林裕勝 王隆柏 吳學敏 周倫江* 邵良平
(1.福建農(nóng)林大學動物科學學院 福州 350002;2.福建省農(nóng)業(yè)科學院畜牧獸醫(yī)研究所 福州 350013)
豬流行性腹瀉(Porcine Epidemic Diarrhea,PED)是由豬流行性腹瀉病毒(Porcine Epidemic Diarrhea Virus,PEDV)引起的豬的一種急性、高度接觸性腸道傳染病,發(fā)生于各種年齡豬,其中對哺乳仔豬的危害最為嚴重,以腹瀉、嘔吐和脫水為臨床特征。1978年英國首次報道PED,并確定為一種冠狀病毒引起的疾?。?]。在之后2年,Debouck P等在許多國家和地區(qū)對該病進行了血清學調(diào)查,結果都檢測到PEDV 特異性抗體的存在[2]。我國于1980年首次分離到PEDV,以后許多地區(qū)均有PED 發(fā)生的報道,且流行范圍逐漸擴大。崔現(xiàn)蘭等對26個省、市、自治區(qū)的調(diào)查表明,因PED 導致的豬死亡率占36 種豬病總死亡率的1.74%,同時PED 與TGE的混感率近年已上升至30.77%[3]。2011年甘海霞等應用RT-PCR 對來自廣東省34個縣144個不同規(guī)模豬場的216 份臨床豬糞樣的檢測結果表明,很多豬場普遍存在TGEV和PEDV,尤其以PEDV 感染更為嚴重,陽性率達27.8%[4]。為了進一步弄清福建省PEDV的分布和感染情況,2012-2013年上半年筆者對采自福建省62個規(guī)模豬場128 份發(fā)生腹瀉的病料進行了PEDV 病原學檢測,研究分析PEDV在豬群中的感染及流行規(guī)律,為豬流行性腹瀉的防治提供科學依據(jù)。
1.1 材料
1.1.1 組織樣品 2012-2013年上半年采集福建省9個地級市62個規(guī)模豬場的腹瀉樣品128 份,樣品組織經(jīng)剪碎、研磨,按1︰10 比例加TE 液稀釋,-70 ℃保存?zhèn)溆谩?/p>
1.1.2 主要試劑 病毒RNA 提取試劑盒購置OMEGA 公司,病毒DNA 提取試劑盒購自ROCHE公司,PCR 擴增試劑盒購置北京全式金生物科技有限公司,AMV 酶、dNTP和DNA Marker-2000 購自TaKaRa 公司。
1.2 方法
1.2.1 引物設計與合成 參照GenBank 中已發(fā)表的PEDV、TGEV、PROV的基因序列,設計合成檢測引物。PEDV的檢測引物,Up-5’-ATGTCTAACGGTTCTATTCCCGTTG-3’,Down-5’-TTAGACTAAA TGAAGCACTTTCTCA-3’,預期片段為563 bp;TGE V 檢測引物,UP-5’-CTTCTAAATGGCCAACCAGGG AC-3’,Down-5’-CGAGCATCTCGTTTAGTTCGTT-3’,預期片段為1 168 bp;PROV 檢測引物,Up-5’-GTATGGTATTGAATATACCAC-3′,Down-5’-GATC CTGTTGGCCATCC -3’,預期片段為342 bp;其他病毒引物參考文獻[5]進行設計合成。引物由寶生物工程(大連)有限公司合成。
1.2.2 核酸提取 采用病毒RNA/DNA 提取試劑盒,參照操作說明,分別提取組織樣品的總RNA/D NA,-70 ℃保存?zhèn)溆谩?/p>
1.3 RT-PCR 或PCR 病原檢測 采用北京全式金生物科技有限公司RT-PCR 擴增試劑盒,按照試劑盒提供的操作手冊配制反應體系,RT-PCR 反應體系:Total RNA 4μL、5×TransScriptTM All-in-One SuperMix for PCR 4μL、Rnase-free Water 12μL,反應條件:25 ℃10 min,42 ℃30 min,85 ℃5 min。
PCR 反 應 體 系:2×GoTaq Master Green Mix 12.5μL,上下游引物各0.5μL,cDNA 或DNA 模版3μL,無菌去離子水8.5μL,混勻后進行擴增,條件為:95 ℃預變性5 min,95 ℃變性30 s,53~61℃復性30 s,72 ℃延伸30 s,35個循環(huán);72 ℃終延伸5 min。取7μL 進行1%瓊脂糖凝膠電泳,觀察結果。
1.4 PEDVORF3和M 基因遺傳進化分析 選取3個豬群發(fā)病嚴重的規(guī)模豬場采集的陽性PEDV 病料,擴增其ORF3和M 基因,將目的片段送生工生物工程(上海)有限公司進行測序,采用DNAstar 軟件進行遺傳進化分析。
2.1 PEDV 檢測結果 對2012年至2013年上半年福建省各縣市采集的128 份腹瀉病料進行PEDV、TGEV、PROV、CSFV、PRRSV和PRV 檢測。結果顯示:PEDV的陽性率為67.97%(87/128),其中PEDV和TGEV 混合感染為19.53%(25/128),PEDV和PROV 混合感染為3.91%(5/128),PEDV和PRV 混合感染為14.84%(19/128),PEDV 與PRRSV 混合感染為6.25%(8/128)。見表1,部分電泳圖見圖1。
表1 PEDV 檢測情況表
圖1 PEDV 檢測電泳圖
2.2 PEDV ORF3和M 基因遺傳進化分析 分別對發(fā)病嚴重的豬場采集的陽性病料進行了PEDV ORF3和M 基因擴增,均能擴增出目的片段。將陽性產(chǎn)物進行序列測序,獲得了3 株PEDV,命名為FJFZ、FJPT和FJ YX 毒株。通過軟件分析表明:3 株PEDV 在ORF3 基因劃分成2個主分支,其中FJFZ毒株與韓國毒株、中國大陸毒株處于一大分支,F(xiàn)JPT 毒株單獨于另一分支,F(xiàn)J YX 單獨處于一大分支,與attenuate DR13 弱毒株和致弱的CV777truncated 毒株的親緣關系較遠(見圖2)。3 株M 基因中以FJFZ 毒株和FJPT 毒株與CV777 標準毒株處于同于小分支,親緣關系較近,而FJYX 毒株單獨處于一大分支(見圖3)。
圖2 4 株PEDVORF3 基因核苷酸遺傳進化樹
圖3 4 株PEDV M 基因核苷酸遺傳進化樹
1)2010年下半年以來,豬流行性腹瀉病毒造成了我國大量的小豬死亡,特別是對于飼養(yǎng)管理等條件不良的豬場,往往造成哺乳仔豬大量脫水、死亡。因此,該病成為嚴重影響我國養(yǎng)豬業(yè)健康的重要疫病之一。本次調(diào)查采集仔豬腹瀉病料的樣品,PEDV檢出陽性率高達60.8%,而且存在PEDV 與TGEV、PEDV 與PROV、PEDV 與PRV、PEDV 與PRRSV 混合感染,與臨近省市相比,福建省的PEDV 疫情相對嚴重,應該引起養(yǎng)殖場的重視。
2)鑒于近年來PED 發(fā)病嚴重,能導致90%以上的發(fā)病哺乳仔豬死亡,而且具有防控難的特點,多數(shù)從業(yè)人員懷疑流行毒株是否發(fā)生了遺傳變異。因此,筆者分別從3個發(fā)生嚴重腹瀉的豬場采集了3 份病料進行ORF3和M 基因序列測定,核苷酸遺傳進化樹分析表明,3 株PEDV 毒株的ORF3 基因和M 基因均存在基因突變,其中FJ YX 毒株與CV777 親緣關系較遠,M 基因片段與CV777和泰國流行毒株的親緣關系較遠。
[1]Pensaert M B,Debouck P.A New Coronavirus-like Particle Associated with Diarrhea in Swine[J].Arch.Virol,1978,58:237-243.
[2]Debouck P,Pensaert M.Experimental Infection of Pigs with a New Porcine Enteric Coronavirus,CV 777[J].Am J Vet Res,1980,41(2):219-223.
[3]崔現(xiàn)蘭,馬思奇,王明,等.應用免疫熒光法診斷豬流行性腹瀉的研究[J].中國畜禽傳染病,1990(5):20-24.
[4]甘海霞,梁晟,韋顯凱,等.2011年廣西豬群豬流行性腹瀉和豬傳染性胃腸炎調(diào)查[J].動物醫(yī)學進展,2012,33(10):125-127.
[5]王隆柏,莊向生,周倫江,等.福建省規(guī)模豬場偽狂犬病流行病學調(diào)查與分析[J].中國畜牧獸醫(yī),2008,35(11):119-121.