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        應(yīng)用Epi Info7軟件建立具有自動(dòng)評(píng)分和自動(dòng)診斷功能的急性胰腺炎數(shù)據(jù)庫(kù)

        2013-10-19 08:19:18何文華劉丕朱勇曾皓祝蔭夏亮陳幼祥呂農(nóng)華
        中華胰腺病雜志 2013年5期
        關(guān)鍵詞:胰腺炎胰腺自動(dòng)

        何文華 劉丕 朱勇 曾皓 祝蔭 夏亮 陳幼祥 呂農(nóng)華

        ·論著·

        應(yīng)用Epi Info7軟件建立具有自動(dòng)評(píng)分和自動(dòng)診斷功能的急性胰腺炎數(shù)據(jù)庫(kù)

        何文華 劉丕 朱勇 曾皓 祝蔭 夏亮 陳幼祥 呂農(nóng)華

        目的建立專業(yè)的急性胰腺炎(AP)數(shù)據(jù)庫(kù),并運(yùn)用于AP的臨床和科研研究。方法從美國(guó)疾病預(yù)防控制中心 (CDC)網(wǎng)站免費(fèi)下載Epi Info 7軟件,按照2012版亞特蘭大急性胰腺炎分類和中國(guó)急性胰腺炎診治指南(2013,上海)的標(biāo)準(zhǔn),經(jīng)南昌大學(xué)第一附屬醫(yī)院消化內(nèi)科專家討論制定收集的數(shù)據(jù)內(nèi)容建立AP數(shù)據(jù)庫(kù)。結(jié)果建立的AP數(shù)據(jù)庫(kù)包括基本信息、病史資料、體格檢查、實(shí)驗(yàn)室檢查、影像學(xué)檢查、內(nèi)科治療、干預(yù)措施、并發(fā)癥、病情評(píng)估與預(yù)后等15個(gè)頁(yè)面和1個(gè)出院隨訪頁(yè)面,共設(shè)置了1133個(gè)字段。數(shù)據(jù)庫(kù)具有自動(dòng)計(jì)算CT嚴(yán)重指數(shù)(CTSI)、改良的CT嚴(yán)重指數(shù)(MCTSI)、SIRS及Marshall、APACHEⅡ、Ranson、BISAP評(píng)分分值,自動(dòng)診斷短暫性和持續(xù)性器官衰竭,自動(dòng)診斷輕度急性胰腺炎(MAP)、中度急性胰腺炎(MSAP)和重度急性胰腺炎(SAP)等功能,還具有數(shù)據(jù)查詢、數(shù)據(jù)導(dǎo)入與交換、自動(dòng)計(jì)算數(shù)據(jù)、自檢錯(cuò)誤與缺失數(shù)據(jù)、數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析等功能。2011年1月1日至2012年12月31日已收集了南昌大學(xué)第一附屬醫(yī)院1087例AP住院患者的臨床數(shù)據(jù)。結(jié)論利用Epi info 7軟件成功建立了專業(yè)的AP數(shù)據(jù)庫(kù),使用簡(jiǎn)單、界面友好、成本低廉,在AP臨床和科研研究中具有很高的應(yīng)用價(jià)值。

        急性胰腺炎; 計(jì)算機(jī); 自動(dòng)數(shù)據(jù)處理; Epi Info7軟件; 數(shù)據(jù)庫(kù)

        大本樣臨床研究需要收集和分析大量的臨床數(shù)據(jù),但Excel表格等辦公軟件難以勝任大量而復(fù)雜數(shù)據(jù)的輸入與處理,因此建立專業(yè)的疾病數(shù)據(jù)庫(kù)可以提高臨床數(shù)據(jù)的管理水平。由于醫(yī)護(hù)人員和公共衛(wèi)生人員缺乏專業(yè)的軟件編程等信息技術(shù)基礎(chǔ),難以使用SQL Server、Fox pro、Sybase等數(shù)據(jù)庫(kù)制作軟件設(shè)計(jì)開發(fā)出專業(yè)數(shù)據(jù)庫(kù)。聘請(qǐng)軟件公司設(shè)計(jì)不僅需要大筆費(fèi)用,而且軟件工程師缺乏專業(yè)的臨床醫(yī)學(xué)背景,難以按每個(gè)疾病的特點(diǎn)設(shè)計(jì)出滿意的疾病數(shù)據(jù)庫(kù)。Epi Info 是世界衛(wèi)生組織 (WHO)聯(lián)合美國(guó)疾病預(yù)防控制中心 (CDC) 專門為公共衛(wèi)生人員及醫(yī)護(hù)人員制作的軟件,Epi Info 7是目前最新的版本。本研究利用Epi Info 7軟件設(shè)計(jì)一個(gè)數(shù)據(jù)收集全面、能自動(dòng)計(jì)算各種評(píng)分系統(tǒng)、具有快速數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析功能的專業(yè)急性胰腺炎(AP)數(shù)據(jù)庫(kù)。

        材料與方法

        一、開發(fā)急性胰腺炎數(shù)據(jù)庫(kù)的硬件和軟件

        惠普筆記本電腦(Intel 酷睿2雙核2.26 GHz; 內(nèi)存:2 GB DDR3;硬盤:320 GB),日立移動(dòng)硬盤(320 G)。操作系統(tǒng)軟件為Windows 7 Professional(專業(yè)版)。數(shù)據(jù)庫(kù)制作軟件為Epi Info 7軟件,從美國(guó)疾病預(yù)防控制中心 (CDC)網(wǎng)站免費(fèi)下載。

        二、數(shù)據(jù)庫(kù)收集的數(shù)據(jù)內(nèi)容及標(biāo)準(zhǔn)

        AP數(shù)據(jù)庫(kù)收集的臨床數(shù)據(jù)最初參考了中華醫(yī)學(xué)會(huì)消化病學(xué)分會(huì)胰腺病學(xué)組制定的指南[1-2]和國(guó)際AP修訂工作組起草的亞特蘭大分類標(biāo)準(zhǔn)修訂草案[3],經(jīng)南昌大學(xué)第一附屬醫(yī)院消化內(nèi)科專家討論后制定了數(shù)據(jù)庫(kù)的收集內(nèi)容及標(biāo)準(zhǔn),之后根據(jù)修訂的亞特蘭大分類標(biāo)準(zhǔn)[4-5]和“中國(guó)急性胰腺炎診治指南(2013,上海)”[6]作了部分修改,構(gòu)建的數(shù)據(jù)庫(kù)收集的數(shù)據(jù)有以下內(nèi)容。

        1.基本信息: 包括姓名、性別、年齡、職業(yè)、籍貫、患者地址、電話號(hào)碼、婚育史、是否妊娠、身高、體重、體重指數(shù)(BMI)、AP發(fā)病次數(shù)、外院治療情況、48 h內(nèi)預(yù)測(cè)嚴(yán)重程度、誘因、病因等。

        2.病史資料:包括既往史(心血管系統(tǒng)疾病,呼吸系統(tǒng)疾病,肝臟疾病,腎臟疾病,免疫系統(tǒng)疾病,內(nèi)分泌疾病,神經(jīng)系統(tǒng)疾病);個(gè)人史(吸煙史,飲酒史,服藥史);家族史等。

        3.體格檢查:包括體溫、脈搏、呼吸、動(dòng)脈壓、舒張壓、平均動(dòng)脈壓、中心靜脈壓、腹內(nèi)壓、意識(shí)、腹痛癥狀分級(jí)、腹痛體征分級(jí)、腸道功能分級(jí)、腹腔灌入量、

        腹腔引流量、輸液量、尿量、大便次數(shù)。

        4.實(shí)驗(yàn)室檢查:包括血細(xì)胞分析、血生物化學(xué)、C反應(yīng)蛋白、降鈣素原、凝血功能、血?dú)夥治觥⒏顾R?guī)、細(xì)菌學(xué)檢查等。

        5.影像學(xué)檢查:包括胰腺形態(tài)學(xué)分級(jí)、胰腺壞死面積、Balthazar CT嚴(yán)重分級(jí)(CTSI)、改良的CT嚴(yán)重指數(shù)(MCTSI)、胰腺局部并發(fā)癥及胸、肺部病變。

        6.內(nèi)科治療:包括主要的藥物和內(nèi)科操作。

        7.干預(yù)措施:包括經(jīng)皮置管引流術(shù)、腹腔灌洗術(shù)、連續(xù)性血液濾過(guò)、呼吸機(jī)機(jī)械通氣、內(nèi)鏡經(jīng)胃十二指腸壁引流、ERCP胰管支架置入或鼻胰管引流,內(nèi)鏡下胰腺壞死清創(chuàng)術(shù)及其他干預(yù)措施。

        8.并發(fā)癥:包括胰腺局部并發(fā)癥、器官衰竭和其他全身并發(fā)癥。

        9.病情評(píng)估與預(yù)后:按2012年修訂的亞特蘭大分類標(biāo)準(zhǔn)評(píng)估短暫性器官衰竭、持續(xù)性器官衰竭;輕度AP(MAP)、中度AP(MSAP)和重度AP(SAP);各種病情嚴(yán)重程度評(píng)分系統(tǒng):SRIS、BISAP、Ranson和APACHEⅡ評(píng)分;總住院天數(shù)、重癥監(jiān)護(hù)天數(shù)、住院費(fèi)用、藥物費(fèi)用、治療轉(zhuǎn)歸、病死原因。

        10.出院隨訪資料:出院后的癥狀、門診隨訪的實(shí)驗(yàn)室檢查、CT檢查等。

        三、數(shù)據(jù)庫(kù)的數(shù)據(jù)輸入頁(yè)面設(shè)計(jì)

        進(jìn)入Epi Info 7軟件的數(shù)據(jù)庫(kù)頁(yè)面設(shè)計(jì)窗口(圖1),根據(jù)確定的數(shù)據(jù)收集內(nèi)容設(shè)計(jì)15個(gè)住院數(shù)據(jù)輸入頁(yè)面和1個(gè)隨訪資料輸入頁(yè)面,在每個(gè)頁(yè)面填加相應(yīng)的字段,設(shè)置每個(gè)字段的類型、屬性和數(shù)據(jù)輸入范圍等。為全面收集臨床數(shù)據(jù)資料,共設(shè)置了1133個(gè)字段。

        圖1 數(shù)據(jù)庫(kù)頁(yè)面設(shè)計(jì)窗口

        四、數(shù)據(jù)庫(kù)自動(dòng)計(jì)算功能的編碼設(shè)計(jì)

        為減少數(shù)據(jù)輸入的工作量和人工計(jì)算導(dǎo)致的數(shù)據(jù)錯(cuò)誤,對(duì)需計(jì)算數(shù)據(jù)的字段、各種評(píng)分系統(tǒng)、出院診斷設(shè)計(jì)自動(dòng)計(jì)算分析的編碼,打開編碼設(shè)計(jì)窗口(圖2),通過(guò)選擇窗口右邊的字段與執(zhí)行命令完成編碼的設(shè)計(jì)。

        圖2 自動(dòng)計(jì)算的編碼設(shè)計(jì)窗口

        結(jié) 果

        一、急性胰腺炎數(shù)據(jù)庫(kù)的數(shù)據(jù)輸入功能

        進(jìn)入AP數(shù)據(jù)庫(kù),登錄數(shù)據(jù)庫(kù)數(shù)據(jù)輸入窗口(圖3、圖4),左邊為頁(yè)面的目錄,右邊是數(shù)據(jù)輸入頁(yè)面,由于設(shè)置了大量的下拉框,數(shù)據(jù)輸入非常簡(jiǎn)便,完成一份住院患者數(shù)據(jù)輸入的時(shí)間約10~30 min。從2011年1月1日到2012年12月31日共輸入1087例AP住院患者的臨床數(shù)據(jù)。

        圖3 急性胰腺炎數(shù)據(jù)庫(kù)的登錄界面

        圖4 急性胰腺炎數(shù)據(jù)庫(kù)的數(shù)據(jù)輸入窗口

        二、自檢錯(cuò)誤與缺失數(shù)據(jù)功能

        當(dāng)輸入錯(cuò)誤的數(shù)據(jù)類型時(shí),系統(tǒng)會(huì)直接拒絕,輸入數(shù)據(jù)超過(guò)設(shè)定的范圍時(shí),系統(tǒng)會(huì)提示數(shù)據(jù)輸入錯(cuò)誤并要求重新輸入。如果遺漏了重要的數(shù)據(jù),在保存數(shù)據(jù)或離開數(shù)據(jù)庫(kù)時(shí)系統(tǒng)會(huì)彈出警示對(duì)話框,可以防止臨床數(shù)據(jù)的缺失。

        三、自動(dòng)檢索重名功能

        當(dāng)輸入的名字在數(shù)據(jù)庫(kù)內(nèi)有重名時(shí),系統(tǒng)會(huì)彈出一個(gè)對(duì)話框,可以進(jìn)入已存在的患者資料中補(bǔ)充數(shù)據(jù),或忽略重名的病歷,輸入一份新的患者資料。

        四、數(shù)據(jù)查詢功能

        數(shù)據(jù)庫(kù)具有完善的數(shù)據(jù)查詢功能,除了在輸入姓名時(shí)能自動(dòng)檢索記錄外,還可以利用查找功能以任一字段(如住院號(hào))或多個(gè)字段(如性別+年齡)作為查詢條件,檢索出需要的記錄。

        五、自動(dòng)計(jì)算數(shù)據(jù)功能

        通過(guò)在數(shù)據(jù)庫(kù)輸入數(shù)據(jù)后顯示自動(dòng)計(jì)算數(shù)據(jù)功能均得以實(shí)現(xiàn),如輸入身高和體重后自動(dòng)計(jì)算出BMI值,輸入收縮壓和舒張壓后可自動(dòng)計(jì)算出平均動(dòng)脈壓,輸入氧分壓、吸入氧濃度后自動(dòng)計(jì)算出氧合指數(shù)(PaO2/FiO2)和肺泡-動(dòng)脈氧分壓差(A-aDO2)等。

        六、自動(dòng)評(píng)分功能

        在數(shù)據(jù)庫(kù)的最后一個(gè)“病情評(píng)估與預(yù)后”頁(yè)面,點(diǎn)擊“SIRS 每項(xiàng)自動(dòng)評(píng)分”按鈕后自動(dòng)得出第1~14 d的每項(xiàng)指標(biāo)評(píng)分,再點(diǎn)擊“SIRS計(jì)算每天總分”按鈕后自動(dòng)得出每天的SIRS總分。同樣,點(diǎn)擊Marshall、BISAP、APACHEⅡ和Ranson相應(yīng)的自動(dòng)評(píng)分按鈕,可以得出上述評(píng)分標(biāo)準(zhǔn)的每項(xiàng)得分和總分(圖5),通過(guò)與人工計(jì)算的評(píng)分作比較,顯示數(shù)據(jù)庫(kù)的自動(dòng)評(píng)分結(jié)果準(zhǔn)確。

        圖5 急性胰腺炎數(shù)據(jù)庫(kù)的自動(dòng)評(píng)分功能

        七、自動(dòng)診斷功能

        輸入一份完整的臨床數(shù)據(jù)后,在數(shù)據(jù)庫(kù)的病情評(píng)估頁(yè)面點(diǎn)擊“自動(dòng)按新亞特蘭大標(biāo)準(zhǔn)評(píng)估并發(fā)癥”,系統(tǒng)根據(jù)患者的數(shù)據(jù)自動(dòng)判定是否存在器官衰竭,是短暫性還是持續(xù)性器官衰竭,點(diǎn)擊“自動(dòng)作出院診斷”按鈕,系統(tǒng)將以新修訂的亞特蘭大標(biāo)準(zhǔn)自動(dòng)作出MAP、MSAP和SAP的診斷(圖6)。

        圖6 急性胰腺炎數(shù)據(jù)庫(kù)的自動(dòng)診斷功能

        八、數(shù)據(jù)導(dǎo)入與交換功能

        數(shù)據(jù)庫(kù)支持從網(wǎng)絡(luò)、外部電腦、平板電腦導(dǎo)入數(shù)據(jù),這樣可以將AP住院患者資料分配給不同的人進(jìn)行數(shù)據(jù)輸入,最后導(dǎo)入?yún)R總為一個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)文件。

        九、數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析功能

        數(shù)據(jù)庫(kù)具有計(jì)算頻率和均數(shù)、t檢驗(yàn)、方差分析、秩和檢驗(yàn)、四格表或行×列的χ2檢驗(yàn)、線性回歸、Logistic回歸、生存分析和圖表制作等統(tǒng)計(jì)分析功能。還可以將數(shù)據(jù)導(dǎo)出Excel表格在SPSS等軟件上統(tǒng)計(jì)分析。

        討 論

        傳統(tǒng)的臨床研究需通過(guò)翻閱大量病歷資料來(lái)獲取數(shù)據(jù)以供統(tǒng)計(jì)分析,這在原始病歷上的數(shù)據(jù)抄錄、整理與統(tǒng)計(jì)不僅工作量大,而且效率與質(zhì)量低下。雖然大部分醫(yī)院已用病案信息管理系統(tǒng),但并不能直接從病案管理系統(tǒng)中提取數(shù)據(jù)進(jìn)行分析。為促進(jìn)臨床研究的開展,有必要建立專業(yè)的疾病數(shù)據(jù)庫(kù)以快速準(zhǔn)確地對(duì)臨床數(shù)據(jù)進(jìn)行分析處理,提高工作效率與準(zhǔn)確性。

        AP是臨床常見的消化系統(tǒng)急性病。合并胰腺壞死、器官衰竭等并發(fā)癥的SAP治療非常棘手,醫(yī)療費(fèi)用高昂,仍是臨床有待攻克的堡壘。通過(guò)建立AP數(shù)據(jù)庫(kù),全面地收集AP患者的臨床數(shù)據(jù)資料,有助于開展臨床科研,評(píng)價(jià)各種診斷和治療方法的優(yōu)缺點(diǎn),改進(jìn)或創(chuàng)立新的診治方法。國(guó)外發(fā)達(dá)國(guó)家已建立了成熟的專業(yè)疾病數(shù)據(jù)庫(kù),這對(duì)提高臨床診治水平起了重要作用。Wu等[7]利用美國(guó)的AP臨床療效研究數(shù)據(jù)庫(kù)收集了2000年至2001年212家醫(yī)院的17 992例AP患者資料,設(shè)計(jì)出一個(gè)新的AP嚴(yán)重程度床邊指數(shù)(BISAP評(píng)分系統(tǒng)),然后以2004年至2005年的18 256例AP患者資料對(duì)新評(píng)分系統(tǒng)進(jìn)行驗(yàn)證,發(fā)現(xiàn)它預(yù)測(cè)病死率的曲線下面積(AUC)為0.82,準(zhǔn)確性接近APACHEⅡ,而BISAP的計(jì)算更為簡(jiǎn)單,已在國(guó)內(nèi)外得到推廣應(yīng)用[7-8]。日本建立了國(guó)家級(jí)的疾病數(shù)據(jù)庫(kù)管理系統(tǒng),2011年Murata等[9]基于日本的疾病數(shù)據(jù)庫(kù)管理系統(tǒng)對(duì)7000余例AP住院患者進(jìn)行分析,顯示醫(yī)院服務(wù)量影響AP患者的臨床預(yù)后,還發(fā)現(xiàn)臨床實(shí)際的醫(yī)療和制定的指南存在差異[10]。2012年該學(xué)者又基于數(shù)據(jù)庫(kù)管理系統(tǒng)對(duì)7193例AP住院患者進(jìn)行多因素Logistic回歸分析,結(jié)果表明急性壞死性胰腺炎是導(dǎo)致住院費(fèi)用增加的最重要的因素[11]。Yasunaga等[12]也基于日本的疾病數(shù)據(jù)庫(kù)管理系統(tǒng)評(píng)估了加貝酯治療AP的療效。在比較2483例使用加貝酯患者與890例未使用加貝酯的患者后發(fā)現(xiàn),加貝酯無(wú)顯著療效且費(fèi)用高,不建議繼續(xù)使用。因此,建立大樣本的AP數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)于促進(jìn)臨床科研、提高臨床診治水平具有重要作用。

        本研究采用了新修訂的亞特蘭大分類標(biāo)準(zhǔn)等國(guó)內(nèi)外最新的共識(shí)和指南建立了符合AP疾病特點(diǎn)的數(shù)據(jù)庫(kù),創(chuàng)新性地設(shè)計(jì)了自動(dòng)計(jì)算APACHEⅡ、BISAP、Ranson、改良的Marshall、CTSI和MCTSI評(píng)分的分值,以及自動(dòng)診斷MAP、MSAP和SAP等功能。該數(shù)據(jù)庫(kù)采用的Epi info 7軟件完全免費(fèi),維護(hù)費(fèi)用低廉,并且具有以下特點(diǎn):(1)使用過(guò)程中隨時(shí)可對(duì)數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行修改升級(jí);(2)數(shù)據(jù)庫(kù)具有簡(jiǎn)明、友好的可視化界面,易于使用;(3)具備數(shù)據(jù)輸入自檢功能,能夠提醒重復(fù)數(shù)據(jù)、錯(cuò)誤數(shù)據(jù)和缺失數(shù)據(jù),提高數(shù)據(jù)的輸入質(zhì)量;(4)數(shù)據(jù)庫(kù)可以在不同的臺(tái)式電腦、平板電腦及網(wǎng)絡(luò)之間進(jìn)行數(shù)據(jù)導(dǎo)入與交換,方便分工協(xié)作;(5)具有快速、簡(jiǎn)明的數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析功能,滿足臨床工作及科學(xué)研究的需要。本研究建立數(shù)據(jù)庫(kù)后,已輸入了1087例住院患者數(shù)據(jù),初步對(duì)數(shù)據(jù)分析獲得了滿意結(jié)果。本數(shù)據(jù)庫(kù)的成功建立對(duì)其他疾病數(shù)據(jù)庫(kù)的構(gòu)建也具有參考價(jià)值。

        [1] 中華醫(yī)學(xué)會(huì)消化病學(xué)分會(huì)胰腺病學(xué)組. 中國(guó)急性胰腺炎診治指南(草案). 胰腺病學(xué),2004,4:35-39.

        [2] 中華醫(yī)學(xué)會(huì)消化病學(xué)分會(huì)胰腺病學(xué)組. 重癥急性胰腺炎內(nèi)科規(guī)范治療建議. 中華消化雜志,2009,29:75-78.

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        AnacutepancreatitisdatabasewithautomaticscoringanddiagnosisfunctionestablishedbyEpiInfo7software

        HEWen-hua,LIUPi,ZHUYong,ZENGHao,ZHUYing,XIALiang,CHENYou-xiang,LüNong-hua.

        DepartmentofGastroenterology,FirstAffiliatedHospital,NanchangUniversity,Nanchang330006,China

        LüNong-hua,Email:lunonghua@ncu.edu.cn

        ObjectiveTo establish a professional acute pancreatitis database, which can be applied for clinical and scientific research.MethodsEpi Info7 software was freely downloaded from the Centers for Disease Control and Prevention (CDC) of United States. According to the revised 2012 Atlanta classification of acute pancreatitis and Chinese national guideline for acute pancreatitis (2013, Shanghai), and experts of Department of Gastroenterology, The First Affiliated Hospital of Nanchang University reached a consensus to establish the acute pancreatitis database.ResultsAcute pancreatitis database includes 15 pages on basic information, medical history, physical examination, laboratory tests, radiology examination, medical treatment, interventions, complications, severity and prognosis, and 1 page for follow-up data. Overall 1133 field was set up. The database could automatically calculate CTSI, MCTSI, SIRS, Marshall, APACHEⅡ, Ranson and BISAP score, and automatically diagnose transient and persistent organ failure, MAP, MSAP and SAP; and data query, data import and exchange; data statistical analysis functions were incorporated. The database had collected clinical data of 1087 patients with AP in our hospital from January 1st 2011 to December 31st 2012.ConclusionsAn acute pancreatitis database is successfully established by Epi Info7 software. The database is simple, friendly, inexpensive and helpful for clinical research of AP.

        Acute pancreatitis; Computers; Automatic data processing; Epi Info7; Database

        10.3760/cma.j.issn.1674-1935.2013.05.001

        江西省研究生創(chuàng)新專項(xiàng)資金(YC2011-B008)

        330006 江西南昌,南昌大學(xué)第一附屬醫(yī)院消化內(nèi)科

        呂農(nóng)華,Email: lunonghua@ncu.edu.cn

        2013-05-16)

        (本文編輯:呂芳萍)

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