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        基于胚部特征的玉米品種識(shí)別

        2013-12-31 00:00:00張文靜程洪王克儉
        湖北農(nóng)業(yè)科學(xué) 2013年17期

        摘要:掃描了4個(gè)玉米品種各70粒種子圖像,采用OSTU法對(duì)圖像進(jìn)行分割,利用改進(jìn)的開閉運(yùn)算對(duì)分割后圖像進(jìn)行修整,并用快速混合重構(gòu)算法對(duì)修整過的二值圖像中的孔洞進(jìn)行填充,最終得到玉米子粒的胚部圖像。利用連通區(qū)域標(biāo)記法和多對(duì)象輪廓提取算法對(duì)胚部圖像進(jìn)行形態(tài)特征參數(shù)的提取,對(duì)每粒玉米子粒的胚部提取了面積、周長(zhǎng)、圓形度、橢圓短長(zhǎng)軸比、矩形度、離心率6個(gè)形態(tài)特征參數(shù)。利用K-均值聚類分析對(duì)提取到的特征參數(shù)進(jìn)行品種識(shí)別,4種玉米品種的檢出率達(dá)到94%以上。利用胚部形態(tài)特征進(jìn)行玉米品種識(shí)別是有效的。

        關(guān)鍵詞:玉米;品種識(shí)別;胚部特征;K-均值聚類

        中圖分類號(hào):TP391.41 文獻(xiàn)識(shí)別碼:A 文章編號(hào):0439-8114(2013)17-4232-03

        Varieties Identification of Maize Based on Embryo Characteristics

        ZHANG Wen-jing1,CHENG Hong1,2,WANG Ke-jian1

        (1.College of Information Science Technology, Agriculture University of Hebei, Baoding 071001,Hebei,China;

        2. College of Information and Electrical Engineering, China Agricultural University,Beijing 100083, China)

        Abstract: Four maize varieties were selected, and 70 images of each variety were scanned. The images were segmentled by OSTU, then were repaired through the improved open-close operation, and the rapid mixing reconstruction algorithm was used to fill the repaired binary image holes, so the embryo images of maize were obtained. Morphological parameters of embryo were extracted with connected components labeling method and multi-object contour extraction algorithm, which contained the following 6 morphological parameters, area, perimeter, circularity, elliptic short-long axis ratio, rectangular degree and eccentricity. Using K-means cluster to identify the maize varieties with the morphological parameters, the detection rates of the four maize varieties were all over 94%. The experimental results verified the effectiveness of maize variety identification using embryo morphology.

        Key words: maize; variety identification; embryo characteristic; K-means cluster

        收稿日期:2013-05-22

        基金項(xiàng)目:河北農(nóng)業(yè)大學(xué)理工基金項(xiàng)目(LG20110604);河北省教育廳資助項(xiàng)目(Q2012139)

        作者簡(jiǎn)介:張文靜(1981-),女,河北邯鄲人,講師,碩士,主要從事數(shù)據(jù)挖掘和人工智能方面的研究,(電話)15903120820(電子信箱)

        zwjndjs@163.com。

        目前,種子品種質(zhì)量檢驗(yàn)的實(shí)驗(yàn)室方法有電泳技術(shù)、色譜分析技術(shù)、熒光掃描技術(shù)、遺傳物質(zhì)DNA分析技術(shù)以及近些年出現(xiàn)的近紅外光譜分析[1-3]等。這些檢驗(yàn)具有準(zhǔn)確率高而且能夠進(jìn)行純度鑒定等顯著優(yōu)勢(shì),但成本高、周期長(zhǎng)而且需要專門的儀器設(shè)備條件等特點(diǎn)使得這些方法都不能應(yīng)用于種子交易流通的現(xiàn)場(chǎng)。利用機(jī)器視覺進(jìn)行農(nóng)作物種子品種的自動(dòng)識(shí)別,可以實(shí)現(xiàn)快速、無(wú)損檢測(cè),便于形成簡(jiǎn)單便攜的應(yīng)用于種子流通和種植現(xiàn)場(chǎng)的檢測(cè)設(shè)備。但是,相對(duì)于上述列舉的各種實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)方法,目前利用機(jī)器視覺進(jìn)行品種自動(dòng)識(shí)別的準(zhǔn)確率還難以滿足實(shí)際應(yīng)用的需要,解決的途徑就是基于更有效的特征參數(shù)建立更準(zhǔn)確的識(shí)別模型。

        利用機(jī)器視覺進(jìn)行玉米品種的自動(dòng)識(shí)別研究,大部分采用針對(duì)玉米種子整體的特征參數(shù)[4-13]。為了提高分類識(shí)別的準(zhǔn)確率,近些年也開始進(jìn)行局部特征的研究。寧紀(jì)鋒等[14]利用玉米種子尖端的形態(tài)特征和胚部圖像的亮度特征進(jìn)行了玉米子粒品質(zhì)的識(shí)別研究;史智興等[15]提出了把玉米子粒的數(shù)字圖像分解為胚部和冠部尋找局部特征參數(shù)的研究思路,分別提取了玉米胚部和冠部的顏色和面積等直接特征,構(gòu)造了胚部和冠部的面積比等間接特征,在少量樣本下驗(yàn)證了局部特征在品種識(shí)別中的有效性;韓仲志等[16]提出了一種基于獨(dú)立分量分析ICA的玉米胚部測(cè)量方法,并建立了檢測(cè)模型。

        玉米子粒由胚部(白色部分)與冠部(黃色部分)組成。其中的胚部部分是玉米的重要農(nóng)藝性狀之一。玉米的胚形指的是玉米子粒白色胚部果皮的形態(tài)、面積的大小及沿形狀。在遺傳過程中,玉米子粒的胚形具有相對(duì)穩(wěn)定性,是玉米品種的主要特征之一。因此,研究玉米種子的胚形可以有效地進(jìn)行玉米品種的鑒別[17]。為了進(jìn)一步驗(yàn)證胚部在玉米識(shí)別過程中的有效性,以玉米子粒的胚部為研究對(duì)象,提取了胚部的6個(gè)形態(tài)特征參數(shù),并以K-聚類分析算法進(jìn)行了基于玉米胚部特征的品種識(shí)別。

        1 試驗(yàn)材料

        試驗(yàn)選取4個(gè)玉米品種,分別是先玉335、農(nóng)大4967、京科25和金秋963,主色調(diào)均為黃色,由河北農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)學(xué)院作物育種部門提供。每個(gè)玉米品種選取具有固有特征的70粒種子作為試驗(yàn)樣本。

        2 圖像采集與參數(shù)提取

        2.1 玉米子粒圖像的采集

        選取的4個(gè)玉米品種共280粒的試驗(yàn)樣本,若每個(gè)子粒單獨(dú)采集圖像,工作量大,效率低,故選擇先同時(shí)采集多個(gè)玉米子粒圖像,后期進(jìn)行圖像分割,進(jìn)而分離出每個(gè)玉米子粒胚部圖像的方法。

        具體方法為:采用人工擺放方式將一個(gè)玉米品種的70粒種子樣本全部放在黑色橡膠板上。要求玉米子粒相互間不重疊,玉米子粒胚部所在面朝上,并且使玉米子粒尖端朝向掃描起始方向(以便減少掃描儀照明所產(chǎn)生的胚部皺褶陰影)。采用明基Q52平板掃描儀以600 dpi進(jìn)行掃描。最終獲得4個(gè)品種玉米子粒的4幅RGB圖像,圖像格式為.bmp。

        2.2 玉米子粒胚部圖像的提取

        采用閾值分割中的OSTU法對(duì)采集到的玉米子粒圖像進(jìn)行分割,并對(duì)分割后圖像運(yùn)用數(shù)學(xué)形態(tài)學(xué)中改進(jìn)的開閉運(yùn)算進(jìn)行修整,采用快速混合重構(gòu)算法對(duì)修整過的二值圖像中的孔洞進(jìn)行填充,可以得到玉米子粒的胚部圖像。

        2.3 特征參數(shù)的提取

        利用連通區(qū)域標(biāo)記法和多對(duì)象輪廓提取算法,從提取到的玉米子粒的胚部圖像中提取胚部的特征參數(shù)。每個(gè)子粒胚部提取6個(gè)形態(tài)特征參數(shù),分別是面積、周長(zhǎng)、圓形度、橢圓短長(zhǎng)軸比、矩形度、離心率(表1)。

        各參數(shù)的定義如下:①面積:胚部區(qū)域像素的個(gè)數(shù);②周長(zhǎng):胚部區(qū)域的邊緣像素個(gè)數(shù);③矩形度:胚部區(qū)域的面積/包圍該連通域的最小矩形面積;④圓形度=4π×面積/(周長(zhǎng)×周長(zhǎng));⑤橢圓短長(zhǎng)軸比:與胚部區(qū)域具有相同標(biāo)準(zhǔn)二階中心矩的橢圓的短軸與長(zhǎng)軸的比值;⑥離心率:具有相同標(biāo)準(zhǔn)二階中心矩的橢圓的離心率。

        3 基于胚部特征的玉米品種的識(shí)別

        3.1 K-均值聚類分析算法

        根據(jù)數(shù)據(jù)的內(nèi)在性質(zhì)將數(shù)據(jù)集合中的數(shù)據(jù)分成若干類,聚類的原則是,將具有相同特性的數(shù)據(jù)盡可能地歸為同一個(gè)聚合類中,并且使不同類之間的屬性差別盡可能大。K-均值聚類算法是目前應(yīng)用最為廣泛的一種聚類算法,其基本原理是用戶指定聚類的數(shù)目k,算法依據(jù)某個(gè)距離函數(shù)把指定的數(shù)據(jù)集合中的數(shù)據(jù)反復(fù)地分入k個(gè)聚類中。

        具體的K-均值聚類過程如下:

        初始的聚類中心由系統(tǒng)隨機(jī)選取的k個(gè)對(duì)象決定,分別計(jì)算各個(gè)種子聚類中心與每個(gè)對(duì)象之間的距離,選擇最近的聚類中心距離分配對(duì)象。一個(gè)聚類由分配的對(duì)象和該類的聚類中心組成。當(dāng)全部對(duì)象都被分配完成后,再根據(jù)聚類中現(xiàn)有的對(duì)象重新計(jì)算該聚類中的聚類中心。不斷地重復(fù)這個(gè)過程,直到某個(gè)終止條件成立。終止條件可以為:

        1)每個(gè)聚類中不再有新的對(duì)象被分配進(jìn)入;

        2)所有的聚類中心不再發(fā)生變化;

        3)誤差平方和局部最小。

        算法的偽代碼如下:

        1)選擇k個(gè)點(diǎn)作為初始質(zhì)心;

        2)repeat

        將每個(gè)點(diǎn)指派到最近的質(zhì)心,形成k個(gè)簇重新計(jì)算每個(gè)簇的質(zhì)心

        util 質(zhì)心不發(fā)生變化

        3.2 品種識(shí)別過程

        采用SPSS軟件提供的k-均值聚類功能對(duì)試驗(yàn)所提取到的4個(gè)玉米品種子粒的6個(gè)胚部形態(tài)特征參數(shù)進(jìn)行聚類分析。每次分析的樣本數(shù)量為100粒,其中含有一定數(shù)量的待測(cè)品種和若干粒其他雜粒品種。初始聚類中心由系統(tǒng)隨機(jī)選擇。4個(gè)玉米品種的識(shí)別率達(dá)到94%以上,結(jié)果如表2所示。

        利用K-均值聚類分析對(duì)4個(gè)玉米品種的識(shí)別率高低不同,原因主要有以下幾點(diǎn):不同的玉米種子本身存在著個(gè)體差異,如胚部的飽滿與凹陷等;在圖像采集時(shí),掃描儀照明產(chǎn)生的某些胚部皺褶陰影導(dǎo)致最后提取到的胚部圖像信息存在一些差異。聚類分析所選取的聚類特征不盡完美,還有待進(jìn)一步的研究。這些都在一定程度上對(duì)玉米種子胚部圖像的提取和參數(shù)特征分析產(chǎn)生了不同程度的影響。

        4 小結(jié)

        種子的質(zhì)量對(duì)農(nóng)作物的產(chǎn)量有著重大的影響。玉米是我國(guó)最主要的農(nóng)作物之一, 對(duì)玉米品種的識(shí)別研究一直是農(nóng)業(yè)領(lǐng)域的熱點(diǎn)課題。玉米子粒的胚部特征是重要的農(nóng)藝性狀之一,不同品種的玉米胚部特征有較大的差別。掃描了玉米4個(gè)品種各70粒種子的圖像,并利用OSTU、開閉運(yùn)算、連通區(qū)域標(biāo)記法和多對(duì)象輪廓提取算法對(duì)圖像進(jìn)行處理,得到了玉米子粒的胚部形態(tài)特征參數(shù)。利用K-均值聚類分析對(duì)提取到的特征參數(shù)進(jìn)行聚類分析,4個(gè)玉米品種的檢出率達(dá)到94%以上。試驗(yàn)結(jié)果驗(yàn)證了利用胚部形態(tài)特征進(jìn)行玉米品種識(shí)別的有效性。

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        (責(zé)任編輯 王曉芳)

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