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        突變型人PRKAG2基因的克隆及其真核表達(dá)載體構(gòu)建

        2013-08-18 09:35:50張必利
        海軍醫(yī)學(xué)雜志 2013年2期
        關(guān)鍵詞:瓊脂糖變性克隆

        陳 挺,張必利,何 平,程 平,鄭 興

        家族性心室預(yù)激、傳導(dǎo)系統(tǒng)病變及心肌肥厚在2002年首次被歸結(jié)為分子遺傳學(xué)疾病,并被統(tǒng)稱為PRKAG2心臟綜合征。這是一種少見(jiàn)的常染色體顯性遺傳性疾病,主要由于編碼腺苷-磷酸激活的蛋白激酶γ2調(diào)節(jié)亞單位基因的PRKAG2發(fā)生錯(cuò)義突變,例如,有人認(rèn)為該基因R302Q位點(diǎn)突變與預(yù)激有關(guān)[1-2]?;颊邥?huì)出現(xiàn)陣發(fā)性室上性心動(dòng)過(guò)速,需安裝永久起搏器,同時(shí)有可能伴有心肌肥厚、左室功能障礙等臨床表型[3-4]。本研究擬通過(guò)構(gòu)建含有突變位點(diǎn)R302Q的PRKAG2的真核表達(dá)載體,為進(jìn)一步研究基因PRKAG2 R302Q突變的功能以及PRKAG2心臟綜合征的發(fā)病機(jī)制奠定基礎(chǔ)。

        1 材料與方法

        1.1 試劑

        大腸桿菌感受態(tài)細(xì)胞Top10,由筆者所在實(shí)驗(yàn)室制備;真核表達(dá)載體 pIRES2-EGFP(Clontech公司);KOD高保真DNA聚合酶(TOYOBO公司);限制性內(nèi)切酶Nhe I、BamH I(Fermantas公司);T4DNA連接酶(NEB公司);普通質(zhì)粒小抽試劑盒、瓊脂糖凝膠DNA回收試劑盒和PCR清潔試劑盒(Axygen公司);Trizol試劑(Invitrogen公司);逆轉(zhuǎn)錄酶(Promega公司)。

        1.2 方法

        1.2.1 引物設(shè)計(jì)與合成 設(shè)計(jì)用于PCR擴(kuò)增人野生型PRKAG2基因(NCBI基因ID號(hào)51422)CDS區(qū)的引物,ATG起始位點(diǎn)前增加Kozak序列GCCACC,引物名稱及序列:F1,5'-GTCAGCTAGCGCCACCATGGGAAGCGCGGTTATGG-3';R1,5'-TGTAGGATCCTCACTCCGTTTCTGTCTCCTTTTGT-3';設(shè)計(jì)R302Q定點(diǎn)突變引物,突變位點(diǎn)位于引物中間位置,引物名稱及序列:RQ1,5'-GCCAACGGTGTCCGAGCAGCGCCACTGT-3';RQ2,5'-ACAGTGGCGCTGCTCGGACACCGTTGGC-3',以上引物由上海生工生物工程有限公司合成。

        1.2.2 人野生型基因 PRKAG2的克隆 用 Trizol法抽提健康人全血mRNA,逆轉(zhuǎn)錄合成cDNA第1條鏈,采用F1/R1特異引物PCR擴(kuò)增目標(biāo)序列,PCR 體系:cDNA 0.5 μl,F(xiàn)1 引物 0.5 μl,R1 引物0.5 μl,KOD DNA 聚合酶 0.5 μl,濃度 2 mmol/L 的dNTP 2 μl,濃度 25 mmol/L 的 MgSO41 μl,10 × KOD Buffer 2.5 μl,無(wú)菌雙蒸水加至 25 μl。反應(yīng)體系在冰上配制,混勻,瞬時(shí)離心后置于PCR儀,95℃預(yù)變性 5 min 后;95℃變性30 s,55℃退火30 s,68℃延伸90 s,進(jìn)行35個(gè)循環(huán);最后68℃延伸5 min。目標(biāo)片段回收,經(jīng)Nhe I、BamH I雙酶切連接至pIRES2-EGFP載體中,篩選陽(yáng)性克隆測(cè)序驗(yàn)證。

        1.2.3 人突變型基因 PRKAG2 R302Q的克隆(1)PCR分段擴(kuò)增引入突變序列。以人野生型PRKAG2基因?yàn)槟0?,分別采用F1/RQ2、RQ1/R2 2對(duì)引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增,擴(kuò)增產(chǎn)物分別命名為RSa、RSb。擴(kuò)增結(jié)束后將PCR擴(kuò)增產(chǎn)物全部上樣,用1%瓊脂糖凝膠電泳,紫外燈下切割目的片段,膠回收試劑盒純化。PCR體系及反應(yīng)條件:模板pPRKAG2-IRES2-EGFP質(zhì)粒 0.1 μl,F(xiàn)1/RQ1 0.5 μl,RQ22/R1 0.5 μl,KOD DNA 聚合酶 0.5 μl,濃度 2 mmol/L 的 dNTP 2 μl,濃度 25 mmol/L 的 MgSO41 μl,10 × KOD Buffer 2.5 μl,無(wú)菌雙蒸水加至25 μl。反應(yīng)體系在冰上配制,混勻,瞬時(shí)離心后置于PCR儀,95℃預(yù)變性5 min后;95℃變性30 s,56℃退火30 s,68℃延伸60 s,進(jìn)行30 個(gè)循環(huán);最后68℃延伸5 min。(2)PCR拼接獲得PRKAG2 R302Q全長(zhǎng)。將上述純化得到的2個(gè)分段PCR產(chǎn)物RSa、RSb作為模板,采用F1/R1引物PCR擴(kuò)增,得到PRKAG2 R302Q基因片段,PCR擴(kuò)增產(chǎn)物全部上樣,用1%瓊脂糖凝膠電泳,紫外燈下切割目的片段,膠回收試劑盒純化。PCR體系及反應(yīng)條件:模板RSa 0.5 μl,模板 RSb 0.5 μl,F(xiàn)1 0.5 μl,R1 0.5 μl,KOD DNA 聚合酶1 μl,濃度 2 mmol/L 的 dNTP 4 μl,濃度25 mmol/L 的 MgSO42 μl,10 × KOD Buffer 5 μl,無(wú)菌雙蒸水加至50 μl。反應(yīng)體系在冰上配制,混勻,瞬時(shí)離心后置于PCR儀,95℃預(yù)變性5 min后;95℃變性30 s,56℃退火30 s,68℃延伸2 min,進(jìn)行30 個(gè)循環(huán);最后68℃延伸5 min。

        1.2.4 重組載體 pR302Q-IRES2-EGFP的構(gòu)建(1)酶切、連接、轉(zhuǎn)化。用Nhe I、BamH I雙酶切回收產(chǎn)物R302Q片段和pIRES2-EGFP載體,37℃水浴酶切2 h。酶切體系:10 × TangoTMBuffer 5 μl,Nhe I 2 μl,BamH I 2 μl,R302Q/pIRES2-EGFP 25 μl,無(wú)菌雙蒸水加至50 μl。PCR清潔試劑盒回收酶切基因及載體產(chǎn)物,T4DNA連接酶4℃連接過(guò)夜,得到的質(zhì)粒為pR302Q-IRES2-EGFP。將重組質(zhì)粒42℃熱擊轉(zhuǎn)化Top10感受態(tài)細(xì)胞,37℃培養(yǎng)箱中培養(yǎng)過(guò)夜。(2)陽(yáng)性克隆鑒定。挑取轉(zhuǎn)化板的單克隆,置于20 μl無(wú)菌水中溶解,取1 μl菌液作模板,特異引物F1/R1進(jìn)行PCR擴(kuò)增,取5 μl擴(kuò)增產(chǎn)物,1%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)。反應(yīng)體系:10×Taq Buffer 2 μl,F(xiàn)1 0.3 μl,R1 0.3 μl,菌液 0.5 μl,Taq 0.3 μl,濃度 2 mmol/L 的 dNTP 2 μl,無(wú)菌雙蒸水加至 20 μl。反應(yīng)體系在冰上配制,混勻,瞬時(shí)離心后置于PCR儀,94℃預(yù)變性5 min后;94℃變性30 s,61℃退火30 s,72℃延伸2 min,進(jìn)行30個(gè)循環(huán);最后72℃延伸10 min。挑取PCR鑒定正確的陽(yáng)性克隆進(jìn)一步采用Nhe I、BamH I雙酶切驗(yàn)證后,挑取2個(gè)克隆送Invitrogen公司采用通用引物測(cè)序。Axygen質(zhì)粒小抽試劑盒抽提測(cè)序正確的克隆質(zhì)粒。

        2 結(jié)果

        2.1 人野生型PRKAG2基因的克隆

        Trizol法提取人細(xì)胞mRNA,經(jīng)RT-PCR合成cDNA第1條鏈,特異性引物PCR擴(kuò)增得到PRKAG2基因片段,目的片段條帶在1710 bp左右,酶切連接至pIRES2-EGFP載體中測(cè)序驗(yàn)證,與NCBI公布序列完全一致,表明正確擴(kuò)增出PRKAG2基因片段見(jiàn)圖1。

        圖1 人野生型PRKAG2的RT-PCR電泳圖

        2.2 人突變型基因PRKAG2R302Q的克隆

        以人野生型基因PRKAG2為模板,通過(guò)PCR拼接的方法,分段擴(kuò)增得到PRKAG2R302Q基因2段,大小分別為900 bp與800 bp左右,均與預(yù)期一致。見(jiàn)圖2。膠回收純化克隆得到的基因片段,再分別以以上2個(gè)片段為模板,通過(guò)PCR拼接得到了約1700 bp的目標(biāo)片段,與預(yù)期一致。見(jiàn)圖3。

        圖2 PRKAG2的RSa、RSb片段擴(kuò)增結(jié)果

        2.3 重組載體pR302Q-IRES2-EGFP的構(gòu)建

        以Nhe I、BamH I分別雙酶切 pIRES2-EGFP和上述膠回收片段,1%瓊脂糖凝膠電泳,紫外燈下切割陽(yáng)性片段,膠回收試劑盒回收酶切片段。經(jīng)T4DNA連接酶連接雙酶切產(chǎn)物,構(gòu)建pR302Q-IRES2-EGFP重組載體。轉(zhuǎn)化Top10感受態(tài)細(xì)胞,菌落PCR篩選陽(yáng)性克隆。見(jiàn)圖4。篩選得到的陽(yáng)性克隆進(jìn)一步采用酶切驗(yàn)證。見(jiàn)圖5。挑取2個(gè)陽(yáng)性克隆送Invitrogen公司測(cè)序,結(jié)果與設(shè)計(jì)完全一致。

        圖3 PRKAG2 R302Q的RSa、RSb片段拼接電泳圖

        圖4 pR302Q-IRES2-EGFP重組載體菌落PCR鑒定結(jié)果

        圖5 pR302Q-IRES2-EGFP重組載體酶切鑒定結(jié)果

        3 討論

        PRKAG2是AMPK γ2調(diào)節(jié)亞基的編碼基因,在心肌和骨骼肌高度表達(dá)[5]。AMPK是一種絲氨酸/蘇氨酸激酶,由α、β、γ亞基組成異質(zhì)三聯(lián)體,在細(xì)胞中作為代謝感受器,監(jiān)測(cè)細(xì)胞內(nèi)AMP/ATP比值,通過(guò)調(diào)節(jié)ATP的消耗和產(chǎn)生,在心肌代謝過(guò)程中發(fā)揮關(guān)鍵作用。在低氧、缺血、肌肉運(yùn)動(dòng)等應(yīng)激情況下,細(xì)胞內(nèi)AMP/ATP的比值升高,AMP與AMPK的γ亞基結(jié)合,使α亞基的蘇氨酸暴露,通過(guò)上游激酶-AMP激活蛋白激酶激酶(AMP-activated protein kinase kinase,AMPKK)使蘇氨酸磷酸化,AMPK 被激活[6]。AMPK激活后通過(guò)減少維持生命并非必要的ATP消耗,以及通過(guò)促進(jìn)細(xì)胞內(nèi)葡萄糖的攝取和加強(qiáng)氧化分解代謝刺激ATP的產(chǎn)生,調(diào)節(jié)體內(nèi)代謝平衡[7]。

        關(guān)于PRKAG2突變對(duì)AMPK功能的影響,在細(xì)胞水平的研究發(fā)現(xiàn),轉(zhuǎn)染突變型PPKAG2基因的人CCL13 細(xì)胞株的 AMPK 活性降低[8];而 Arad 等[9]的研究表明,AMPK基礎(chǔ)活性反而增高。Hamilton[10]和Barnes[11]等的研究結(jié)果與Arad的研究結(jié)果一致,并且發(fā)現(xiàn)AMPK對(duì)AMP的敏感性降低。Burwinkel等[12]認(rèn)為,由于不同實(shí)驗(yàn)所用的細(xì)胞株不一樣,因此研究結(jié)果不同。CCL13細(xì)胞株中的腫瘤抑制蛋白LKB1是AMPK的主要上游底物,含量與其他細(xì)胞有顯著差異,而突變的AMPK結(jié)構(gòu)基因只有在足量LKB1存在的條件下才能增加AMPK的基礎(chǔ)活性,并降低AMPK對(duì)AMP的敏感性。

        研究表明,PRKAG2心臟綜合征患者均有PRKAG2基因突變。所以,對(duì)該基因突變進(jìn)行研究,進(jìn)而闡述其發(fā)病機(jī)制尤為重要。為闡明這種缺陷機(jī)制,Sidhu等制備了表達(dá)人類突變PRKAG2基因的轉(zhuǎn)基因小鼠[13],轉(zhuǎn)基因小鼠出現(xiàn)的變化表型與人的家系性預(yù)激患者相似。

        本研究克隆了突變型人PRKAG2 R302Q基因并構(gòu)建了其真核表達(dá)載體pR302QvIRES-EGFP,后續(xù)可通過(guò)轉(zhuǎn)染心肌細(xì)胞進(jìn)行相關(guān)檢測(cè),為進(jìn)一步研究PRKAG2 R302Q突變功能奠定了基礎(chǔ)。

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