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        生物分離工程綜合實驗的設(shè)計

        2013-05-03 10:47:06趙東旭羅愛芹張建麗周曉宏楊新芳
        實驗技術(shù)與管理 2013年4期
        關(guān)鍵詞:天花粉鹽析純度

        趙東旭,羅愛芹,李 春,張建麗,周曉宏,楊新芳

        在高等教育過程中,實驗教學(xué)對于促使學(xué)生加強對書本知識的理解、掌握基本的實驗設(shè)計方法和操作技能、增強感性認(rèn)識、貫徹系統(tǒng)性實踐的能力等,具有不可替代的作用,應(yīng)該受到更多的重視,加強新型交叉學(xué)科生物工程專業(yè)學(xué)生的實踐創(chuàng)新能力更是迫在眉睫[1-2]。生物分離工程課程是生物工程專業(yè)的必修基礎(chǔ)課程,生物分離工程的實驗環(huán)節(jié)不同于傳統(tǒng)的化工分離操作,其在上游生物工程、發(fā)酵技術(shù)的基礎(chǔ)上,從濃度稀、成分復(fù)雜、物料不穩(wěn)定的料液開始操作,整個生物分離過程包括材料預(yù)處理和固液分離、初步純化、高度精制和成品制作四大單元操作。分離工藝經(jīng)過不同批次的條件摸索后,即可用于放大生產(chǎn)。生物分離過程集現(xiàn)代生命科學(xué)和工程設(shè)計學(xué)為一體,重復(fù)性強、步驟多、交叉性明顯、應(yīng)用性強。

        1 現(xiàn)代生物分離工程綜合性實驗設(shè)計的必要性

        生物工程已經(jīng)作為一級學(xué)科列入國務(wù)院學(xué)位辦下發(fā)的學(xué)科目錄,表明現(xiàn)代生物技術(shù)在國民經(jīng)濟建設(shè)中的作用愈來愈受到重視。生物分離工程(有時也稱作生化分離工程,bio-separation)是生化工程的一個重要組成部分,它是描述回收生物產(chǎn)品分離過程原理和方法的一個術(shù)語。生化分離工程是生物技術(shù)轉(zhuǎn)化為生產(chǎn)力所不可缺少的重要環(huán)節(jié),為突出其在生物技術(shù)領(lǐng)域中的地位和作用,常稱它為生物技術(shù)下游加工過程(down-stream processing)。傳統(tǒng)上的生物分離工程是作為生物工程或生物技術(shù)進入實際應(yīng)用的必須后續(xù)技術(shù)之一。最新的發(fā)展趨勢表明,生物分離工程或?qū)⒆鳛楝F(xiàn)代生物工程的重要研究方向之一,與“細胞培養(yǎng)與代謝工程”、“生物催化與轉(zhuǎn)化工程”、“合成生物技術(shù)與系統(tǒng)生物工程”、“生物藥物與材料工程”、“生物資源與環(huán)境工程”等共同發(fā)展。作為重要的工科課程,同時也作為生物工程專業(yè)的重要基礎(chǔ)課程,關(guān)于其理論課的教學(xué)探討已有較多的討論[3-6],甚至有學(xué)者提出了“研究型”教學(xué)的模式[7-8],但是在其實踐環(huán)節(jié)的綜合性實驗方面的討論還有待深入。生物分離工程實驗教學(xué)是整個教學(xué)計劃中的有機部分,它具有鞏固和加深學(xué)生所學(xué)的理論知識,使學(xué)生獲得生產(chǎn)知識、培養(yǎng)學(xué)生實際工作能力的功能。學(xué)生動手能力的培養(yǎng)不在于一定要發(fā)現(xiàn)新的生物分離技術(shù),爭創(chuàng)專利,而是學(xué)生在現(xiàn)有的知識、能力的基礎(chǔ)上,能夠創(chuàng)造性地解決問題[9-10]。為提高學(xué)生的綜合性、工程性創(chuàng)新能力,有必要將相對分散的課程體系提煉出一個系統(tǒng)性強的綜合性實驗體系,同時也是強化與改革現(xiàn)有的實踐教學(xué)環(huán)節(jié)的具體體現(xiàn)。本文將以天花粉蛋白的提取和純化過程為例,根據(jù)現(xiàn)代生物工程的學(xué)科特點和實際生產(chǎn)過程中的單元操作安排,設(shè)計出從原料提取到純度鑒定的實驗框架。

        2 現(xiàn)代生物分離工程設(shè)計的理念

        現(xiàn)代生物分離工程涉及到很多的分離技術(shù),在設(shè)計理念上應(yīng)該堅持以下原則:

        (1)體現(xiàn)系統(tǒng)性。以某一蛋白為模型蛋白,內(nèi)容包括原材料的預(yù)處理技術(shù)、破碎技術(shù)、初步提取技術(shù)、高度純化(精制)技術(shù)、純度鑒定技術(shù)等內(nèi)容。

        (2)工程性。將全部的實驗操作完全按照工業(yè)生產(chǎn)的單元操作進行劃分,分成若干個工藝段。

        (3)目標(biāo)產(chǎn)物明顯。通過制得一定量的產(chǎn)物來體現(xiàn)所用的分離技術(shù)的可行性,同時也可以提升學(xué)生的“成就感”和興趣。

        目前,以水溶性蛋白或酶為目標(biāo)蛋白的制備過程,是生命科學(xué)實驗室中最為常見的操作,其中基本上全部用到了最為常見的分離技術(shù),如針對動植物組織的組織破碎或高壓壓榨技術(shù),實現(xiàn)液固分離的離心技術(shù)、過濾技術(shù),可對大體積樣品進行快速濃縮并且有初步純化作用的鹽析技術(shù)和吸附技術(shù),可對樣品進行高度純化的各種層析技術(shù)等。離子交換層析是一種特殊的吸附層析,基本上是一種必不可少的手段。對于蛋白純度檢測來說,尺寸排阻層析和SDS-PAGE(SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳)是2種最為普遍的手段。對終產(chǎn)品的加工技術(shù)主要包括超濾濃縮、冷凍干燥技術(shù)等。因此,在綜合性分離工程實驗設(shè)計上,應(yīng)該包括上述全部技術(shù),或至少是絕大部分技術(shù)。本文將以傳統(tǒng)中藥天花粉蛋白為模型蛋白,設(shè)計其分離純化的技術(shù)路線。

        3 以天花粉蛋白為模型的綜合性生物分離工程的實驗設(shè)計及應(yīng)用

        天花粉是一種傳統(tǒng)中藥,來自于栝樓的塊根,傳統(tǒng)上一般用于終止妊娠反應(yīng)。研究表明,其生物學(xué)活性物質(zhì)是其含有的天花粉蛋白,而且,最近的研究表明,天花粉蛋白具有明顯的抗腫瘤作用。該蛋白分子量27kD,pI9.4(pI即等電點,絕大多數(shù)蛋白的pI在pH 5.0~9.0范圍內(nèi))。本文將根據(jù)上述原則,以天花粉為原料,提出對其中富含的天花粉蛋白進行提取、分離和純度鑒定的實驗框架[11-13]。

        3.1 操作單元1:原料處理

        主要操作包括:

        (1)原材料的預(yù)處理;

        (2)天花粉的粉碎及效果評價;

        (3)活性炭吸附(脫色處理)。

        在原料預(yù)處理環(huán)節(jié),主要實驗內(nèi)容包括:去除粘附在塊根上的泥土、清洗、晾干、去皮及稱重、粉碎機(或勻漿機)的多次破碎、大容量低速離心機沉淀未徹底破碎的組織及淀粉粒等、高速冷凍離心機實現(xiàn)較徹底的固液分離以得到真溶液(提取液)、活性炭吸附以脫去色素成分、分光光度計比色方法初步評判破碎效果和所需破碎次數(shù)。

        需要探索的技術(shù)參數(shù)包括:

        (1)原料與提取液的比例;

        (2)破碎次數(shù);

        (3)1g活性炭吸附提取液的量或100g原料所需活性炭量(g);

        (4)吸附過程的流速等。

        3.2 操作單元2:初步純化

        主要操作包括:

        (1)合適鹽析條件的確定;

        (2)大量提取液的處理——鹽析技術(shù);

        (3)透析脫鹽方法;

        (4)凍干處理方法。

        在初步純化環(huán)節(jié),主要實驗內(nèi)容包括:利用小體積溶液進行硫酸銨20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%飽和度鹽析并配合SDS-PAGE檢測,確定鹽析技術(shù)對天花粉蛋白的初步純化,同時為實現(xiàn)對大體積提取液的濃縮摸索條件;大量提取液的鹽析操作、低溫透析操作及凍干操作,以便對高含量比的混合物進行較長時間保存、SDS-PAGE操作。

        需要探索的技術(shù)參數(shù)包括:

        (1)合適鹽析范圍,既保證最大限度地去除雜質(zhì),又可在最低鹽用量時回收最多的目標(biāo)蛋白;

        (2)比較理想的PAG濃度,以得到理想的電泳圖。

        3.3 操作單元3:高度純化(精制)

        主要操作包括:

        (1)pH階段梯度洗脫方式的陽離子交換層析;

        (2)鹽離子線性梯度洗脫方式的陽離子交換層析;

        (3)飽和進樣時的階段梯度洗脫方式的陽離子交換層析;

        (4)尺寸排阻層析進一步純化天花粉蛋白。

        在高度純化(精制)環(huán)節(jié),主要實驗內(nèi)容包括:根據(jù)天花粉蛋白在中性pH條件下帶正電荷的性質(zhì),在pH 8時進行吸附,可將大部分雜蛋白去除,改變pH再去除pI低于9.4的一些雜蛋白,再用高pH緩沖液洗脫即可得到較純的目標(biāo)蛋白溶液。充分使用了目標(biāo)蛋白pI為9.4的特點。鹽離子線性梯度洗脫方式也是一種最為普通的洗脫方式,常用的鹽離子濃度范圍一般是0~0.5mol/L NaCl。常用的梯度儀有2個形狀完全相同,且底部有細管道相連的同水平放置的容器組成,高效液相層析系統(tǒng)則由電腦控制的柱塞泵組成,精確度更高。飽和進樣操作也是一種基本操作,可以高效利用層析系統(tǒng)。尺寸排阻層析既是一種最后的純化手段,也是一種純度鑒定技術(shù),操作過程相對簡單些。

        需要探索的技術(shù)參數(shù)包括:

        (1)合適的pH梯度;

        (2)在給定層析柱條件下,鹽梯度洗脫時的體積及洗脫速度;

        (3)尺寸排阻層析的進樣量及洗脫速度等。

        3.4 操作單元4:成品加工

        主要操作包括:

        (1)超濾濃縮;

        (2)冰凍干燥處理。

        在對末端產(chǎn)物的加工環(huán)節(jié),主要實驗內(nèi)容包括:

        (1)利用超濾濃縮技術(shù)對大體積的含有目標(biāo)產(chǎn)物的溶液進行濃縮,達到合適的濃度;

        (2)利用冰凍干燥機對上述樣品進行凍干并分裝保存。

        需要探索的技術(shù)參數(shù)包括:

        (1)在選定截留一定分子量蛋白的超濾后,探索合適的過膜壓力和濃縮倍數(shù);

        (2)在給定容器和樣品體積條件下,探索凍干所需的大致時間。

        3.5 操作單元5:純度鑒定

        主要操作包括:

        (1)分析型尺寸排阻層析技術(shù);

        (2)SDS-PAGE方法。

        在純度鑒定環(huán)節(jié),主要實驗內(nèi)容包括:

        (1)分析性尺寸排阻層析對目標(biāo)樣品的分析,根據(jù)出峰情況初步斷定樣品的純度,該操作需要用到高效液相層析系統(tǒng);

        (2)利用SDS-PAGE方法檢測樣品中蛋白單體/亞基的組成,該操作是普通生物化學(xué)實驗室里的常規(guī)操作,通過與分析性尺寸排阻層析的比較來斷定樣品的純度。

        需要探索的技術(shù)參數(shù)包括:

        (1)給定尺寸排阻層析柱時,不同的流動相的選擇以及進樣體積的范圍;

        (2)SDS-PAGE操作時,合適的凝膠濃度。

        根據(jù)上述操作,需要得到的結(jié)果匯總到簡表(表1)中,以指示實驗進度。

        表1 不同操作環(huán)節(jié)的蛋白回收情況比較(空白表)

        3.6 應(yīng)用

        我們將上述實驗設(shè)計的內(nèi)容作為我校2010級和2011級研究生課程“高等生物分離工程”的實驗部分,選課學(xué)生包括“化學(xué)工程與技術(shù)”學(xué)科及“生物學(xué)”學(xué)科的100多位碩士研究生(含少量博士生),加深了學(xué)生對現(xiàn)代生物分離工程系統(tǒng)性、工程性的認(rèn)識,取得了預(yù)期的訓(xùn)練效果。

        4 結(jié)束語

        通過生物分離工程綜合性實驗的設(shè)計和在我校2010級和2011級相關(guān)專業(yè)研究生的具體實踐,達到了我們的預(yù)期目標(biāo),同時在實踐中也對具體的實驗過程進行了完善。這項工作的進一步改進,將會更加有利于生物工程類研究生(含本科生)的教育教學(xué)。

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