亞紅祥,王靜林
恙蟲病(tsutsugamushi disease)又稱叢林斑疹傷寒(scrub typhus),是由恙蟲病東方體(Oreintia tsutsugamushi,Ot)引起的急性傳染病,該病常引起多器官損害,臨床表現(xiàn)復(fù)雜多變,容易誤診[1]。云南為恙蟲病的主要流行省份,近年恙蟲病病例增多[2]。國際上恙蟲病已被認(rèn)為是威脅旅游健康的重要傳染病之一,隨著云南生態(tài)旅游的日益發(fā)展,該病已成為我省一個(gè)重要的公共衛(wèi)生問題。為了明確我省恙蟲病病原體的類型,我們應(yīng)用血清學(xué)方法對(duì)云南大理地區(qū)恙蟲病病例進(jìn)行血清學(xué)診斷,并對(duì)病原體做基因序列分析。
1.1 材料 2010年2月—12月收集到當(dāng)?shù)馗麽t(yī)療機(jī)構(gòu)送檢的云南大理地區(qū)不明原因持續(xù)發(fā)熱≥3天的病人血液19份,每份樣本取一部分全血進(jìn)行低速離心分離血清用于血清抗體檢測(cè),另一部分全血用于核酸提取。
1.2 方法
1.2.1 間接免疫熒光試驗(yàn)(IFA)用PBS從1∶20開始對(duì)被檢樣本血清作系列稀釋至1∶320,將各稀釋度血清分別加到Ot Karp型和Kato型抗原片(中國疾病預(yù)防控制中心傳染病預(yù)防控制所提供)孔內(nèi),放入濕盒置37℃孵育45min,用PBS洗片3次,每次1~2min,吹干,加入熒光素標(biāo)記的羊抗人IgG抗體(KPL公司),放入濕盒置37℃孵育30min,用PBS洗片3次,每次1~2min,吹干,用Nikon熒光顯微鏡觀察結(jié)果。熒光明亮,呈黃綠色,病原體均勻分布,即可判定該滴度為陽性。
1.2.2 巢式PCR(nPCR)檢測(cè) 用 QIAGEN 公司DNA提取試劑盒對(duì)患者血液提取總DNA,應(yīng)用文獻(xiàn) 中的引物(表1)及條件對(duì)Ot groEL 和sta56基因進(jìn)行擴(kuò)增,引物由上海生工公司合成。PCR反應(yīng)總體積為25μL,應(yīng)用Promega公司 Go-TaqGreen Master Mix試劑盒在Biometra TProfessional PCR儀中進(jìn)行二次PCR擴(kuò)增,以無菌水作為陰性對(duì)照,無陽性對(duì)照。第一次擴(kuò)增時(shí)取6μL被檢標(biāo)本DNA為模板,第二次擴(kuò)增時(shí)取第一次擴(kuò)增產(chǎn)物1μL作為模板。取二次PCR產(chǎn)物用1.5%瓊脂糖凝膠檢測(cè),DNA標(biāo)準(zhǔn)為DL2000(Takara公司)。
1.2.3 DNA序列測(cè)定及分析 PCR陽性產(chǎn)物送北京博邁德科技發(fā)展有限公司進(jìn)行序列測(cè)定。將所得到的序列通過Internet網(wǎng)進(jìn)入美國國家生物技術(shù)信息中心(www.ncbi.nlm.nih.gov)站點(diǎn)后,利用BLAST工具以及采用DNAStar中的MegAlign軟件對(duì)序列進(jìn)行同源性比較,運(yùn)用MEGA5.0軟件構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹。
表1 Ot檢測(cè)所用引物序列Tab.1 Primers’sequences for detection of Ot
2.1 病例資料 收集到病例19份資料(編號(hào)DL1-19),均有不明原因發(fā)熱,發(fā)熱時(shí)間在3~24d,體溫在38~41℃,伴有全身酸痛7例、焦痂2例(DL1患者左腿腘窩處焦痂,見圖1),有的還伴咳嗽、咳痰、鼻出血、胃出血、尿少等;其中農(nóng)民15例、學(xué)生2例、其他2例,男:女性別為11/8,年齡在8~63歲。
2.2 IFA檢測(cè) 對(duì)19例患者血清進(jìn)行Ot IgG抗體檢測(cè),以效價(jià)1∶40作為陽性參考值,結(jié)果Karp型陽性7例,效價(jià)在1∶160-1∶40;Kato型陽性4例,效價(jià)在1∶320-1∶40;兩型均陰性11例;兩型均陽性3例,其中DL1樣本兩型效價(jià)均達(dá)1∶160(表2)。
圖1 特異性焦痂Fig.1 Specific eschar
2.3 groEL基因檢測(cè)及序列分析 對(duì)19例患者血液進(jìn)行nPCR Ot groEL 基因檢測(cè),結(jié)果 DL1、DL4和DL5共3份擴(kuò)增到364bp大小的目的片斷(圖2和表2)。
圖2 nPCR擴(kuò)增groEL片斷部分結(jié)果Fig.2 Partial result of nPCR detection by Ot groELsegment specific primersM:DL2000DNA marker;1:DL1;2:DL2;3:DL3;4:DL4;5:DL5;6:DL6;7:DL7;8:DL8;9:DL9;10:DL10.
表2 Ot抗體及groEL片斷檢測(cè)結(jié)果Tab.2 Detection results for Ab and groELsegment of Ot
從DL1、DL4和DL5樣本中擴(kuò)得的Ot groEL基因測(cè)序,將其序列進(jìn)行比較,結(jié)果3者之間的同源性為100%。
應(yīng)用BLAST工具將該測(cè)定序列(321bp)與GenBank中已知序列進(jìn)行同源性比較,結(jié)果該序列與 AH-GD-OT-S6(GQ499933)、Karp (M31887)、ZJ-TT-OT-O21(GQ499953)、UT332(EF551306)的同源性均為100%;與Kato(AY191586)的同源性為99%; 與 Kawasaki (AY191587)、 Gilliam(AY191585)的同源性分別為94%、93%。
2.4 sta56基因檢測(cè)及序列分析 對(duì)DL1樣本應(yīng)用群特異引物nPCR檢測(cè)Ot sta56基因,結(jié)果擴(kuò)增到481-507bp大小的目的片斷,應(yīng)用BLAST工具將測(cè)序獲得的樣本DL1序列(459bp)與GenBank中已知序列進(jìn)行同源性比較,結(jié)果DL1序列與臺(tái)灣株 KM05(GU120150)、HL04(GU120144)、TW45R(AY222632)、 KM17-2 (GU446600) KM18(GU446601)的同源性最高均為99%;與Karp株(M33004)的同源性為93%;與中國山東Shandong-XDM2(DQ514320)、TWZ(JX202573)株的同源性均為78%,與Kato(M63382)株的同源性為77%。
對(duì)DL1樣本應(yīng)用分型引物nPCR檢測(cè)Ot sta56基因,結(jié)果擴(kuò)增到230bp大小的Karp型sta56基因目的片斷(圖3),應(yīng)用BLAST工具將測(cè)序獲得的樣本DL1序列與GenBank中已知序列進(jìn)行同源性比較,結(jié)果 DL1序列(216bp)與臺(tái)灣株 KM05(GU120150)、HL04(GU120144)、TW45R(AY222632)、KM17-2(GU446600)KM18GU446601的同源性均為100%,與Karp株(M33004)的同源性為91%。
圖3 分型引物nPCR檢測(cè)DL1樣本結(jié)果Fig.3 Results of DL1by nPCR with Karp and Kato specific primersM:DL2000DNA marker;1:Karp;2:Kato
2.5 系統(tǒng)進(jìn)化樹分析 根據(jù)Ot groEL 基因部分序列進(jìn)行系統(tǒng)進(jìn)化樹分析,結(jié)果顯示樣本DL1序列(321bp)與 AH-GD-OT-S6(GQ499933)、Karp(M31887)、ZJ-TT-OT-O21(GQ499953)、UT332(EF551306)、Kato(AY191586)株在同一個(gè)分支上(圖4)。
根據(jù)Ot sta56基因部分序列進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)生樹分析,結(jié)果顯示樣本DL1序列(據(jù)群特引物檢測(cè)Ot sta56片斷所獲得459bp大小的序列)與臺(tái)灣KM05(GU120150)、HL04(GU120144)、TW45R(AY222632)、 KM17-2 (GU446600)、 KM18(GU446601)株在同一個(gè)分支上,見圖5。
圖4 根據(jù)Ot groEL基因部分序列構(gòu)建的系統(tǒng)進(jìn)化樹Fig.4 Phylogenetic tree of partial segments of Ot groELgene
圖5 根據(jù)Ot sta56基因部分序列構(gòu)建的系統(tǒng)進(jìn)化樹Fig.5 Phylogenetic tree of partial segments of Ot sta56gene
2.6 恙蟲病病例診斷 根據(jù)恙蟲病預(yù)防控制技術(shù)指南[7],結(jié)合患者臨床發(fā)病情況和實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)結(jié)果進(jìn)行綜合分析,恙蟲病患者共8例:其中實(shí)驗(yàn)室確診4例(其中2例Ot核酸陽性且抗體效價(jià)≥1∶160、1例Ot核酸陽性且抗體效價(jià)1∶40、1例Ot抗體效價(jià)1∶160)、臨床診斷病例4例(Ot抗體效價(jià)在1∶80~1∶40);Karp血清型4例、Kato血清型3例、Karp+Kato血清型1例;農(nóng)民7例、學(xué)生1例;春季3例、夏季2例、秋季2例、冬季1例。
恙蟲病是由恙蟲病東方體引起的自然疫源性疾病,以鼠類為主要傳染源,經(jīng)恙螨叮咬而傳播,臨床上以發(fā)熱、焦痂或潰瘍、淋巴結(jié)腫大、肝脾腫大及皮疹為特征,全身毒血癥狀可致多臟器受累,甚至死亡[8]。恙蟲病在我國分布廣泛,近年全國流行態(tài)勢(shì)呈上升趨勢(shì)[9]。云南作為恙蟲病流行的主要省份之一,其病例也在逐年增多,主要分布于保山、大理、西雙版納等滇西南地區(qū),全年均有發(fā)病,以夏秋季為主,農(nóng)民居多,且高度散發(fā),誤診率高達(dá)80%[2]。以往多采用血清學(xué)方法對(duì)Ot進(jìn)行鑒定,近年許多省份和地區(qū)均有應(yīng)用RFLP、PCR技術(shù)及核苷酸序列分析等技術(shù)對(duì)Ot進(jìn)行基因序列鑒定[9],然而云南對(duì)Ot的研究較少,特別是型別鑒定及序列分析尤為滯后。本次采用WHO推薦的恙蟲病標(biāo)準(zhǔn)診斷方法IFA[10]以及nPCR與序列分析技術(shù)進(jìn)行恙蟲病病例診斷,確診恙蟲病8例。其中2例有特異性焦痂,占總病例的25%,低于以往本省恙蟲病焦痂發(fā)生率30~80%[2];8例確診恙蟲病病例中7例患者為農(nóng)民,符合該病以農(nóng)民居多的特點(diǎn);春季3例、夏季2例、秋季2例、冬季1例,這也符合本省恙蟲病全年均有發(fā)病的特點(diǎn)。以往研究顯示大理地區(qū)恙蟲病患者以Karp血清型多見、Kato血清型甚少[11],而本次研究發(fā)現(xiàn)該地區(qū)8例確認(rèn)的恙蟲病中,Karp血清型4例和Kato血清型3例,Karp+Kato混合血清型1例。該結(jié)果說明大理地區(qū)存在Karp和Kato血清型恙蟲病東方體,以及可能某些患者為Karp和Kato血清型恙蟲病東方體的混合感染。
Ot 58kD蛋白較為保守,其編碼基因groEL常用于Ot的篩查,而56kD蛋白具有型或株特異性,sta56為其編碼基因通常應(yīng)用于Ot的型別鑒定。本次研究通過nPCR檢測(cè)到groEL基因目的片斷3例(檢出率15.79%,同時(shí)它們的Ot抗體也檢測(cè)陽性),序列系統(tǒng)進(jìn)化樹分析顯示該3株Ot均與Karp、AH-GD-OT-S6 (GQ499933)、ZJ-TT-OTO21、UT332、Kato株在同一個(gè)分支上,表明該方法不能區(qū)分出Ot的血清型別。從Karp+Kato混合血清型樣本擴(kuò)得sta56基因片斷,其序列(216bp)分析結(jié)果表明該Ot株的遺傳進(jìn)化關(guān)系與臺(tái)灣KM05、HL04、TW45R、KM17-2、KM18株最為密切,而與Karp株的關(guān)系較遠(yuǎn);群引物檢測(cè)到sta56基因片斷,其序列(459bp)系統(tǒng)進(jìn)化樹分析顯示該Ot株與臺(tái)灣 KM05、HL04、TW45R、KM17-2、KM18株在同一個(gè)分支上,而與Karp株不在同一分支,再次表明該Ot株的遺傳進(jìn)化關(guān)系與臺(tái)灣KM05、HL04、TW45R、KM17-2、KM18株最為密切,與 Karp株關(guān)系較遠(yuǎn)。
云南省大理地區(qū)為我國旅游勝地,該地區(qū)地形地貌復(fù)雜、植被豐富、鼠類和恙螨繁多[12-13],是恙蟲病流行較為嚴(yán)重的地區(qū),人們深受該病的危害。隨著當(dāng)?shù)芈糜螛I(yè)等人類活動(dòng)的日益擴(kuò)張,可致使一些恙蟲病疫源地的微環(huán)境發(fā)生改變,Ot可能發(fā)生一定的基因變異而出現(xiàn)新的基因型,使恙蟲病的流行可能呈現(xiàn)更為復(fù)雜多樣化,不僅對(duì)旅游健康構(gòu)成威脅,而且會(huì)對(duì)當(dāng)?shù)亟?jīng)濟(jì)產(chǎn)生明顯的負(fù)面影響。因此為了加強(qiáng)當(dāng)?shù)仨οx病的預(yù)防與控制,開展Ot的基因型別、毒力及其遺傳特征等方面的研究具有重要的現(xiàn)實(shí)意義。
[1]Tamura A,Ohashi N,Urakami H,etal.Classification of Rick-ettsia tsutsugamushi in a new genusOreintiagen.nov.a(chǎn)s Oreintia tsutsugamushi comb.Nov[J].Int J Syst Bacteriol,1995,45(3):589-591.DOI:10.1099/00207713-45-3-589
[2]Xuan Q,Liu AH,Bao FK.Current progress in research of tsutsugamushi disease in Yunnan Province in China[J].Chin Trop Med,2010,10(10):1278-1280.(in Chinese)宣群,柳愛華,寶福凱.云南恙蟲病研究概況[J].中國熱帶醫(yī)學(xué),2010,10(10):1278-1280.
[3]Zhang LJ,Li XM,Zhang DR,etal.Molecular epidemic survey on co-prevalence of scrub typhus and marine typhus in Yuxi city,Yunnan province of China[J].Chin Med J(Engl),2007,120(15):1314-1318.
[4]Park HS,Lee JH,Jeong EJ,etal.Rapid and simple identification oforeintia tsutsugamushi from other group rickettsia by duplex PCR assay using groELgene[J].Micro Immunol,2005,49(6):545-549.
[5]Furuya Y,Yoshida Y,Katayama T,etal.Serotye specific amplification of Rickettsia tsutsugamushi DNA by nested polymerase chain reaction[J].J Clin Microbiol,1993,31(6):1637-1640.
[6]Tamura A,Yamamoto N,Koyama S,etal.Epidemiological survey oforeintia tsutsugamushi distribution in filed rodents in Saitama prefecture,Japan,and discovery of a new type[J].Microbial Immunol,2001,45(6):439-446.
[7]Chinese Center for Disease Control and Prevention.Tsutsugamushi disease prevention and control technical manual(Pilot Edition)[Z].2009-1.(in Chinese)中國疾病預(yù)防控制中心.恙蟲病預(yù)防控制技術(shù)指南(試行)[Z].中疾控疾發(fā),2009-1.
[8]Koh GC,Maude RJ,Paris DH,etal.Diagnosis of scrub typhus[J].Am J Trop Med Hyg,2010,82(3):368-370.DOI:10.4269/ajtmh.2010.09-0233 9Zhang MWang XJZhao ZT.Current epidemic status and issues on prevention and control of scrub typhus[J].Chin J Epidemiol,201l,32(4):419-423.DOI:10.3760/cma.j.issn.0254-6450.2011.04.021 (in Chinese)張萌,王顯軍,趙仲堂.中國恙蟲病流行態(tài)勢(shì)及預(yù)防控制[J].中華流行病學(xué)雜志,2011,32(4):419-423.DOI:10.3760/cma.j.issn.0254-6450.2011.04.021
[10]Blacksell SD,Bryant NJ,Paris DH,etal.Scrub typhus serologic testing with the indirect immuno-fluorescence method as a diagnostic gold standard:a lack of consensus leads to a lot of confusion[J].Clin Infect Dis,2007,44(3):391-401.DOI:10.1086/510585
[11]Feng XG,Yuan QH.Detection of antibody against tsutsugamushi disease from sera provided by fever patients and research of it's classification in Dali city of Yunnan Province[J].Chin J Zoonoses,1999,15(3):74.(in Chinese)馮錫光,袁慶虹.大理市發(fā)熱病人血清恙蟲病抗體檢測(cè)及其分型研究[J].中國人獸共患病雜志,1999,15(3):74.
[12]Niu AQ,Guo XG,Men XY,etal.Community structure of chigger mites on small mammals in the surrounding areas of Erhai Lake in Dali of Yunnan[J].Chin J Vect Bio Ctrl,2005,16(6):434-437.(in Chinese)牛愛琴,郭憲國,門興元,等.云南省大理洱海周邊地帶小獸體表恙螨群落結(jié)構(gòu)[J].中國媒介生物學(xué)及控制雜志,2005,16(6):434-437.
[13]Gong ZD,Wu HY,Duan XD,etal.The species diversity and distribution trends of small mammals in Hengduan Mountains,Yunnan[J].Biodiversity Sci,2001,9(1):73-79.(in Chinese)龔正達(dá),吳厚永,段興德,等.云南橫斷山區(qū)小型獸類物種多樣性與地理分布趨勢(shì)[J].生物多樣性,2001,9(1):73-79.