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        吉林省常見的5種委陵菜trnL-F序列比對(duì)

        2013-10-10 03:22:42王伯川劉春明凌云輝張紹軒吉林大學(xué)再生醫(yī)學(xué)科學(xué)研究所吉林長(zhǎng)春00吉林省腫瘤醫(yī)院吉林長(zhǎng)春00吉林大學(xué)中日聯(lián)誼醫(yī)院吉林長(zhǎng)春00吉林省中醫(yī)藥研究院吉林長(zhǎng)春00
        關(guān)鍵詞:委陵菜藥典長(zhǎng)春

        王伯川,金 剛,劉春明,凌云輝,石 巖,張 本,張紹軒* (.吉林大學(xué)再生醫(yī)學(xué)科學(xué)研究所,吉林 長(zhǎng)春 00;.吉林省腫瘤醫(yī)院,吉林 長(zhǎng)春 00;.吉林大學(xué)中日聯(lián)誼醫(yī)院,吉林 長(zhǎng)春 00;.吉林省中醫(yī)藥研究院,吉林長(zhǎng)春 00)

        委陵菜(Potentilla chinesis)為薔薇科委陵菜屬植物,具有清熱解毒、涼血止痢之功能[1]。由于療效確切,在《中國(guó)藥典》歷版中均被收載[2]。該屬植物較多,僅吉林省境內(nèi)就有10種之多。由于它們的親緣關(guān)系接近,在同一生境內(nèi)或不同生境內(nèi)生長(zhǎng)的各個(gè)物種間從外觀上很難區(qū)別,加之所含化學(xué)成分接近,因而,用傳統(tǒng)的外觀鑒別、顯微鑒別、薄層色譜鑒別很難達(dá)到滿意效果[3],導(dǎo)致誤采、誤用,影響療效。為此,本研究采用trnL-F序列分析,對(duì)吉林省地產(chǎn)委陵菜屬植物進(jìn)行鑒別,以彌補(bǔ)上述方法的不足。

        1 材料與方法

        1.1 樣品

        委陵菜伏委陵菜,小叉葉委陵菜,霉葉委陵菜,蔓委陵菜為硅膠快速干燥的葉片。分別集于長(zhǎng)吉高速公路和長(zhǎng)春南湖公園處。均由長(zhǎng)春中醫(yī)藥大學(xué)鄧明魯教授鑒定(見表1)。

        表1 樣品的采集地點(diǎn)和時(shí)間

        1.2 DNA提取

        稱取0.3 g各樣品葉片,置于培養(yǎng)皿中,加水少許,浸泡至充分展開,剪去病斑,用棉球擦拭葉片,去除雜質(zhì),再用70%乙醇擦拭葉片表面,然后用超純水清洗3次,置于超凈臺(tái)上干燥;在液氮中研磨成細(xì)粉,然后按說明用北京鼎國(guó)植物基因組DNA提取試劑盒提取其總 DNA,溶于適量的超純水中。取5 μL用1%瓊脂糖凝膠電泳,檢查DNA質(zhì)量和數(shù)量。

        1.3 引物設(shè)計(jì)

        選擇trnL通用引物[4],由寶生物(中國(guó) 大連)合成,其序列如下:

        PCR引物:

        trnLF-cF:5'-TCC ACT GAA CCT TAT CAT TTA G-3'

        trnLK-fR:5'-CCA TGC TTA AAC TCA GCG GGT-3'

        測(cè)序用引物:

        trnLF-cF:5'-TCC ACT GAA CCT TAT CAT TTA G-3'

        trnLF-dR:5'-GAC TCG ATG GTT CAC GGG ATT CT-3'

        trnLK-eF:5'-TCT CGC ATC GAT GAA GAA CG-3'

        trnLK-fR:5'-CCA TGC TTA AAC TCA GCG GGT-3'

        1.4 DNA擴(kuò)增

        擴(kuò)增采用50 μL 體系,其中1.3 引物各1 μL,模板各 5 μL,10 × Buffer 5 μL,dNTPs 5 μL,Taq DNA 多聚酶1 μL,超純凈水32 μL。反應(yīng)條件:94℃預(yù)變性5 min。94 ℃ 1 min,55 ℃ 2 min,72℃ 2 min,循環(huán)35次。72℃延長(zhǎng)循環(huán)10 min,4℃保存。

        1.5 測(cè)序

        1.4 PCR產(chǎn)物經(jīng)Montage PCR Filter Units(Millipore Corporation,U.S.A.)純化后,進(jìn)行測(cè)序反應(yīng)。反應(yīng)采用10 μL體系,用 ABI BigDye Terminator v3.1 Cycle Sequencing Kit(Applied Biosystems,U.S.A.)測(cè)序,其中含 5 ×sequencing buffer 2.0 μL BigDye(3.1)0.5 μL,純化模板 1.0 μL,1.3 引物 1.0 μL,純凈水5.5 μL。反應(yīng)條件:預(yù)變性 96℃ 1 min。96℃30 sec,50℃ 5 sec,循環(huán)25次。60℃ 延長(zhǎng)4 min。

        1.6 序列分析

        采用網(wǎng)頁http://bioinfo.genopole-toulouse.prd.fr/multalin/multalin.html和Genetyx-SV/RC version 11.0(Software Development Co.,Ltd.,Tokyo,Japan)進(jìn)行序列的比對(duì)和編輯。

        2 結(jié)果

        5種委陵菜trnL-F序列比較見圖1。

        圖1 5種委陵菜trnL序列比較

        3 討論

        除委陵菜外,其他種的trnL-F序列都是首次報(bào)道。如圖1所示,委陵菜各種間trnL-F序列差異明顯,故trnL-F序列分析及其衍生的方法可以用于鑒別委陵菜。委陵菜種類繁多,僅吉林省內(nèi)就有十余種之多,所以本研究?jī)H僅是一個(gè)開始,在今后的研究中需要擴(kuò)大研究樣本的種類,蓄積更多的資料,只有這樣才能更準(zhǔn)確地對(duì)委陵菜各種間進(jìn)行鑒別。

        [1]趙 川,喬 衛(wèi),張彥文,等.委陵菜抗糖尿病有效部位及有效成分的研究[J].中國(guó)中藥雜志,2008,33(6):680-682.

        [2]國(guó)家藥典委員會(huì).中華人民共和國(guó)藥典[M].2010版.北京:中國(guó)醫(yī)藥科技出版社,2010:199.

        [3]楊 婷,孫海峰,曹思思,等.10種委陵菜生藥學(xué)研究[J].時(shí)珍國(guó)醫(yī)國(guó)藥,2008,19(12):3039-3041.

        [4]Taberlet P,Gielly L,Pautou G,et al.Universal primers for amplification of three non-coding regions of chloroplast DNA[J].Plant Mol Biol,1991,17(5):1105-1109.

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