朱志明,鄭嫩珠,繆中緯,段園園,辛清武,陳 暉*
(1. 福建省農(nóng)業(yè)科學(xué)院 畜牧獸醫(yī)研究所,福建 福州 350013;2. 農(nóng)業(yè)經(jīng)濟與科技信息研究所,福建 福州 350003)
隨著雜種優(yōu)勢在畜牧業(yè)上的利用日益廣泛,雜種優(yōu)勢的預(yù)測亦越顯重要,對畜禽雜種優(yōu)勢做出快速有力的預(yù)測已經(jīng)成為一個研究熱點[1]。微衛(wèi)星標(biāo)記因具有數(shù)量多,基因組中分布廣泛,多態(tài)性豐富,呈孟德爾共顯性遺傳方式,檢測容易、快速等優(yōu)點而越來越廣泛應(yīng)用于動植物研究中[2]。雜種優(yōu)勢的利用是提高家畜生產(chǎn)水平的重要手段,而對雜種優(yōu)勢的預(yù)測則是利用雜種優(yōu)勢的關(guān)鍵環(huán)節(jié)。因此,尋求最佳雜種優(yōu)勢預(yù)測方法一直是育種學(xué)研究的熱點問題。本研究以幾個白羽半番鴨親本為研究對象,采用微衛(wèi)星標(biāo)記技術(shù)估測雜交親本間的遺傳距離,研究微衛(wèi)星標(biāo)記遺傳距離與雜交后代半番鴨生長性狀雜種優(yōu)勢率的相關(guān)關(guān)系,以期為白羽半番鴨優(yōu)良雜交組合的選擇提供參考依據(jù)。
試驗鴨共分為九組,包括1個父本(白番鴨),4個母本種鴨,其中:M18由克里莫公司培育、大型、中型和小型分別是以北京鴨、白羽蛋鴨與北京鴨雜交合成系以及蛋鴨為素材培育的專門化品系。4個雜交后代半番鴨(番鴨♂×大型♀、番鴨♂×中型♀和番鴨♂×小型♀)。每個親本及其雜交后代半番鴨各100~120只,共900~1 180只。試驗鴨群同時出雛,全程飼養(yǎng)管理條件一致。飼養(yǎng)至70日齡時,每組選取平均體重6只(公母各半)供屠宰試驗,同時親本各組隨機采血40只(公母各半),4 ℃保存?zhèn)溆?,用于提取血液基因組DNA,微衛(wèi)星標(biāo)記分析。
從20多個微衛(wèi)星引物中篩選了8個多態(tài)性較好的作為試驗位點。所有引物均由上海生工生物工程技術(shù)服務(wù)有限公司合成。
常規(guī)酚/氯仿提取DNA,溶于適量的TE(pH8.0)中,置于-20 ℃保存。
PCR反應(yīng)體系采用25 μL:模板DNA 50 ng,10×buffer 2.5 μL,dNTPs 0.2 mM,上下游引物各5 pM,Mg2+2.0 mM,Taq DNA聚合酶1 U。反應(yīng)條件:95 ℃預(yù)變性4 min,94 ℃變性50 s,50~65 ℃復(fù)性50 s,72 ℃延伸1 min,30~35個循環(huán);最后72 ℃延伸10 min;4 ℃保存。擴增產(chǎn)物95 ℃變性5 min后,放入冰水中冷卻,點樣6 μL在8%變性聚丙烯酰胺凝膠上電泳檢測,200 V恒壓電泳,電泳時間的長短依據(jù)DNA片段大小確定,電泳結(jié)束后銀染。
1.5.1 群體遺傳信息的計算 統(tǒng)計5個鴨群體的等位基因組成,利用PopGen32軟件計算各微衛(wèi)星座位的基因頻率,多態(tài)信息含量(Polymorplism Information Content, PIC)和平均雜合度(Heterozygosity, H);利用Phylip軟件計算各品種間的Nei氏遺傳距離(DA)。
表1 8對微衛(wèi)星引物信息Table 1 Information of 8 pair primers of microsatellite
1.5.2 雜種優(yōu)勢率的計算 每組試驗鴨測定0~10周齡體重、耗料量,10周齡時隨機抽取接近組平均體重的6只試驗鴨(公母各半)按照中華人民共和國農(nóng)業(yè)行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)(NY/T823-2004)“家禽生產(chǎn)性能名詞術(shù)語和度量統(tǒng)計方法”進行相應(yīng)性狀的現(xiàn)場測定,計算各性狀雜交后代雜種優(yōu)勢率。雜種優(yōu)勢率(H%)的計算公式[3]如下:
H%=H/(P1+P2)/2×100%
式中:H為雜種優(yōu)勢值,P1、P2分別代表父本、母本均值。
1.5.3 遺傳距離與雜種優(yōu)勢率的相關(guān)分析 采用SPSS13.0軟件對親本間的遺傳距離與各性狀的雜種優(yōu)勢率進行相關(guān)分析。
等位基因數(shù)、有效等位基因數(shù)、多態(tài)信息含量和基因雜合度,計算結(jié)果見表2。由表2可知,8個微衛(wèi)星測定的5個種群等位基因數(shù)在3.1250~4.0000之間,平均等位基因數(shù)為3.6250;有效等位基因數(shù)在2.5699~3.0737之間,平均有效等位基因數(shù)為2.8881;基因雜合度在0.5918~0.6580之間,平均基因雜合度為0.6331;多態(tài)信息含量在0.4222~0.5977之間,平均多態(tài)信息含量為0.5181。結(jié)果顯示5個種群的雜合度和多態(tài)性為中等。
表2 供試種群遺傳信息Table 2 Genetic information of populations tested
注:M18-M18母本;LFP-大型母本;MFP-中型母本;SFP-小型母本;MD-番鴨。下表同。
Note:M18-M18 female parent;LFP-Large female parent;MFP-Middle female parent;SFP-Small female parent;MD-Mule duck。The same in the below.
根據(jù)親本間的奈氏遺傳距離(DA)見表3。由表3可知,番鴨♂×M18♀的遺傳距離最大,其次番鴨♂×中型♀、番鴨♂×大型♀,而番鴨♂×小型♀的遺傳距離最小,分別為0.4452、0.3671、0.3623和0.3224。
2.3.1 親本間的遺傳距離與半番鴨日增重雜種優(yōu)勢率的相關(guān)性 表4為各親本及其后代半番鴨各周齡日增重實測值,表5為親本間的遺傳距離與半番鴨各周齡日增重雜種優(yōu)勢率的相關(guān)關(guān)系。由表5可知,4組半番鴨在各個周齡的累積日增重呈現(xiàn)明顯的雜種優(yōu)勢,其中番鴨♂× M18♀最大,其次為番鴨♂×大型♀、番鴨♂×中型♀,番鴨♂×小型♀雜種優(yōu)勢最小。各組半番鴨的雜種優(yōu)勢率隨著周齡日益遞減。半番鴨日增重的雜種優(yōu)勢率與其親本間的遺傳距離相關(guān)分析結(jié)果表明,它們之間存在較強的正相關(guān)關(guān)系,相關(guān)系數(shù)在0.9285~0.9978,顯著性檢驗結(jié)果表明親本間遺傳距離與8周齡日增重呈極顯著相關(guān)(P<0.01),與10周齡日增重呈顯著相關(guān)(P<0.05)。
表3 親本種群間的遺傳距離(DA)Table 3 Genetic distance between parental populations
表4 親本及后代半番鴨日增重實測值Table 4 Observerd value of ADG of parental population and its hybrid offspring with mule duck
表5 親本間遺傳距離與半番鴨日增重的相關(guān)性 Table 5 Correlation between genetic distance of parental populations and ADG of hybrid offspring of mule duck
注:*表示差異顯著,**表示差異極顯著。
Note: * means significant difference, ** means extreme difference.
2.3.2 親本間的遺傳距離與半番鴨飼料轉(zhuǎn)化率雜種優(yōu)勢率的相關(guān)性 表6為各親本及其后代半番鴨飼料轉(zhuǎn)化率實測值,表7為親本間的遺傳距離與半番鴨飼料轉(zhuǎn)化率雜種優(yōu)勢率的相關(guān)關(guān)系。由表7可知,4組半番鴨各周齡的累積飼料轉(zhuǎn)化率的雜種優(yōu)勢呈負值,且隨著周齡日益遞減。半番鴨累積飼料轉(zhuǎn)化率的雜種優(yōu)勢率與其親本間的遺傳距離相關(guān)分析結(jié)果表明,它們之間呈較強的負相關(guān)關(guān)系,相關(guān)系數(shù)在-0.8246~-0.9426,顯著性檢驗結(jié)果表明各性狀相關(guān)系數(shù)均不顯著(P>0.05)。
表6 親本及后代半番鴨累積飼料轉(zhuǎn)化率實測值Table 6 Observerd value of feed conversion rate of parental population and its hybrid offspring with mule duck
2.3.3 親本間的遺傳距離與半番鴨10周齡屠宰性狀雜種優(yōu)勢率的相關(guān)性 表8為各親本及其后代半番鴨10周齡屠宰性狀實測值,表9為親本間的遺傳距離與半番鴨10周齡屠宰性狀雜種優(yōu)勢率的相關(guān)關(guān)系。由表9可知,4組半番鴨10周齡屠宰性狀中的半凈膛率、全凈膛率、胸肌率和腿肌率的雜種優(yōu)勢均呈正值,皮脂率和腹脂率呈負值。半番鴨10周齡屠宰性狀的雜種優(yōu)勢率與其親本間的遺傳距離相關(guān)分析結(jié)果表明,它們之間呈較強的正相關(guān)關(guān)系,相關(guān)系數(shù)0.7983~0.9378,顯著性檢驗結(jié)果表明各性狀的相關(guān)系數(shù)均不顯著(P>0.05)。
表7 親本間遺傳距離與半番鴨飼料轉(zhuǎn)化率的相關(guān)性 Table 7 Correlation between genetic distance and heterosis of feed conversion rate
表8 親本及后代半番鴨10周齡屠宰性狀測定值Table 8 Observerd value of carcass traits at 10 weeks age of parental population and its hybrid offspring with mule duck
表9 親本間遺傳距離與半番鴨10周齡屠宰性狀的相關(guān)性Table 9 Correlation between genetic distance and heterosis of carcass traits at 10 weeks age
本研究所用的番鴨和M18母本是從法國克里莫公司引進的經(jīng)多年提純選育的品種,大、中、小型白羽半番鴨母本為福建省農(nóng)業(yè)科學(xué)院經(jīng)過4~8個世代選育的白羽半番鴨母本專門化品系[4]。 利用8個微衛(wèi)星標(biāo)記測定的5個半番鴨親本種群均表現(xiàn)中度雜合度和多態(tài)性,這與5個親本均為高度選育的品系,基因純合度較高有關(guān)。
番鴨與各個母本雜交后代半番鴨的日增重、飼料轉(zhuǎn)化率和屠宰性能分別為番鴨♂×M18♀最高、番鴨♂×大型♀和番鴨♂×中型♀次之、而番鴨♂×小型♀最低。一般來說,來源差別較大的種群間雜交以及基因型相對較純的種群間雜交,可以獲得較大的雜種優(yōu)勢[5]。雜種優(yōu)勢的大小主要決定于雙親的遺傳差異和性狀互補,差異越大雜種優(yōu)勢越明顯,而本研究獲得的結(jié)果可能是由于各個母本早期生長速度差異較大,決定了各雜交組合各個性狀上的遺傳差異的原因。由估測的遺傳距離可以看出,番鴨♂×M18♀的遺傳距離最大,其次為番鴨♂×中型♀、番鴨♂×大型♀,而番鴨♂×小型♀的遺傳距離最小。一般而言,種群間的遺傳差異可用遺傳距離定量描述[6],遺傳距離越大,雜種優(yōu)勢越大。這與本研究結(jié)果相一致。
研究結(jié)果表明,親本間的遺傳距離與不同經(jīng)濟性狀呈正相關(guān)或負相關(guān),相關(guān)程度的大小亦不同。遺傳距離與雜交后代日增重呈強正相關(guān)關(guān)系,與飼料轉(zhuǎn)化率呈強負相關(guān)關(guān)系,與屠宰性狀的部分性狀呈正相關(guān)(10周齡的半凈膛率和全凈膛率等)或負相關(guān)系數(shù)(如腿肌率)。黃生強等[2]對微衛(wèi)星標(biāo)記與豬經(jīng)濟性狀雜種優(yōu)勢相關(guān)關(guān)系的研究結(jié)果表明,遺傳距離與日增重、料肉比呈正相關(guān),與胴體性狀呈負相關(guān)。左福元等[7]開展的肉牛雜交親本遺傳距離與雜種優(yōu)勢的相關(guān)性研究的實驗結(jié)果表明,親本間遺傳距離與體尺、體重雜種優(yōu)勢相關(guān)系數(shù)偏小(-0.003~0.304),未達到顯著水平。朱慶等[8]利用微衛(wèi)星分析了不同品系黃羽肉雞的遺傳距離與體重雜種優(yōu)勢的關(guān)系,發(fā)現(xiàn)遺傳距離與后代體重雜種優(yōu)勢率多數(shù)沒有相關(guān)性,僅C×B組合遺傳距離與8周齡體重雜種優(yōu)勢率呈顯著相關(guān)。此外,國內(nèi)不少研究人員對其他物種進行了相類似的研究。從研究結(jié)果可以看出,親本間的遺傳距離與雜種優(yōu)勢的相關(guān)程度隨不同性狀而異,造成差異的因素有很多,包括研究的物種不同,遺傳背景不同,選取微衛(wèi)星標(biāo)記的位點、數(shù)量不同,用于試驗的樣本含量差異較大等因素。因此,要準(zhǔn)確評價微衛(wèi)星標(biāo)記遺傳距離與雜種優(yōu)勢的相關(guān)性,還需要更加深入地研究。
本研究表明,親本種群間的遺傳距離與后代半番鴨累積日增重呈強正相關(guān),與飼料轉(zhuǎn)化率呈強負相關(guān),與10周齡的屠宰性狀均呈較強相關(guān)關(guān)系,相關(guān)系數(shù)均達到0.8以上。利用微衛(wèi)星標(biāo)記預(yù)測半番鴨主要經(jīng)濟性狀的雜種優(yōu)勢是可行的。
參考文獻:
[1] 王淑新,連林生.畜禽雜種優(yōu)勢預(yù)測方法的研究進展[J].當(dāng)代畜牧,2008(1):39-41.
[2] 黃生強,柳小春,晏光榮,等.微衛(wèi)星標(biāo)記預(yù)測豬部分經(jīng)濟性狀雜種優(yōu)勢的研究[J].湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報:自然科學(xué)版,2007,33(5):592-594.
[3] 趙宗勝,李大全,李應(yīng)生,等.微衛(wèi)星標(biāo)記遺傳距離與雞雜種優(yōu)勢的相關(guān)分析[J].中國畜牧獸醫(yī),2010,37(8):112-115.
[4] 鄭嫩珠,李盛霖,陳 暉.福建省白羽半番鴨及其母本選育[J].中國家禽,2010,32(14):5-8.
[5] 張英杰,趙有璋,劉月琴,等.3個山羊群體中4個微衛(wèi)星DNA多態(tài)性及其與雜種優(yōu)勢的關(guān)系[J].遺傳,2004,26(5):631-636.
[6] 李明爽,傅洪拓,龔永生,等.雜種優(yōu)勢預(yù)測研究進展[J].中國農(nóng)學(xué)通報,2008,24(1):117-122.
[7] 左福元,王 玲,劉昌林.肉牛雜交親本遺傳距離與雜種優(yōu)勢的相關(guān)性研究[J].中國畜牧雜志,2010,46(1):1-4.
[8] 朱 慶,張義正,劉繼霞,等.黃羽肉雞群體遺傳變異的微衛(wèi)星分析及其與體重雜種優(yōu)勢的關(guān)系[J].畜牧與獸醫(yī),2006,38(3):8-10.