張 慧, 徐 海,, 況媛媛, 宋 波, 陳龍正, 袁希漢
(1.南京農(nóng)業(yè)大學園藝學院,江蘇 南京 210095;2.江蘇省農(nóng)業(yè)科學院蔬菜研究所,江蘇 南京 210014)
不結球白菜(Brassica campestris ssp.chinensis)起源于中國,在全國各地區(qū)尤其是南方廣泛栽培,是國內重要的綠葉菜之一[1]。根腫病是由蕓薹根腫菌(Plasmodiophora brassicae Woronin)侵染引起的一種世界性病害,可導致十字花科作物根和莖吸收傳導養(yǎng)分受阻,生長不良,萎蔫、矮化,產(chǎn)量和質量受損,以致減產(chǎn),造成巨大經(jīng)濟損失[2-3]。近年來,由于不結球白菜栽培效益好,復種指數(shù)高,土傳病害逐漸成為制約不結球白菜發(fā)展的重要因素,根腫病由過去不常見的病害逐漸顯露出來,并呈蔓延趨勢。
目前,抗根腫病分子標記研究主要集中在結球白菜和甘藍上,在這些研究中,分別利用RAPD及RFLP等標記確定了與抗性有關的QTL[4]。在結球白菜上已經(jīng)對抗根腫病基因位點進行了定位和基因圖譜的繪制??剐赃z傳研究發(fā)現(xiàn),不同的生理小種抗性遺傳機制不同[5]。甘藍苗期根腫病抗性遺傳規(guī)律結果表明,抗病性受3對以上基因控制,為不完全隱性[6];而一些研究結果表明B.napus的根腫病抗性是由1~2個獨立的顯性基因所控制,這些顯性基因在大量抗性材料中都存在[7-9]。
由于不結球白菜根腫病為土傳病害,不易控制,目前關于不結球白菜根腫病方面的研究鮮有報道。因此開發(fā)抗根腫病特異分子標記,對提高育種效率及開展分子標記輔助育種具有重要意義。本研究利用引自結球白菜根腫病抗源,與不結球白菜進行亞種間雜交,構建分離群體,試圖篩選出抗根腫病特異分子標記,并鑒別回交后代材料的根腫病抗性,為分子標記輔助育種奠定基礎。
2010年,從韓國園藝研究所引進1份結球白菜抗根腫病材料,其對根腫病表現(xiàn)為高抗。利用江蘇省農(nóng)業(yè)科學院蔬菜研究所十字花科項目組不結球白菜研究材料T青做父本進行轉育,得到F1代。2011年春,將雙親及F1代種植于江蘇省農(nóng)業(yè)科學院蔬菜研究所實驗田。對F1代植株進行自交,得到F2代,F(xiàn)1代單株與不結球白菜親本回交,得到BC1代。田間管理按常規(guī)方法進行。
1.2.1 各世代植株抗性鑒定 供試材料:T青、結球白菜抗源 CR、F1、F2及 BC1。每個材料3次重復,每次重復30株,隨機排列,播種于50孔穴盤。
待苗長到3~4片真葉時移栽營養(yǎng)缽,采用灌根法進行抗性鑒定。用移液器吸取1 ml含5×107或1×108個孢子懸浮液10 ml,澆注到寄主根際周圍,接菌6周后,洗凈根部泥土,調查單株發(fā)病情況,并計算病情指數(shù)。田間病情分級參考前人研究分級標準[3],略有改動。分級標準為:0級,未發(fā)生病害;1級,根系的須根、側根有較少細小腫瘤,主根未發(fā)生病害;2級,根系的須根腫瘤多,側根腫瘤較多,主根發(fā)病較輕,微微腫大;3級,根系的主根發(fā)病較重,異常腫大,大部分須根、側根腫瘤多;4級,根系的主根異常腫大,根系幾乎無須根。0級為抗病,其他均為感病。
1.2.2 DNA提取與檢測 采用CTAB法提取幼嫩葉片DNA。利用1.0%瓊脂糖凝膠電泳檢測其完整性和純度,用紫外分光光度計檢測DNA質量和濃度,并稀釋至 15 ng/μl。
1.2.3 抗感池的構建及引物篩選 采用BSA法,在F2群體中分別隨機選取10株抗病單株和10株感病單株,將其DNA等量混合,構建抗病基因池和感病基因池,對引物進行篩選,挑選在抗、感病池間能夠產(chǎn)生特異性條帶的引物。
1.2.4 PCR反應體系及反應程序 ISSR反應體系的總體積為20 μl,包括1 ×PCR buffer,模板 DNA 30 ng,Taq 酶 1 U、dNTP 250.00 μmol/L、引物 0.25 μmol/L、Mg2+2.5 mmol/L。
ISSR反應程序為94℃預變性5 min;94℃變性1 min,52 ℃退火 1 min,72 ℃延伸 1 min 30 s,循環(huán)35次;72℃延伸10 min,擴增產(chǎn)物4℃保存。
1.2.5 瓊脂糖電泳分離 反應結束后,PCR產(chǎn)物點入含0.5 μg/ml EB的2.0% 瓊脂糖凝膠中,以DNA marker V(Tiangen)作為分子量標準,在2.0%瓊脂糖凝膠中電泳1 h,紫外凝膠成像儀下照相。
1.2.6 ISSR標記的連鎖分析 將篩選出的 ISSR標記在雙親及F2分離群體中進行驗證,用2.0%瓊脂糖凝膠電泳檢測。親本為抗病有標記帶和感病無標記帶,F(xiàn)1代為感病有標記帶,F(xiàn)2代中重組型個體為抗病無標記帶、雜合感病無標記帶和純合感病有標記帶,根據(jù)F2代中重組型單株的數(shù)量計算交換率,再根據(jù)Kosambi作圖函數(shù)公式換算成Morgan遺傳距離。
表1 親本、F1、F2和BC1群體對根腫病的抗性Table 1 Resistance to clubroot in parental lines,F(xiàn)1,F(xiàn)2and BC1
用90條ISSR引物進行親本PCR擴增,其中21條ISSR引物可以在親本間穩(wěn)定擴增出清晰多態(tài)性條帶,占總引物數(shù)的23.0%。將能夠擴增到清晰多態(tài)性條帶的引物在抗感池中篩選,結果發(fā)現(xiàn),引物873(5'-GACAGACAGACAGACA-3')可以在抗感基因池中擴增出多態(tài)性條帶,差異片段分別約為500 bp(圖1)。
圖1 引物873對親本和抗感DNA池的PCR電泳圖譜Fig.1 The electrophoresis pattern of parents and DNA pools by primer 873
由于抗根腫病基因是顯性基因,如果標記與抗病基因緊密連鎖,純合抗病株和雜合抗病株都能擴增出此帶,而純合感病株應沒有此帶。利用F2分離群體中的73個單株DNA對候選引物進一步驗證,結果(圖2)顯示,標記873在54份高抗根腫病單株(抗性0級)中,53個擴增出差異條帶,1個未擴增出差異條帶。同樣19份感病單株中,有6份擴增產(chǎn)生特異條帶。因此共有7株在標記873與抗病基因之間發(fā)生重組,交換率為9.59%。依據(jù)Kogambi作圖函數(shù)公式得出標記873與抗根腫病基因之間的遺傳距離為9.72 cM,命名為CR-873。
圖2 引物873對F2部分單株的擴增圖譜Fig.2 The PCR pattern of individuals of F2by primer 873
根腫病抗性(Clubroot resistance,CR)的遺傳機制研究主要集中在白菜、甘藍、甘藍型油菜這3類蕓薹屬作物中。Laurens等認為,甘藍的根腫病抗性由許多主效的等位基因所控制,這些等位基因是不完全顯性的,并具有明顯的加性遺傳效應[10]。Voorrips等認為控制甘藍根腫病抗性的基因都是隱性基因[11]。在B.rapa中發(fā)現(xiàn)了至少3個主要的根腫病抗性基因,這些基因是相對獨立的,且分別對不同的P.brassicae 生理小種發(fā)生作用[12-14]。Diederichsen等利用ECD04和DH群體發(fā)現(xiàn)了B.napus根腫病抗性由1個主效基因和至少2個隱性基因控制[15]。王芳展等認為,B.rapa大多數(shù)抗性基因都來自于歐洲飼料蕪菁,不同的品種獲得了1個或者多個的抗性基因,而這些基因之間又相對保持獨立[16]。本研究通過對抗根腫病多世代群體進行抗性鑒定表明,不結球白菜抗性由顯性單基因控制。
Matsumoto等發(fā)現(xiàn)了2個RFLP標記與1個CR基因CRa連鎖,并將其定位在 R3染色體34 cM的位置上[17]。Suwabe等利用 SSR標記,發(fā)現(xiàn)了Crr1和Crr2 2個CR位點[18]。Kuginuki等利用Siloga作為抗源,發(fā)現(xiàn)了3個RAPD標記與CR位點連鎖[19]。ISSR技術可以比RFLP、SSR、RAPD等技術更多地揭示基因組中的多態(tài)性,并比RAPD穩(wěn)定,比AFLP簡便,是一種很好的DNA指紋標記。本研究采用BSA和ISSR技術相結合來研究與不結球白菜抗根腫病基因連鎖的標記,得到1個與根腫病抗性基因連鎖較緊密的分子標記CR-873,遺傳距離為9.72 cM。本研究中得到的CR-873標記與抗根腫病基因的遺傳距離仍然較遠,可能是因為本研究中用于計算遺傳距離的群體偏小,一定程度上影響遺傳距離的準確性。后續(xù)研究可以進一步擴大群體并把獲得的可能與抗根腫病基因相連鎖的ISSR標記轉換為更穩(wěn)定的SCAR標記。
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