常振華,何 成
(1.渭南職業(yè)技術(shù)學(xué)院,陜西渭南714000;2.渭南市畜牧技術(shù)推廣中心,陜西渭南714000)
甘油三酯是乳脂和體脂的主要成分,其中磷酸甘油?;D(zhuǎn)移酶(1-acyl-sn-glycerol-3-pho sphate acyltransferase,AGPAT)是甘油三酯合成的關(guān)鍵酶[1]。研究發(fā)現(xiàn),人AGPAT有8種異構(gòu)體。鼠的AGPAT1基因和AGPAT3 基因在多種組織中表達(dá),而AGPAT2 基因、AGPAT4 基因和AGPAT5基因的表達(dá)具有組織特異性[2],AGPAT6基因在小鼠的內(nèi)臟、乳腺上皮細(xì)胞及皮下脂肪中高水平表達(dá)[3]。缺失AGPAT6基因的小鼠泌乳期會出現(xiàn)乳腺小泡和導(dǎo)管不發(fā)達(dá)的癥狀,而且會導(dǎo)致乳腺導(dǎo)管和乳腺上皮細(xì)胞中乳脂肪滴的大小和數(shù)量都顯著下降[4]。因此,AGPAT6 酶對乳脂肪的產(chǎn)生至關(guān)重要,AGPAT6基因可作為影響奶牛泌乳性能的候選基因。昝林森等[5]發(fā)現(xiàn)AGPAT6基因?qū)伤固鼓膛H橹屎湍坍a(chǎn)量有影響,而在奶山羊中尚未有AGPAT6基因多態(tài)性對產(chǎn)奶性狀的報道。為此本文采用PCR-RFLP技術(shù)分析了西農(nóng)薩能奶山羊和關(guān)中奶山羊品種AGPAT6基因多態(tài)性對產(chǎn)奶性狀的影響,旨在為其產(chǎn)奶性狀選育提供理論依據(jù)。
從陜西千陽縣西農(nóng)薩能奶山羊種羊場(202只)和西北農(nóng)林科技大學(xué)種羊場(66只)采集西農(nóng)薩能奶山羊(SN)268份血樣,從陜西省三原縣關(guān)中奶山羊良種繁育中心采集關(guān)中奶山羊(GZ)血樣281份,共計549 份血樣。每個個體采集血液10 mL,加ACD 抗凝劑帶回實驗室,-20 ℃冷凍保存?zhèn)溆?;同時收集549頭奶山羊的羊奶進(jìn)行奶成分分析,收集西農(nóng)薩能奶山羊268只羊的產(chǎn)奶量。
1.2.1 基因組DNA 提取與AGPAT6基因引物奶山羊DNA 提取參照Chen[6]的方法。本試驗所用到的引物全部參照GenBank中公布的牛的AGPAT6基因序列(NC_007328.3),用Primer premier5.0軟件自行設(shè)計,如表1所示。
1.2.2 AGPAT6 基因PCR-RFLP 反應(yīng)條件 以奶山羊的混合DNA 池(每10個不同樣本混合成1個DNA 池)做模板進(jìn)行AGPAT6 基因的PCR 擴(kuò)增。PCR 擴(kuò)增反應(yīng)總體系為:10×PCR Buffer 2.7 μL、dNTPs 2.0μL、上游引物(F)0.5μL、下游引物(R)0.5μL、Taq DNA 聚合酶0.4μL、DNA 模板(10ng/μL)1.0μL和超純水17.9μL,總體積是25 μL。PCR 擴(kuò)增反應(yīng)程序如下:95℃預(yù)變性4 min,94℃變性30s,退火30s,72℃延伸40s,循環(huán)次數(shù)33,72 ℃延伸10 min,4℃保存。利用PCR-RFLP技術(shù)對發(fā)現(xiàn)的SNPs進(jìn)行分型。PCR-RFLP技術(shù)的具體方法為:將10×Buffer緩沖液1.0μL,超純水3.5μL,限制性內(nèi)切酶(10U/μL)0.5μL,PCR 產(chǎn)物5.0μL,合計10μL。根據(jù)限制性內(nèi)切酶說明書中的反應(yīng)溫度水浴8h,用3%的瓊脂糖電泳、成像,然后進(jìn)行基因型分析。
表1 山羊AGPAT6基因所用引物信息Table 1 Primer information of the goat AGPAT6gene
根據(jù)突變位點的基因分型結(jié)果,對測得的基因型進(jìn)行統(tǒng)計,直接計算出基因頻率和基因型頻率。用SPSS 16.0計算基因型和奶山羊經(jīng)濟(jì)性狀之間的關(guān)系,基因型與產(chǎn)奶量、奶成分關(guān)聯(lián)分析用到的線性模型為:yijklmn=μ+Farmi+Breedj+Agek+Genotypem+Xn+eijklmn。式中:yijklmnpq為個體表型記錄;Farmi為場別效應(yīng);Breedj為品種效應(yīng);Agek為年齡效應(yīng);Sexl為性別效應(yīng);Markerm為標(biāo)記基因型效應(yīng);Xn為各種二級和二級以上互作效應(yīng),如:Farm×Breed,F(xiàn)arm×Age,F(xiàn)arm×Genotype,Breed×Age,Breed×Genotype,Age×Genotype,Breed×Age×Genogype等;eijklmn為隨機(jī)誤差。
通過對西農(nóng)薩能奶山羊和關(guān)中奶山羊共549個個體AGPAT6基因全部外顯子和部分5'UTR 和3'UTR(P1~P10位點)進(jìn)行SNP掃描,經(jīng)DNA 池測序發(fā)現(xiàn)在P1、P2、P4、P10 位點共有4 個SNPs:5'UTR(g.152G>C)、內(nèi)含子2(g.8124G>A)、外顯子4(g.9263C>G)和3'UTR(g.16436G>A)。其中在外顯子4(g.9263C>G)處引起ACC(蘇氨酸)>ACG(蘇氨酸)的同義突變,而5'UTR、內(nèi)含子2和3'UTR 不進(jìn)行蛋白編碼,未引起氨基酸突變。
對于發(fā)現(xiàn)的4 個多態(tài)位點,本試驗采用PCRRFLP和測序的方法去檢測。P1 基因座由于沒有相應(yīng)的酶切位點,所以采用引入酶切位點的方法來檢測這個突變,利用下游引物P1-KpnI 155位的A被突變?yōu)門 從而引入KpnI 的酶切位點(GGTACC)用來檢測g.152 G>C 突變,對P1 位點(g.152G>C)的PCR 產(chǎn)物(175bp)進(jìn)行分型,結(jié)果在兩個奶山羊品種中都檢測到了GG 型、GC 型和CC型三種基因型,GG 基因型表現(xiàn)175bp 1 條帶型;GC基因型表現(xiàn)175bp、150bp 和25bp 共3條帶型;CC基因型表現(xiàn)150bp 和25bp 2條帶型。
利用限制性內(nèi)切酶EcoRΙΙ對發(fā)現(xiàn)的P2 位點(g.8124G>A)的PCR 產(chǎn)物(372bp)進(jìn)行分型,結(jié)果在兩個奶山羊品種中都檢測到了GG 型、GA 型和AA 型三種基因型,GG 型表現(xiàn)372bp 1條帶型;GA 型表現(xiàn)372bp、253bp 和119bp 共3條帶型;CC型表現(xiàn)253bp 和119bp 2條帶型。
利用限制性內(nèi)切酶NcoΙ 對發(fā)現(xiàn)的P4 位點(g.9263C>G)的PCR 產(chǎn)物(241bp)進(jìn)行分型,在兩個奶山羊品種中都檢測到了CC 型、CG 型和GG型三種基因型,CC 型表現(xiàn)241bp 1條帶型;CG 型表現(xiàn)241bp、130bp 和111bp 共3條帶型;CC 基因型表現(xiàn)130bp 和111bp 2條帶型(見圖1)。最后,利用限制性內(nèi)切酶BglΙ對P10位點(g.16436G>A)的PCR 產(chǎn)物(336bp)進(jìn)行分型,在兩個奶山羊品種中都檢測到了GG 型、GA 型和AA 型三種基因型,GG 基因型表現(xiàn)336bp 1條帶型;GA 基因型表現(xiàn)336bp、195bp和141bp共3條帶型;CC基因型表現(xiàn)195bp 和141bp 2條帶型。
在西農(nóng)薩能和關(guān)中奶山羊群體中,AGPAT6基因P1位點KpnΙ、P2位點EcoRII、P4位點NcoΙ和P10位點BglΙ基因頻率和基因型頻率見表2,說明基因頻率差異很大。P4位點(NcoΙ)在這兩個奶山羊品種中GG 和CG 基因型個體的產(chǎn)奶量顯著優(yōu)于CC基因型個體(P<0.05)(表3),在兩個奶山羊品種奶成分分析上,GG基因型個體乳脂率顯著高于CC型個體(P<0.05),GG 和CG 基因型個體乳蛋白含量極顯著高于CC 基因型個體(P<0.01)(表4)。而P1、P2和P10位點的不同基因型對兩個奶山羊品種的產(chǎn)奶性狀影響均不顯著(P>0.05)。
圖1 奶山羊AGPAT6 基因P4位點PCR 產(chǎn)物NcoΙ酶切多態(tài)性1.Marker I;2,3,5,7.CC基因型;4.CG 基因型;6.GG 基因型Fig.1 NcoΙdigesting polymorphism of AGPAT6-P4PCR products in dairy goat;1.Marker I;2,3,5,7.CC genotype;4.CG genotype;60GG genotype
表2 兩個奶山羊品種AGPAT6基因的基因頻率和基因型頻率Table 2 Allelic and genotypic frequencies of AGPAT6gene in two dairy goat breeds
表3 AGPAT6基因P4位點不同基因型與薩能奶山羊產(chǎn)奶量的相關(guān)分析Table 3 Relationship between different genotypes of AGPAT6-P4and milk yield in Saanen breed
磷酸甘油?;D(zhuǎn)移酶6(AGPAT6)起著調(diào)節(jié)甘油三酯合成過程中的關(guān)鍵作用[7]。對人類的研究表明,AGPAT6基因的超表達(dá)可以增加細(xì)胞中溶血磷脂酸和磷脂酸水平[8-9]。Beigneux等[10]研究顯示,AGPAT6缺陷的小鼠產(chǎn)生的奶中顯著缺少甘油二酯和甘油三酯。在牛上的報道顯示,AGPAT6連同其他基因協(xié)同調(diào)控奶牛乳腺中脂肪酸向乳脂的合成[11-12]。因此,AGPAT6是影響奶成分和奶產(chǎn)量的一個關(guān)鍵基因。
表4 AGPAT6基因P4位點不同基因型與兩個奶山羊品種奶成分的相關(guān)分析Table 4 Relationship between different genotypes of AGPAT6-P4and milk composition in Saanen and Guanzhong dairy goat breeds
張佳蘭等[13]在中國荷斯坦牛AGPAT6基因第2內(nèi)含子發(fā)現(xiàn)了一個SNP。在該位點不同基因型個體的產(chǎn)奶量、乳脂率和乳蛋白率之間存在顯著差異。昝林森[5]等研究發(fā)現(xiàn),不同品系的荷斯坦牛乳脂率和奶產(chǎn)量都存在著顯著性差異,其中在AGPAT6基因的第3 內(nèi)含子上檢測到兩個SNPs,它們能顯著影響奶牛的產(chǎn)奶量和乳脂率。目前的研究還表明,AGPAT6 基因與奶牛的脂肪吸收、合成和沉積和產(chǎn)乳性狀相關(guān)[14],表明AGPAT6 基因是影響奶牛產(chǎn)奶性狀的候選基因。
本研究中通過對西農(nóng)薩能奶山羊和關(guān)中奶山羊共549只羊的AGPAT6基因全部外顯子和部分5'UTR 和3'UTR 進(jìn)行分析,經(jīng)DNA 池測序發(fā)現(xiàn)4個突變位點(P1、P2、P4、P10),在P4 (9263C>G)NcoI位點上突變與產(chǎn)奶量和乳脂肪及乳蛋白顯著相關(guān),這與其它的研究結(jié)果相似。Baumgard等[15]研究表明,與乳脂合成相關(guān)的酶包括脂肪酸的合成、轉(zhuǎn)運(yùn)、去飽和以及甘油三酸酯的合成等,這些酶表達(dá)的變化影響乳脂率。其中對AGPAT 家族的研究也說明了這一點,AGPAT2 突變會導(dǎo)致AGPAT2酶活性的降低,以至于引發(fā)先天性脂肪營養(yǎng)障礙[16]。另一項研究顯示,缺失AGPAT6 基因的小鼠泌乳量和乳脂肪含量顯著下降[10]。對牛AGPAT6基因的多態(tài)性研究發(fā)現(xiàn)多個SNPs位點,它們能引起個體間乳脂率、乳蛋白率及乳中干物質(zhì)的顯著差異[5,14]。因此AGPAT6基因可以作為奶山羊分子育種的候選基因。
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