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        EC9706細胞和人食管鱗狀細胞癌組織中MAL基因啟動子區(qū)的甲基化狀態(tài)

        2013-11-20 10:39:04劉伯新郭長青王曼華王明榮
        鄭州大學學報(醫(yī)學版) 2013年4期
        關(guān)鍵詞:鱗癌甲基化食管癌

        劉伯新,郭長青#,王曼華,王明榮

        1)鄭州大學第一附屬醫(yī)院消化內(nèi)科 鄭州 450052 2)中國醫(yī)學科學院北京協(xié)和醫(yī)學院腫瘤醫(yī)院腫瘤研究所分子腫瘤學國家重點實驗室 北京 100021

        MAL基因是由Alonso等[1]于1987年分離得到的一個在T細胞分化中晚期表達的基因。研究[2-4]表明MAL基因在多種腫瘤中表達下調(diào)或者缺失,DNA甲基化被認為是該基因失活的可能機制之一[5-8]。該研究利用亞硫酸氫鹽測序法檢測人食管鱗狀細胞癌(食管鱗癌)細胞系EC9706中MAL基因啟動子區(qū)CpG位點的甲基化情況,并采用甲基化敏感性限制性內(nèi)切酶酶切結(jié)合PCR技術(shù)進一步檢測食管鱗癌組織MAL基因啟動子區(qū)的甲基化情況,以期對食管鱗癌發(fā)生發(fā)展的機制進行探討。

        1 材料與方法

        1.1材料26例食管鱗癌及其配對癌旁正常食管組織取自鄭州大學第一附屬醫(yī)院2009年1月至2011年12月住院手術(shù)患者,男22例,女4例,年齡46~74(57.2±8.3)歲。其中腫瘤直徑≥3 cm 24例,<3 cm 2例;高、中分化19例,低分化7例;侵襲深度未達肌層2例,肌或肌外層24例;有淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移23例,無淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移3例;有遠處轉(zhuǎn)移20例、無遠處轉(zhuǎn)移6例?;颊咝g(shù)前均未接受放化療,所有標本經(jīng)組織病理學檢查證實為食管鱗癌。標本取材后置液氮中速凍,然后置-70 ℃冰箱保存。EC9706細胞由鄭州大學基礎(chǔ)醫(yī)學院微生物和免疫學教研室提供,常規(guī)培養(yǎng),至70%~80%飽和密度時收獲細胞。

        1.2EC9706細胞MAL基因啟動子區(qū)甲基化檢測

        1.2.1 基因組DNA的亞硫酸氫鹽修飾及純化回收

        提取EC9706細胞的基因組DNA,采用蛋白酶K消化,酚-氯仿抽提。DNA樣品中加入3 mol/L NaOH 42 ℃水浴30 min,加入新配制的10 mmol/L氫醌30 μL和3.6 mol/L亞硫酸氫鈉(pH 5.0)520 μL,加200 μL石蠟油,50 ℃避光水浴16 h。用Wizard DNA Clean-up System(Promega公司產(chǎn)品)純化DNA。加3 mol/L NaOH 5.5 μL,37 ℃孵育15 min,加1 μg鮭精DNA,加10 mol/L乙酸銨33 μL,再加270 μL冰無水乙醇,-20 ℃過夜沉淀,12 000 r/min離心10 min,加體積分數(shù)70%乙醇離心,空氣中干燥后加20 μL TE溶液,-20 ℃保存。

        1.2.2 PCR擴增 MAL基因啟動子區(qū)引物序列:上游5’-GTGGTTGGTTTTATTTTTTATTGTAGATTT-3’,下游5’-CAAAAACCACTCACAAACTCAAAAAT-3’,產(chǎn)物大小699 bp。引物由上海生工生物工程有限公司合成。PCR反應(yīng)體系為25 μL,其中包含DNA 0.5 μL,Master Amp 2×PCR Premix buffer 12.5 μL,引物0.4 μmol/L各1 μL,Taq酶2 U(日本TaKaRa公司)。反應(yīng)條件:94 ℃預變性5 min后,94 ℃ 40 s,60 ℃ 1 min,72 ℃ 130 s,進行35個循環(huán),最后于72 ℃延伸7 min。PCR產(chǎn)物用15 g/L瓊脂糖凝膠電泳檢測,用QIAEXⅡ Agarose gel extraction試劑盒回收,將終產(chǎn)物送至大連日本TaKaRa公司進行測序。

        1.3食管組織MAL基因啟動子區(qū)甲基化檢測

        1.3.1 DNA甲基化敏感性限制性內(nèi)切酶EheⅠ酶切及純化 組織標本采用酚-氯仿抽提法提取DNA,50 μL酶切體系內(nèi)含10×buffer 5 μL,EheⅠ 10 U,基因組DNA 1 μg,上加礦物油200 μL,37 ℃酶切過夜。吸棄礦物油,酚-氯仿抽提純化DNA。

        1.3.2 PCR擴增 MAL基因5’調(diào)控區(qū)(含啟動子區(qū))引物序列:上游5’-TCAGTGGACGCGGAAGG-3’,下游5’-GAGCCACTCACAAACTCAAAGATC-3’,產(chǎn)物大小為724 bp。引物由上海生工生物工程有限公司合成。PCR反應(yīng)體系及循環(huán)參數(shù)同1.2.2。取10 μL上樣于1.5 g/L瓊脂糖凝膠(含0.1 g/L溴化乙錠)電泳。

        1.4統(tǒng)計學處理采用SPSS 17.0進行分析,應(yīng)用配對χ2檢驗分析食管鱗癌及配對癌旁正常食管組織中MAL基因啟動子區(qū)甲基化率的差異,應(yīng)用Fisher確切概率法分析不同臨床病理因素食管鱗癌組織中MAL基因啟動子區(qū)甲基化率的差異,檢驗水準α=0.05。

        2 結(jié)果

        2.1EC9706細胞MAL基因啟動子區(qū)的甲基化情況EC9706細胞基因組DNA經(jīng)亞硫酸氫鹽修飾后PCR擴增結(jié)果見圖1。MAL基因啟動子區(qū)699 bp范圍內(nèi)檢測出42個胞嘧啶位點的甲基化,占所有CpG位點的73.7%(42/57)。

        圖1 EC9706細胞MAL基因啟動子區(qū)的PCR結(jié)果

        2.2食管組織中MAL基因啟動子區(qū)的甲基化情況PCR擴增結(jié)果見圖2、表1。

        圖2 2種食管組織MAL基因啟動子區(qū)PCR結(jié)果

        表1 2種食管組織中MAL基因啟動子區(qū)的甲基化情況 例

        配對χ2=10.924,P<0.001。

        2.3不同臨床病理特征患者食管鱗癌組織中MAL基因啟動子區(qū)的甲基化情況見表2。

        表2 不同臨床病理特征患者食管鱗癌組織中MAL基因啟動子區(qū)的甲基化情況

        3 討論

        MAL基因表達一個高度疏水性蛋白,即 MAL蛋白,這個蛋白缺少一個疏水的引導肽序列,并包含四個被短親水片段分離開的潛在跨膜區(qū)域[1]。MAL基因可能是高爾基體和遠端質(zhì)膜之間囊泡轉(zhuǎn)運和蛋白質(zhì)分選的一個功能成分[9-11]。

        許多腫瘤組織中MAL基因表達異常,基因甲基化可能是MAL基因失活的主要機制[12]。許智雄等[13]發(fā)現(xiàn)MAL基因在92.7%(38/41)食管癌組織中表達顯著下調(diào),且在3個食管癌細胞株未見表達,認為MAL基因表達下調(diào)是食管癌發(fā)生、發(fā)展過程中的一個頻發(fā)事件。Mimori等[14]發(fā)現(xiàn)MAL基因在食管上皮細胞的分化和角質(zhì)化中起調(diào)節(jié)作用。Zinovyeva等[15]通過cDNA序列分析和RT-PCR對人食管癌和正常食管黏膜組織進行分析,也發(fā)現(xiàn)MAL基因在腫瘤組織中表達下調(diào)。郭長青等[8]對食管癌MAL基因表達下調(diào)機制進行了探討,對MAL基因的5’調(diào)控區(qū)進行克隆和序列分析,結(jié)果表明食管癌中可能存在MAL基因5’調(diào)控區(qū)的點突變。根據(jù)以上研究推測MAL基因啟動子區(qū)可能存在甲基化,這可能是食管癌MAL基因表達下調(diào)的機制之一。

        該研究發(fā)現(xiàn)在EC9706細胞中MAL基因啟動子區(qū)有42個CpG位點的胞嘧啶發(fā)生了甲基化,占所有CpG位點的73.7%(42/57),提示MAL基因啟動子區(qū)的甲基化可能導致MAL基因轉(zhuǎn)錄沉默。該研究亦發(fā)現(xiàn)食管鱗癌組織中MAL基因啟動子區(qū)的甲基化率高于癌旁正常食管組織,不同臨床病理特征患者食管鱗癌組織中MAL基因啟動子區(qū)甲基化率差異均無統(tǒng)計學意義。

        綜上所述,在食管黏膜的癌變過程中MAL基因啟動子區(qū)CpG島可能發(fā)生了甲基化,導致MAL基因的轉(zhuǎn)錄沉默,表達水平顯著下調(diào),從而導致食管黏膜癌變的發(fā)生。

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