楊劍,劉劍榮,黃永建
(萍鄉(xiāng)市人民醫(yī)院檢驗科,江西萍鄉(xiāng)337055)
·實驗研究·
細菌培養(yǎng)法與核酸(熒光PCR法)檢測肺炎克雷伯菌的對比分析
楊劍,劉劍榮,黃永建
(萍鄉(xiāng)市人民醫(yī)院檢驗科,江西萍鄉(xiāng)337055)
目的探討培養(yǎng)及核酸檢測兩種不同方法進行肺炎克雷伯菌檢測分析的相關性,為臨床提供及時準確的結果。方法對本院68例疑似肺炎克雷伯菌感染病人采集送檢的痰標本,采用細菌培養(yǎng)法及核酸(熒光PCR法)檢測,結果進行對比統(tǒng)計分析。同時對熒光PCR法的特異性和敏感性進行研究。結果在68例痰標本中肺炎克雷伯菌檢出的結果,常規(guī)細菌培養(yǎng)法檢出陽性33例,陰性35例,陽性率48.53%;熒光PCR法檢出陽性49例,陰性19例,陽性率72.06%。對肺炎克雷伯菌標本DNA檢測得擴增產物,對非肺炎克雷伯菌無交叉反應,其檢測敏感性為1×103copies/ml。結論熒光PCR法檢出肺炎克雷伯菌的陽性率高于常規(guī)細菌培養(yǎng)法,具有很高的敏感性和特異性,檢測時間短,能為臨床診斷提供及時準確的結果。
肺炎克雷伯菌;細菌培養(yǎng)法;熒光PCR法
克雷伯菌屬為腸桿菌科中一類有莢膜的革蘭陰性桿菌,本屬中肺炎克雷伯菌、臭鼻克雷伯桿菌和鼻硬結克雷伯菌與人類關系密切。其中肺炎克雷伯菌占克雷伯菌屬感染的95%以上。該菌存在于人類腸道、呼吸道以及水和谷物。當機體免疫力降低或長期大量使用抗生素導致菌群失調時,進入人體可引起肺炎、尿路感染、敗血癥、傷口感染、腦膜炎等多種疾病[1,2]。
近十來年發(fā)展的分子生物學技術,特別是聚合酶鏈反應(PCR)在臨床應用上越來越受到青睞,且不斷在推廣,使得臨床細菌感染后快速、準確診斷成為可能。本文對本院68例疑似肺炎克雷伯菌感染病人采集送檢的痰標本,通過細菌培養(yǎng)及核酸PCR檢測兩種不同方法對肺炎克雷伯菌進行檢測分析,比較兩種方法的相關性,同時對熒光PCR法的特異性和敏感性進行觀察,現報告如下。
1.1 標本來源本院68例疑似肺炎克雷伯菌感染病人采集送檢的痰標本密閉送檢,同一患者標本多次分離同樣細菌按一株算。
1.2 儀器和試劑VITEK32全自動細菌分析儀鑒定,鑒定卡由生物梅里埃公司提供。肺炎克雷伯菌核酸測定試劑盒(熒光PCR法)由上海之江生物科技股份有限公司提供。本科室PCR實驗室已通過國家衛(wèi)生部驗收。
1.3 方法
1.3.1 常規(guī)細菌培養(yǎng)檢測肺炎克雷伯菌將送檢的痰標本分別接種于血平板、巧克力平板、中國蘭平板、TTC-沙氏。放于37℃培養(yǎng)箱培養(yǎng)。巧克力平板置5%CO237℃培養(yǎng)箱培養(yǎng)。培養(yǎng)18~24h后做進一步鑒定。并用標準株大腸埃希菌ATCC25922作為質控株[3]。嚴格按照《全國臨床檢驗操作規(guī)程》第3版操作[4]。
1.3.2 核酸檢測(熒光PCR法)嚴格按照肺炎克雷伯菌核酸測定試劑盒(熒光PCR法)說明書進行操作。包括標本、對照品的核酸裂解處理,試劑配制,加樣,PCR擴增,閾值設定,質量控制,試驗結果計算。進行定量檢測時,陽性參考品(1×107copies/ml)進行10、100和1000倍梯度稀釋,試驗結束后,儀器自動生成標準曲線。
1.3.3 特異性試驗將培養(yǎng)為肺炎克雷伯菌、金黃色葡萄球菌、大腸埃希菌、銅綠假單胞菌、化膿性鏈球菌、白念珠菌的痰標本分別用肺炎克雷伯菌核酸測定試劑盒(熒光PCR法)進行DNA提取檢測。
1.3.4 敏感性試驗將肺炎克雷伯菌陽性參考品(1×107copies/ml)進行10倍梯度稀釋成:106copies/ ml、105copies/ml、104copies/ml、103copies/ml、102copies/ml、101copies/ml,然后進行DNA提取檢測[5]。
1.4 統(tǒng)計學方法分析兩種方法的陽性檢出率比較采用四格表資料的χ2檢驗,P<0.05為差異有統(tǒng)計學差異。
2.1 肺炎克雷伯菌檢出情況在68例痰標本中肺炎克雷伯菌檢出的結果,常規(guī)細菌培養(yǎng)法檢出陽性33例,陰性35例,陽性率48.53%;熒光PCR法檢出陽性49例,陰性19例,陽性率72.06%。熒光PCR法檢出肺炎克雷伯菌的陽性率高于常規(guī)細菌培養(yǎng)法。未發(fā)現細菌培養(yǎng)陽性而熒光PCR法擴增陰性標本。見表1。
表1 兩種方法對68例痰標本檢測肺炎克雷伯菌陽性率比較
經統(tǒng)計學方法處理,χ2=3.93>3.84=χ20.05(1),P<0.05,陽性檢出率的差異具有統(tǒng)計學意義。
2.2 特異性試驗培養(yǎng)為肺炎克雷伯菌的痰標本進行DNA提取后,PCR方法檢測得7.06× 106copies/ml;而非肺炎克雷伯菌的痰標本結果為低于檢測下限(<500copies/ml)。表明熒光PCR法具有良好的特異性。
2.3 敏感性試驗分別選取濃度為106copies/ml、105copies/ml、104copies/ml、103copies/ml、102copies/ ml、101copies/ml的標本進行DNA檢測,結果最低可檢出1×103copies/ml,與試劑說明書中產品性能指標的最低檢測限:1×103copies/ml相符。
目前,肺炎克雷伯菌是重要的條件致病菌和醫(yī)院感染病原菌之一,多見于年老體弱或原有慢性支氣管-肺疾患者,亦可通過機械呼吸器、霧化器或各種導管而感染,筆者采用細菌培養(yǎng)法和熒光PCR法對肺炎克雷伯菌進行檢測對比分析。結果表明,PCR檢測的陽性率高于常規(guī)細菌培養(yǎng)法,且經統(tǒng)計學分析,兩法有差異,具有統(tǒng)計學意義。同時結果表明熒光PCR法具有很高敏感性和特異性,與有關報道相符[6]。
培養(yǎng)法一直被認為是檢測細菌最可靠的方法,但該方法操作復雜、技術要求嚴格、費時;而細菌熒光定量PCR檢測技術具有很高的敏感性和特異性,不受細菌存活與否的限制,近年來廣泛應用臨床標本檢測,但該方法對實驗條件和檢查技術要求較高,又因敏感性較高,容易受外界污染的影響而產生假陽性[7]。本實驗中49例PCR陽性結果的標本,筆者認為不排除存在假陽性的可能。但未發(fā)現細菌培養(yǎng)陽性而熒光PCR法擴增陰性標本。然而,PCR檢測的陽性率明顯高于常規(guī)細菌培養(yǎng)法,分析原因可能還有:(1)采集標本細菌量少,加之雜菌生長迅速所覆蓋;(2)患者采樣前已使用過抗菌藥物,抗菌藥物抑制了細菌生長,導致培養(yǎng)結果陰性[5]。
肺炎克雷伯菌培養(yǎng)法一直是診斷克雷伯菌性肺炎的最可靠的方法,仍是目前主要的檢測手段。但細菌培養(yǎng)所需時間較長,對疾病的的診斷有一定的滯后。熒光PCR法核酸檢測具有不受病程影響、快速、敏感性和特異性高的優(yōu)點[8,9],作為一項常規(guī)實驗室檢查發(fā)出報告只需要4h[10],可以及時為臨床提供病原學的診斷結果。雖然PCR能較早檢出病原菌,但不能進行抗菌藥物的體外敏感試驗,其在臨床的應用還是受到一定的限制。加上PCR法要求在合格的PCR室進行,具有一定的局限性。但熒光PCR法是目前臨床上檢測克雷伯菌性肺炎的最佳方法之一,有條件的醫(yī)院可以開展。
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Comparison between bacterium culture and real-time PCR in detection of Klebsiella pneumoniae
YANG Jian,LIU Jianrong HUANG Yongjian.Department of Clinical Laboratory,Pingxiang People’s Hospital,Pingxiang Jiangxi 337005,China
Objective To compare the correlation of bacterium culture and real-time PCR for Klebsiella pneumoniae detection.Methods A total of 68 suspected-infection sputum samples were taken and analyzed by both bacterium culture and realtime PCR to detect Klebsiella pneumoniae.The sensitivity and specificity of real-time PCR were also analyzed.Results The detection rate of Klebsiella pneumoniae by real-time PCR was significantly higher than that by bacterium culture[72.06%(49/68)vs. 48.53%(33/68),P<0.05].The sensitivity of real-time PCR was 1×103copies/ml and there were no cross reactions with Klebsiella pneumoniae.Conclusion The positive rate of real-time PCR was higher than bacterium culture.The high sensitivity and specificity and the rapid turnaround time make real-time PCR valuable for effective clinical diagnosis.
Klebsiella pneumoniae;Bacterium culture;Real-time PCR
R446.5,R446.62,R378.99+6
A
1674-1129(2014)06-0692-02DOI∶10.3969/j.issn.1674-1129.2014.06.015
2014-08-25;
2014-09-17)
楊劍,女,1983年6月出生,學士學位,主管技師,研究方向為臨床免疫學和分子生物學檢驗。