒的植株形態(tài)、生理生化指標(biāo)進(jìn)行了研究,但從分子水平系統(tǒng)研究辣椒耐熱特性的報(bào)道較少[2~6]。本研究以辣椒耐熱高代自交系A(chǔ)11與辣椒熱敏高代自交系B22雜交的F2代植株為材料,進(jìn)行了耐高溫脅迫后,選擇耐熱和熱敏的植株進(jìn)行AFLP分析,尋找與辣椒耐熱性狀相關(guān)的分子標(biāo)記,為辣椒耐熱相關(guān)功能基因的克隆分析及進(jìn)行分子標(biāo)記輔助育種提供基礎(chǔ)。
1 材料與方法
1.1 試驗(yàn)材料
植物材料為辣椒耐熱高代自交系A(chǔ)11與辣椒熱敏高代自交系B22雜交的F2代植株,采用大棚栽培和人工氣候箱盆栽方式種植。試驗(yàn)所需生化試劑、酶類購(gòu)自南寧宏泰、Fermentas公司及New Englad公司。AFLP分析所用接頭和引物由捷瑞公司合成,相關(guān)信息如下。
Ase I 接頭序列:5'-TAGGTACGCAGTCTAC-3'; 5'-CTCGTAGACTGCGTACC-3';Ase I 預(yù)擴(kuò)增引物序列:5'-CTCGTAGACTGCGTACCTAAT-3';Ase I 選擇性擴(kuò)增引物序列:5'-GACTGCGTACCTAATNNN-3', N 為A、T、C、G 堿基的任意一種。Taq I 接頭序列:5'-GACGATGAGTCCTGAC-3';5'-CGGTCAGGACTCAT-3';Taq I 預(yù)擴(kuò)增引物序列:5'-GACGATGAGTCCTGACCGA-3';Taq I 選擇性擴(kuò)增引物序列:5'-GATGAGTCCTGACCGANNN-3',N 為A、T、C、G 堿基的任意一種。
1.2 辣椒葉片總DNA的提取及酶切反應(yīng)
利用改良SDS法小量提取F2代耐熱及熱敏辣椒植株葉片的總DNA,對(duì)所提取的總DNA分別進(jìn)行抽提純化和電泳檢測(cè)。
利用限制性內(nèi)切酶Taq I和Ase I對(duì)總DNA進(jìn)行酶切反應(yīng),酶切產(chǎn)物回收純化后備用。
1.3 接頭退火及連接反應(yīng)
Ase I接頭和Taq I接頭退火,然后與DNA雙酶切反應(yīng)產(chǎn)物于16℃連接過夜,連接產(chǎn)物保存于
-20℃冰箱備用。
1.4 AFLP 分析
①預(yù)擴(kuò)增反應(yīng) 分別以所有樣品的連接產(chǎn)物為模板,用與Taq I接頭、Ase I接頭匹配的預(yù)擴(kuò)增引物進(jìn)行預(yù)擴(kuò)增反應(yīng),反應(yīng)程序是94℃ 5 min、94℃ 80 s、52℃ 60 s、72℃ 90 s,20個(gè)循環(huán);72℃ 10 min。預(yù)擴(kuò)增產(chǎn)物按需要進(jìn)行不同倍數(shù)的稀釋備用。
②選擇性擴(kuò)增 預(yù)擴(kuò)增產(chǎn)物分別稀釋成5倍、10倍、15倍和20倍的工作用液,篩選合適的擴(kuò)增模板濃度。利用選擇性擴(kuò)增引物對(duì)A11、B22雜交F2代辣椒植株進(jìn)行AFLP分析,94℃ 3 min;94℃ 80 s,65℃ 60 s,72℃ 90 s,每循環(huán)退火溫度下降0.7℃,反應(yīng)12個(gè)循環(huán);然后94℃ 3 min;94℃ 80 s,56℃ 60 s,72℃ 90 s,23個(gè)循環(huán);延伸72℃ 10 min。
③電泳檢測(cè) 配制6%丙烯酰胺變性凝膠,電泳及銀染參照王關(guān)林等[7]的方法。
2 結(jié)果與分析
2.1 辣椒葉片總DNA的提取
用SDS法從辣椒葉片中提取的總DNA的OD260/OD280比值在1.8左右,在1%的瓊脂糖凝膠中樣品帶清楚、凝膠背景清晰(圖1),經(jīng)過RNase A處理和酚/氯仿抽提后適用于酶切、連接等試驗(yàn)。
2.2 AFLP反應(yīng)體系的建立
在預(yù)擴(kuò)增反應(yīng)中,進(jìn)行濃度測(cè)定,根據(jù)濃度的大小稀釋10~20倍后用作AFLP預(yù)擴(kuò)增的模板,進(jìn)行預(yù)擴(kuò)增條件優(yōu)化研究。結(jié)果表明,以連接產(chǎn)物的10倍稀釋液為模板,擴(kuò)增20循環(huán)的效果最好,預(yù)擴(kuò)增產(chǎn)物主要集中在100~750 bp(圖2)。
選擇性擴(kuò)增以預(yù)擴(kuò)增產(chǎn)物稀釋15倍為模板,擴(kuò)增約35個(gè)循環(huán)效果較好(包括降落PCR部分)。循環(huán)數(shù)少,獲得的擴(kuò)增產(chǎn)物濃度低,在變性聚丙烯酰胺凝膠中條帶顏色較淺,通過延長(zhǎng)顯色時(shí)間可以增加條帶的清晰度,但是也導(dǎo)致了凝膠背景增加;循環(huán)數(shù)過多時(shí)擴(kuò)增產(chǎn)物的濃度過高和非特異條帶增多,變性凝膠中模糊的弱條帶增多,重復(fù)效果不穩(wěn)定。
2.3 辣椒耐熱基因的AFLP分析
本研究利用123對(duì)引物組合對(duì)辣椒耐熱、熱敏基因池進(jìn)行了引物篩選,從中選擇6對(duì)多態(tài)性較好的引物組合對(duì)辣椒F2代植株進(jìn)行AFLP分析。聚丙烯酰胺變性凝膠電泳結(jié)果顯示,每個(gè)樣品的擴(kuò)增條帶多數(shù)在30~70條,獲得11 400條穩(wěn)定、清晰條帶。其中A8T19和A12T15引物組合的擴(kuò)增結(jié)果中,耐熱辣椒品種中分別出現(xiàn)1條穩(wěn)定的差異條帶,推斷該差異條帶與辣椒耐熱性狀相關(guān),至于確切關(guān)系還有待進(jìn)一步分析驗(yàn)證。
3 討論與結(jié)論
AFLP分析多態(tài)性豐富、靈敏度高、重復(fù)性好[8,9],在植物分子標(biāo)記研究中應(yīng)用廣泛,但DNA模板的質(zhì)量高低及銀染操作水平均對(duì)其分析結(jié)果產(chǎn)生重要影響,尤其在銀染中無(wú)水碳酸鈉(Na2CO3)質(zhì)量、漂洗操作及顯色時(shí)間的控制對(duì)條帶的清晰度和凝膠的背景的影響尤為突出[10]。
辣椒材料的高溫脅迫試驗(yàn)結(jié)果的判定對(duì)利用AFLP技術(shù)分析辣椒耐熱性狀相關(guān)基因的結(jié)果有十分重要的影響。本研究的高溫脅迫試驗(yàn)中,在42℃、相對(duì)濕度75%的條件下保持一定時(shí)間后,根據(jù)辣椒植株的形態(tài)特征去判定F2代植株的耐熱性,主觀的判定標(biāo)準(zhǔn)會(huì)對(duì)AFLP分析結(jié)果產(chǎn)生影響;如能結(jié)合分析高溫脅迫下辣椒的生理生化指標(biāo),可以提高判定F2代植株的耐熱、熱敏性的準(zhǔn)確性[11]。在AFLP分析中耐熱、熱敏辣椒材料之間的差異條帶是否與耐熱性狀相關(guān)或連鎖還需要進(jìn)一步的回收克隆及進(jìn)行功能分析來(lái)加以確定。
參考文獻(xiàn)
[1] 顧曉慧.與辣椒抗根結(jié)線蟲N基因緊密連鎖的AFLP標(biāo)記的開發(fā)[D].呼和浩特:內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué),2006.
[2] 金新文,沈征言.高溫脅迫下三種蔬菜抗熱性不同的品種間葉片蒸騰強(qiáng)度作用的比較[J].石河子大學(xué)學(xué)報(bào):自然科學(xué)版,1997,1(3):195-198.
[3] 姚元干,石雪暉,楊建國(guó),等.辣椒葉片耐熱性生理生化指標(biāo)探討[J].湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào),1998,24(2):119-122.
[4] 賈志銀,鞏振輝,許紅娟,等.高溫脅迫對(duì)辣椒幼苗生長(zhǎng)及生理性狀的影響[J].北方園藝,2010(12):5-8.
[5] 姚元干,石雪暉,楊建國(guó),等.辣椒耐熱性與葉片質(zhì)膜透性及幾種生化物質(zhì)含量的關(guān)系[J].湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào),2000,26(2):97-99.
[6] 徐小萬(wàn),雷建軍,羅少波,等.高溫高濕對(duì)現(xiàn)蕾期辣椒不同品種抗氧化性差異研究[J].核農(nóng)學(xué)報(bào),2010,24(2):394-400.
[7] 王關(guān)林,張宏筠.植物基因工程[M].北京:科學(xué)出版社,2002.
[8] Kehoe D M, Villand P, Omerille S. DNA microarrays for studies of higher plants and other photosynthetic organisms[J]. Trends plant sci., 1999, 4(1): 38-41.
[9] Diachenko L B, Ledesma J, Chenchik A A, et al. Combining the technique of RNA fingerprinting and differential display to obtain differentially expressed mRNA[J]. Biochem Biophys Res Commun, 1996, 219(3): 824-828.
[10] 魏源文,鄧智年,黃誠(chéng)梅,等.乙烯利調(diào)控甘蔗基因的差異表達(dá)研究[J].南方農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào),2011,42(1):6-10.
[11] 何鐵光,董文斌,王愛勤,等.高溫脅迫下辣椒生理生化響應(yīng)機(jī)理初步探討[J].西南農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào),2013,26(2):541-544.