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        利用酵母雙雜交系統(tǒng)篩選與牛MSTN相互作用蛋白

        2013-11-23 06:52:42鄭立雙孫城濤呂文發(fā)
        中國獸醫(yī)雜志 2013年10期
        關(guān)鍵詞:酵母菌

        趙 靜,王 軍,陳 洋,鄭立雙,孫城濤,呂文發(fā)

        (1.吉林農(nóng)業(yè)大學(xué)動物科學(xué)技術(shù)學(xué)院,吉林 長春130118;2.遼寧醫(yī)學(xué)院畜牧獸醫(yī)學(xué)院,遼寧 錦州121001)

        肌肉生成抑制素(MSTN)屬轉(zhuǎn)化生長因子-β(TGF-β)超家族成員,是骨骼肌發(fā)育的負(fù)調(diào)可溶性mystatin節(jié)因子[1-3]。在哺乳動物體內(nèi),MSTN 能夠抑制肌細(xì)胞的增殖和分化[4-6]。目前有研究發(fā)現(xiàn),受體、myostatin前肽、卵泡抑素及其相關(guān)多肽和蛋白質(zhì)、myostatin阻斷抗體、RNA干涉及其他一些化學(xué)抑制劑[2],通過主動免疫方式抑制MSTN前體蛋白成熟化,從而抑制活性MSTN蛋白二聚體的形成,最終抑制MSTN的生物活性,從而導(dǎo)致肌肉的快速增長,但是有關(guān)體內(nèi)MSTN生物學(xué)功能的調(diào)控機(jī)制目前還未闡明。蛋白質(zhì)是細(xì)胞活性及功能的最終執(zhí)行者,研究MSTN相互作用蛋白不僅對闡明MSTN的調(diào)控機(jī)制具有重要意義,而且也為開發(fā)MSTN功能調(diào)控技術(shù)和產(chǎn)品提供新的方向。酵母雙雜交系統(tǒng)是一種具有很高靈敏度的研究蛋白質(zhì)之間關(guān)系的技術(shù),可以高通路的篩選細(xì)胞內(nèi)相互作用蛋白,是發(fā)現(xiàn)相互作用新蛋白的一種強(qiáng)有力的手段[7,9]。本試驗利用酵母雙雜交技術(shù)對牛MSTN相互作用蛋白進(jìn)行了篩選并應(yīng)用免疫共沉淀技術(shù)對篩選蛋白進(jìn)行體內(nèi)驗證,為闡明MSTN生物學(xué)功能的調(diào)控機(jī)制奠定基礎(chǔ)。

        1 材料與方法

        1.1 試驗材料 大腸桿菌KC8,酵母菌Y2HGold,pGEX-4T-l和pcDNA 3.0-Flag載體均由本實驗室保存;pGBKT7和pGADT7質(zhì)粒、酵母雙雜交系統(tǒng)Make Your Own“Mate & Plate”Library System(Cat.No.630490)試劑盒,購自Clontech公司;酵母培養(yǎng)基所需各種氨基酸,購自美國Amresco公司;人胚胎腎細(xì)胞(293T)由本實驗室保存,抗Flag標(biāo)簽的單克隆抗體偶聯(lián)的瓊脂糖凝膠珠(anti-Flag M2-Agarose)等,購自Sigma公司;轉(zhuǎn)染試劑Lipofectmine2 000,購自Invitrogen公司,其他試劑均為國產(chǎn)分析純。

        1.2 誘餌質(zhì)粒的構(gòu)建及自激活和毒性檢測 根據(jù)GenBank上公布的牛MSTN成熟片段mRNA序列設(shè)計引物,上游引物引入ECORⅠ酶切位點:5′-TCGGAATTCGATTTTGGGCTTGATTGTGAT-GAAC-3′,下 游 引 物 引 入 PSTⅠ 酶 切 位 點:5′-CGCTGCAGTCATGAACACCCACAGCGATC-3′,對pMD18-T-MSTN重組載體和pGBKT7質(zhì)粒進(jìn)行雙酶切,利用SolutionⅠ連接液定向連接,構(gòu)建pGBKT7-MSTN誘餌質(zhì)粒,對獲得的重組質(zhì)粒進(jìn)行PCR和雙酶切鑒定,并送上海生工生物工程技術(shù)服務(wù)有限公司測序分析比對。將構(gòu)建好的含誘餌載體pGBKT7-MSTN的Y2HGold酵母菌作為試驗組,含載體pGBKT7-53的Y2H酵母菌作為陽性對照組,空Y2HGold酵母菌作為陰性對照組,涂布接種于 SD/-Trp-His、SD/-Trp-Leu、SD/-Trp/-Leu/-Ade/-His平板上,30℃倒置培養(yǎng)3~5d,觀察菌落的生長情況。再分別將轉(zhuǎn)有空載體pGBKT7的Y2H酵母菌和試驗組接種于SD/-Trp的液體培養(yǎng)基中過夜振蕩培養(yǎng),用紫外分光光度計測量其OD600值。

        1.3 牛肌肉cDNA文庫的篩選 挑取在SD/-Trp固體培養(yǎng)基上生長大于2mm含有pGBKT7-MSTN質(zhì)粒的Y2HGold酵母菌落,接種于SD/-Trp液體培養(yǎng)基中,30℃振蕩培養(yǎng)16h~24h,當(dāng)OD600值達(dá)到0.8時,與含有牛肌肉cDNA文庫的Y187酵母菌交配融合,交配18h~24h后,觀察交配情況,離心收集菌液,將菌液用玻璃珠涂布于SD/-Trp/-Leu/-His/-Ade平板上初步篩選陽性克隆,30℃倒置培養(yǎng)3~8d。同時取樣品100μL梯度稀釋濃度分別為:10-1、10-2、10-3、10-4;分別涂布在SD/-Trp,SD/-Leu,SD/-Trp-Leu平板上計算融合效率。

        1.4 文庫陽性克隆的鑒定分析 初步篩選的陽性克 隆 劃 線 于 SD/-Trp/-Leu/-His/-Ade 平 板 上,30℃倒置培養(yǎng)3~8d。挑取生長旺盛的菌落進(jìn)行PCR鑒定,將PCR鑒定成功的菌落接種于SD-Leu液體培養(yǎng)基中并提取質(zhì)粒,將提取的質(zhì)粒轉(zhuǎn)化大腸桿菌KC8送上海生工生物工程技術(shù)服務(wù)有限公司測序并將質(zhì)?;剞D(zhuǎn)酵母驗證,測序結(jié)果與NCBI數(shù)據(jù)庫比對、分析。

        1.5 免疫共沉淀 將293T細(xì)胞在37℃5%CO2培養(yǎng)箱中培養(yǎng),待細(xì)胞長到90%~95%融合度時開始轉(zhuǎn)染;在轉(zhuǎn)染前1天,將細(xì)胞傳代至直徑6cm細(xì)胞培養(yǎng)板上。每孔加不含抗生素培養(yǎng)基DMEM 2 mL,將準(zhǔn)備好的滅菌的蓋玻片放入培養(yǎng)孔里,取構(gòu)建成功的pLEGFP-MSTN 與pcDNA 3.0-Flag-T-cap重組質(zhì)粒各5μg加入到250μL的DMEM(無血清、無抗生素)中為溶液1,再取同樣的250μL的DMEM加入10μL lipofectamineTM2 000混勻,室溫靜置5min為溶液2,將溶液1和溶液2混合,室溫條件下靜置30min;將混合均勻的溶液1與溶液2逐滴加入孔中,輕輕混勻,于5%濃度的CO2培養(yǎng)箱中37℃條件下培養(yǎng),6h后換液,繼續(xù)培養(yǎng)18h~42 h;收細(xì)胞,用預(yù)冷的PBS洗2次,用1mL PBS懸浮細(xì)胞至1.5mL的離心管中,2 500r/min離心5 min,留上清;加500μL細(xì)胞裂解液裂解細(xì)胞;小探頭超聲細(xì)胞裂解液后,12 000r/min(4℃)離心10 min,取含相等量蛋白的上清加入25μL抗Flag標(biāo)簽的單克隆抗體偶聯(lián)的瓊脂糖凝膠珠懸液中,4℃緩慢搖晃孵育過夜,回收凝膠珠,再用裂解液洗滌3遍以上凝膠珠,在4℃條件下旋轉(zhuǎn)孵育5h,3 000r/min(4℃)離心5min,將上清小心吸去,最終沉淀用20μL 2×SDS上樣緩沖液懸浮煮沸10min,12 000 r/min離心1min。用抗GFP和Flag標(biāo)簽蛋白的兩種單克隆抗體進(jìn)行免疫印跡分析(Westem-blot)。

        2 結(jié)果

        2.1 誘餌質(zhì)粒pGBKT7-MSTN構(gòu)建及自激活和毒性檢測分析 以pGBKT7-MSTN質(zhì)粒為模板做PCR,并做雙酶切獲得7 600bp載體片段和330bp目的片段(見圖1),送上海生工生物工程技術(shù)服務(wù)有限公司測序結(jié)果正確,表明pGBKT7-MSTN誘餌重組質(zhì)粒構(gòu)建成功。將含有誘餌質(zhì)粒的pGBKT7-MSTN的 Y2HGold酵母菌 涂布在 SD/-Trp-His、SD/-Trp-Leu、SD/-Trp/-Leu/-Ada/-His平板培養(yǎng)基上都無菌落生長,且陽性對照組出現(xiàn)菌落,說明誘餌蛋白不能自激活。將試驗組與轉(zhuǎn)有空載體pGBKT7的Y2HGold酵母菌分別接種于SD/-Trp液體培養(yǎng)基中30℃振蕩培養(yǎng)過夜后,OD600值分別為0.813和0.809無明顯差別,說明構(gòu)建的誘餌蛋白對宿主酵母菌無毒性。

        2.2 陽性克隆篩選 酵母融合18h~20h后,取1滴菌液于載玻片上,置于倒置顯微鏡下觀察細(xì)胞,酵母出現(xiàn)了三葉草狀二倍體融合細(xì)胞,說明雜交融合成功。4個稀釋度分別涂布接種于SD/-Trp、SD/-Leu、SD/-Trp/-Leu平板上,按照公式:融合率 =(SD/-Trp/-Leu菌落數(shù))/(SD/-Trp和 SD/-Leu中較少的菌落數(shù))計算融合率為16%,符合文庫篩選要求。篩選出的陽性克隆在SD/-Leu/-Trp/-His/-Ade平板上反復(fù)篩選3次,得到3個陽性克隆,將這3個陽性克隆進(jìn)行回轉(zhuǎn)驗證,得到一個陽性克?。▓D2),再將得到的陽性克隆轉(zhuǎn)入大腸桿菌中進(jìn)行測序分析,與NCBI GenBank數(shù)據(jù)庫進(jìn)行BLAST比對,發(fā)現(xiàn)該基因與家牛titin-cap蛋白同源性高達(dá)99%,GenBank登錄號為NM_001014915.1。

        圖1 誘餌重組質(zhì)粒pGBKT7-MSTN

        圖2 酵母雙雜交分析陽性克隆

        2.3 通過免疫共沉淀驗證MSTN和T-cap在體內(nèi)的相互作用 用抗Flag抗體偶聯(lián)的瓊脂糖珠子結(jié)合,免疫沉淀帶有Flag標(biāo)簽的T-cap,再用GFP抗體做 Western-blot分析,檢測免疫沉淀物中是否有GFP-MSTN。結(jié)果如圖3,MSTN和T-cap可以在哺乳動物細(xì)胞中特異的結(jié)合,而GFP不會與T-cap結(jié)合。結(jié)果證明,MSTN和T-cap能夠在哺乳動物細(xì)胞中特異的結(jié)合。

        3 討論

        MSTN是近年來發(fā)現(xiàn)的一個重要的肌細(xì)胞生長調(diào)控因子,其主要功能是負(fù)向調(diào)控肌細(xì)胞生長發(fā)育,對該基因的進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn),有兩種雙肌牛骨骼肌中編碼肌生成抑制素的遺傳密碼發(fā)生了突變[,9],用基因打靶敲除GDF-8基因,制備了基因缺失小鼠,其骨骼肌的重量是普通小鼠的2~3倍以上[10]。因此通過抑制MSTN活性來增加畜禽肌肉量及在醫(yī)學(xué)上的疾病治療將是一個非常重要的研究。有研究發(fā)現(xiàn),相互作用蛋白之間能夠結(jié)合形成復(fù)合物,使某一蛋白處于非活性狀態(tài),因而從相互作用蛋白角度研究MSTN,能為MSTN生物學(xué)功能的調(diào)控打開新的思路。

        酵母雙雜交系統(tǒng)是研究蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用的一項有效技術(shù),使用此種方法可以篩選與某一已知蛋白質(zhì)或結(jié)構(gòu)域發(fā)生相互作用的新成員。本研究利用酵母雙雜交體系從牛肌肉cDNA中篩選與MSTN相互作用的蛋白,經(jīng)2輪嚴(yán)格篩庫,排除了假陽性,得到3個陽性克隆,經(jīng)測序分析blast比對證實為1個基因,其余為相同序列或同源性較接近序列。本研究也通過免疫共沉淀技術(shù)對MSTN與T-cap進(jìn)行相互作用驗證,排除酵母雙雜交存在的假陽性可能。

        對篩選得到的MSTN相互作用蛋白進(jìn)行功能分析,T-cap是一個19kDa的肌蛋白,最初被確定在骨骼肌中含量最為豐富[11]。據(jù)報道,T-cap在肌原纖維生成和肌纖維翻轉(zhuǎn)過程中參與細(xì)胞骨架重組[12],表明它在肌節(jié)蛋白的結(jié)構(gòu)融合中起重要作用,是肌節(jié)的結(jié)構(gòu)完整性所必要的[13],有研究結(jié)果表明,T-cap在Z-拉鏈區(qū)域內(nèi)起著連接肌原纖維與肌原纖維膜的作用[14]。MSTN蛋白以自分泌方式依賴劑量效應(yīng)對肌纖維的增長分化起抑制作用。Zheng等[15]在C2C12成肌細(xì)胞中過度表達(dá) T-cap蛋白,成肌細(xì)胞中 MSTN的濃度非常低,說明T-cap蛋白對MSTN起到一定的抑制作用。綜上所述,本研究發(fā)現(xiàn)的T-cap蛋白能夠抑制 MSTN功能,但這個蛋白是如何與MSTN發(fā)生相互作用,通過什么機(jī)制來發(fā)揮作用,還需進(jìn)一步研究。

        4 結(jié)論

        本試驗中,我們利用酵母雙雜交技術(shù)篩選出與牛MSTN有相互作用的T-cap蛋白,并通過免疫共沉淀試驗驗證了二者之間存在相互作用,為探索MSTN蛋白功能和作用機(jī)理提供了新的方向。

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