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        用數(shù)據(jù)說(shuō)話
        ——記章振林教授團(tuán)隊(duì)對(duì)遺傳性骨病的病例收集與數(shù)據(jù)分析

        2013-07-24 19:00:40
        世界科學(xué) 2013年8期
        關(guān)鍵詞:骨病遺傳性基因突變

        本刊記者/李 輝

        用數(shù)據(jù)說(shuō)話
        ——記章振林教授團(tuán)隊(duì)對(duì)遺傳性骨病的病例收集與數(shù)據(jù)分析

        本刊記者/李 輝

        本期項(xiàng)目:骨質(zhì)疏松和單基因骨病遺傳機(jī)制及臨床應(yīng)用;

        所獲獎(jiǎng)項(xiàng):2012年度上海市科技進(jìn)步獎(jiǎng)一等獎(jiǎng);

        第一完成人:上海交通大學(xué)附屬第六人民醫(yī)院章振林教授。

        章振林,上海交通大學(xué)附屬第六人民醫(yī)院骨質(zhì)疏松和骨病專(zhuān)科主任,骨代謝病和遺傳研究室主任,醫(yī)學(xué)博士,主任醫(yī)師,上海交通大學(xué)博士研究生導(dǎo)師。兼任中華醫(yī)學(xué)會(huì)骨質(zhì)疏松和骨礦鹽疾病分會(huì)副主任委員、上海醫(yī)學(xué)會(huì)骨質(zhì)疏松專(zhuān)科分會(huì)主任委員。2008年入選上海市科委優(yōu)秀學(xué)科帶頭人;2013年入選上海市領(lǐng)軍人才。

        2007年的一天,章振林教授接到一名51歲的女性患者。她訴說(shuō)30多歲后容貌變化很大,手指明顯變粗,顴骨也越來(lái)越突出。出于對(duì)遺傳性骨病的敏感,章振林詢(xún)問(wèn)其家人是否有類(lèi)似的癥狀,該女士說(shuō)她的父親和哥哥都有。這位女士是嫁在上海的江蘇人,于是章振林請(qǐng)求和她回一趟江蘇,探訪她的父親和哥哥并請(qǐng)他們一起來(lái)上海診治。

        根據(jù)癥狀,章振林一開(kāi)始認(rèn)為這一家三人可能是佝僂病患者,但在反復(fù)分析患者X線特征并結(jié)合生化檢查結(jié)果后,章振林判斷他們罹患的可能是特殊類(lèi)型的畸形性骨炎——一種相當(dāng)罕見(jiàn)的骨病。根據(jù)這一判斷,章振林大膽對(duì)先證者予以雙膦酸鹽靜脈滴注,僅僅一個(gè)月之后,患者的骨痛就顯著減輕,其特征性表現(xiàn)之一的高水平血堿性磷酸酶,也開(kāi)始呈現(xiàn)顯著下降。

        在已報(bào)告的文獻(xiàn)中,全球只在日本有一個(gè)同類(lèi)型病例——由RANK基因突變導(dǎo)致的早發(fā)性畸形性骨炎——的家系,毫無(wú)疑問(wèn),這是一種極為罕見(jiàn)的疾病。根據(jù)日本的這一報(bào)道,章振林對(duì)三名患者進(jìn)行了RANK基因突變檢測(cè),并找到了這一致病基因。章振林診治的這一病例,因而也成為了全球公開(kāi)報(bào)道的早發(fā)性畸形性骨炎的第二例。

        查明病因后,進(jìn)行醫(yī)治就可以有的放矢了。該疾病因于破骨細(xì)胞功能顯著增高,因此使用雙膦酸鹽類(lèi)藥物治療,即可以抑制骨吸收,緩解骨痛,延緩病情。經(jīng)過(guò)章振林的治療,這位女士和她哥哥的病情都得到了有效的控制,她父親也沒(méi)有特別受到這種疾病的折磨,一直活到近80歲。

        國(guó)人自身的骨病致病基因突變譜

        這位女士一家三口所罹患的畸形性骨炎,在醫(yī)學(xué)上被歸于罕見(jiàn)病,顧名思義,是指發(fā)病率極低的疾病。章振林關(guān)心的主要是涉及骨骼的罕見(jiàn)病。由于骨病大多是先天性的,患者在青少年時(shí)期往往就表現(xiàn)為骨骼無(wú)法正常生長(zhǎng),成年后畸形殘疾的比例很高。

        對(duì)于罕見(jiàn)性骨病來(lái)說(shuō),遺傳因素——致病基因的突變——通常是最主要的致病原因。具體來(lái)說(shuō),罕見(jiàn)性骨病屬于單基因遺傳性疾病,只要任何一個(gè)與疾病相關(guān)的致病基因發(fā)生突變,這種疾病將必然發(fā)生——發(fā)病率是100%。目前已知的單基因遺傳性骨病有456種。通過(guò)對(duì)先證者檢測(cè)與某種單基因遺傳性疾病相關(guān)的所有已知致病基因,就能夠發(fā)現(xiàn)有可能導(dǎo)致先證者發(fā)病的致病基因突變?;驒z測(cè)對(duì)于疾病確診、有效治療以及產(chǎn)前診斷和干預(yù),都是關(guān)鍵。

        對(duì)于單基因遺傳性骨病的診斷治療,西方發(fā)達(dá)國(guó)家開(kāi)展較早。他們對(duì)一些遺傳性骨病已經(jīng)建立了較完善的基因篩選流程。但在中國(guó),僅僅一些大型醫(yī)院或者科研單位開(kāi)展有相關(guān)的工作,規(guī)范化的診治才剛剛開(kāi)始。

        占中國(guó)人口絕大多數(shù)的漢族人群屬于蒙古人種,與白種人或黑種人的遺傳背景有很大差別。因此基因檢測(cè),必須基于中國(guó)人自己的致病基因突變譜。但由于起步較晚,現(xiàn)在國(guó)人骨病的致病基因突變譜還沒(méi)有建立起來(lái)。

        事實(shí)上,在中國(guó)眾多人口的基數(shù)下,雖然某一種罕見(jiàn)病分散各地較為少見(jiàn),但整合起來(lái)也有相當(dāng)大的數(shù)量。將這些罕見(jiàn)病的病例聚集在一起,統(tǒng)計(jì)、分析、研究,建立漢族人群的致病基因突變譜是完全可能的。

        這正是章振林所做的工作。建立大樣本量的單基因骨病數(shù)據(jù)庫(kù),以及開(kāi)展后續(xù)基因篩查研究的重要發(fā)現(xiàn),正是章振林團(tuán)隊(duì)此次獲得上海市科技進(jìn)步獎(jiǎng)的關(guān)鍵成果之一。

        歷時(shí)10年的門(mén)診、探訪、分析和記錄

        章振林對(duì)罕見(jiàn)骨病病例收集整理的動(dòng)力,來(lái)源于他對(duì)疑難雜癥的興趣。章振林畢業(yè)于中國(guó)協(xié)和醫(yī)科大學(xué)北京協(xié)和醫(yī)院?!皡f(xié)和的人喜歡看疑難病。這是研究型醫(yī)院的職責(zé),也是我們一貫的思想。”他如此說(shuō),“遇到疑難病、少見(jiàn)病,我喜歡做記錄。我已經(jīng)記錄了十幾本。”這種對(duì)疑難雜癥收集研究的功力,章振林歸功于其博士研究生導(dǎo)師孟迅吾教授的言傳身教。

        2000年于協(xié)和獲得醫(yī)學(xué)博士學(xué)位后,章振林來(lái)到中科院上海生命科學(xué)院做了兩年博士后。期間,他完成了FasL轉(zhuǎn)基因小鼠胰島移植方面的研究工作。這兩年的研究涉及一些遺傳學(xué)方面的科研思路和訓(xùn)練,為章振林日后開(kāi)展骨病遺傳學(xué)研究打下了良好的基礎(chǔ)。“做博士后是為了鍛煉我自己的科研能力”,他說(shuō)。

        每遇到一例疑難骨病病例,章振林就會(huì)紀(jì)錄下來(lái),這樣的筆記本他已經(jīng)紀(jì)錄了十幾本

        然而,既受到協(xié)和的臨床培訓(xùn)又在中科院經(jīng)歷了科研的錘煉,在剛剛進(jìn)入第六人民醫(yī)院時(shí),章振林卻遇到了瓶頸。十年前,國(guó)家自然科學(xué)基金委員會(huì)對(duì)醫(yī)院臨床申請(qǐng)的項(xiàng)目批準(zhǔn)很少。在當(dāng)時(shí),大多數(shù)醫(yī)院在臨床上有明顯優(yōu)勢(shì),但在科研上則水平有限?!笆昵拔覄倎?lái)六院的時(shí)候,六院的科研氛圍也還不夠濃?!被貞浧甬?dāng)時(shí)的情形,章振林繼續(xù)說(shuō)道:“當(dāng)時(shí)我很迷茫。沒(méi)有條件用小動(dòng)物做實(shí)驗(yàn),也找不到研究方向。”

        但在半年之后,章振林意識(shí)到,臨床資源也是獨(dú)特的科研資源。對(duì)于某一罕見(jiàn)病患者,確診病情之前必須明白其發(fā)病原因;對(duì)于某一罕見(jiàn)病病因,必須有患者出現(xiàn)才能獲取數(shù)據(jù)和分析數(shù)據(jù)。罕見(jiàn)病病例研究正是醫(yī)院得天獨(dú)厚的優(yōu)勢(shì)。“我找到了這個(gè)思路,利用臨床資源來(lái)做科學(xué)研究,反過(guò)來(lái)科研成果指導(dǎo)臨床實(shí)踐?!?/p>

        章振林診治和研究罕見(jiàn)病的患者來(lái)源,一些是前來(lái)上門(mén)門(mén)診的,還有一些是網(wǎng)上發(fā)布求助信息的。對(duì)于后者,章振林發(fā)現(xiàn)后會(huì)自己或派團(tuán)隊(duì)成員到病人所在地,與病人約談,有時(shí)候還用自己的科研經(jīng)費(fèi)將病人請(qǐng)到上海。如今他們實(shí)地探訪和采樣的足跡已經(jīng)遍及新疆、內(nèi)蒙、安徽等全國(guó)20多個(gè)省市。

        隨著病例的增多,數(shù)據(jù)的量也越來(lái)越大。章振林團(tuán)隊(duì)在全國(guó)范圍收集成骨不全、原發(fā)性骨硬化癥和佝僂病等近30種主要骨代謝病的臨床資料(影像學(xué)、病理學(xué)等)和血液、組織等標(biāo)本,截至目前已經(jīng)構(gòu)建了較為完善的近600個(gè)家系庫(kù),達(dá)到2 000多例。這些骨病中,最多的是成骨不全(由于組成骨骼重要的1型膠原基因突變導(dǎo)致骨骼反復(fù)骨折以及發(fā)生耳聾等癥狀),其次是佝僂病,患者生長(zhǎng)遲緩、骨骼畸形等。

        由于政策原因,基因檢測(cè)項(xiàng)目在我國(guó)臨床還是不能收費(fèi)的,因此章振林對(duì)所有患者及其家庭成員的基因突變篩查,都是用自己所申請(qǐng)的課題經(jīng)費(fèi)來(lái)承擔(dān)的。到現(xiàn)在為止課題組在此方面花費(fèi)的經(jīng)費(fèi)已超過(guò)200萬(wàn)元。

        在從2002年開(kāi)始的十余年時(shí)間里,章振林就這樣通過(guò)門(mén)診、探訪、分析、記錄,一步步建成了如今國(guó)內(nèi)最大的單基因遺傳性骨病數(shù)據(jù)庫(kù)。

        基因突變譜系建成后的臨床與科研

        從對(duì)這些數(shù)據(jù)的分析中,章振林獲得了臨床與科研的雙重收獲。

        基因突變譜系建立之后,對(duì)本土罕見(jiàn)骨病進(jìn)行有效地確診、干預(yù)和預(yù)防就有了基礎(chǔ)。截至目前,章振林團(tuán)隊(duì)根據(jù)基因診斷,已經(jīng)在上海第六人民醫(yī)院確診了200余例涉及30多種類(lèi)的遺傳性骨病,并對(duì)部分家系開(kāi)展了產(chǎn)前診斷、干預(yù)和預(yù)防工作。所謂干預(yù),是指針對(duì)發(fā)現(xiàn)的致病基因突變,確診疾病,對(duì)一些有治療藥物的病例進(jìn)行及早處理。所謂預(yù)防,是對(duì)有家族遺傳風(fēng)險(xiǎn)的產(chǎn)婦進(jìn)行產(chǎn)檢,從8-12周孕婦處提取羊水,獲得DNA,進(jìn)行基因突變檢測(cè)。如果發(fā)現(xiàn)致病基因突變,在孕婦同意的情況下,通過(guò)流產(chǎn)等手段切斷該遺傳病的遺傳鏈,從而降低發(fā)病率。章振林的診治方法,已經(jīng)在多家醫(yī)療單位得到推廣和應(yīng)用。

        在診治病情的過(guò)程中,章振林也發(fā)現(xiàn)了一些新的致病基因。一種名為原發(fā)性厚皮骨膜病的骨病,患者通常表現(xiàn)為顏面、前額、頭部皮膚肥厚,呈皺褶狀,額橫紋增深,伴有杵狀指(趾)。2008年,英國(guó)學(xué)者證實(shí)前列腺素E2(PGE2)水平增高是這一骨病的發(fā)病原因,并發(fā)現(xiàn)了降解PGE2的酶HPGD基因突變導(dǎo)致該病,在此之后醫(yī)學(xué)界認(rèn)定該基因突變是唯一病因。而章振林團(tuán)隊(duì)在長(zhǎng)期臨床實(shí)踐中發(fā)現(xiàn),該基因突變不能完全解釋一些臨床表現(xiàn)嚴(yán)重的病例,他們應(yīng)用全外顯子測(cè)序技術(shù),發(fā)現(xiàn)了導(dǎo)致本病的另一元兇——SLCO2A1(其功能是調(diào)節(jié)細(xì)胞內(nèi)外轉(zhuǎn)運(yùn)PGE2的蛋白)。

        這一研究成果在國(guó)際人類(lèi)遺傳學(xué)研究領(lǐng)域的頂級(jí)學(xué)術(shù)期刊《美國(guó)人類(lèi)遺傳學(xué)雜志》發(fā)表,旋即引起了全球關(guān)注。這一創(chuàng)新性發(fā)現(xiàn)正是依賴(lài)于收集的家系——因?yàn)橹挥芯邆湟欢ǖ臉颖玖坎趴梢蚤_(kāi)展致病基因突變篩查。根據(jù)他們的研究結(jié)果,該基因的發(fā)現(xiàn)使臨床上可以使用降低PGE2的藥物進(jìn)行對(duì)癥下藥。治療三個(gè)月,患者面部皮膚等癥狀即可得到顯著好轉(zhuǎn)。

        章振林團(tuán)隊(duì)根據(jù)他們建立的大樣本量國(guó)人成骨不全致病基因突變譜,也統(tǒng)計(jì)分析出了一些以前不曾發(fā)現(xiàn)的罕見(jiàn)骨病發(fā)病規(guī)律。例如,他們發(fā)現(xiàn)95%成骨不全患者為1型膠原α1或1型膠原α2基因突變,其中1型膠原α1基因突變最常見(jiàn),占所有患者的75%。再比如,他們發(fā)現(xiàn)國(guó)人最常見(jiàn)的遺傳性骨硬化癥是常顯2型,其致病基因?yàn)镃LCN7。

        ●相關(guān)鏈接●

        在章振林的患者中,有一對(duì)夫婦是一種隱性遺傳病——脊柱骨骺發(fā)育不良——的隱性突變攜帶者。他們的第一個(gè)孩子長(zhǎng)大后,呈現(xiàn)出腳彎的疾病癥狀。在對(duì)這一孩子醫(yī)治的過(guò)程中,章振林告訴這對(duì)夫婦,在生二胎之前,務(wù)必做羊水穿刺測(cè)定孩子遺傳該病的幾率,以避免新的悲劇產(chǎn)生。很遺憾,由于這對(duì)夫婦當(dāng)時(shí)沒(méi)有做這樣的測(cè)試,第二胎罹患了同樣的疾病。

        單基因骨病雖然已有310種致病基因明確,但是僅12種可以治療。章振林介紹說(shuō),目前能夠進(jìn)行藥物緩解癥狀的骨病僅僅是極少部分,有三分之一患者可以通過(guò)骨科手術(shù)進(jìn)行矯形,但其他部分基本處于無(wú)藥可治的狀態(tài),唯一能夠減少悲劇的方法是開(kāi)展高危人群篩查,開(kāi)展產(chǎn)前診斷等干預(yù),阻斷疾病的遺傳鏈。近年來(lái),章振林團(tuán)隊(duì)一直與這類(lèi)病患人群保持聯(lián)系,目的就是希望能防患于未然。

        寫(xiě)在最后

        限于篇幅,本文只寫(xiě)了章振林此次獲獎(jiǎng)項(xiàng)目“骨質(zhì)疏松和單基因骨病遺傳機(jī)制及臨床應(yīng)用”中關(guān)于“單基因骨病”的部分。事實(shí)上,章振林團(tuán)隊(duì)在骨質(zhì)疏松方面所做的工作同樣值得公眾所知。他們?cè)谑甑臅r(shí)間里,收集了近6 000例漢族人群骨密度等數(shù)據(jù)和DNA樣本庫(kù)!通過(guò)這些數(shù)據(jù),他們發(fā)現(xiàn)了容易患骨質(zhì)疏松的人群特點(diǎn)。通過(guò)這些數(shù)據(jù),他們發(fā)現(xiàn)漢族人群骨質(zhì)疏松遺傳背景與白種人群有顯著不同,一些候選基因多態(tài)性對(duì)白種人和漢族人群具有不同的風(fēng)險(xiǎn)性。

        我們之所以主要介紹章振林教授關(guān)于遺傳性骨病的科研成果,是因?yàn)槲覀兿M嗟摹昂币?jiàn)”病患者通過(guò)本文能夠獲得信息和信心。實(shí)際上,無(wú)論是針對(duì)遺傳骨病還是骨質(zhì)疏松,章振林以數(shù)據(jù)的積累和分析為中心的項(xiàng)目本身,毫無(wú)疑問(wèn)是現(xiàn)階段科技創(chuàng)新的經(jīng)典案例?!按髷?shù)據(jù)”時(shí)代的來(lái)臨基于數(shù)據(jù)的大量產(chǎn)生,而數(shù)據(jù)的產(chǎn)生則需要扎實(shí)而持久的積累——這正是“章振林”們所做出的貢獻(xiàn)。他們熱衷于收集數(shù)據(jù),將數(shù)據(jù)電子化,將數(shù)據(jù)規(guī)?;?,為本領(lǐng)域大數(shù)據(jù)的來(lái)臨奠定著堅(jiān)實(shí)的基礎(chǔ)。我們有理由相信,隨著數(shù)據(jù)的持續(xù)積累,章振林團(tuán)隊(duì)將繼續(xù)在骨病的臨床、科研以及轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)等方面做出更多更優(yōu)異的成果。

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