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        釀酒酵母GSH I基因的克隆、表達與結構分析

        2013-12-06 07:14:34宋冬梅朱益波周麗麗鄭麗雪
        食品工業(yè)科技 2013年13期
        關鍵詞:谷胱甘肽克隆質粒

        宋冬梅,朱益波,周麗麗,鄭麗雪,齊 斌,*

        (1.吉林農業(yè)大學,食品科學與工程學院,吉林長春130118;2.常熟理工學院發(fā)酵工程技術研究中心,蘇州食品生物技術重點實驗室,江蘇常熟215500)

        谷胱甘肽(glutathione,GSH)是在γ-谷氨酰半胱氨酸合成酶(GSH I)和谷胱甘肽合成酶(GSHⅡ)的連續(xù)催化下合成的含巰基活性三肽,具有解毒、抗氧化和抗衰老等重要的生理功能[1-3],在食品、醫(yī)藥和生物等領域有著廣泛地應用[4-7]。但是我國GSH的生產滿足不了市場的需求。近年來,GSH生產研究的熱點是利用DNA重組技術構建高產GSH的重組菌。Murata等[8]構建了具有較高GSH催化活性的重組 Escherichia coli。沈立新等[9]構建了含 GSH I及GSHⅡ基因的質粒pTrc-gsh,并在E.coli中得到了活性表達。Liao等[10]構建的E.coli GSH I和GSH Ⅱ基因融合表達質粒,提高了胞內GSH含量。這些研究在一定程度上提高了重組菌GSH的產量,但總的來說都不理想。GSH I是GSH合成途徑的關鍵酶和限速酶[11],構建高GSH I活性的菌株將有助于提高重組菌GSH的產量。本文從實驗室保存的一株高產GSH的Saccharomyces cerevisiae 2-10515出發(fā),采用PCR技術擴增得到GSH I基因,并在E.coli中實現(xiàn)表達,同時利用生物信息學方法對GSH I基因序列和結構進行分析和預測,為進一步提高GSH I表達量和活性提供理論依據(jù)。

        1 材料與方法

        1.1 材料與儀器

        S.cerevisiae 2-10515、E.coli JM109、E.coli BL21(DE3)、質粒pET-28a 本實驗室保藏;DNA限制性內切酶Sac I和HindⅢ、Taq DNA聚合酶、T4 DNA Ligase、pMD19-T 載體、DNA Marker、質粒小量提取試劑盒、DNA純化及膠回收試劑盒等 TaKaRa公司;其他試劑 均為國產分析純;YEPD培養(yǎng)基、LB培養(yǎng)基 配方見文獻[12]。

        高速臺式離心機Legend Micro 17R Thermo公司;PCR儀、Gel Doc XR、水平電泳系統(tǒng)、垂直電泳系統(tǒng)、凝膠電泳成像儀 Bio-RAD公司;恒溫金屬浴Eppendorf公司;SW-CJ-ZF凈化工作臺 蘇州凈化設備有限公司;恒溫培養(yǎng)箱 太倉市華美生化儀器廠;電子天平 Mettler公司。

        1.2 實驗方法

        1.2.1 引物設計 根據(jù)Gene bank里已公布的S.cerevisiae S288c的gsh I基因設計引物,分別在上游和下游引物中引入酶切位點Sac I和HindⅢ:

        P1(Forward):CACGAGCTCATGGGACTCTTAGCTTT酶切位點Sac I

        P2(Reverse):CCCAAGCTTTTAACATTTGCTTTCTA酶切位點HindⅢ

        1.2.2 克隆載體的構建 采用周小玲等人[13]的方法提取S.cerevisiae 2-10515的基因組 DNA,以其為模板,P1和P2為引物進行PCR擴增,得到gsh I基因。PCR 反應參數(shù)為:95℃ 5min;94℃ 30s,58℃ 30s,72℃ 2min(30cycles);72℃ 10min。將gsh I連接到克隆載體pMD19-T上,構建克隆質粒 pMD19-T-gsh I,并轉化E.coli JM109,得到E.coli JM109(pMD19-T-gsh I),提取克隆質粒進行酶切驗證,送上海生工生物有限公司測序。

        1.2.3 E.coli重組表達載體的構建 分別用限制性內切酶Sac I和HindⅢ酶切克隆質粒pMD19-T-gsh I和質粒pET-28a,酶切產物經膠回收純化,16℃連接過夜,轉化E.coli DH5α。抽提重組質粒,經酶切驗證后測序。

        將重組表達質粒 pET-28a-gsh I熱激轉化到E.coli BL21(DE3)。

        1.2.4 GSH I的誘導表達 挑取單菌落接入LB培養(yǎng)基(含100mg/mL Amp),37℃培養(yǎng)至 OD550為 0.5左右時,在34℃,IPTG(0.1mmol/L)條件下,誘導表達。

        1.2.5 SDS-PAGE檢測 按《分子克隆》[14]操作說明進行SDS-PAGE電泳后,考馬斯亮藍R-250染色,脫色過夜,觀察結果。

        1.2.6 GSH I酶活性的測定 取5mL培養(yǎng)液12000×g離心5min,棄上清,用50mmol/L,pH7.0的磷酸緩沖液洗滌,離心后收集菌體。用同樣的磷酸緩沖液4mL懸浮菌體后超聲波破碎[15],加入GSH前體反應液(谷氨酸、甘氨酸和半胱氨酸濃度均為40mmol/L,MgCl2和ATP濃度均為50mmol/L,GSH I濃度為2g/L)4mL,37℃反應 30min,沸水浴 2min以終止反應,用ALLOXAN試劑法[16]測GSH的生成量。酶活力單位(U)定義為37℃,pH7.0條件下,每分鐘催化合成1μg GSH所需的酶量。

        1.2.7 GSH I的結構分析 利用DNAMAN軟件推導出目的基因的氨基酸序列,分析其與Gene bank數(shù)據(jù)庫中其它物種同源蛋白氨基酸序列的一致性。

        通過蛋白分析專家系統(tǒng)(ExPASy,http://ca.expasy.org/)提供的分析工具分別預測蛋白質的理化性質、一級結構和二級結構。

        利用3D-JIGSAW模擬GSH I的三級結構。

        2 結果與分析

        2.1 基因克隆

        以S.cerevisiae 2-10515基因組DNA為模板進行PCR擴增反應,擴增產物純化后電泳結果見圖1。圖1顯示:目的條帶在2000bp附近,與預計的條帶大小相吻合。

        圖1 gsh I基因的PCR純化產物Fig.1 PCR purification product of gsh I

        2.2 重組表達載體的構建

        成功構建的表達載體pET-28a-gsh I的結構示意圖如圖2。將其用Sac I和HindⅢ酶切鑒定,結果如圖3。經酶切的重組質粒含有單一的約2Kb插入片段,這表明gsh I基因已插入質粒pET-28a中。測序結果證明閱讀框插入位點正確。

        圖2 重組表達載體pET-28a-gsh I結構示意圖Fig.2 Construction of recombinant expression plasmid pET-28a-gsh I simple

        圖3 重組質粒pET-28a-gsh I/Sac I+HindⅢ酶切鑒定Fig.3 pET-28a-gsh I digested by Sac I and Hind Ⅲ

        2.3 SDS-PAGE電泳分析

        SDS-PAGE電泳后考馬斯亮藍染色,脫色過夜,觀察結果如圖4所示:2、3、4泳道與陰性對照(1泳道)相比,在81Ku附近有一條明顯的蛋白條帶,除去載體上的his-tag(分子量約為3ku),其實際的蛋白質分子量約為78ku,與預測的GSH I蛋白大小相符,很可能為表達的GSH I蛋白,該蛋白以融合蛋白的形式存在。

        圖4 SDS-PAGE分析圖譜Fig.4 SDS-PAGE analysis of expression products

        2.4 酶活力的測定

        重組菌的GSH I活力測定結果見圖5,34℃誘導4h時,其活力達到46.09U/mg濕菌,隨著誘導時間的延長,GSH I活力并沒有增加,最佳誘導時間為4h。優(yōu)化各種表達條件,酶活力無明顯改善。

        圖5 重組菌GSH I酶活力曲線Fig.5 GSH I enzymatic activity curve of recombinant strain

        2.5 GSH I基因的結構分析

        2.5.1 Blast分析結果 該基因全長為2037bp,編碼678個氨基酸。對GSH I氨基酸序列進行同源多重序列比對(如圖6)發(fā)現(xiàn):序列中部為保守序列,其關鍵氨基酸都在該保守序列中;與Gene bank中S.cerevisiae S288c、Macaca mulatta、Musmusculus、Branchiostoma floridae同源基因的氨基酸序列一致性分別為99%、42%、42%、41%。

        圖6 GSH I的Clustal多重序列比對Fig.6 Multiple alignment of GSH I by Clustal

        2.5.2 GSH I蛋白質的理化性質 利用ExPASy中ProtParam預測GSH I的理論分子量為78281.6u;等電點為5.87;含有9個半胱氨酸;其中第164位和第642位半胱氨酸有形成二硫鍵的可能性;該蛋白質的性質不穩(wěn)定,在溶液中的不穩(wěn)定指數(shù)為42.19,高于閾值40;脂溶性指數(shù)為77.52;親水指數(shù)(GRAVY)為-0.507,為親水性蛋白。其成熟肽N端為蛋氨酸時,在哺乳動物網狀紅細胞體外表達的半衰期為30h,在酵母和大腸桿菌中表達的半衰期分別為20、10h。

        2.5.3 GSH I的二級結構 利用ExPASy中PredictProtein分析蛋白的拓撲結構和二級結構,該蛋白沒有信號肽,為非分泌蛋白;在253~272aa、285~308aa和484~511aa處有三個跨膜區(qū);α-螺旋∶延伸鏈:β-折疊∶無規(guī)則卷曲 =35.10∶16.52∶8.85∶39.53,表明蛋白質二級結構的主要結構元件是α-螺旋和無規(guī)則卷曲,具有較多的無規(guī)則卷曲,不利于其穩(wěn)定;mRNA的二級結構在起始密碼子處形成發(fā)卡結構。

        2.5.4 GSH I的三級結構 將GSH I的氨基酸序列提交到3D-JIGSAW服務器預測GSH I三級結構,用Pymol軟件打開,如圖7所示,發(fā)現(xiàn)酶結構較松散,側鏈間相互作用不強,這與ProtParam的預測結果相一致。

        圖7 GSH I三級結構圖Fig.7 3D structure of GSH I

        3 結論與討論

        已有學者在S.cerevisiae和Pichia pastoris中表達了 GSH I[17-18],但這些報道中 GSH I 的表達量不高,酶活力也較低,使得構建好的菌株無法達到工業(yè)化生產的要求。S.cerevisiae是高產GSH的菌株,將其GSH I在E.coli中表達,有望構建高活性的GSH I重組菌,為工業(yè)化生產GSH奠定基礎。本研究成功克隆了S.cerevisiae 2-10515的gsh I基因,將編碼GSH I的基因定向克隆到pET-28a載體上,構建了重組菌株 E.coli BL21(DE3)/pET-28a-gsh I,34℃ 誘導 4h時,活力達到 46.09U/mg 濕菌,高于 Fan[17]、饒志明[18]等構建的重組菌株。

        利用生物信息學方法分析S.cerevisiae 2-10515 GSH I序列可知:a.gsh I基因轉錄出的mRNA在5'端起始部位區(qū)形成了發(fā)卡結構,有研究證實這種發(fā)卡結構會遮蔽SD序列和起始密碼子部位能阻止30s核糖體亞基的結合,從而減慢翻譯起始頻率[19],降低相應蛋白質的表達量。B.GSH I在溶液中的不穩(wěn)定指數(shù)為 42.19,高于閾值 40;GSH I親水指數(shù)為-0.507,為親水性蛋白;該酶分子中含有較多的無規(guī)則卷曲,結構比較松散。這些都說明GSH I穩(wěn)定性較差[20],不利于活性的提高。所以,從基因水平對S.cerevisiae 2-10515進行分子改造能進一步提高該酶的表達量和活性。

        Huang[21]通過對 mRNA 結構的改造,消除了起始密碼子附近mRNA的二級結構,從而提高了木聚糖酶的表達量;Jeong[22]、Mahadevan[23]等通過同源建模及結構分析,利用定點突變增加了酶的穩(wěn)定性。這些研究都為后續(xù)對S.cerevisiae GSH I分子改造提供了很好的基礎。本文在 E.coli中成功表達了S.cerevisiae來源的GSH I,為工業(yè)應用奠定了基礎;并對其進行了初步的生物信息學分析,為后續(xù)研究指明了方向。

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