鄺筱珊,成曉維,游淑珠,王小玉,劉李登,馮家望
(珠海出入境檢驗(yàn)檢疫局檢驗(yàn)檢疫技術(shù)中心,廣東珠海 519015)
食品過敏原大豆成分LAMP實(shí)時(shí)濁度檢測法的建立
鄺筱珊,成曉維,游淑珠,王小玉,劉李登,馮家望*
(珠海出入境檢驗(yàn)檢疫局檢驗(yàn)檢疫技術(shù)中心,廣東珠海 519015)
根據(jù)過敏原大豆的保守內(nèi)源基因Lectin的序列,設(shè)計(jì)6條特異性LAMP引物,利用實(shí)時(shí)濁度儀對(duì)反應(yīng)體系中擴(kuò)增產(chǎn)物的實(shí)時(shí)監(jiān)控篩選出最佳引物,建立食品中過敏原大豆成分的環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增(LAMP)檢測方法,并對(duì)該方法的特異性、靈敏度、穩(wěn)定性進(jìn)行了評(píng)價(jià)。結(jié)果表明:該方法能夠特異性檢出食品中的過敏原大豆成分,特異性高,靈敏度達(dá)0.1%(w/w)。對(duì)含有大豆成分為10%、1%、0.1%、0%(w/w)的樣品分別進(jìn)行20次重復(fù)實(shí)驗(yàn),其穩(wěn)定性好,假陽性和假陰性率為0%。本實(shí)驗(yàn)建立的LAMP方法適用于特異性快速檢測食品中的過敏原大豆成分。
環(huán)節(jié)導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增法(LAMP),實(shí)時(shí)濁度儀,過敏原,大豆,檢測
食物過敏是人的機(jī)體對(duì)外源物質(zhì)(過敏原)產(chǎn)生的一種常見變態(tài)反應(yīng)。在過去的20年里,食物過敏的發(fā)病率顯著上升,過敏原己成為食品安全隱患之一[1]。各國政府和國際組織非常重視這個(gè)問題,先后通過嚴(yán)密的科學(xué)調(diào)查和理發(fā)論證,相繼修改和出臺(tái)規(guī)范食品中過敏物質(zhì)標(biāo)識(shí)的法律方案,對(duì)食品標(biāo)簽上過敏原成分的標(biāo)注作出嚴(yán)格規(guī)定,尤其是歐美、日本等發(fā)達(dá)國家[2]。我國的國家標(biāo)準(zhǔn)GB7718-2011《預(yù)包裝食品標(biāo)簽通則》也推薦標(biāo)識(shí)大豆等常見致敏物質(zhì)。大豆作為含有豐富蛋白質(zhì)的豆科植物,由于其豐富的營養(yǎng)特性和功能屬性被廣泛應(yīng)用于配方食物、肉類和家禽類產(chǎn)品、面包點(diǎn)心、乳制品和各種可食用產(chǎn)品中。據(jù)報(bào)道,有90%的食物過敏情況都是由八大類食品造成的,而大豆就是其中之一[3]。大豆過敏患者在攝食大豆及其制品或者吸入大豆粉末時(shí)可能出現(xiàn)惡心、嘔吐、舌咽腫、嘴唇紅腫、口腔疼痛和一些腸道疾病等臨床癥狀,嚴(yán)重的會(huì)導(dǎo)致休克甚至死亡[4]。關(guān)于食用大豆后過敏致死的事件已有報(bào)道[5]。
目前,對(duì)食物過敏最有效最直接的治療手段是避免食用含有過敏原的食物,因此大豆過敏原檢測技術(shù)對(duì)大豆過敏患者的安全消費(fèi)意義重大。食物過敏原檢測方法既可以基于蛋白,也可以基于DNA[6-8]。前者包括電泳法[9]、色譜法、質(zhì)譜法和免疫學(xué)方法,如酶聯(lián)免疫吸附實(shí)驗(yàn)(ELISA)[10]、放射過敏原吸收抑制實(shí)驗(yàn)[11]、免疫印跡[12]和免疫擴(kuò)散及各種試劑盒等;后者主要采用各種PCR方法,如實(shí)時(shí)熒光定量PCR、多重PCR等[13-15]。也有新型技術(shù)如生物傳感器[16]、生物芯片技術(shù)[17]等方法。環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)(loop mediated isothermal amplification,LAMP)是Notami等開發(fā)的一種簡單快速、特異性強(qiáng)的體外恒溫?cái)U(kuò)增方法[18]。該方法針對(duì)靶基因的6個(gè)區(qū)域設(shè)計(jì)4條特異的引物,利用鏈置換DNA聚合酶在恒溫條件保溫條件下完成核酸擴(kuò)增反應(yīng),通過觀察副產(chǎn)物焦磷酸鎂沉淀的濁度或者顯色反應(yīng)即可判定結(jié)果。無需昂貴的儀器設(shè)備,具有耗時(shí)、操作簡單的優(yōu)勢,更適合基層的推廣應(yīng)用。本研究采用LAMP實(shí)時(shí)濁度法對(duì)食品中過敏原大豆成分進(jìn)行檢測,為食品的風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估、加工、管理及過敏原成分的標(biāo)識(shí)提供可靠的技術(shù)保障。
1.1 材料與儀器
大豆、四季豆、羽扇豆、鷹嘴豆、荷蘭豆、豌豆、扁豆、豇豆、蠶豆、紅豆、綠豆、燕麥、蕎麥、黑麥、小麥、大麥、花生、芝麻、雞肉、魚肉、牛肉、鵝肉、鴨肉、羊肉、豬肉、蝦肉、蟹肉、扇貝、胡蘿卜、芹菜、核桃 購于珠海超市或?qū)嶒?yàn)室自留樣;食品樣品 購于珠海超 市 ;DNA 提 取 試 劑 盒 Biosprint 15 DNA plant kit QIAGEN公司;Bst DNA polymerase large fragment New England Biolabs公 司 ;甜 菜 堿(Betaine) 10 × Thermol Buffer,Sigma公司;dNTPs 寶生物工程(大連)有限公司;LAMP引物 寶生物工程(大連)有限公司。
LA-320C型LAMP實(shí)時(shí)濁度儀 日本榮研化學(xué)株式會(huì)社;NanoDrop型紫外分光光度計(jì) 美國Thermo公司;PCR儀7500Fast型實(shí)時(shí)熒光定量 美國ABI公司。
1.2 實(shí)驗(yàn)方法
1.2.1 LAMP引物設(shè)計(jì) 60~65℃是雙鏈DNA復(fù)性及延伸的中間溫度,DNA在65℃左右處于動(dòng)態(tài)平衡狀態(tài),任何一條引物與雙鏈DNA的互補(bǔ)部位進(jìn)行堿基互補(bǔ)配對(duì)延伸的時(shí)候,另一條鏈就會(huì)脫落變成單鏈。LAMP方法正是利用這一特點(diǎn)進(jìn)行反應(yīng)的。利用4條特異性引物依靠一種高活性鏈置換DNA聚合酶,使得鏈置換DNA的合成在不停的自我循環(huán)[19]。LAMP反應(yīng)階段,隨著反應(yīng)的進(jìn)行,dNTP會(huì)釋放出焦磷酸根離子,焦磷酸根離子遇到Mg2+會(huì)生成焦磷酸鎂白色沉淀,而實(shí)時(shí)濁度儀每6s自動(dòng)對(duì)每個(gè)反應(yīng)管的濁度進(jìn)行測定,可實(shí)時(shí)監(jiān)控?cái)U(kuò)增反應(yīng)中沉淀物的增加。根據(jù)LAMP引物設(shè)計(jì)的原則,在NCBI網(wǎng)站中查找Lectin基因相關(guān)序列,利用DNAMAN軟件對(duì)查到的各序列進(jìn)行比對(duì),使用在線設(shè)計(jì)軟件Primer Explorer version4和LAMP Designer軟件設(shè)計(jì)特異引物,設(shè)計(jì)多套LAMP引物。利用實(shí)時(shí)濁度儀對(duì)反應(yīng)體系中擴(kuò)增產(chǎn)物的實(shí)時(shí)監(jiān)控篩選出最佳引物。共6條分別為內(nèi)引物FIP包含F(xiàn)1c(與Fl區(qū)域互補(bǔ))和F2序列,內(nèi)引物BIP包含B1c(與B1區(qū)域互補(bǔ))和B2序列,外引物為F3和B3序列,本研究在內(nèi)外引物的基礎(chǔ)上引入環(huán)引物FLP和BLP。引入環(huán)引物后,當(dāng)?shù)谝浑A段的啞鈴狀莖環(huán)結(jié)構(gòu)形成,環(huán)引物能與其結(jié)合并引導(dǎo)擴(kuò)增。即引入環(huán)引物后,自主擴(kuò)增增加了兩個(gè)位點(diǎn),加快擴(kuò)增進(jìn)程,大大縮短了反應(yīng)時(shí)間。引物序列見表1。
1.2.2 樣品DNA提取 將待測樣品用潔凈研缽或粉碎裝置充分研磨混勻,食品樣品的取樣部位盡可能覆蓋其各種原料成分。稱取1g樣品進(jìn)行DNA提取,DNA提取步驟按試劑盒的說明書進(jìn)行,所提取的DNA經(jīng)紫外分光光度計(jì)檢測濃度并稀釋至100ng/μL,于-20℃保存?zhèn)溆谩?/p>
1.2.3 LAMP擴(kuò)增反應(yīng) 反應(yīng)總體積為25μL,包括10× Thermol Buffer 2.5μL、內(nèi)引物FIP和BIP(40μmol/L)各1.0μL、外引物F3和B3(10mol/L)各0.5μL、FLP和BLP(20μmol/L)各 1.0μL、dNTPs(10mmol/L)4.0μL、甜 菜堿(5mol/L)5.0μL、硫 酸 鎂(150mmol/L)1.0μL、Bst DNA聚合酶(8U/μL)1.0μL、模板DNA(約100ng/μL )2.0μL,用滅菌去離子水補(bǔ)齊到25.0μL,充分混勻。實(shí)時(shí)濁度儀63℃恒溫反應(yīng)1h,最后80℃滅活5min結(jié)束反應(yīng)。
1.2.4 特異性實(shí)驗(yàn) 利用建立的LAMP實(shí)時(shí)濁度法,分別以大豆、四季豆、羽扇豆、鷹嘴豆、荷蘭豆、豌豆、扁豆、豇豆、蠶豆、紅豆、綠豆、燕麥、蕎麥、黑麥、小麥、大麥、花生、芝麻、雞肉、魚肉、牛肉、鵝肉、鴨肉、羊肉、豬肉、蝦肉、蟹肉、扇貝、胡蘿卜、芹菜、核桃的DNA作為LAMP反應(yīng)模板,以ddH2O為空白對(duì)照,進(jìn)行LAMP反應(yīng),以評(píng)價(jià)該方法的特異性。
1.2.5 靈敏度實(shí)驗(yàn) 用研磨機(jī)將大豆和小麥磨成粉末狀,并60℃烘干6h。用小麥粉配成大豆粉含量為10%、5%、1%、0.5% 、0.1% 、0.05% 和0.01%(W/W)的混合樣品,以小麥粉為陰性對(duì)照,用于過敏原大豆成分的重量比靈敏度測試。
1.2.6 穩(wěn)定性實(shí)驗(yàn) 利用建立的LAMP實(shí)時(shí)濁度法,對(duì)大豆含量為10%、1%、0.1%、0%(w/w)4個(gè)不同濃度的樣品分別進(jìn)行20次重復(fù)擴(kuò)增,以評(píng)價(jià)該方法的穩(wěn)定性。
1.3 數(shù)據(jù)處理
利用實(shí)時(shí)濁度儀的LA-320CE軟件分析擴(kuò)增反應(yīng),橫坐標(biāo)為擴(kuò)增時(shí)間,縱坐標(biāo)為濁度值,產(chǎn)生濁度曲線表明發(fā)生擴(kuò)增反應(yīng),并篩選濁度出峰時(shí)間早,峰值較高的引物為反應(yīng)引物。
表1 LAMP引物序列Table 1 LAMP primers sequence
2.1 LAMP引物篩選結(jié)果
用大豆DNA作為陽性模板進(jìn)行引物的初步篩選,在所設(shè)計(jì)的多套引物中,選擇發(fā)生了擴(kuò)增反應(yīng),且出峰時(shí)間較早,峰高值較高的一套引物。該套引物出峰時(shí)間為45min左右,峰高為0.16(見圖1)。對(duì)該套引物引入環(huán)引物進(jìn)行優(yōu)化,引入環(huán)引物后,出峰時(shí)間提前至22min左右(見圖2)。
圖2 引入環(huán)引物的LAMP引物實(shí)驗(yàn)結(jié)果Fig.2 Result of LAMP primers with ring
2.2 特異性實(shí)驗(yàn)結(jié)果
利用建立的LAMP實(shí)時(shí)濁度法,對(duì)31種成分進(jìn)行檢測。結(jié)果顯示,除大豆出現(xiàn)了陽性擴(kuò)增外,其余30種成分均未發(fā)生擴(kuò)增。實(shí)驗(yàn)表明該LAMP引物具有特異性(見圖3)。
2.3 靈敏度實(shí)驗(yàn)結(jié)果
利用建立的LAMP實(shí)時(shí)濁度法,對(duì)大豆含量為10%、5%、1%、0.5%、0.1%、0.05%、0.01%(w/w)的樣品進(jìn)行檢測,含量為10%、5%、1%、0.5%、0.1%的樣品均發(fā)生了擴(kuò)增反應(yīng),含量為0.05%、0.01%及陰性對(duì)照小麥粉樣品未發(fā)生擴(kuò)增反應(yīng)(見圖4),實(shí)驗(yàn)表明,該方法檢測大豆過敏原成分的靈敏度為0.1%(w/w)。
2.4 穩(wěn)定性實(shí)驗(yàn)結(jié)果
利用建立的LAMP實(shí)時(shí)濁度法,對(duì)大豆含量為10%、1%、0.1%、0%(w/w)的4個(gè)樣品分別進(jìn)行20次重復(fù)實(shí)驗(yàn),假陽性率和假陰性率為0%,表明本實(shí)驗(yàn)建立的LAMP實(shí)時(shí)濁度法對(duì)過敏原大豆成分的檢測具有良好的穩(wěn)定性。
圖3 LAMP實(shí)時(shí)濁度法特異性實(shí)驗(yàn)結(jié)果Fig.3 Results of specificity test by real-time turbidimeterbased LAMP
2.5 實(shí)際樣品檢測
從超市收集大豆加工產(chǎn)品38份以及不含大豆成分的樣品22份。用本實(shí)驗(yàn)建立的LAMP實(shí)時(shí)濁度法對(duì)這60個(gè)樣品進(jìn)行檢測,并與熒光PCR法的結(jié)果進(jìn)行比較,評(píng)價(jià)該方法的實(shí)際應(yīng)用價(jià)值,實(shí)驗(yàn)結(jié)果見表3。實(shí)時(shí)熒光PCR法根據(jù)SN/T 1961.19-2013進(jìn)行。
圖4 LAMP實(shí)時(shí)濁度法靈敏度實(shí)驗(yàn)結(jié)果Fig.4 Results of sensitivity test by real-time turbidimeterbased LAMP
表2 實(shí)際樣品檢測Table 2 Test results of commercial samples
表3 實(shí)際樣品檢測Table 3 Test results of commercial samples
在實(shí)際樣品檢測中,熒光PCR法的Ct值及LAMP實(shí)時(shí)濁度法的峰值拐點(diǎn)時(shí)間與樣品中過敏原大豆成分的含量成正比關(guān)系。上述樣品的檢測中,熒光PCR法的Ct值出現(xiàn)在50~70min,而LAMP實(shí)時(shí)濁度法的峰值拐點(diǎn)則出現(xiàn)在18~30min,LAMP實(shí)時(shí)濁度法的檢測時(shí)間明顯比熒光PCR法的檢測時(shí)間短。并且在實(shí)際應(yīng)用中,LAMP法僅需在簡單的恒溫設(shè)備中進(jìn)行,以肉眼觀察反應(yīng)管中產(chǎn)生的白色沉淀判斷結(jié)果,操作簡便,成本低,更適合基層實(shí)驗(yàn)室甚至現(xiàn)場實(shí)驗(yàn)。
本研究建立了食品中過敏原大豆成分的LAMP實(shí)時(shí)濁度檢測方法,引入環(huán)引物的LAMP引物使擴(kuò)增反應(yīng)從1h內(nèi)進(jìn)一步縮短至30min內(nèi)。該方法的靈敏度為0.1%(w/w)。對(duì)4個(gè)不同質(zhì)量濃度的大豆樣品分別進(jìn)行20次重復(fù)實(shí)驗(yàn),假陽性率及假陰性率為0%。對(duì)31種成分的測試中僅有大豆成分出現(xiàn)陽性擴(kuò)增,其他成分均無出現(xiàn)擴(kuò)增。對(duì)60個(gè)實(shí)際樣品的檢測結(jié)果與熒光PCR法的結(jié)果一致,并與預(yù)期相符,表明該方法具有良好的穩(wěn)定性和特異性,適用于食品中過敏原大豆成分的快速檢測。
[1]孟偉帥,關(guān)榮發(fā),任駿恩,等.食品過敏原檢測技術(shù)的研究[J]. 廣東化工,2010,37(4):167-168.
[2]王文枝,溫?zé)ū?,靳淑敏,?世界各國食品過敏原種類及標(biāo)識(shí)情況概述[J]. 食品工業(yè)科技,2011,32(4):419-422.
[3]王蒙,張汆,賈小麗,等.食物中常見過敏原及其過敏特性[J]. 中國食物與營養(yǎng),2008(11):62-64.
[4]方旭前,朱友林,邱麗娟.大豆過敏原與低過敏原種質(zhì)創(chuàng)新[J]. 遺傳,2006,28(8):1043-1050.
[5]Foucard T,Malmheden-Yman I.A study severe food reactions in Sweden is soy protein an underestimated cause of food anaphylaxis[J].Allergy,1999,53(3):251-265.
[6]POMS R E,KLEIN C L,ANKLAM E.Methods for allergen analysis in food:a review[J].Food Additions and Contaminants,2004,21(1):1-31.
[7]馮彥娟,袁娟麗,佟平,等.大豆過敏原檢測方法研究進(jìn)展[J]. 食品科學(xué),2012,33(23):365-369.
[8]鄭義成,華萍,楊安樹,等.食物中過敏原檢測技術(shù)研究進(jìn)展[J]. 食品科學(xué),2010,31(21):417-421.
[9]LOPEZ-TAPIA J,GARCIA-RISCO M R,MSNSO M A,et al. Detection of the presence of soya protein in milk powder by sodium dodecyl sulfate capillary electrophoresis[J].J Chromatogr A,1999,836(1):153-60.
[10]MA Xi, SUN Peng , HE Pengli, et al.Development of monoclonal antibodies and a competitive ELISA detection method for glycinin,an allergen in soybean[J].Food Chemistry,2010,121:546-551.
[11]PASCHKE A,ZUNKER K,WIGOTZKI M,et al.Determination of the IgE-binding activity of soy lecithin and refined and nonrefined soybean oils[J].Journal of Chromatography B,2001,756:249-254.
[12]IWABUCHI S,YAMAUCHI F.Determination of glycinin and β-conglycinin in soybean proteins by immunological methods [J].JAgric Food Chem,1987,35(2):200-205.
[13]SOARES S,MAFRA I,AMARAL J S,et al.A PCR assay to detect trace amounts of soybean in meat sausages[J].International Journal of Food Science and Technology,2010,45(12):2581-2588.
[14]TIAN Fang,WANG Xiumin,TENG Da,et al.Optimization of a multiplex PCR assay for detecting transgenic soybean components in feed products[J].Appl Biochem Biotechnol,2011,165:1225-1234.
[15]BAUER T,KIRSCHBAUM K,PANTER S,et al.Sensitivedetection of soy(Glycine max) by real-time polymerase chain reaction targeting the mitochondrial atpA gene[J].J AOAC Int,2011,94(6):1863-1873.
[16]WANG Wei,HAN Jianxun,WU Yajun,et al.Simultaneous detection of eight food allergens using optical thin-film biosensor chips[J].J Agric Food Chem,2011,59:6889-6894.
[17]KIM T E ,PARK S W ,CHO N Y ,et al.Quantitative measurement ofserum allergen-specific IgE on protein chip[J]. Exp Mol Med,2002,34(2):152-158.
[18]Notomi T,Okayama H,Masubuchi H,et al.Loop-mediated isothermal amplification of DNA[J].Nucleic Acids Research ,2000,28(12):e63.
[19]黃思佳,解庭波,嚴(yán)家新.環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增反應(yīng)的原理及應(yīng)用[J]. 中國生物制學(xué)雜志,2011,24(12):1511-1513.
Development of a real-time turbidimeter-based LAMP method for detection of allergen soybean in food
KUANG Xiao-shan,CHENG Xiao-wei,YOU Shu-zhu,WANG Xiao-yu,LIU Li-deng,F(xiàn)ENG Jia-wang*
(The Inspection Technical Center of Zhuhai Entry-Exit Inspection and Quarantine Bureau,Zhuhai 519015,China)
According to the endogenous gene of allergen soybean Lectin , six specific LAMP primers were designed.A loop-mediated isothermal amplification(LAMP) method for detecting allergen soybean in food was established.Real-time monitoring of the LAMP reaction was achieved by a turbidimeter.Specificity ,sensitivity,stability and repeatability of this method were tested.The results showed that the method could specifically detect the soybean in food,and the detection sensitivity of the method was 0.1% (w/w).With the soybean sample of 10%,1%,0.1%,0%(w/w) concentration as templates,stability and repeatability testing was conducted,false negative rate was 0%.The results showed that the LAMP method is suitable for specifically detecting allergen soybean in food.
loop-mediated isothermal amplification(LAMP);real-time turbidimeter;allergen;soybean;detection
Q78
A
1002-0306(2014)22-0065-05
10.13386/j.issn1002-0306.2014.22.005
2014-02-10
鄺筱珊(1982-),女,碩士研究生,工程師,研究方向:食品安全檢測。
* 通訊作者:馮家望(1965-),男,碩士研究生,研究員,研究方向:食品安全檢測。
國家質(zhì)檢總局科技計(jì)劃項(xiàng)目(2011IK255)。