王金鵬 , 田耀旗 , 周 星 , 焦愛權 , 趙建偉 , 金征宇 *1,
(1.食品科學與技術國家重點實驗室 江南大學,江蘇 無錫 214122;2.江南大學 食品學院,江蘇 無錫 214122;3.食品安全與營養(yǎng)協(xié)同創(chuàng)新中心 江南大學,江蘇 無錫214122)
大環(huán)糊精(LR-CD)是由9個以上D-吡喃型葡萄糖單元通過α-1,4糖苷鍵連接而成的環(huán)狀糊精的統(tǒng)稱[1-2],具有比常見環(huán)糊精更加優(yōu)越的水溶性及包埋性能[3]。合成大環(huán)糊精(LR-CD)的酶類被統(tǒng)稱為4-α-糖基轉移酶 (4αGtase)。 不同菌株來源的4αGtase的酶學性質具有很大的差異,這些差異導致LR-CD產率及聚合度范圍存在很大區(qū)別,例如來自Paenibacillus sp.F8的CGTase能夠作用淀粉產生聚合度6~9的環(huán)糊精,其中CD9的產量約為10%[4];而來自T.aquaticus的Maltase能夠作用淀粉產生聚合度>22的LR-CD,產率高達84%[5]。從酶本身來考慮,造成產物專一性差異的因素主要有:氨基酸序列差異、酶-淀粉結合區(qū)域差異、酶-淀粉結合位點差異及酶活性中心區(qū)域的差異等。作者所在實驗室構建了能夠表達產生4αGtase的菌株[6],并驗證了該酶催化淀粉產生聚合度(DP)范圍為20~40的大環(huán)糊精,且最高轉化率達55%[7],經核苷酸序列鑒定及生物信息學的方法分析發(fā)現4αGtase的α-螺旋/β-折疊比例為2.1,其中α-螺旋占23.3%,β-折疊占11.1%,酶的催化催化區(qū)域均勻分布在整個酶分子[8]。但是關于該酶的結構信息報道還非常少。為了加深對4αGtase的進一步了解,作者對4αGtase進行了化學修飾,深入探討該酶活性中心的氨基酸種類,以期為揭示4αGtase的結構特點提供參考。
低相對分子質量標準蛋白:分析純,重慶升博科技有限公司產品;LB培養(yǎng)基(質量分數)(0.5%酵母膏,1%NaCl,1%蛋白胨);氨芐青霉素鈉:美國Sigma公司產品;咪唑、三羥甲基氨基甲烷(Tris)、HCl,及巰基乙醇:均為分析純,北京國藥集團產品;丁二酮(DIC)、苯甲基黃酰氯(PMSF)、氯氨-T(Ch-T)、N-溴代丁二酰亞胺 (NBS)、 焦碳酸二乙酯(DEPC)、碳二亞胺(EDC)、二硫蘇糖醇(DTT):均為分析純,美國Sigma公司產品。
淋洗緩沖液(50 mmol/L Tris-HCl(pH 7.5)、300 mmol/L NaCl、20 mmol/L 咪唑)
洗脫緩沖液(50 mmol/L Tris-HCl(pH 7.5)、300 mmol/L NaCl、250 mmol/L 咪唑)。
SW-CJ-1F雙人單面超凈工作臺:蘇州安泰空氣技術有限公司產品;LS-B50L自動立式電熱壓力蒸汽滅菌鍋:上海華線醫(yī)用核子儀器有限公司產品;3K30冷凍離心機:美國SIGMA公司產品;JYD-650超聲波細胞粉碎機:上海三信儀器有限公司產品;RJ-TDL-50A底物臺式大容量離心機:江蘇瑞江分析儀器公司產品;純泰Ni-NTA親和層析柱(5 mL),生物醫(yī)藥純化技術公共服務平臺,AKTA purifier 900蛋白純化系統(tǒng):瑞典AKTA公司產品。
1.2.1 質粒的轉化 采用氯化鈣法制備感受態(tài)細胞并對攜帶目標基因的p6×HTAaGT Ampr質粒進行轉化,具體過程參見文獻[9]。
1.2.2 4αGtase粗酶的提取 挑取陽性轉化的基因工程菌單菌落,37℃培養(yǎng)8 h后,4 000 r/min離心10 min收集菌體,將菌體分散在約10 mL的Tris-HCl緩沖液(pH 7.5,50 mmol/L)中,冰浴下采用超聲破壁的方法提取粗酶液,超聲破壁提取條件為:功率300 W,超聲時間3 s,間歇時間 5 s,超聲次數180次。
1.2.3 4αGtase的分離純化 采用Ni-NTA親和層析柱對重組蛋白進行純化,并采用不連續(xù)垂直平板電泳系統(tǒng)對純化后的目標酶進行純度鑒定。分離膠質量濃度15 g/L,濃縮膠質量濃度5 g/L,電泳采用pH 7.5的Tris-HCl緩沖體系,考馬斯亮藍R-250染色。
1.2.4 4αGtase的活性測定 酶活分析采用碘比色法。準確吸取100 μL體積分數90%DMSO溶解的質量分數0.2%的直鏈淀粉溶液,置入2 mL離心管中,加入 800 μL 50 mmol/L Tris-HCl(pH 7.5),用漩渦混合器將其混勻,置于超級恒溫金屬浴中75℃保溫10 min,加入100 μL酶液,立即混勻并開始計時,當75℃保溫10 min后,立即取出100 μL反應液加入到900 μL稀碘液,搖勻。以稀碘液為空白,采用三波長分光光度法(TWC)測定反應溶液中大環(huán)糊精的生成量,采用正交函數分光光度法來測定反應溶液中直鏈淀粉的下降量。
酶活定義:在測定條件下,每分鐘轉化生成1 μg大環(huán)糊精所需要的酶量為1 U的環(huán)化活性;每分鐘轉化1 μg直鏈淀粉所需要的酶量為1 U的總活性。
1.2.5 4αGtase的化學修飾
1)化學修飾劑對4αGtase的穩(wěn)定性影響 分別采用精氨酸修飾劑DIC、蛋氨酸修飾劑ChT、色氨酸修飾劑NBS、組氨酸修飾劑DEPC、羧基修飾劑EDC、二硫鍵修飾劑DTT及蛋白變性劑巰基乙醇等修飾劑與等量4αGtase進行混合,達到各自所需修飾濃度,在25℃下保溫30、60、90 min,然后測定4αGtase催化淀粉產生大環(huán)糊精的量及淀粉的下降量,在同樣的條件下測定未加修飾劑的4αGtase環(huán)化活性及總酶活的影響。
2)化學修飾劑對4αGtase活性的影響 分別將上述化學修飾劑與4αGtase進行不同比例混合,并保持總體積一致,測定經不同濃度修飾的4αGtase環(huán)化活性及總酶活的變化。
精氨酸殘基含有1個強堿性的胍基,可以與丁二酮可逆的生成精氨酸-丁二酮復合物[13]。向4αGtase中加入 0.1 mmol/L的DIC,分別保溫 30、60、90 min,結果見圖 1(a)。 由圖 1(a)可以看出,在90 min的修飾時間內,經DIC修飾的4αGtase環(huán)化活性及總酶活性基本保持穩(wěn)定,因此選擇30 min作為修飾時間,進一步探討DIC濃度對4αGtase活性的影響,結果見圖 1(b)。 由圖 1(b)可以看出,不同濃度的DIC添加對大環(huán)糊精含量及直鏈淀粉的含量基本無明顯變化,統(tǒng)計學分析顯示無明顯差異,表明精氨酸不是4αGtase活性中心的必須基團。
圖1 (a)DIC對4αGtase穩(wěn)定性的影響,(b)DIC濃度對4αGtase活性的影響Fig.1 (a)The effect of DIC on the stability of 4αGtase,(b)Effect of DIC concentration on the activity of 4αGtase
向4αGtase中加入0.1 mmol/L的ChT,分別保溫 30、60、90 min,結果見圖 2(a)。 由圖 2(a)可以看出,在60 min的時間內,隨著保溫時間延長,大環(huán)糊精含量呈現明顯上升趨勢,而且直鏈淀粉含量呈現明顯下降趨勢,表明低濃度ChT修飾能夠促進4αGtase的環(huán)化活性及總酶活。在 90 min時,4αGtase的活性基本保持穩(wěn)定,因此選擇90 min作為修飾時間,進一步探討ChT濃度對4αGtase活性的影響,結果見圖 2(b)。 由圖 2(b)可以看出,隨著ChT添加濃度增加到10 mmol/L時,大環(huán)糊精質量濃度由0.26 mg/mL下降至0.16 mg/mL,環(huán)化活性下降了38.5%;直鏈淀粉的質量濃度由425 μg/mL下降至307 μg/mL表明總酶活提高了27.8%。該結果說明蛋氨酸可能位于4αGtase的淀粉結合區(qū)域,而非催化區(qū)域。
圖2 (a)ChT對4αGtase穩(wěn)定性的影響,(b)ChT濃度對4αGtase活性的影響Fig.2 (a)The effect of ChT on the stability of 4αGtase,(b)Effect of ChT concentration on the activity of 4αGtase
向4αGtase中加入0.1 mmol/L的NBS,分別保溫 30、60、90 min,結果見圖 3(a)。 由圖 3(a)可以看出,在60 min的時間內,隨著保溫時間延長,大環(huán)糊精含量呈現明顯上升趨勢,而且直鏈淀粉含量呈現明顯下降趨勢,表明低濃度NBS修飾能夠促進4αGtase的環(huán)化活性及總酶活。在 90 min時,4αGtase的活性基本保持穩(wěn)定,因此選擇90 min作為修飾時間,進一步探討NBS濃度對4αGtase活性的影響,結果見圖 3(b)。由圖 3(b)可以看出,隨著NBS添加濃度提高到10 mmol/L,大環(huán)糊精質量濃度由0.26 mg/mL增加到0.27 mg/mL,環(huán)化活性增加了3.8%;直鏈淀粉質量濃度由425 μg/mL減低到357 μg/mL,總酶活增加了16%,當修飾劑濃度超過10 mmol/L時,酶活基本不變,表明所有的色氨酸均被修飾。表明色氨酸可能是4αGtase催化活性中心的關鍵氨基酸之一。
圖3 (a)NBS對4αGtase穩(wěn)定性的影響,(b)NBS濃度對4αGtase活性的影響Fig.3 (a)The effect of NBS on the stability of 4αGtase,(b)Effect of NBS concentration on the activity of 4αGtase
向4αGtase中加入0.1 mmol/L的DEPC,分別保溫 30、60、90 min,結果見圖 4(a)。 由圖 4(a)及 4(b)可以看出,DEPC的加入使4αGtase迅速失活,圖4(b)也表明不同濃度的DEPC能夠造成4αGtase的環(huán)化活性及總酶活均完全失活,表明組氨酸是位于催化中心的關鍵氨基酸。
圖4 (a)DEPC對4αGtase穩(wěn)定性的影響,(b)DEPC濃度對4αGtase活性的影響Fig.4 (a)The effect of DEPC on the stability of 4αGtase,(b)Effect of DEPC concentration on the activity of 4αGtase
EDC是羧基(谷氨酸/天冬氨酸)專一性修飾試劑。向4αGtase中加入0.1 mmol/L的EDC,分別保溫 30、60、90 min,結果見圖 5(a)。 由圖 5(a)可以看出,在30 min的時間內,隨著保溫時間延長,大環(huán)糊精含量呈現明顯下降趨勢,而且直鏈淀粉含量呈現明顯上升趨勢,表明低濃度EDC修飾能夠使4αGtase的環(huán)化活性及總酶活均降低。在30 min時,4αGtase的活性基本保持穩(wěn)定,因此選擇30 min作為修飾時間,進一步探討EDC濃度對4αGtase活性的影響,結果見圖 5(b)。 由圖 5(b)可以看出,隨著EDC添加濃度提高到10 mmol/L,大環(huán)糊精質量濃度由0.53 mg/mL降低到0.41 mg/mL,環(huán)化活性降低了22.6%;直鏈淀粉質量濃度由108 μg/mL升高到161 μg/mL,總酶活降低了 58.3%,表明 4αGtase 的環(huán)化活性及總酶活均得到抑制,說明酶的活性中心存在有關鍵性的谷氨酸及天冬氨酸,這一結果和4αGtase結構生物信息學分析結果相一致[8]。
圖5 (a)EDC對4αGtase穩(wěn)定性的影響,(b)EDC濃度對4αGtase活性的影響Fig.5 (a)The effect of EDC on the stability of 4αGtase,(b)Effect of EDC concentration on the activity of 4αGtase
向4αGtase中加入0.1 mmol/L的DTT,分別保溫 30、60、90,結果見圖 6(a)。由圖 6(a)可以看出,在30 min的時間內,隨著保溫時間延長,大環(huán)糊精含量呈現明顯下降趨勢,而且直鏈淀粉含量呈現明顯上升趨勢,表明低濃度DTT修飾能夠使4αGtase的環(huán)化活性及總酶活均降低。在30 min時,4αGtase的活性基本保持穩(wěn)定,因此選擇30 min作為修飾時間,進一步探討DTT濃度對4αGtase活性的影響,結果見圖5(b)。由圖 5(b)可以看出,隨著 DTT添加濃度提高到50 mmol/L,大環(huán)糊精質量濃度由0.23 mg/mL降低到0.1 mg/mL,環(huán)化活性降低了56.5%;直鏈淀粉質量濃度由 101 μg/mL升高到 177 μg/mL,總酶活降低了75.2%,這表明二硫蘇糖醇還原了酶的二硫鍵后,破壞了酶的高級結構,影響酶的穩(wěn)定性。
圖6 (a)DTT對4αGtase穩(wěn)定性的影響,(b)DTT濃度對4αGtase活性的影響Fig.6 (a)The effect of DTT on the stability of 4αGtase,(b)Effect of DTT concentration on the activity of 4αGtase
向4αGtase中加入0.1 mmol/L的巰基乙醇,分別保溫 30、60、90 min,結果見圖 7(a)。 由圖 7(a)可以看出,在90 min的修飾時間內,經巰基乙醇修飾的4αGtase環(huán)化活性及總酶活性基本保持穩(wěn)定,因此選擇30 min作為修飾時間,進一步探討巰基乙醇濃度對4αGtase活性的影響,結果見圖7(b)。由圖7(b)可以看出,巰基乙醇濃度達到0.1 mmol/L時,4αGtase的環(huán)化活性幾乎不變,總酶活增加了42.6%,表明空間結構的改變造成4αGtase催化區(qū)域以及與淀粉結合區(qū)域的變化不盡相同,再次證明了4αGtase也許同時存在催化區(qū)域和淀粉鍵合區(qū)域。
在一定的條件下,4αGtase經DIC修飾后活性基本無明顯變化;而經DEPC、EDC、DTT等修飾后4αGtase的環(huán)化活性及總酶活都有不同程度的下降,表明組氨酸、谷氨酸/天冬氨酸是構成4αGtase活性中心的關鍵氨基酸,二硫鍵對于維持4αGtase活性中心的空間結構具有重要作用;ChT、NBS、巰基乙醇等的修飾分別造成了總酶活不同程度的增加,而ChT修飾卻導致環(huán)化活性下降、NBS修飾引起環(huán)化活性上升、巰基乙醇修飾對環(huán)化活性基本無影響,推測造成這個復雜現象的可能是酶分子同時存在淀粉鍵合區(qū)域和催化區(qū)域,蛋氨酸、色氨酸在兩個區(qū)域存在狀態(tài)不盡相同,空間結構的適當變換能夠促進該酶與淀粉的結合,從而有利于總酶活的增加。
圖7 (a)巰基乙醇對4αGtase穩(wěn)定性的影響,(b)巰基乙醇濃度對4αGtase活性的影響Fig.7 (a)The effect of mercaptoethanol on the stability of 4αGtase, (b)Effect of mercaptoethanol concentration on the activity of 4αGtase
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