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        長白山中華蜜蜂(Apis cerana cerana)遺傳多樣性分析

        2013-12-24 10:00:20于瀛龍周姝婧徐新建朱翔杰周冰峰
        關(guān)鍵詞:微衛(wèi)星雜合長白山

        于瀛龍,周姝婧,徐新建,朱翔杰,周冰峰

        (福建農(nóng)林大學(xué)蜂學(xué)學(xué)院,福建福州350002)

        遺傳多樣性是物種適應(yīng)環(huán)境變化的必備條件,是進(jìn)化的物質(zhì)基礎(chǔ),反映了物種的進(jìn)化潛力[1].遺傳多樣性和遺傳結(jié)構(gòu)是種群遺傳學(xué)、進(jìn)化生物學(xué)和保育遺傳學(xué)等生命科學(xué)的重要內(nèi)容[1-3].在我國中華蜜蜂遺傳多樣性和遺傳結(jié)構(gòu)的研究中,云南[4]、福建[5-6]、海南[7]、重慶[8]、廣東[9]、華東[10]、東北[11]等地區(qū)中華蜜蜂的研究已開展[12-13].通過19群樣本的測定,在長白山中華蜜蜂遺傳多樣性的研究中已發(fā)現(xiàn)了5種mtDNA單倍型種類[11,14-15];嘗試用2群中華蜜蜂樣本的csd基因和用12群中華蜜蜂樣本的RAPD標(biāo)記,對長白山中華蜜蜂的遺傳多樣性和遺傳結(jié)構(gòu)進(jìn)行探索[16-18].長白山地區(qū)中華蜜蜂mtDNA標(biāo)記、微衛(wèi)星標(biāo)記的遺傳多樣性與遺傳結(jié)構(gòu)的分析還需深入研究.

        長白山是東北中華蜜蜂的主要分布區(qū),是中華蜜蜂分布的東北部邊緣,具有獨特的生物學(xué)特性[19-20].長白山中華蜜蜂在長期的進(jìn)化過程中形成了群勢強(qiáng)、耐寒力高、分蜂性弱等適應(yīng)當(dāng)?shù)丨h(huán)境的特性[21],可在最低氣溫-40℃的環(huán)境自然越冬,越冬期長達(dá)半年[11,20].長白山中華蜜蜂在體色、體長、前翅翅脈、肘脈指數(shù)等主要形態(tài)標(biāo)記表現(xiàn)出特殊性.相比于其他地區(qū)中華蜜蜂,長白山中華蜜蜂個體較大,體色偏黑[21-22],肘脈指數(shù)較高,為 4.09-5.99[21,23-24],第三徑中橫脈出現(xiàn)突出的頻率較高,為 30%-80%[22,24].

        本研究在長白山的腹地,中華蜜蜂主產(chǎn)區(qū)采集110群樣本,采用5對微衛(wèi)星引物和mtDNA tRNAleu-COII 357 bp片段,分析該地區(qū)中華蜜蜂的遺傳多樣性與遺傳結(jié)構(gòu).本研究為長白山地區(qū)中華蜜蜂資源保護(hù)和利用提供重要理論依據(jù).

        1 材料與方法

        1.1 試驗材料

        中華蜜蜂樣本于2008年8月采自吉林省長白山區(qū)的安圖縣池北區(qū)、二道白河鎮(zhèn)、松江鎮(zhèn)地區(qū),總計樣本數(shù)量110群蜜蜂(表1).

        表1 長白山中華蜜蜂樣本信息Table 1 Information of samples from Changbai Mountains

        1.2 試驗方法

        每群取1只工蜂,利用UNIQ10柱式基因組DNA抽提試劑盒(生工生物上海股份有限公司)提取基因組.

        PCR擴(kuò)增微衛(wèi)星位點的引物來源于NCBI網(wǎng)站(表2),反應(yīng)條件為95℃預(yù)變性5 min;95℃變性50 s,退火30 s(退火溫度參照表2),72℃延伸30 s,30個循環(huán);72℃延伸10 min;4℃保存.微衛(wèi)星PCR產(chǎn)物經(jīng)8%非變性聚丙烯酰胺凝膠電泳檢測.

        表2 微衛(wèi)星位點信息Table 2 Information of 5 microsatellite loci

        PCR擴(kuò)增mtDNA tRNAleu-COII片段,上游引物為E2:5'-GGCAGAATAAGTGCATTG-3',下游引物H2:5'-CAATATCATTGATGACC-3'[25].反應(yīng)條件為95 ℃預(yù)變性5 min;95 ℃變性30 s,50 ℃退火30 s,72 ℃ 延伸30 s,30個循環(huán);72℃延伸8 min;8℃保存.mtDNA PCR產(chǎn)物送至上海英駿生物技術(shù)有限公司進(jìn)行測序.為保證結(jié)果的準(zhǔn)確性,測序結(jié)果中個體數(shù)量在3只以下的單倍型進(jìn)行重復(fù)測序.

        1.3 統(tǒng)計方法

        根據(jù)8%非變性聚丙烯酰胺電泳結(jié)果進(jìn)行微衛(wèi)星位點的等位基因判讀,利用Ms tools軟件計算期望雜合度(expected heterozygosity,He)、觀察雜合度(observed heterozygosity,Ho)、多態(tài)信息含量(polymorphism information content,PIC)與等位基因頻率.利用Popgene 1.31軟件計算等位基因數(shù)(observed number of alleles,Na)、有效等位基因數(shù)(effective number of alleles,Ne)與香農(nóng)指數(shù)(Shannon's information index,I).

        mtDNA測序序列以非編碼區(qū)“AAAATTT”序列為開始,截取357 bp的序列片段進(jìn)行分析,利用ClustalX 1.83軟件對其進(jìn)行比對,統(tǒng)計單倍型種類,利用MEGA 4.0軟件計算序列的堿基組成,利用DnaSP 5.00.07軟件計算單倍型多樣度(haplotype diversity,Hd),核苷酸多樣度(nucleotide diversity,Pi)與平均核苷酸差異數(shù)(average number of nucleotide differences,K).

        2 結(jié)果與分析

        2.1 長白山中華蜜蜂遺傳多樣性

        2.1.1 微衛(wèi)星位點的遺傳多樣性 長白山中華蜜蜂在A107、AP043、AP085、AP313、AT101位點整體等位基因較少,遺傳多樣性水平低.每個微衛(wèi)星位點發(fā)現(xiàn)1-4個等位基因,平均等位基因數(shù)為2.6000±1.1402,平均有效等位基因數(shù)為1.4181±0.6487.長白山中華蜜蜂5個微衛(wèi)星位點的期望雜合度為0-0.6107,平均期望雜合度為0.2110±0.2333.除A107位點的期望雜合度為0.6107外,其余4個位點的期望雜合度為0-0.1780.5 個位點的觀察雜合度為0-0.1827,平均觀察雜合度為0.0645 ±0.0718.5 個位點的平均香農(nóng)指數(shù)為 0.4031 ±0.4202(表3).

        表3 長白山中華蜜蜂微衛(wèi)星DNA的遺傳多樣性參數(shù)Table 3 Genetic diversity parameters of Apis cerana cerana from Changbai Mountains by microsatellite loci

        2.1.2 線粒體DNA遺傳多樣性 長白山中華蜜蜂在mtDNA tRNAleu-COII 357 bp片段T、C、A、G 4種核苷酸的平均比例分別為44.8%、9.5%、40.6%和5.0%.長白山中華蜜蜂共檢測出9種單倍型,H1單倍型(Japan1型,AB078733)是文獻(xiàn)報道中分布較為廣泛的類型,相比于H1單倍型,1種單倍型在1個位點上發(fā)生缺失,7種單倍型分別在1個位點發(fā)生突變(表4),其中單一多態(tài)位點4個,簡約信息位點3個.

        表4 長白山中華蜜蜂mtDNA tRNAleu-COII片段單倍型種類及變異信息1)Table 4 Variable sites and haplotypes of Apis cerana cerana from Changbai Mountains in mtDNA tRNAleu-COII region

        長白山中華蜜蜂mtDNA tRNAleu-COII 357 bp片段遺傳多樣性偏低,單倍型多樣度為0.249±0.054、核苷酸多樣度為0.00074 ±0.00017、平均核苷酸差異為0.263.

        本研究在長白山地區(qū)新發(fā)現(xiàn) H2、H3、H4、H5、H7、H8、H9等7種單倍型.與 NCBI網(wǎng)站進(jìn)行比對,H3(登錄號:KF673779)、H5(登錄號:KF673782)、H7(登錄號:KF673780)、H8(登錄號:KF673781)等4種單倍型為中華蜜蜂中首次發(fā)現(xiàn)(表4),H2、H4、H9等3種單倍型為在長白山地區(qū)發(fā)現(xiàn)的新記錄.

        2.2 長白山中華蜜蜂遺傳結(jié)構(gòu)

        2.2.1 微衛(wèi)星遺傳結(jié)構(gòu) 長白山中華蜜蜂5個微衛(wèi)星位點的遺傳結(jié)構(gòu)中,均以一種等位基因為主.AP043、AP085、AP313、AT101等4個位點的主要主等位基因,占所檢測到的等位基因90%以上.AP313位點只有1種等位基因(342 bp).A107有4種等位基因,其中165 bp占所檢測到的等位基因50%以上(表5).2.2.2 線粒體遺傳結(jié)構(gòu) 長白山中華蜜蜂mtDNA tRNAleu-COII 357 bp片段的遺傳結(jié)構(gòu)較單一.9種單倍型中,以H1(Japan1型)單倍型為主,占83.64%.其次為H9單倍型,占6.36%.其余7種單倍型頻率為0.91%-2.73%(表 4).

        表5 長白山中華蜜蜂的微衛(wèi)星遺傳結(jié)構(gòu)Table 5 Genetic structure of Apis cerana cerana based on microsatellite in Changbai Mountains

        3 討論

        (1)在現(xiàn)有中華蜜蜂遺傳多樣性研究中,中華蜜蜂 A107、AP043、AP085、AP313、AT101 這 5 個微衛(wèi)星位點的 PIC 值主要范圍分別是0.5-0.6、0.2-0.5、0.7-0.85、0.2-0.4 和 0.2-0.5[5-6,26],長白山中華蜜蜂的 PIC 值分別為 0.5541、0.1186、0.1319、0和0.1644,均低于PIC值的主要分布范圍或處于較低水平.期望雜合度也體現(xiàn)出相似的規(guī)律[5-6,26].目前,較少使用mtDNA tRNAleu-COII片段進(jìn)行中華蜜蜂遺傳多樣性研究,僅有海南中華蜜蜂的相關(guān)研究中運用了該片段.海南中華蜜蜂 mtDNA tRNAleu-COII片段發(fā)現(xiàn)單倍型多樣度、核苷酸多樣度、平均核苷 酸 差異分別為 0.742 ± 0.017、0.00354 ±0.00013和1.248[7],而長白山中華蜜蜂的這3個指標(biāo)均遠(yuǎn)低于海南中華蜜蜂的研究結(jié)果.所以微衛(wèi)星和線粒體分子遺傳標(biāo)記分析,均說明長白山中華蜜蜂遺傳多樣性水平處于非常低的水平.

        (2)長白山植被良好、具有大宗蜜源以及豐富的輔助蜜粉源,是中華蜜蜂優(yōu)良的棲息地.20世紀(jì)前長白山野生中華蜜蜂資源極豐富,此地蜂蜜是皇家貢品[27].由于西方蜜蜂引進(jìn)后引起種間競爭,導(dǎo)致長白山中華蜜蜂種群數(shù)量下降;外來中華蜜蜂基因滲入,使得當(dāng)?shù)刂腥A蜜蜂面對環(huán)境變化、疾病等惡劣條件的耐受性下降;經(jīng)濟(jì)較發(fā)達(dá)的鄰國對野生蜂蜜的高價需求,促進(jìn)毀巢取蜜的行為,毀滅性減少了當(dāng)?shù)匾吧腥A蜜蜂的種群數(shù)量;社會經(jīng)濟(jì)的發(fā)展,養(yǎng)蜂人的數(shù)量減少,養(yǎng)蜂技術(shù)下降;人工育王技術(shù)應(yīng)用不當(dāng),以上原因均使得長白山中華蜜蜂種群遺傳多樣性降低.長白山中華蜜蜂形成分散的小種群,遺傳變異低于其它地區(qū)的中華蜜蜂,并表現(xiàn)出較為單一的遺傳結(jié)構(gòu).

        (3)長白山中華蜜蜂是分布在我國東北地區(qū)的中華蜜蜂代表,是耐寒型中華蜜蜂的寶貴資源.原長白山中華蜜蜂廣泛分布在黑龍江省的小興安嶺以南、吉林省和遼寧省的長白山脈,具有維持強(qiáng)群、耐寒力強(qiáng)等優(yōu)良蜂種特性.但近年來長白山中華蜜蜂數(shù)量大幅度減少,已成為中華蜜蜂中數(shù)量最少的生態(tài)型,處于瀕危維持狀態(tài)[9,28].長白山中華蜜蜂存在著滅絕的風(fēng)險.生命資源的滅絕將會永久消失,因此搶救性保護(hù)長白山中華蜜蜂刻不容緩.建議在長白山中華蜜蜂分布較多、生態(tài)條件較好的地方設(shè)立中華蜜蜂保護(hù)區(qū);在保護(hù)區(qū)內(nèi)政府用補(bǔ)貼、技術(shù)支持等形式鼓勵當(dāng)?shù)剞r(nóng)民原始飼養(yǎng)本土的中華蜜蜂,擴(kuò)大長白山中華蜜蜂的種群數(shù)量;禁止西方蜜蜂和轉(zhuǎn)地的中華蜜蜂進(jìn)入,禁止從保護(hù)區(qū)外購買蜂種或蜂王,保持長白山中華蜜蜂的遺傳特征;在保護(hù)區(qū)內(nèi)適當(dāng)?shù)挠杏媱澋姆淙航涣鳎贿M(jìn)行人工選育,保持長白山中華蜜蜂的遺傳多樣性.致謝:樣本采集中得到了楊明福等同志的幫助.本科生夏鳳枝參與部分實驗.謹(jǐn)此致謝!

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