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        基于從頭算的孤立條件下α—丙氨酸分子手性轉(zhuǎn)變理論研究

        2014-01-15 01:43:41羅香怡趙衍輝王佐成
        關(guān)鍵詞:能壘映體過渡態(tài)

        張 新,錢 研,羅香怡,趙衍輝,王佐成*

        (1.白城師范學院 物理學院,吉林 白城 137000;2.白城師范學院 傳媒學院,吉林 白城 137000)

        0 引言

        α—丙氨酸有左旋與右旋一對對映體.左旋體對動物體尤為重要,廣泛地存在于動物體內(nèi),對預防腎結(jié)石、協(xié)助葡萄糖的代謝有不可忽視的作用,并且有助于緩和低血糖.右旋α—丙氨酸主要應用于手性藥物和手性助劑等領(lǐng)域,在制藥及食品行業(yè)作為手性合成的手性源[1].主要用于生產(chǎn)新型廣譜抗生素、右旋丙氨醇、多肽合成過程的丙氨酸保護劑,以及合成新型甜味劑阿利甜[2].右旋丙氨酸有抑菌作用,是自然保濕因子的主要成分,是角質(zhì)層保持水分的重要角色,也廣泛用于化妝品之中.

        基于α—丙氨酸手性對映體的廣泛應用,人們對丙氨酸進行了大量的研究.劉鳳閣等人對丙氨酸的結(jié)構(gòu)特性及氫在羧基上的轉(zhuǎn)移進行了研究[3、4].王道尚等人對丙氨酸分子的最優(yōu)構(gòu)型、能量及非鍵性質(zhì)進行了理論研究[5],王文清等人對α—丙氨酸分子做了變溫中子結(jié)構(gòu)研究[6].然而,對丙氨酸分子手性轉(zhuǎn)變的研究未見報道.工作希望對弄清α—丙氨酸的手性轉(zhuǎn)變機制、獲得光學純的對映體、拓寬其應用領(lǐng)域,產(chǎn)生積極的作用.

        1 研究與計算方法

        用從頭算理論的HF方法[7],采用6-31G(d)基組,對S型與R型α—丙氨酸分子幾何結(jié)構(gòu)及反應的中間體進行單重態(tài)勢能面上的極小值、紅外振動頻率的理論計算;對反應過程中的過渡態(tài)[8,9]進行探索;對過渡態(tài)進行IRC計算[10].文中分子結(jié)構(gòu)圖、振動模式圖及IRC曲線圖均由GaussView3.0依據(jù)Gaussian03的計算結(jié)果而生成.

        2 結(jié)果與討論

        2.1 α—丙氨酸分子手性轉(zhuǎn)變路徑

        (1)α—丙氨酸分子對映體的結(jié)構(gòu)

        在HF/6-31G(d)水平上優(yōu)化的S型與R型α—丙氨酸分子幾何結(jié)構(gòu)如圖1所示.這對對映體的能量均為:E(RHF)=-321.8648a.u. 從這對對映體的空間結(jié)構(gòu)可以看出,應是13H先從1C遷移到9C、再從9C遷移到100、又在另一側(cè)從100遷移到9C的另一側(cè),最后在另一側(cè)從9C遷移到1C的另一側(cè),同時伴隨著其它基團及鍵角的的異構(gòu)過程,便可實現(xiàn)這對對映體從S型到R型的手性轉(zhuǎn)變.

        圖1 在HF/6-31G(d)理論水平優(yōu)化的S型與R型α—丙氨酸分子的幾何結(jié)構(gòu)

        (2)α—丙氨酸分子手性轉(zhuǎn)變路徑的中間體及過渡態(tài)探索

        根據(jù)前面的分析預測,α—丙氨酸分子從S型轉(zhuǎn)變?yōu)镽型的過程是:(1)S型α—丙氨酸分子的13H從1C通過過渡態(tài)TS1遷移到9C上形成中間體INT1,實現(xiàn)4C-1C-9C碳骨架異構(gòu)的第一步,這個過程同時伴隨著其它基團的微弱異構(gòu);(2)13H從9C通過過渡態(tài)TS2遷移到10C上形成中間體INT2,實現(xiàn)4C-1C-9C碳骨架進一步的異構(gòu),這個過程也同時伴隨著其它基團的異構(gòu);(3)13H從10O通過過渡態(tài)TS3從另一側(cè)遷回到9C上形成INT3 ;(4)13H從9C通過過渡態(tài)TS4從另一側(cè)遷回到1C上形成產(chǎn)物R型α—丙氨酸分子.

        首先結(jié)合前面的分析對INT1、INT2與INT3的結(jié)構(gòu),在HF/6-31G(d)水平下進行幾何結(jié)構(gòu)優(yōu)化、計算單重態(tài)的最低單點能、計算紅外振動頻率.得到INT1、INT2及INT3的結(jié)構(gòu)如圖2所示,能量分別為:EINT1(RHF)=-321.7840 a.u;EINT2(RHF)=-321.8209 a.u;EINT3(RHF)=-321.7840 a.u.

        圖2 在HF/6-31G(d)理論水平優(yōu)化得到的INT的幾何結(jié)構(gòu)

        而后,在HF/6-31G(d)理論水平上,對過渡態(tài)TS1、TS2、TS3與TS4進行了的探索,計算了過渡態(tài)的幾何結(jié)構(gòu)、能量、紅外振動頻率及其前線分子軌道.得到過渡態(tài)TS1、TS2、TS3與TS4的幾何構(gòu)型如圖3所示,對過渡態(tài)進行全優(yōu)化后的能量為:能量分別為:ETS1(RHF)=-321.7617 a.u;ETS2(RHF)=-321.7506 a.u;ETS3(RHF)=-321.7506 a.u;ETS4(RHF)=-321.7617 a.u.紅外振動均存在一虛頻,虛頻下的振動模式見圖(3).

        從圖3可以看出:TS1的振動模式顯示13H可以從S型α—丙氨酸分子的1C遷移到9C上,這個過程同時伴隨著碳骨架二面角變化的異構(gòu)、6N基團與羧基的旋轉(zhuǎn)異構(gòu),形成中間體INT1;TS2的振動模式顯示13H可以從S型α—丙氨酸分子的9C遷移到10O上,形成中間體INT2;TS3的振動模式顯示13H可以從S型α—丙氨酸分子的另一側(cè)10O遷移到9C上,形成中間體INT3;TS4的振動模式顯示13H可以從S型α—丙氨酸分子另一側(cè)的9C遷移回到1C上,這個過程也同時伴隨著碳骨架二面角變化的異構(gòu)、6N基團與羧基的旋轉(zhuǎn)異構(gòu),形成產(chǎn)物R型α—丙氨酸分子.我們沿著虛頻下13H的振動方向微調(diào)結(jié)構(gòu)進行優(yōu)化的結(jié)果見圖(2)和圖(1),證明了我們分析的正確性.

        圖3 在HF/6-31G(d)理論水平上得到的各過渡態(tài)的幾何結(jié)構(gòu)及虛頻下的振動模式

        (3)α—丙氨酸分子手性轉(zhuǎn)變路徑

        綜合前面的研究得到,α—丙氨酸分子從S型到R型的手性轉(zhuǎn)變路徑為:S→TS1→INT1→TS2→INT2→TS3→INT3→TS4→R,過程涉及到的局域極小點的幾何結(jié)構(gòu)及過渡態(tài)的結(jié)構(gòu)見圖1、圖2與圖3.表(1)給出了穩(wěn)定點與過渡態(tài)的能量.

        由表1可知,S型α—丙氨酸分子經(jīng)過過渡態(tài)TS1轉(zhuǎn)變到中間體INT1,需要跨越的能壘是64.97 Kcal/mol;中間體INT1經(jīng)過過渡態(tài)TS2轉(zhuǎn)變到中間體INT2,需要跨越的能壘是21.05 kcal/mol;中間體INT2經(jīng)過過渡態(tài)TS3轉(zhuǎn)變到中間體INT3,需要跨越的能壘是44.30 kcal/mol;中間體INT3經(jīng)過過渡態(tài)TS4轉(zhuǎn)變到R型α—丙氨酸分子,需要跨越的能壘是14.06 kcal/mol.

        2.2 α—丙氨酸分子手性轉(zhuǎn)變過渡態(tài)的IRC計算

        為了進一步驗證過渡態(tài)的可靠性,分別對這四個過渡態(tài)在HF/6-31G(d)理論水平上進行了正向

        表1在HF/6-31G(d)理論水平上計算得到的反應路徑中各穩(wěn)定點及過渡態(tài)的能量,過渡態(tài)及中間體與反應物及產(chǎn)物的能量差

        StructuresE(Hartree)ΔE(Hartree)ΔE/kcal·mol-1S-321.86480.00000.00TS1-321.76170.103164.97INT1-321.78400.080850.91TS2-321.75060.114271.96INT2-321.82090.043927.66TS3-321.75060.114271.96INT3-321.78400.080850.91TS4-321.76170.103164.97R-321.86480.00000.00

        與反向的IRC路徑探測.探測結(jié)果表明,我們得到的各個過渡態(tài)是可靠的,的卻是連接著對應的反應物與產(chǎn)物.由于篇幅所限,只給出對過渡態(tài)TS1的IRC計算結(jié)果見圖4,其它從略.

        上圖的能量最高點是過渡態(tài)TS1,最低點分別是指向中間體INT1和S型α—丙氨酸分子的結(jié)構(gòu),圖4顯示的最高點和最低點的能量值與表1數(shù)據(jù)十分的吻合,說明對過渡態(tài)TS1進行的IRC探測結(jié)果證明了TS1是可靠的.

        向后探測的從過渡態(tài)到中間體INT1的IRC路徑 向前探測的從過渡態(tài)到S型對映體的IRC路徑

        圖4在HF/6-31G(d)理論水平上對過渡態(tài)TS1進行的IRC分析

        3 結(jié)論與展望

        使用從頭算的HF方法采用6-31G(d)基組,計算研究了α—丙氨酸分子從S型到R型的手性對映體的轉(zhuǎn)變過程.結(jié)果表明:反應的路徑是:S→TS1→INT1→TS2→INT2→TS3→INT3→TS4→R;S型α—丙氨酸分子經(jīng)過過渡態(tài)TS1轉(zhuǎn)變到中間體INT1,需要跨越的能壘是64.97 kcal/mol;中間體INT1經(jīng)過過渡態(tài)TS2轉(zhuǎn)變到中間體INT2,需要跨越的能壘是21.05 kcal/mol;中間體INT2經(jīng)過過渡態(tài)TS3轉(zhuǎn)變到中間體INT3,需要跨越的能壘是44.30 kcal/mol;中間體INT3經(jīng)過過渡態(tài)TS4轉(zhuǎn)變到R型α—丙氨酸分子,需要跨越的能壘是14.06 kcal/mol.對過渡態(tài)進行的IRC計算表明,諸過渡態(tài)是可靠的.

        α—丙氨酸分子的手性轉(zhuǎn)變很可能還存在其它的路徑,本工作使用的HF方法沒有考慮到電子相關(guān),得到的最低單點能及能壘等物理量不是很精確,這些問題還有待于我們繼續(xù)進行研究.

        [1]趙亞華.分子生物學教程[M].北京:科學出版社,2011.

        [2]林國強,等.手性合成不對稱反應及其應用[M].北京:科學出版社,2003.

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        [4]劉鳳閣,等.孤立條件下丙氨酸分子羧基氫轉(zhuǎn)移的理論研究[J].吉林師范大學學報(自然科學版),2014,35(1):41~47.

        [5]王道尚,等.丙氨酸分子的最優(yōu)構(gòu)型、能量及非鍵性質(zhì)理論研究[J].城市建設(shè)理論研究,2013,(3):26~30.

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