俞麗麗,李 力△,趙 丹,盧林杉,鄭英如,陳星云,李 平,周元國
(第三軍醫(yī)大學大坪醫(yī)院野戰(zhàn)外科研究所:1.婦產(chǎn)科;2.第七研究室,重慶 400042)
基因印跡是一種不遵從經(jīng)典的孟德爾遺傳規(guī)律的依靠單親傳遞某些遺傳學性狀的現(xiàn)象,目前已成為遺傳學領(lǐng)域的研究熱點。其中H19作為發(fā)現(xiàn)最早的印跡基因之一,主要在人胎盤及胚胎組織中豐富表達,在成人組織中很少表達。而且有證據(jù)表明,H19在配子形成、胚胎的早期形成、著床以及生長發(fā)育過程中發(fā)揮了重要的生理功能,并與腫瘤的發(fā)生密切相關(guān)[1]。但H19的作用機制目前仍未能完全闡明。因此,本研究利用國際常用的人滋養(yǎng)層細胞模型--人絨毛膜上皮癌細胞系(JEG-3)作為體外實驗模型,通過基因工程技術(shù)來深入探討H19對滋養(yǎng)細胞基因表達譜的影響,以期闡明H19對滋養(yǎng)細胞生物學行為的調(diào)控機制。
1.1 材料
1.1.1 質(zhì)粒 包含人全長H19cDNA重組真核表達質(zhì)粒pRc/CMV由蒙特利爾大學醫(yī)院內(nèi)分泌科Cheri.L.Deal教授惠贈??蛰d質(zhì)粒pRC/CMV購自invitrogen公司。
1.1.2 細胞系 JEG-3細胞,為人滋養(yǎng)細胞腫瘤株,由第四軍醫(yī)大學唐都醫(yī)院婦產(chǎn)科實驗室惠贈,購買于美國ATCC細胞庫。
1.1.3 主要試劑及儀器 DMEM/F12基礎(chǔ)培養(yǎng)基和胎牛血清,質(zhì)粒小量提取試劑盒(OMEGA),質(zhì)粒去內(nèi)毒素純化試劑盒 D6944-1,Trizol、脂質(zhì)體轉(zhuǎn)染試劑盒(Lipofectamine 2000),定量PCR試劑(ABI Power SYBR Green PCR Master Mix),定量PCR儀(7000Sequence Detection System)。H19基因和GAPDH基因上、下游引物均由上海英俊生物技術(shù)有限公司合成。
1.2 實驗方法
1.2.1 JEG-3細胞的培養(yǎng) 凍存于液氮的JEG-3細胞經(jīng)復蘇后,于37℃5%CO2條件下培養(yǎng)于含10%胎牛血清的DMEM/F12培養(yǎng)液中,經(jīng)3次傳代穩(wěn)定后,進行基因轉(zhuǎn)染。
表1 驗證基因PCR引物序列
1.2.2 質(zhì)粒的純化及鑒定 重組H19真核表達質(zhì)粒pRc/CMV-H19質(zhì)粒,先用OMEGA質(zhì)粒小提試劑盒抽提后送invitrogen公司測序。測序結(jié)果經(jīng)BLAST確證后pRc/CMVH19質(zhì)粒和空載質(zhì)粒pRc/CMV按QIAGEN試劑盒手冊操作大量抽提。
1.2.3 基因轉(zhuǎn)染和鑒定 以pRc/CMV-H19質(zhì)粒轉(zhuǎn)染JEG-3細胞,按Lipofectamine 2000手冊操作,并以空載質(zhì)粒pRc/CMV轉(zhuǎn)染JEG-3細胞為pRc/CMV轉(zhuǎn)染陰性對照,以僅加Lipofectamine 2000的JEG-3細胞為空白對照。實驗組和對照組在轉(zhuǎn)染后24h收集細胞,采用Trizol一步法提取總RNA,逆轉(zhuǎn)錄后熒光定量PCR分析H19基因表達變化。H19基因上游引物:5′-TCC CAG AAC CCA CAA CAT GAA-3′,下游引物:5′-TTC ACC TTC CAG AGC CGA TTC-3′(150bp),GAPDH 基因上游引物:5′-TGA CTT CAA CAG CGA CAC CCA-3′,下游引物:5′-CAC CCT GTT GCT GTA GCC AAA-3′。SYBR Green RT-PCR反應條件:50℃孵育2min,95℃2 min,95℃15s,59℃1min,40個循環(huán)。
1.2.4 芯片檢測 3組細胞采用Trizol一步法提取總RNA,經(jīng)純化后合成cDNA和生物素標記cDNA,采用Affymetrix公司生產(chǎn)的U133plus 2.0Array基因表達譜芯片,在Affymetrix Genechip Hybridization Oven640中雜交后,在 Affymetrix Fluidics Station 450中洗脫和染色,芯片結(jié)果采用Gene array Scanner30007G進行掃描。GCOS軟件讀取、處理數(shù)據(jù)。差異基因篩選標準為實驗組和對照組比值取Log2后的值即Signal Log Ratio≥1(上調(diào))或≤-1(下調(diào))。
1.3 熒光定量PCR驗證芯片結(jié)果 分別選取芯片結(jié)果中已知的差異基因(EPS15、DUSP5、HES1)和非差異基因(IGF2、MMP-9),采用SYBER Green熒光定量PCR方法檢測3組細胞中相關(guān)基因的mRNA的表達,驗證兩種方法是否一致。各檢測基因引物序列見表1。
1.4 熒光定量PCR檢測差異基因HES1(hairy enhancer of split 1)的表達水平 采用Trizol一步法提取重度子癇前期胎盤組織與正常晚孕胎盤組織總RNA,逆轉(zhuǎn)錄合成cDNA,采用SYBER Green熒光定量PCR方法檢測RNA的表達水平。
1.5 統(tǒng)計學處理 采用SPSS13.0統(tǒng)計軟件進行統(tǒng)計學處理,計量資料用表示,采用單因素方差分析檢驗。P<0.05為差異有統(tǒng)計學意義。
2.1 pRc/CMV-H19質(zhì)粒的測序結(jié)果 測序結(jié)果與Gene-Bank上的序列進行BLAST,結(jié)果完全正確。
2.2 各組細胞H19基因的表達 熒光定量PCR的檢測結(jié)果顯示pRc/CMV-H19質(zhì)粒轉(zhuǎn)染組、pRc/CMV轉(zhuǎn)染陰性對照組和空白對照組的ΔCT分別為-0.8594、4.2975、3.4284。pRc/CMV-H19質(zhì)粒轉(zhuǎn)染組H19mRNA水平相對于pRc/CMV轉(zhuǎn)染陰性對照組和空白對照組高16倍以上,而pRc/CMV轉(zhuǎn)染陰性對照組和空白對照組H19mRNA水平無差異。該檢測結(jié)果與后期芯片的檢測結(jié)果是一致的。
2.3 芯片檢測結(jié)果 通過采用Affymetri:U133plus 2.0Array基因表達譜芯片共檢測了三張芯片,檢測工作均由上海生物芯片有限公司(生物芯片上海國家工程研究中心)完成,有嚴格的樣本質(zhì)檢報告以及質(zhì)控標準。結(jié)果發(fā)現(xiàn)pRc/CMV-H19質(zhì)粒轉(zhuǎn)染組細胞與空白對照組細胞相比,共有491條上調(diào)基因,664條下調(diào)基因;pRc/CMV-H19質(zhì)粒轉(zhuǎn)染組細胞與pRc/CMV轉(zhuǎn)染陰性對照組細胞相比,共有82條上調(diào)基因,220條下調(diào)基因;pRc/CMV轉(zhuǎn)染陰性對照組細胞與空白對照組細胞相比,共有409條上調(diào)基因,314條下調(diào)基因。為了獲得印跡基因H19對JEG-3細胞基因表達譜的影響,進一步優(yōu)化篩選標準:pRc/CMV-H19質(zhì)粒轉(zhuǎn)染組細胞與兩對照組細胞相同的差異基因,但必須是兩對照組之間的非差異基因。結(jié)果發(fā)現(xiàn)共有96條差異基因,其中上調(diào)基因19條,下調(diào)基因77條。見表2。
2.4 熒光定量PCR 檢測H19過表達對IGF2、HES1、EPS15、DUSP5、MMP-9基因mRNA的影響以驗證芯片數(shù)據(jù)的可靠性:除EPS15外其余基因熒光定量PCR結(jié)果與芯片相符。采用2-△△CT法計算各組目的基因相對于陰性對照組目的基因的相對表達水平,ΔΔCT=各樣品ΔCt-陰性對照組ΔCt平均值。熒光定量PCR的檢測結(jié)果顯示H19質(zhì)粒轉(zhuǎn)染后HES1、DUSP5mRNA表達較陰性對照組明顯下調(diào),而EPS15、IGF2、MMP-9mRNA表達則無明顯改變。H19質(zhì)粒轉(zhuǎn)染組HES1和DUSP5mRNA相對于陰性對照組的表達倍數(shù)分別是0.44±0.07、0.38±0.02,與陰性對照組比較,P<0.01。即H19過表達后HES1和DUSP5mRNA表達水平分別被抑制了56%和62%,而EPS15、IGF2mRNA和 MMP-9基因表達水平與陰性對照組比較,差異無統(tǒng)計學意義。空白對照組HES1、DUSP5、IGF2和 MMP-9mRNA表達相對于陰性對照組的表達倍數(shù)分別是3.16±1.13、3.89±0.08、1.95±0.37和0.15±0.02,而EPS15mRNA表達則無明顯改變。見圖1。實驗結(jié)果顯示除EPS15外其余基因熒光定量PCR結(jié)果與芯片相符。
表2 差異基因的基因分類
圖1 H19過表達對EPS15、DUSP5、HES1、IGF2、MMP-9基因mRNA表達的影響
2.5 重度子癇前期胎盤組織與正常晚孕胎盤組織HES1mRNA表達水平 重度子癇前期胎盤組織HES1mRNA相對表達倍數(shù)為0.14±0.05,正常晚孕胎盤組織HES1mRNA相對表達倍數(shù)為0.49±0.27。兩者比較,重度子癇前期胎盤組織HES1mRNA的表達水平較正常晚孕胎盤組織中HES1mRNA的表達水平明顯降低(P<0.01)。
正常的基因印跡在功能上與胎兒及胎盤的發(fā)育、細胞分化和增殖等有關(guān)[2]?;蛴≯E異常(如印跡丟失、雜合性丟失、單親二倍體等現(xiàn)象)與某些特殊的遺傳性疾病及腫瘤的發(fā)生密切相關(guān)[3]。人H19是一種母方表達、父方沉默的印跡基因,定位于染色體11p15.5區(qū),全長約3kb,共含有5個外顯子、4個內(nèi)含子。目前公認H19不能產(chǎn)生蛋白質(zhì),其最終表達產(chǎn)物是RNA,并在RNA水平發(fā)揮作用。但H19的作用機制目前仍未能完全闡明。有學者認為它是原癌基因[4],也有學者認為它是抑癌基因,因此有人認為H19在細胞的增殖、分化和侵襲方面具有雙重作用[5]。本研究以人滋養(yǎng)細胞腫瘤細胞系JEG-3為體外實驗模型,通過含人全長H19cDNA重組真核表達質(zhì)粒轉(zhuǎn)染JEG-3后,結(jié)果發(fā)現(xiàn)3組之間的細胞基因表達譜均存在的明顯差異。作者運用生物信息學方法進一步優(yōu)化篩選標準:pRc/CMV-H19質(zhì)粒轉(zhuǎn)染組細胞與兩對照組細胞均存在差異的基因,但這些基因必須是兩對照組之間的非差異基因。結(jié)果發(fā)現(xiàn)共有96條差異基因,其中上調(diào)基因19條,下調(diào)基因77條。這些基因共有30條為未知功能基因,66條已知功能基因主要與轉(zhuǎn)錄調(diào)控、受體結(jié)合、細胞代謝、細胞發(fā)育、細胞進程和生物學調(diào)節(jié)功能相關(guān)。
胰島素樣生長因子-2(IGF2)作為與H19互為連鎖的印跡基因,位于同一條染色體上,也是人類基因組中最早被鑒定的印跡基因之一,在大部分組織中呈父系表達,母系印跡。有文獻報道H19可調(diào)控IGF2的表達,H19基因的缺失,將導致IGF2基因母系等位基因表達[6-8]。之后越來越多的研究結(jié)果發(fā)現(xiàn)H19、IGF2的表達水平和印跡狀態(tài)之間,H19與IGF2之間并未存在固定的聯(lián)系[9-10]。本研究前期發(fā)現(xiàn)H19過表達不引起IGF2的表達變化;同樣采用RNA干擾的方法來觀察H19對IGF2表達的影響也發(fā)現(xiàn)在滋養(yǎng)細胞中H19與IGF2之間不存在固定的聯(lián)系[11]。
HES1屬于HES基因家族,而HES基因家族又屬于抑制型bHLH(basic helix-loop-h(huán)elix)基因。HES基因編碼的蛋白為堿性螺旋-環(huán)-螺旋結(jié)合蛋白,是一類含有特征性堿性螺旋-環(huán)-螺旋結(jié)構(gòu)(bHLH)的DNA結(jié)合蛋白,在進化過程中高度保守,可通過bHLH區(qū)域直接與靶DNA或與其他bHLH蛋白結(jié)合形成無活性二聚體阻斷激活路徑而抑制轉(zhuǎn)錄,最終抑制干細胞分化而影響細胞命運。HES1基因敲除的小鼠神經(jīng)細胞在前體細胞增殖前就過早分化,結(jié)果導致神經(jīng)系統(tǒng)嚴重發(fā)育異常,如無腦畸形、眼形成異常等,在胚胎發(fā)育晚期或出生后不久即死亡[12-13]。Kunnimalaiyaan等[14]通過將HES1基因穩(wěn)定地導入H727類癌瘤細胞,使其穩(wěn)定表達,發(fā)現(xiàn)可以抑制類癌瘤細胞的增殖。Liu等[15]研究發(fā)現(xiàn)在宮頸上皮內(nèi)瘤變及宮頸癌中HES1表達增強,并隨著病變加重表達逐漸增強。
在正常胎盤滋養(yǎng)細胞以及滋養(yǎng)細胞腫瘤組織中均未見HES1的研究報道,也無印跡基因H19與HES1之間關(guān)系的研究報道。經(jīng)芯片檢測的結(jié)果提示,通過定量PCR方法檢測了H19的過表達可下調(diào)JEG-3細胞HES1的表達。進一步研究表明重度子癇前期胎盤組織中HES1mRNA表達水平下調(diào),提示HES1表達受阻時,滋養(yǎng)細胞的分化障礙導致滋養(yǎng)細胞功能異常,從而參與子癇前期的發(fā)病。
總之,本次芯片實驗結(jié)果表明印跡基因H19主要可引起轉(zhuǎn)錄調(diào)控、受體結(jié)合、細胞代謝、細胞發(fā)育、細胞進程和生物學調(diào)節(jié)相關(guān)基因的改變,從而調(diào)節(jié)滋養(yǎng)細胞的生物學功能,對未知功能基因的深入研究將有助于進一步了解H19對滋養(yǎng)細胞的調(diào)控機制。
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