李昆太,彭衛(wèi)福,周 佳,黃 林,程 新
(江西農(nóng)業(yè)大學(xué) 生物科學(xué)與工程學(xué)院,江西 南昌 330045)
紫杉醇(paclitaxel,商品名taxol)系三環(huán)二萜類生物堿[1],是當(dāng)今世界公認(rèn)的廣譜、療效確切的天然抗癌藥物。早在1971年,美國化學(xué)家Wani等[2]最先從太平洋短葉紅豆杉(Taxus brevifolia)的樹皮中分離提取到紫杉醇。由于紫杉醇在樹皮中的含量極低(平均產(chǎn)量約0.015%)[3],使得傳統(tǒng)的從紅豆杉植株中直接提取紫杉醇的方式受到了極大的限制和挑戰(zhàn)。因此,如何尋求到新的藥源途徑來生產(chǎn)紫杉醇,成為了國內(nèi)外藥學(xué)界急需解決的課題。
植物內(nèi)生菌在與宿主植物長期共進(jìn)化過程中,可產(chǎn)生一系列具有抗腫瘤、抗菌、抗病毒、殺蟲等作用的生物活性物質(zhì)[4-6]。因此,從植物內(nèi)生菌中尋找并開發(fā)新的生物活性物質(zhì),正成為國內(nèi)外學(xué)者研究的熱點(diǎn)。1993年,Stierle等[7]首次從短葉紅豆杉中分離到一株能產(chǎn)紫杉醇的內(nèi)生真菌紫杉霉(Taxomyces andreanae),該發(fā)現(xiàn)極大地激發(fā)了國內(nèi)外學(xué)者開展產(chǎn)紫杉醇內(nèi)生菌的研究熱潮。
本文以南方紅豆杉(Taxus chinensis var.mairei)植株為材料,從中分離篩選到1株具有產(chǎn)紫杉醇能力的內(nèi)生真菌,并通過菌株形態(tài)學(xué)觀察以及18S rRNA序列分析對該菌株進(jìn)行了鑒定。
搖床、離心機(jī)、培養(yǎng)箱、電子天平、高效液相色譜儀、超聲波細(xì)胞破碎儀等。
供試植物為采自于江西農(nóng)業(yè)大學(xué)中藥園的南方紅豆杉新鮮樹枝,紫杉醇標(biāo)準(zhǔn)品(上海源葉生物工程有限公司),牛肉膏(北京奧博星生物技術(shù)有限公司),蛋白胨(北京奧博星生物技術(shù)有限公司),其它試劑均為國產(chǎn)分析純。
1.3.1 內(nèi)生菌分離平板培養(yǎng)基 PDA培養(yǎng)基(g/L):馬鈴薯(去皮煮汁,過濾取液)200;葡萄糖20;瓊脂20;pH自然。牛肉膏蛋白胨培養(yǎng)基(g/L):牛肉膏5;蛋白胨10;氯化鈉5;瓊脂20;pH 7.0~7.2。高氏一號培養(yǎng)基(g/L):可溶性淀粉 20;KNO31;K2HPO40.5;MgSO4·7H2O 0.5;NaCl 0.5;FeSO4·7H2O 0.01;瓊脂20;pH 7.2 ~7.4。
1.3.2 內(nèi)生菌發(fā)酵培養(yǎng)基(g/L) 馬鈴薯(去皮煮汁,過濾取液)200;葡萄糖10;蔗糖10;硫酸鎂0.15;乙酸鈉1.0;苯丙氨酸0.02;pH自然。
1.3.3 內(nèi)生菌鑒定培養(yǎng)基 察氏培養(yǎng)基(g/L):硝酸鈉3.0;磷酸氫二鉀1.0;硫酸鎂0.5;氯化鉀 0.5;硫酸亞鐵0.01;蔗糖30;瓊脂20;pH自然。
采用組織塊法對南方紅豆杉內(nèi)生菌進(jìn)行分離[8]。將采集的新鮮南方紅豆杉莖表面以無菌水沖洗干凈,在無菌操作室中用體積分?jǐn)?shù)75%的酒精溶液浸泡3 min,以無菌水沖洗4至5次,然后用體積分?jǐn)?shù)0.1%升汞溶液浸泡3 min,再用無菌水沖洗4~5次。將經(jīng)上述處理的材料按無菌操作技術(shù),切成0.5 cm×0.5 cm的小段,分別覆蓋接種至PDA、牛肉膏蛋白胨、高氏一號等分離培養(yǎng)基平板上,然后置于28℃恒溫培養(yǎng)箱中培養(yǎng)。當(dāng)觀察到組織塊邊緣有絲狀真菌長出后,及時(shí)將邊緣菌絲轉(zhuǎn)接到新鮮的培養(yǎng)基平板上進(jìn)行劃線純化。
1.5.1 內(nèi)生真菌的發(fā)酵培養(yǎng)方法 每支內(nèi)生真菌的新鮮斜面以10 mL無菌水洗下菌絲體,打碎均勻制成菌懸液。吸取1 mL菌懸液接至裝量為50 mL/250 mL三角瓶的發(fā)酵培養(yǎng)基中,28℃振蕩(150 r/min)培養(yǎng)7 d。
1.5.2 內(nèi)生真菌發(fā)酵液的預(yù)處理[9]搖瓶發(fā)酵結(jié)束后,用干凈的4層紗布過濾發(fā)酵液,分別收集濾液和菌絲體。濾液用等體積的二氯甲烷萃取2次,每次1 h,合并二氯甲烷萃取相,加入無水硫酸鈉干燥,過濾后35℃下以旋轉(zhuǎn)蒸發(fā)儀除去有機(jī)溶劑,得到粗提物Ⅰ;菌絲體反復(fù)凍融3次后,用超聲波細(xì)胞破碎儀破碎菌體(可涂片在顯微鏡下觀察菌絲破碎與否),加入30 mL甲醇浸提1 h,過濾后,35℃下以旋轉(zhuǎn)蒸發(fā)儀除去有機(jī)溶劑,得到粗提物Ⅱ;粗提物Ⅰ和Ⅱ合并,以5 mL甲醇溶解后,用薄層層析和HPLC法進(jìn)行紫杉醇的鑒定。
1.5.3 薄層層析(TLC)鑒定法 用毛細(xì)吸管吸取內(nèi)生真菌發(fā)酵液的處理液,點(diǎn)樣于硅膠G板(50 mm×100 mm,使用前放入105℃烘燥箱中活化30 min)的底部,以紫杉醇標(biāo)準(zhǔn)品溶液為對照。點(diǎn)樣后,用甲醇∶氯仿=1∶7(V/V)的混合液為展開劑進(jìn)行展層,展層結(jié)束后以飽和碘蒸氣進(jìn)行斑點(diǎn)的顯色。
1.5.4 HPLC 鑒定法 高效液相系統(tǒng):Aglient 1100 HPLC;色譜柱:Kromasil C18 column(4.6 mm ×250 mm,5 μm);流動相:H2O/乙腈 =5/5(v/v);流速:1 mL/min;檢測波長:227 nm;柱溫:25 ℃;進(jìn)樣量:20 μL。
1.6.1 菌株形態(tài)特征觀察[10]經(jīng)薄層層析與HPLC法確定產(chǎn)紫杉醇類物質(zhì)的內(nèi)生真菌,在察氏培養(yǎng)基上分別采用點(diǎn)植培養(yǎng)法、載片培養(yǎng)觀察法以及插片法觀察菌落、菌絲體和孢子的形態(tài)特征,該菌株進(jìn)行初步鑒定。
1.6.2 18S rRNA序列測定及系統(tǒng)進(jìn)化分析 以內(nèi)生真菌的基因組DNA為模板,用NS1(5'-GTAGTCATATGCTTGTCTC-3')和NS6(5'-GCATCACAGACCTGTTATTGCCTC-3')為18S rRNA上下游引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增。PCR產(chǎn)物經(jīng)純化后由上海生工生物工程有限公司測序。將得到的18S rRNA序列與GenBank數(shù)據(jù)庫中的序列進(jìn)行BLAST相似性比對,下載同源性較高的序列,保存成FASTA格式的文件,利用MEGA 4.0軟件構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹。
以南方紅豆杉植株的莖部為材料,從中分離純化得到5株內(nèi)生真菌,初步命名為紅莖-1、紅莖-2、紅莖-3、紅莖-4、紅莖-5。將這5株內(nèi)生真菌的發(fā)酵液處理物首先進(jìn)行TLC分析,結(jié)果發(fā)現(xiàn)紅莖-3的發(fā)酵液處理物與紫杉醇標(biāo)準(zhǔn)品具有相同的比移值(Rf≈0.93)和顏色相近的顯色斑點(diǎn)(圖1),這初步表明紅莖-3可能具有產(chǎn)紫杉醇的能力。
為了進(jìn)一步驗(yàn)證紅莖-3能否產(chǎn)紫杉醇,將其發(fā)酵液處理物與紫杉醇標(biāo)準(zhǔn)品進(jìn)行HPLC分析,二者的HPLC圖譜如圖2所示。
由圖2可以看出,紫杉醇標(biāo)準(zhǔn)品和紅莖-3的發(fā)酵液浸提物具有相同保留時(shí)間的洗脫峰,二者均在3.1 min左右。綜合紅莖-3發(fā)酵液浸提物以及紫杉醇標(biāo)準(zhǔn)品的TLC和HPLC分析,可以初步判定紅莖-3具有發(fā)酵產(chǎn)紫杉醇的能力。需要說明的是,盡管初步判定了紅莖-3具有產(chǎn)紫杉醇的能力,但是還需進(jìn)一步對其發(fā)酵產(chǎn)物進(jìn)行分離純化,并借助紫外光譜、質(zhì)譜、紅外光譜、核磁共振等技術(shù)手段進(jìn)行結(jié)構(gòu)解析。
圖1 紅莖-3發(fā)酵液處理物與紫杉醇標(biāo)準(zhǔn)品的薄層層析比較Fig.1 The TLC comparison between Red stem -3 fermentation broths with standard paclitaxel
圖2 紫杉醇標(biāo)準(zhǔn)品(a)與紅莖-3發(fā)酵液處理物(b)的HPLC圖譜Fig.2 The HPLC figures of standard paclitaxel(a)and Red stem -3 fermentation broths(b)
2.2.1 紅莖-3的菌株形態(tài)特征觀察 紅莖-3菌株點(diǎn)植于察氏培養(yǎng)基平板上,菌絲生長速率快,培養(yǎng)2 d后菌落直徑可達(dá)6 cm左右,3 d可長滿整個培養(yǎng)皿。菌落在前3 d呈白色絨毛狀,后期轉(zhuǎn)變成深褐色,如圖3所示。借助插片法和載片法對紅莖-3的菌絲和分生孢子形態(tài)進(jìn)行顯微觀察,可以看出紅莖-3菌絲發(fā)達(dá)呈交織的分支狀(圖4a),菌絲有橫隔(圖4b),分生孢子呈橢圓形且緊密聚集形成子囊殼結(jié)構(gòu)(圖4c)。
根據(jù)以上形態(tài)特征觀察,可初步鑒定紅莖-3為子囊菌亞門的核菌綱。
2.2.2 紅莖-3的18S rRNA序列測定及系統(tǒng)進(jìn)化分析 將紅莖-3(IS279)的18S rRNA序列與Gen-Bank數(shù)據(jù)庫序列進(jìn)行BLAST相似性搜索,收集相似性較高的序列,利用MEGA 4.0軟件,Neighbor-Joining法構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹,結(jié)果如圖5所示。
圖3 紅莖-3的菌落形態(tài)特征Fig.3 The morphologic colony of Red stem-3(culture for 48 h)
由圖5可以看出,紅莖-3與間座殼屬 2個菌株(Diaporthe sp.MI 02和Diaporthe sp.MI 03)聚類在同一個分支上,序列同源性為99%。根據(jù)紅莖-3的形態(tài)和生物學(xué)特征,及其序列同源性比較的結(jié)果,內(nèi)生菌紅莖-3菌株可鑒定為間座殼屬(Diaporthe sp.),并初步命名為Diaporthe sp.H-3。
圖4 紅莖-3的菌絲體及孢子形態(tài)圖Fig.4 The morphologic hyphal and acervulus of endophyte Red stem-3
目前的紫杉醇生產(chǎn)技術(shù),即從紅豆杉原料中直接提取紫杉醇或其中間體的方法,已遠(yuǎn)遠(yuǎn)不能滿足市場需求。由于微生物發(fā)酵法具有菌體生長快、發(fā)酵周期短、產(chǎn)物產(chǎn)率高、生產(chǎn)成本低且發(fā)酵過程易實(shí)現(xiàn)自動化控制等諸多優(yōu)勢,因此利用植物內(nèi)生真菌工業(yè)化發(fā)酵產(chǎn)紫杉醇或中間體,是解決這個問題的有效途徑。
到目前為止,國內(nèi)外已報(bào)道的從紅豆杉屬植物中分離到的產(chǎn)紫杉醇內(nèi)生真菌多達(dá)20多個屬,且多以霉菌為主,如 Taxomyces andreanae(紫杉霉屬)、Fusarium lateritum(鐮刀霉屬)、Alternariu sp.(交鏈霉屬)、Pestalotiopsis micropora(盤多拉毛霉屬)、Nodulisporium sylviform(多節(jié)孢屬)等[11-12]。除了紅豆杉屬植物外,從非紅豆杉屬植物中,如木橘[13]、榧樹[14]、夾竹桃[15]、柏樹[16]等,也分離篩選到了可產(chǎn)紫杉醇的各種內(nèi)生真菌。這充分說明了紫杉醇產(chǎn)生菌具有生物多樣性,同時(shí)也顯示了紫杉醇產(chǎn)生菌宿主的生物多樣性。
迄今,國內(nèi)外許多學(xué)者不僅在產(chǎn)紫杉醇內(nèi)生菌的分離篩選方面做了大量的工作,而且就產(chǎn)紫杉醇內(nèi)生菌的菌種選育及其發(fā)酵工藝優(yōu)化等方面也進(jìn)行了大量研究[17-19]。盡管利用內(nèi)生真菌進(jìn)行紫杉醇的發(fā)酵生產(chǎn)已顯示出誘人的前景和巨大的潛力,而且借助高產(chǎn)菌種的選育、發(fā)酵條件的優(yōu)化等手段使得內(nèi)生菌產(chǎn)紫杉醇的能力得到了大幅度的提高,但是這些研究大多停留在實(shí)驗(yàn)室階段,目前仍難以實(shí)現(xiàn)中型或大型工業(yè)化規(guī)模的發(fā)酵生產(chǎn)[20]。究其原因,還在于缺乏適合于工業(yè)化的高產(chǎn)菌株。因此,尋找高產(chǎn)紫杉醇的內(nèi)生菌株并建立合適的發(fā)酵工藝控制路線,仍然是今后的重點(diǎn)研究方向。
圖5 紅莖-3的18S rRNA序列系統(tǒng)進(jìn)化樹Fig.5 The phylognetic tree of Red stem-3 18S rRNA sequences
本文以南方紅豆杉植株為材料開展了內(nèi)生菌的分離篩選,并最終獲得一株具有產(chǎn)紫杉醇能力的內(nèi)生真菌Diaporthe sp.H-3。值得注意的是,目前有關(guān)間座殼屬內(nèi)生菌產(chǎn)紫杉醇的報(bào)道尚屬首次,但Diaporthe sp.H-3發(fā)酵產(chǎn)紫杉醇的潛能還有待進(jìn)一步的研究。
[1]紀(jì)元,畢建男,嚴(yán)冰,等.產(chǎn)紫杉醇真菌的研究概況與紫杉醇工業(yè)生產(chǎn)的一個新思路[J].生物工程學(xué)報(bào),2006,22(1):1-6.
[2]Wani M C,Taylor H L,Wall M E,et al.Plant antitumor agents VI:The isolation and structure of taxol,a novel antileukemic and antitumor agent from Taxus brevifolia[J].J Am Chem Soc,1971,93:2325 -2327.
[3]Vidensek N,Lim P,Campbell A,et al.Taxol content in bark,wood,root,leaf,twig,and seedling from several Taxus species[J].J Nat Prod,1990,53(6):1609 -1615.
[4]張祺玲,楊宇紅,譚周進(jìn).植物內(nèi)生菌的功能研究進(jìn)展[J].生物技術(shù)通報(bào),2010,7:28-34.
[5]江曙,陳代杰,陶金華.植物內(nèi)生菌及其代謝產(chǎn)物的藥學(xué)研究進(jìn)展[J].中國生化藥物雜志,2008,29(6):424-426.
[6]Aly A H,Debbab A,Proksch P.Fungal endophytes:unique plant inhabitants with great promises[J].Appl Microbiol Biotechnol,2011,90:1829 -1845.
[7]Stierle A,Strobel G A,Stierle D.Taxol and taxane production by Taxomyces andreanae,an endophytic fungus of Pacific Yew[J].Science,1993,260:214 -216.
[8]陳傳文,孫前光,朱軍,等.三種藥用植物內(nèi)生菌的分離及其抗腫瘤活性菌株的篩選[J].微生物學(xué)通報(bào),2010,37(10):1462-1466.
[9]竺俊鑫,李勇超,孟麗.紅豆杉中產(chǎn)紫杉醇內(nèi)生真菌分離部位的比較研究[J].生物技術(shù)通報(bào),2008,4:191-194.
[10]張紀(jì)忠.微生物分類學(xué)[M].上海:復(fù)旦大學(xué)出版社,1990,93-105.
[11]馬玉超,趙凱,王世偉,等.產(chǎn)紫杉醇(Taxol)內(nèi)生真菌的生物多樣性[J].菌物研究,2003,1(1):28-32.
[12]趙凱,平文祥,周東坡.內(nèi)生真菌發(fā)酵生產(chǎn)紫杉醇的研究現(xiàn)狀與展望[J].微生物學(xué)報(bào),2008,48(3):403-407.
[13]Gangadevi V,Muthumary J Taxol,an anticancer drug produced by an endophytic fungus Bartalinia robillardoides Tassi,isolated from a medicinal plant,Aegle marmelos Correa ex Roxb[J].World J Microbiol Biotechnol,2008,24:717 - 724.
[14]Li J Y,Sidhu R S,F(xiàn)ord E J,et al.The induction of taxol production in the endophytic fungus-Periconia sp from Torreya grandifolia[J].Journal of Industrial Microbiology and Biotechnology,1998,20:259 -264.
[15]Kumaran R S,Muthumary J,Hur B.Isolation and identification of an anticancer drug,Taxol from Phyllosticta tabernaemontanae,a leaf spot fungus of an angiosperm,Wrightia tinctoria[J].The Journal of Microbiology,2009,47(1):40 -49.
[16]嚴(yán)冰,畢建男,紀(jì)元,等.一株柏樹內(nèi)生真菌產(chǎn)生抗腫瘤藥物紫杉醇[J].南開大學(xué)學(xué)報(bào):自然科學(xué)版,2007,40(6):67-70.
[17]趙凱,平文祥,張麗娜,等.用Genome shuffling技術(shù)選育紫杉醇高產(chǎn)菌株[J].中國科學(xué)(C 輯),2008,38(3):221 -229.
[18]趙凱,周東坡,平文祥.產(chǎn)紫杉醇菌株原生質(zhì)體誘變育種的研究[J].生物工程學(xué)報(bào),2005,21(5):847-850.
[19]王世偉,馬璽,平文祥,等.微生物發(fā)酵生產(chǎn)紫杉醇研究進(jìn)展[J].微生物學(xué)通報(bào),2007,34(3):561-565.
[20]林福呈,劉小紅,王洪凱,等.紫杉醇及其產(chǎn)生菌的研究現(xiàn)狀與展望[J].微生物學(xué)報(bào),2003,43(4):534-538.