生物多樣性是生物及其與環(huán)境形成的生態(tài)復(fù)合體以及與此相關(guān)的各種生態(tài)過程的總和，包括動物、植物、微生物和它們所擁有的基因以及它們與其生存環(huán)境形成的復(fù)雜生態(tài)系統(tǒng)。

云南，地處全球3個生物多樣性熱點(diǎn)（喜馬拉雅山、中國西南山區(qū)和印緬區(qū)域）的交匯區(qū)域，因其特殊的地理環(huán)境，是全球生物多樣性最豐富的地區(qū)之一，被譽(yù)為“生物基因?qū)殠臁焙汀皠又参锿鯂?。云南省擁有全?5%以上的生態(tài)系統(tǒng)和50%以上的動植物種類，集中了從熱帶、亞熱帶至溫帶甚至寒帶的多數(shù)植物種類。在全國3萬多種植物種類中，云南有1.7萬多種，占全國總數(shù)的52.8%。已知陸生野生脊椎動物1416種，國家重點(diǎn)保護(hù)野生動物222種，占全國重點(diǎn)保護(hù)野生動物種數(shù)的55.4%。

大自然的慷慨饋贈是云南的瑰寶，更是中華民族和全人類的財富，但是持續(xù)4年的特大干旱給云南生物多樣性帶來了沉重的打擊。有報告顯示，自2009年以來，受干旱影響的野生植物有7594096株，野生動物18774頭（只）。其中，受干旱影響的主要保護(hù)對象旗艦種和極小種群野生植物為4416970株。在國家重點(diǎn)保護(hù)的野生動植物中，受影響的野生植物為157223株，死亡2725株，野生動物出現(xiàn)生病等異常情況的232頭（只），死亡34頭（只）。昭通市巧家縣五針?biāo)商烊恢仓瓿霈F(xiàn)不同程度的針葉卷曲、發(fā)黃，新梢生長緩慢等明顯的干旱特征，死亡5株；分布于昭通市三江口自然保護(hù)區(qū)的珙桐死亡700株；蒼山洱海國家自然保護(hù)區(qū)600株紅豆杉死亡；云南南滾河國家級自然保護(hù)區(qū)水鹿死亡2頭，居群減少；昭通大山包國家級自然保護(hù)區(qū)農(nóng)田、濕地受災(zāi)范圍大，影響黑頸鶴的棲息和生存，黑頸鶴死亡11只。

位于滇東北的昭通市、曲靖市是這次旱災(zāi)的重災(zāi)區(qū)，同時也是黑頸鶴的重要棲息地。據(jù)了解，大山包黑頸鶴保護(hù)區(qū)內(nèi)濕地急劇萎縮，魚類也因?yàn)樗俣罅克劳?，而以高原魚為主要食物的黑頸鶴，也面臨著食物短缺的困境。當(dāng)?shù)厝罕姼嬖V記者，黑頸鶴往年通常在3月底4月初才會離開，今年則提早了一個月飛走。

干旱甚至影響到野生動物的生活習(xí)性。今年2月初，西雙版納境內(nèi)10余頭亞洲象鉆出密林，先后進(jìn)入三岔河谷中飲水、尋找食物。相比往年，象群提前了半個多月下山覓食。普洱市瀾滄縣糯扎渡鎮(zhèn)勐礦村下勐礦組周邊的亞洲象，因水源短缺到瀾滄江邊1個多月未返回森林，給當(dāng)?shù)卮迕竦纳敭a(chǎn)帶來威脅，而亞洲象在民間覓食的主要原因就是它的主要食物巨龍竹因干旱而不同程度的死亡。長期過著遷移生活的亞洲象因干旱可能較長時間在一個地方停留，使得常規(guī)的遷移生活發(fā)生改變；由于食物的短缺，哈巴雪山保護(hù)區(qū)100多只獼猴下山偷吃播種到地里的包谷籽，致使猴群對農(nóng)田的肇事案件不斷攀升……

干旱影響植物的發(fā)育和物候條件，進(jìn)而影響動物的食物來源，植物生物多樣性和動物生物多樣性都可能因此而受到?jīng)_擊。干旱導(dǎo)致云南很多野生植物開花數(shù)量明顯減少，種子庫的數(shù)量和質(zhì)量勢必因此而降低，從而影響未來植物種群或群落的動態(tài)；很多動物以植物的嫩葉、花、果實(shí)或種子、地下根或地下莖為食，干旱導(dǎo)致植物難以正常發(fā)育，從而提供給動物的食物數(shù)量和質(zhì)量將難以滿足，嚴(yán)重影響動物的生長發(fā)育。有的動物可能因缺乏有效的食物來源而死亡。如果有的物種以極小種群形式存在，嚴(yán)重的干旱將可能因此導(dǎo)致該類物種的滅絕。

干旱往往使植物群落生產(chǎn)力下降，生態(tài)系統(tǒng)結(jié)構(gòu)和層次簡單化發(fā)展，生態(tài)系統(tǒng)功能因此而降低，從而承載生物多樣性的基礎(chǔ)條件受到基礎(chǔ)性干擾，生物多樣性降低。很多植物因干旱高溫?zé)o法完成春化過程而難以成花。這些生物行為的變化本身就是生物多樣性受到改變的一種方式。

干旱為有害生物的入侵和擴(kuò)展提供了條件。很多外來入侵生物，如紫莖澤蘭、飛機(jī)草等外來入侵植物，在風(fēng)干物燥的情況下容易長距離傳播種子，擴(kuò)大了它的入侵范圍；某些有害昆蟲，抵抗干旱能力強(qiáng)，進(jìn)而在干旱條件下更容易大規(guī)模暴發(fā)。

干旱增大了水體的蒸發(fā)，水體中的污染物濃度將可能增大，高原湖泊流域的污染程度將進(jìn)一步加強(qiáng)，并將在雨季時集中遷移到湖泊，進(jìn)而惡化了河流或湖泊的污染狀況，為久治不愈的湖泊整治、生態(tài)系統(tǒng)功能恢復(fù)重建帶來了新的挑戰(zhàn)。高原湖泊富營養(yǎng)化程度加劇，有害藍(lán)藻更容易發(fā)展或暴發(fā)；水環(huán)境惡化，也將直接導(dǎo)致區(qū)域生物多樣性的降低。

干旱對云南生物多樣性產(chǎn)生的影響是持久的，并且在短期內(nèi)很難得到恢復(fù)。旱情導(dǎo)致國家重點(diǎn)保護(hù)植物有23種約10萬株死亡，許多珍稀瀕危野生植物植株變?nèi)?，很難在短期內(nèi)恢復(fù)。野生動物尤其是水禽和兩棲類數(shù)量減少、行為活動異常，干擾了正常生存繁衍，造成部分野生動物種群數(shù)量下降，使部分國家重點(diǎn)保護(hù)野生動植物的遺傳多樣性喪失，增加了物種的滅絕風(fēng)險；旱災(zāi)造成生態(tài)系統(tǒng)和生物多樣性結(jié)構(gòu)改變。專家在調(diào)查中發(fā)現(xiàn)，比如暖性石灰?guī)r灌叢、竹林、干熱灌叢、亞高山草甸、湖泊水生植被等出現(xiàn)枯萎死亡，同時物種抗干旱能力的程度不同，物種之間的共生關(guān)系被破壞，這就會改變現(xiàn)有的生態(tài)系統(tǒng)和生物多樣性的組成結(jié)構(gòu)。