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        冠心病候選基因β2腎上腺素能受體基因相關(guān)微小核糖核酸let-7i的實(shí)驗(yàn)研究

        2013-07-31 03:08:28郭威早李琳
        中國(guó)循環(huán)雜志 2013年1期
        關(guān)鍵詞:冠心病水平實(shí)驗(yàn)

        郭威早,李琳

        β2腎上腺素能受體基因[人類基因組織(HUGO)命名委員會(huì)(HGNC)標(biāo)準(zhǔn)全名:“adrenergic,beta-2-,receptor,surface”,HGNC 標(biāo)準(zhǔn)基因代號(hào):ADRB2],是冠心病的重要候選基因,與重型進(jìn)行性冠心病,例如伴有急性心肌梗死的冠心病關(guān)系尤為密切[1]。該基因的蛋白產(chǎn)物屬于G蛋白偶聯(lián)受體家族,通過G蛋白作用介導(dǎo)兒茶酚胺誘導(dǎo)的腺苷酸環(huán)化酶活化。在結(jié)構(gòu)方面,該基因非常特殊,同絕大多數(shù)結(jié)構(gòu)基因不同,該基因沒有內(nèi)含子,因此該基因在表達(dá)調(diào)控方面可能具備區(qū)別于大多數(shù)基因的特點(diǎn)。此外,該基因的5’側(cè)翼序列中含有糖皮質(zhì)激素反應(yīng)基序(glucocorticoid response element,GRE)[2],而糖皮質(zhì)激素與應(yīng)激及心功能關(guān)系極為密切[3]。因此該基因具有GRE的結(jié)構(gòu)特點(diǎn),有助于合理地解釋冠心病與應(yīng)激的密切關(guān)系[4]。微小核糖核酸(microRNA,簡(jiǎn)稱miRNA)是生物體中內(nèi)源性的,由基因表達(dá)產(chǎn)生的RNA分子,其最終的活性形式為短鏈RNA分子,長(zhǎng)度為22核苷酸左右,通過與相關(guān)的信使RNA結(jié)合抑制其翻譯或誘發(fā)其降解。miRNA通過基因調(diào)控,在細(xì)胞的生長(zhǎng)、發(fā)育、分化以及對(duì)環(huán)境的適應(yīng)中發(fā)揮著非常重要的作用[5]。探討miRNA調(diào)控機(jī)制與ADRB2的基因功能的關(guān)系,可以更深入地認(rèn)識(shí)ADRB2的基因調(diào)控機(jī)制,亦可以促進(jìn)對(duì)冠心病的分子病理學(xué)的認(rèn)識(shí),為探索新的預(yù)防和治療途徑提供分子水平的新線索。

        1 資料與方法

        調(diào)節(jié)ADRB2基因候選miRNA的預(yù)測(cè):miRNA機(jī)制是一類特殊的基因調(diào)控機(jī)制,miRNA和被調(diào)控基因之間沒有特定的、嚴(yán)格的對(duì)應(yīng)關(guān)系,具有“一對(duì)多、多對(duì)一”的特點(diǎn),復(fù)雜的網(wǎng)絡(luò)模式使直接的實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證難度很高、成本巨大。因此,對(duì)調(diào)節(jié)特定基因的miRNA進(jìn)行預(yù)測(cè)具有重要的實(shí)用意義?;谏鲜鲈?,學(xué)界對(duì)miRNA與靶位點(diǎn)之間的模糊匹配關(guān)系進(jìn)行了大量深入的研究,建立了行之有效的預(yù)測(cè)模型。本研究所采用的預(yù)測(cè)方法就是依據(jù)既往研究所發(fā)現(xiàn)的一種組合策略[6],這一策略認(rèn)為,如果以下二個(gè)條件滿足,則相關(guān)miRNA和基因之間就具備調(diào)控和被調(diào)控關(guān)系:①從miRNA 5’端第一或第二堿基算起的7個(gè)連續(xù)堿基的“核”序列或“種子”序列與被調(diào)節(jié)基因3’端非轉(zhuǎn)錄區(qū)(UTR)部分序列構(gòu)成完全Watson-Crick匹配(即符合堿基配對(duì)原則的匹配);②上述“核”序列和3’-UTR對(duì)應(yīng)序列之間可以具有不匹配的堿基,只要二者結(jié)合的自由能不增加并且不含G∶U配對(duì)。此策略簡(jiǎn)稱為“種子區(qū)”(seed-region)預(yù)測(cè)法,按種子區(qū)法,利用美國(guó)麻省理工學(xué)院(MIT)TargetScan數(shù)據(jù)庫(2011-11第6版),對(duì)人ADRB2基因561bp(根據(jù)NCBI編號(hào)為NM_000024的參考序列)的3’-UTR進(jìn)行了候選miRNA的預(yù)測(cè)。

        心肌細(xì)胞株培養(yǎng):實(shí)驗(yàn)研究于2011-09至2012-04之間進(jìn)行。大鼠心肌細(xì)胞株H9c2(2-1)按照既往報(bào)道的方法[7]進(jìn)行培養(yǎng)?;静襟E為,采用DMEM培養(yǎng)基加10%胎牛血清,在5%CO2,37℃條件下培養(yǎng)。一輪培養(yǎng)3天,然后按1∶4的比例分盤繼續(xù)培養(yǎng),細(xì)胞脫壁收集采用0.25%胰蛋白酶合并0.53 mM依地酸二鈉(EDTA)溶液處理10 min。

        miRNA的增強(qiáng)和抑制:Pre-miR miRNA前體(增強(qiáng)劑)和Anti-miR miRNA抑制劑及相應(yīng)對(duì)照均從美國(guó)Ambion公司購買。根據(jù)相應(yīng)miRNA序列的隨機(jī)化紊亂(scramble)序列所合成的短鏈RNA作為陰性對(duì)照。采用美國(guó)Neuromics公司iFect轉(zhuǎn)染試劑盒,將let-7i增強(qiáng)劑(n=6)、抑制劑(n=6)及miRNA陰性對(duì)照(n=6)分別導(dǎo)入培養(yǎng)的H9c2(2-1)大鼠心肌細(xì)胞,具體操作按照該試劑盒說明書進(jìn)行。每種miRNA轉(zhuǎn)染劑量在前期預(yù)實(shí)驗(yàn)的基礎(chǔ)上,正式實(shí)驗(yàn)劑量選擇為20 nmol/L。細(xì)胞在轉(zhuǎn)染后狀態(tài)繼續(xù)培養(yǎng)48 h。

        蛋白免疫印跡雜交:蛋白免疫印跡雜交(Western Blot)參照文獻(xiàn)報(bào)道[7]方法進(jìn)行,作了少許簡(jiǎn)化和適應(yīng)性修改。具體步驟簡(jiǎn)述如下,將所收集的約106心肌細(xì)胞重懸于1ml冰冷的裂解緩沖液,勻漿后通過Virtis超聲細(xì)胞粉碎儀進(jìn)行超聲剪切,繼以14000g離心5 min去除不溶性沉渣。蛋白濃度測(cè)定采用Pierce公司BCA蛋白試劑盒進(jìn)行。等量的蛋白加入到8% ~16%SDS-PAGE凝膠進(jìn)行電泳分離,然后電轉(zhuǎn)移至硝酸纖維素膜。硝酸纖維素膜上的非特異結(jié)合通過以下雜交液屏蔽。雜交液包括Tris緩沖鹽水,0.1%吐溫-20?,5%脫脂牛奶。兔抗人 ADRB2抗體購自美國(guó)Santa-Cruz生物技術(shù)公司,該抗體除可用于人源性ADRB2蛋白的檢測(cè),亦可以用于大鼠ADRB2蛋白的檢測(cè)。實(shí)驗(yàn)中采用1∶200的比例稀釋。β-肌動(dòng)蛋白抗體(美國(guó)Cell Signaling公司)用作上樣對(duì)照。次級(jí)抗體為辣根過氧化物酶耦聯(lián)的抗兔抗體。免疫復(fù)合物用Amersham ECL加強(qiáng)型試劑盒探測(cè)。免疫印跡的定量分析采用Syngene凝膠建檔及分析系統(tǒng)進(jìn)行。

        統(tǒng)計(jì)分析:一元ANOVA采用SPSS 11.5版進(jìn)行。資料收集,一般統(tǒng)計(jì)計(jì)算(均值±標(biāo)準(zhǔn)差等)以及統(tǒng)計(jì)作圖采用GraphPad Prism(第4版)進(jìn)行。P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

        2 結(jié)果

        miRNA let-7家族與ADRB2基因關(guān)系:根據(jù)預(yù)測(cè)結(jié)果,約有150個(gè) miRNA具有不同程度的調(diào)節(jié)人ADRB2基因的可能性。表1列舉了種子區(qū)完全配對(duì)的ADRB2基因候選miRNA。

        表1 種子區(qū)完全配對(duì)的β2腎上腺素能受體基因候選微小核糖核酸

        其中4個(gè)miRNA家族具有種系穩(wěn)定性(conservation)[8]:靈長(zhǎng)類、嚙齒類等動(dòng)物之間具有高度一致的同源性。該4個(gè)miRNA家族中11個(gè)miRNA成員按照種子區(qū)原理與ADRB2具有很好的匹配性,無論從5’端的第一個(gè)或第二個(gè)堿基開始,均表現(xiàn)為其后7個(gè)堿基的完全Watson-Crick配對(duì),也就是5’端開始的8個(gè)堿基的完全配對(duì),符合種子區(qū)挑選法的最高要求。4個(gè) miRNA 家族為 miRNA-98、miRNA-4458、miRNA-4500和let-7,其中l(wèi)et-7家族與 ADRB2關(guān)系特別明顯,let-7家族的 8個(gè)成員,let-7a/b/c/d/e/f/g/i,都對(duì)ADRB2基因具有理論預(yù)測(cè)的調(diào)控作用。根據(jù)已知的研究資料,在let-7家族內(nèi)部,let-7i和冠心病關(guān)系密切[9],因此,被挑選作為進(jìn)一步實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證對(duì)象。

        let-7i功能水平與ADRB2基因蛋白表達(dá)水平:用let-7i的Pre-miRNA前體和let-7i的Anti-miRNA分別對(duì)培養(yǎng)的大鼠心肌細(xì)胞株H9c2(2-1)實(shí)施轉(zhuǎn)染,然后處理48 h.let-7i的原序列為5’-UGAGGUAGUAGUUUGUGCUGU-3’,采用美國(guó)麻薩諸塞大學(xué)醫(yī)學(xué)院的在線程序?qū)嵤┪蓙y化處理,得到的序列為5’-GAUGGGGCUUAGUUUUGUGUA-3’,作為實(shí)驗(yàn)的 miRNA陰性對(duì)照。大鼠心肌細(xì)胞在增強(qiáng)和抑制處理后,組織形態(tài)學(xué)無明顯變化,根據(jù)倒置顯微鏡觀察計(jì)數(shù),let-7i增強(qiáng)劑作用的細(xì)胞計(jì)數(shù)比miRNA陰性對(duì)照高8% ~11%,但無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05,圖1)。

        圖1 經(jīng)let-7i Pre-miRNA前體和let-7i Anti-miRNA抑制劑處理的大鼠心肌細(xì)胞

        let-7i功能水平與ADRB2基因蛋白表達(dá)水平相關(guān)關(guān)系:使用 let-7i Pre-miRNA(增強(qiáng)劑)處理細(xì)胞48h后,ADRB2基因蛋白表達(dá)水平降低,以光密度(OD)所表示的蛋白水平由 miRNA陰性對(duì)照水平67.03±15.20下降至 25.59±10.53,下降了 61.83%(P=0.0012,95%可信區(qū)間:19.22~63.66);與 let-7i增強(qiáng)劑處理效果相反,當(dāng)使用let-7i Anti-miRNA(抑制劑)處理細(xì)胞48 h后,ADRB2基因蛋白表達(dá)水平由miRNA陰性對(duì)照水平上升至99.53±25.23,升高了48.49%(P=0.0071,95% 可 信 區(qū) 間:-54.72~-10.28),let-7i功能水平與ADRB2基因蛋白表達(dá)水平呈負(fù)相關(guān)關(guān)系,見圖2。

        圖2 let-7i增強(qiáng)劑和let-7i抑制劑對(duì)ADRB2蛋白質(zhì)水平的影響。大鼠心肌細(xì)胞株H9c2(2-1)分別以let-7i增強(qiáng)劑和let-7i抑制劑轉(zhuǎn)染處理48 h,ADRB2蛋白水平以免疫印跡雜交確定。圖中蛋白水平為miRNA陰性對(duì)照水平的百分比(miRNA陰性對(duì)照水平設(shè)定為100%),β-肌動(dòng)蛋白(ACTB)抗體作為電泳上樣內(nèi)參照。圖示的數(shù)據(jù)為均值±標(biāo)準(zhǔn)差,每組6個(gè)樣本(n=6),與miRNA陰性對(duì)照比較**P<0.01,統(tǒng)計(jì)檢驗(yàn)采用方差分析

        3 討論

        冠心病作為復(fù)雜性疾病,其發(fā)病機(jī)制尚無定論,但一般認(rèn)為是遺傳易感性和環(huán)境相互作用的結(jié)果[10]。在遺傳易感性方面,研究主要聚焦于一些與冠心病發(fā)病密切相關(guān)的候選基因方面,例如ADRB2;在環(huán)境方面,應(yīng)激因素歷來是被關(guān)注的重點(diǎn)[11]。miRNA與上述二個(gè)方面都有極為密切的關(guān)系。首先,miRNA是近年來才發(fā)現(xiàn)的基因調(diào)控的重要機(jī)制,miRNA以特定的方式在轉(zhuǎn)錄后和翻譯前調(diào)節(jié)眾多基因的表達(dá)水平。此外,miRNA是機(jī)體應(yīng)激反應(yīng)中最重要的基因調(diào)控機(jī)制之一[12]。將上述二個(gè)方面聯(lián)系起來,miRNA和冠心病之間存在聯(lián)系具有極高的可能性。

        本研究以冠心病一個(gè)重要候選基因ADRB2為基礎(chǔ),預(yù)測(cè)了可能調(diào)節(jié)該基因的miRNA。在調(diào)節(jié)ADRB2的多個(gè)miRNA家族中,let-7家族值得特別關(guān)注。首先,let-7家族具有廣泛的種系穩(wěn)定性或稱為保守性,說明其在基因調(diào)控中具有基礎(chǔ)級(jí)的重要作用。另外,本文作者自己和其他研究者的工作均提示,let-7家族與心血管病關(guān)系密切。第一點(diǎn)表現(xiàn)在間接關(guān)系方面。Let-7家族對(duì)細(xì)胞外信號(hào)調(diào)節(jié)激酶(ERK)的上游信號(hào)分子RAS通過多位點(diǎn)結(jié)合發(fā)揮重要的調(diào)節(jié)作用,此點(diǎn)已被研究證實(shí)[13]。另外,在let-7家族成員中非常值得關(guān)注的是,日本巖手醫(yī)科大學(xué)佐藤衛(wèi)等的研究提示[8],let-7i和冠心病具有直接的關(guān)聯(lián)。用于冠心病預(yù)防和治療的降脂藥阿托伐他汀的一部分治療作用就是通過調(diào)節(jié)let-7i實(shí)現(xiàn)的。因此,let-7i被挑選進(jìn)行了實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證。實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證的結(jié)果和理論預(yù)計(jì)完全一致,let-7i的功能水平和ADRB2基因的蛋白表達(dá)呈明顯的負(fù)相關(guān)。由此進(jìn)一步證實(shí)了let-7家族對(duì)ADRB2基因存在調(diào)控作用的預(yù)測(cè)。此外,其它候選miRNA也值得關(guān)注,例如 miR-98與血管損傷有關(guān)[14],此外更值得關(guān)注的是,在血管加壓素-Ⅱ所誘導(dǎo)的心肌肥厚中,miRNA-98和let-7的變化表現(xiàn)出聯(lián)動(dòng)性[15]。

        目前的研究是基于心肌細(xì)胞的分子生物學(xué)研究,進(jìn)一步采用實(shí)驗(yàn)動(dòng)物的在體研究以及采用臨床病例的應(yīng)用研究是值得深入的研究方向。

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