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        基于聚類分析的河南荷花品種資源分類1)

        2013-08-08 07:22:18管志濤郝改蓮孔德政
        關(guān)鍵詞:野生種重瓣株型

        管志濤 郝改蓮 孔德政

        (濮陽(yáng)職業(yè)技術(shù)學(xué)院,濮陽(yáng),457000) (河南農(nóng)業(yè)大學(xué))

        確定荷花品種主要性狀對(duì)鑒定新品種及分類至關(guān)重要[1]。面對(duì)眾多的荷花品種,只有了解品種的特性和相互之間的關(guān)系,才能更好地為選擇親本,培育更優(yōu)質(zhì)品種服務(wù)。在借鑒以往研究方法的基礎(chǔ)上,研究選用河南地區(qū)127個(gè)荷花品種及野生種,借助聚類分析方法,對(duì)荷花品種進(jìn)行遺傳距離研究,旨在為荷花育種、分類、應(yīng)用及親緣關(guān)系的研究提供依據(jù)。

        1 材料與方法

        試驗(yàn)所用荷花品種均來(lái)源于河南省各城市公園、風(fēng)景區(qū)、蓮藕生產(chǎn)地及野生藕生長(zhǎng)地培育及生長(zhǎng)的花蓮、藕蓮和子蓮。在2008年調(diào)查的96個(gè)品種[2]基礎(chǔ)上,擴(kuò)大調(diào)查范圍,加深調(diào)查力度,增加了扣馬白蓮等31個(gè)品種及野生種,因野生種目前尚未申報(bào)命名,筆者采用發(fā)現(xiàn)野生種的地名命名。供試荷花品種名稱見(jiàn)表1。

        參照《中國(guó)蓮》[3]《中國(guó)荷花品種圖志》[4]《中國(guó)荷花》[5],確定荷花品種性狀指標(biāo),對(duì)24個(gè)生物學(xué)性狀進(jìn)行統(tǒng)計(jì)與測(cè)量,將性狀分為數(shù)值性狀和質(zhì)量性狀。其中又將質(zhì)量性狀分為二元性狀和有序多態(tài)性狀。本研究采用等級(jí)數(shù)量編碼方法進(jìn)行性狀編碼[6],二元性狀以0,1表示,有序多態(tài)性狀以1,2,3…表示,數(shù)值性狀取平均值直接轉(zhuǎn)人下一步數(shù)學(xué)運(yùn)算。

        試驗(yàn)數(shù)據(jù)應(yīng)用DPS軟件統(tǒng)計(jì)分析。孔德政等[7]認(rèn)為卡方距離最長(zhǎng)距離法分辨力最好,聚類分析時(shí)最適合蓮屬資源分類。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 R型聚類分析結(jié)果

        根據(jù)分類的需要,對(duì)荷花的生物學(xué)性狀進(jìn)行的R型聚類。分析結(jié)果見(jiàn)圖1,依據(jù)聚合水平,計(jì)算出跳變值,在圖1中作結(jié)合線L=9.401 7。分析顯示,大多數(shù)性狀間都彼此獨(dú)立,說(shuō)明這些性狀間的變異和演進(jìn)是互不干擾的。

        2.2 Q型聚類分析結(jié)果

        對(duì)127個(gè)荷花品種進(jìn)行卡方距離最長(zhǎng)距離法聚類,結(jié)果見(jiàn)圖2。由圖2可以看出,在結(jié)合線L1=3.745 3處將荷花品種分為兩大類,即大株型群(Ⅰ類)和中小株型群(Ⅱ類);結(jié)合線L2=2.823 4又將大株型群分為三大類,即A組、B組、C組。結(jié)合線L4=2.567 1又將中小株型群分為3類,即重臺(tái)類(D組)、重瓣類(E組和 F組)、少瓣和半重瓣類(G組)。這些大類下面又可分為若干小類。

        A組:所含品種類型為少瓣類。結(jié)合線L3=2.623 9將其分為兩類①組和②組。①組品種均為花蓮品種,但還在大株型群中出現(xiàn)了‘娃娃蓮’、‘金珠落玉盤’、‘風(fēng)采’、‘紅領(lǐng)巾’等中株型群品種,這說(shuō)明碗蓮品種性狀進(jìn)化不穩(wěn)定,給其適合的條件和環(huán)境,有變回大株型的趨勢(shì)[2];②組均為藕蓮品種。

        表1 供試荷花品種

        圖1 24個(gè)形態(tài)性狀R型聚類

        B組:所含品種類型為少瓣類。結(jié)合線L5=2.547 1將其分類為③組和④組。③組均為目前全國(guó)廣為栽培的藕蓮品種。鄂蓮5號(hào)為鄂蓮1號(hào)和鄂蓮2號(hào)的雜交品種,鄂蓮系列從遺傳距離中可看出,親緣關(guān)系較近,這與實(shí)際生產(chǎn)相符。但觀賞品種‘眼兒媚’、‘一丈青’與藕蓮品種聚為一類,說(shuō)明其在親緣關(guān)系中與藕蓮較近,只是在生產(chǎn)中作為花蓮?fù)茝V。④組均為河南本土野生種,因野生種負(fù)載荷花的原始信息,故它們聚為一類。又因野生種目前尚未申報(bào)命名,故在聚類和生物學(xué)性狀描述時(shí),筆者采用發(fā)現(xiàn)野生種的地名命名。

        C組:所含品種類型為少瓣類,并且均為冬荷品種,故聚為一類。

        D組:所包含的品種類型為重臺(tái)類,少數(shù)為重瓣類。D組中重瓣類品種的心皮大部分瓣化或泡狀,很少結(jié)實(shí),有向重臺(tái)類進(jìn)化的趨勢(shì),故其與重臺(tái)類聚類在一起。結(jié)合線L6=2.147 8將D組分類為⑤、⑥、⑦3組。⑤組品種全為粉色系。⑥組品種為紅蓮系,因復(fù)色品種‘蝶戀花’由紅蓮進(jìn)化而成,故與紅蓮聚類在一起。白色品種‘小碧臺(tái)’因其遺傳性狀與其他品種相近而聚類在一起。⑦組品種為白色系。粉色品種‘紅寶石’、‘壽星蓮’由白色系進(jìn)化而成,故與白色系聚類在一起。

        E組:所包含的品種類型為半重瓣和重瓣型。結(jié)合線L7=1.987 1將E組分類為⑧組和⑨組。⑧組品種為少瓣和半重瓣品種,因重瓣品種‘別樣紅’、‘友誼紅2號(hào)’因花色與其他品種相同,又因花瓣數(shù)為重瓣品種中的較少數(shù),與重瓣相近,故與半重瓣聚類為一類。⑨組品種均為重瓣類。

        G組:所包含品種類型為大中型株型群?;ㄐ蜑橹匕晷秃蜕侔晷?。結(jié)合線L8=2.595 7將G組分類為⑩組和○11組。⑩組品種為重瓣型,從遺傳距離上看,⑩組和⑨組較遠(yuǎn),故⑩組沒(méi)和⑨組聚類在一起?!?1組品種為少瓣類,且為大株型群。但其沒(méi)和I組聚類在一起,大概是因?yàn)樯飳W(xué)性狀與Ⅱ組其他品種較近,而與其聚類在一起。這一問(wèn)題需要進(jìn)一步研究討論。

        圖2 127個(gè)荷花品種聚類分析

        3 結(jié)論與討論

        依據(jù)主成分分析結(jié)果,對(duì)荷花品種的24個(gè)性狀進(jìn)行R型聚類。聚類結(jié)果表明,大多數(shù)性狀間都彼此獨(dú)立,性狀間的變異和演進(jìn)是互不干擾的。只有少數(shù)性狀具有連帶和相互關(guān)系,在以后的運(yùn)用中可淘汰掉部分性狀。

        本研究采用卡方距離最長(zhǎng)距離法對(duì)127個(gè)荷花品種的24個(gè)性狀進(jìn)行Q型聚類分析,通過(guò)分析,將其劃分為兩大類,又依據(jù)各品種的相似性狀,細(xì)分為11小類。通過(guò)對(duì)荷花每一品種分類位置進(jìn)行分析與比較[4,7-8],筆者認(rèn)為,數(shù)量分類結(jié)果行之有效,并可減少細(xì)胞學(xué)標(biāo)記分類、蛋白質(zhì)標(biāo)記分類、DNA分子標(biāo)記分類等工作的試驗(yàn)繁雜。與形態(tài)學(xué)形狀分類比較,又增強(qiáng)了科學(xué)性及客觀性。如唐招提寺蓮[9]通過(guò)數(shù)量分類和RAPD鑒定都聚在藕蓮中,但在生產(chǎn)中則作為花蓮栽培,有充分理由將其認(rèn)定為藕蓮。

        R型和Q型聚類分析結(jié)果具有客觀性,必要時(shí)能為修改和改進(jìn)分類提供幫助,聚類分析方法本身只是一種運(yùn)算方法,不提供新的分類系統(tǒng),但其客觀地檢查現(xiàn)有的分類結(jié)果,還能在許多情況下為完善和改進(jìn)現(xiàn)有的分類提供啟示作用。尤其在研究品種和野生種遺傳距離時(shí),聚類分析可從繁雜的現(xiàn)象中,找出主要問(wèn)題。目前,關(guān)于聚類分析方法,已被廣泛應(yīng)用于李[10]、茄子[11]、山藥[12]等果蔬及農(nóng)作物,加之?dāng)?shù)理分類方法可以檢驗(yàn)和重復(fù),因此,在研究植物分類中應(yīng)充分利用。

        [1] 王其超,張行言.荷花新品種性狀記載項(xiàng)目的制定[J].中國(guó)園林,2012,28(1):74-77.

        [2] 管志濤.河南省荷花資源調(diào)查及其品種分類的研究[D].鄭州:河南農(nóng)業(yè)大學(xué),2008.

        [3] 倪學(xué)明.中國(guó)蓮[M].北京:科學(xué)出版社,1987.

        [4] 王其超,張行言.中國(guó)荷花品種圖志[M].北京:中國(guó)林業(yè)出版社,2004.

        [5] 鄒秀文,趙效銳,靳曉白.中國(guó)荷花[M].北京:金盾出版社,1997.

        [6] 徐克學(xué).數(shù)量分類學(xué)[M].北京:科學(xué)出版社,1994.

        [7] 孔德政,管志濤.基于主成分和聚類分析的荷花品種生物學(xué)性狀的比較研究[J].中國(guó)園林,2008,24(8):86-89.

        [8] 趙海艦.荷花部分品種資源調(diào)查及孢粉學(xué)研究[D].鄭州:河南農(nóng)業(yè)大學(xué),2010.

        [9] 郭宏波.蓮屬(Nelumbo)資源的分類[D].武漢:華中農(nóng)業(yè)大學(xué),2003.

        [10] 焦揚(yáng),葛慧玲.聚類分析在李品種譜系分析中的應(yīng)用[J].東北農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào),2011,42(5):72-76.

        [11] 趙德新,孫治強(qiáng),任子君,等.茄子形態(tài)學(xué)性狀主成分分析及聚類分析[J].河南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào),2009,43(4):393-397.

        [12] 梁任繁,王軍民,覃芳,等.廣西山藥種質(zhì)資源聚類分析[J].中國(guó)蔬菜,2009(4):30-34.

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