李海波 劉敏娟 毛君 李紅 陳瑛
(南京醫(yī)科大學(xué)附屬蘇州醫(yī)院 生殖與遺傳中心,江蘇 蘇州 215002)
脆性X綜合征(fragile X syndrome,F(xiàn)XS)是 X連鎖顯性遺傳病[MIM:300624],F(xiàn)MR1基因中(CGG)n重復(fù)序列的不穩(wěn)定性擴展及其上游Cp G島的異常甲基化是導(dǎo)致該病的分子基礎(chǔ)。臨床表現(xiàn)以不同程度的智力障礙為主,此外可伴有行為和體格發(fā)育異常及卵巢早衰等。在正常人群中其攜帶者所占比例高達1%[1],目前尚無確切的藥物可以治療,女性攜帶者不但可累及生殖系統(tǒng),還會將生育后代的致病效應(yīng)放大,使子女出現(xiàn)嚴重的智力及生理功能異常,因此對孕婦行產(chǎn)前篩查進而指導(dǎo)生育就顯得尤為重要[2]。
因FMR1基因序列的特殊性,傳統(tǒng)的PCR或PCR聯(lián)合Southern Blot等技術(shù)或難于擴增,或檢測精度不夠,本文旨在建立基于熒光PCR快速篩查技術(shù),分析普通孕婦人群中的FMR1基因(CGG)n序列重復(fù)次數(shù),并評估對其產(chǎn)前基因篩查的臨床應(yīng)用價值。
1.1 研究對象 2009~2010年間在蘇州市立醫(yī)院持母嬰陽光工程基因篩查券進行孕中期產(chǎn)前篩查的孕婦356名,均簽署知情同意書。有3例明確CGG重復(fù)數(shù)的女性攜帶者樣本用于技術(shù)體系的驗證檢測。
1.2 實驗方法
1.2.1 基因組DNA制備 每例取200μl外周血,利用QIAamp DNA Mini Blood Kit(Qiagen公司,德國)提取基因組DNA,應(yīng)用 NanoDrop-1000(Thermo公司,美國)檢測其濃度和純度后,稀釋至20 ng/μl。
1.2.2 熒光PCR 參考Coffee等[3]報導(dǎo)的方法加以改進,正反向引物跨越CGG重復(fù)區(qū)及側(cè)翼序列,引 物 序 列 為:FXFOR 5′-AGGCGCTCAGCTCCGTTTCGGTTTCCTTC-3′(正 向)和 FXX3 5′-FAM-GTGGGCTGCGGGCGCTCGAGG-3′(反向)(捷瑞生物工程有限公司,上海)。PCR總反應(yīng)體系15μl,試劑主要購自瑞士Roche公司:去離子水4.83μl,10×PCR fasttaq buffer 1.0μl,5×RICH buffer 0.08μl,DMSO 0.5μl,25m M MgCl2溶液0.6μl,10m M 含有等比例d NTP和deaza d GTP 1.6μl,4 m M 引物FXFOR、FXX3各0.2μl,F(xiàn)aststart Taq聚合酶0.6μl,模板DNA為0.6μl。反應(yīng)于熱循環(huán)儀上進行 (9700型,ABI公司,美國)。反應(yīng)起始溫度98℃ 變性5分鐘;共10個循環(huán)中97℃變性35秒,62℃復(fù)性35秒,72℃延伸3分鐘;接著20個循環(huán),97℃變性35秒,62℃復(fù)性35秒,72℃延伸4分鐘,每循環(huán)延伸時間增加20秒;72℃延伸10分鐘。
1.2.3 毛細管電泳分析 每反應(yīng)體系中加入Hi-Di甲酰胺(ABI公司,美國)9.0μl,內(nèi)標ROX-1000(ABI公司,美國)0.2μl,熒光PCR產(chǎn)物1.0μl,混勻離心后,95℃變性5分鐘,立即置冰上5分鐘。采用ABI 3130遺傳分析儀進行毛細管電泳,應(yīng)用GeneMaper V3.0軟件進行數(shù)據(jù)分析,根據(jù)電泳峰位置坐標計算CGG重復(fù)次數(shù),公式為(CGG)n=(橫坐標位置-151)/3+漂移系數(shù)。
參考Coffee等[3]的電泳峰圖判讀標準,在356例孕婦中,275例(77.25%)毛細管電泳結(jié)果顯示為2組峰,提示為雜合型基因型,可以明確診斷,且2組峰計算后(CGG)n重復(fù)數(shù)均低于130個重復(fù)。雜合基因型等位基因分布范圍見圖1所示,CGG重復(fù)數(shù)主要分布在29~35之間,占69.44%。275例樣本中(CGG)重復(fù)大于45的前突變攜帶者共6例(2.18%)。
圖1 CGG重復(fù)數(shù)的人群分布柱狀圖
81例(22.75%)僅見到一組峰,提示可能是純合子,也可能存在一組峰(CGG)n重復(fù)數(shù)高于130而超出本方法檢測范圍之外,這部分顯示單組峰的樣本也可能是前突變或全突變攜帶者(圖2)。
圖2 不同基因型毛細管電泳峰型圖
3例已知CGG重復(fù)數(shù)樣本的驗證檢測中,1例正常、1例CGG重復(fù)數(shù)115的攜帶者均能夠正確檢出,1例CGG重復(fù)數(shù)為350的攜帶者未能明確檢出。
1991年P(guān)ieretti等[4]發(fā)現(xiàn)了FXS相關(guān)致病基因FMR1,提出FMR1基因內(nèi)(CGG)n重復(fù)序列的不穩(wěn)定性擴展及其上游Cp G島的異常甲基化是導(dǎo)致該病的分子基礎(chǔ)。研究指出小于44個CGG重復(fù)為正常;45~54個CGG重復(fù)為中間型(灰區(qū));55~200個CGG重復(fù)屬于前突變型;大于200個CGG重復(fù)為突變型,為致病型。前突變型未表現(xiàn)臨床癥狀,但約有20%的前突變型女性攜帶者易發(fā)生“脆性X原發(fā)性卵巢功能不全(FX-POI)”,而部分前突變型男性攜帶者在其老年時期易發(fā)生“脆性X相關(guān)震顫-共濟失調(diào)綜合征(FX-TAS)”。全突變型的男性100%表現(xiàn)臨床癥狀,女性則依據(jù)X染色體失活的不同而具有異質(zhì)性臨床癥狀。
前突變攜帶者的后代會增加約100個CGG的重復(fù),這樣子代變成致病性全突變的幾率近100%。經(jīng)過大樣本的檢測分析[5]和人群調(diào)研[6],美國醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)協(xié)會(ACMG)、世界衛(wèi)生組織(WHO)已公布出進行FXS分子診斷的適宜人群,并確立了診療指南[7,8],以色列等國家已在孕婦中進行常規(guī)篩查[9]。我國FMR1前突變的篩查未被廣泛接受的主要原因為檢測技術(shù)水平的限制及缺少區(qū)域人群突變攜帶率的有效數(shù)據(jù),本研究也旨在揭示蘇州地區(qū)脆性X攜帶者的突變譜及頻率,初步結(jié)果顯示CGG重復(fù)數(shù)低于130個重復(fù)的樣本前突變攜帶率即達2.18%,高于以往報道[1],提示蘇州地區(qū)產(chǎn)前FXS產(chǎn)前遺傳學(xué)篩查的可行性。
現(xiàn)有多種方法用于FXS的分子診斷,其中包括Southern印跡雜交法,按照雜交出的條帶結(jié)果可檢出全部前突變和全突變等位基因,還可檢測CpG島的甲基化,是目前較為可靠的診斷方法。但是該方法的缺點是酶解不完全,容易造成假陽性結(jié)果,操作繁瑣,花費高,對樣本量要求大,難于精確確定拷貝數(shù)等。在基因表達水平上的檢測方法有RT-PCR方法(檢測FMR1基因的轉(zhuǎn)錄)和免疫學(xué)方法(采用抗體檢測FMR1基因的翻譯產(chǎn)物FMRP蛋白),但只能檢測全突變患者,所以很難將其應(yīng)用于大范圍的人群篩查。本實驗方法與上述方法相比,具有高通量、簡便、快速、價廉的特點,初篩能夠快速排除近80%的雜合的正常個體及重復(fù)數(shù)在50~130個重復(fù)的前突變個體。剩余病例的明確診斷尚需其他與本技術(shù)檢測手段類似的技術(shù)(如AmplideX FMR1 PCR Kit,Asuragen公司,美國)加以輔助[10]。通過本研究,我們認為本方法可靠、簡便,對產(chǎn)前孕婦FMR1基因CGG重復(fù)數(shù)篩查具有一定的臨床應(yīng)用價值。
致謝感謝北京大學(xué)醫(yī)學(xué)部醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)系鐘南教授對本研究的指導(dǎo)。
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