劉靜,胡玲,王海英,趙遵田
(山東師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,山東 濟(jì)南 250014)
地衣(Iichens)是真菌和藻類的共生復(fù)合體,地衣內(nèi)生菌可產(chǎn)生對多種病原菌具抑制活性的次生代謝產(chǎn)物,因此,許多地衣學(xué)家期望能通過人工培養(yǎng)手段盡快獲得足夠生物量的地衣內(nèi)生菌及其代謝產(chǎn)物,為研究其活性及化學(xué)特性提供豐富的原材料。目前,幾乎都是通過Yamamoto法[1]分離地衣內(nèi)生菌,然而該方法污染率非常高,因此,我們采用刮皮層挑取菌絲的新方法以較高效地獲得目標(biāo)內(nèi)生菌[2]。
對浙江省清涼峰10m×10m樣方采集的地衣體標(biāo)本進(jìn)行分離培養(yǎng),得到的55株地衣內(nèi)生菌進(jìn)行ITS序列和28S序列的分子鑒定,并通過GenBank數(shù)據(jù)庫搜索,ClastalX 2.11多重序列比對以及MEGA 5.0最小進(jìn)化法(ME)構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹[3],得知該地區(qū)地衣內(nèi)生菌的物種多樣性[4]。
該研究對55株地衣內(nèi)生菌的次生代謝產(chǎn)物進(jìn)行活性初篩,利用濾紙片法[5]檢測其次生代謝產(chǎn)物的抗細(xì)菌、真菌活性。結(jié)果表明,其代謝產(chǎn)物具較強(qiáng)的抗細(xì)菌、白色念珠菌的生物活性,具抑菌活性的菌株占所測總菌株的14.55%。地衣內(nèi)生菌產(chǎn)生的各種活性物質(zhì)在生物制藥、農(nóng)業(yè)生產(chǎn)、工業(yè)發(fā)酵等方面都表現(xiàn)出很好的應(yīng)用前景[6],受到世界各國專家的廣泛關(guān)注。
從分離培養(yǎng)的82株地衣內(nèi)生菌中選取菌落的形態(tài)、顏色差異較大的55株作為受試菌株。
對55株受試菌株進(jìn)行ITS序列和28S序列測定[7]。
1.2.1 地衣內(nèi)生菌的分子鑒定
采用CTAB法[8]提取內(nèi)生菌總DNA,然后進(jìn)行ITS序列和28S序列的擴(kuò)增,ITS序列所用引物為E9:5′-TTGTACACACCGCCCGT-3′;CL2R:5′-TTTCTTTTCCTCCGCT TTATTGA-3′,28S 序 列 所 用 引 物 為 L1:5′-ACCCGCTGAACTTAAGCATA-3′;CL6R:5′-TGCTACTACCACCAAGATC-3′。擴(kuò)增條件[9]為:95℃ 預(yù)變性3 min,94℃變性30 s;52℃復(fù)性30 s,72℃延伸30 s,共37個循環(huán),72℃后延伸10min,4℃保存。擴(kuò)增的PCR產(chǎn)物進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳檢測之后進(jìn)行測序。
1.2.2 地衣內(nèi)生菌的活性初篩
1.2.2.1 培養(yǎng)基[10-12]
(1)PDA培養(yǎng)基:馬鈴薯200 g、葡萄糖20 g、瓊脂18 g、去離子水1000mL、pH值7.0;
(2)LB 培養(yǎng)基:蛋白胨10 g、酵母膏5 g、NaCl 10 g、去離子水1000mL、pH 值7.4。
1.2.2.2 拮抗實驗菌株
(1)供試細(xì)菌:大腸桿菌(Escherichia coli DH5αi)、金黃色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)、枯草芽孢桿菌(Bacillus subtilis)、鰻弧菌(Vibrio anguillarum);
(2)供試真菌:白色念珠菌(Monilia albican)。
1.2.2.3 抗生素
氨芐青霉素(Ampicillin)、鹽酸四環(huán)素(Tetracycline hydrochloride)。
1.2.2.4 內(nèi)生真菌發(fā)酵及代謝產(chǎn)物的提取
分離到的地衣內(nèi)生菌斜面培養(yǎng)物經(jīng)活化后分別接種至200mL PDA發(fā)酵培養(yǎng)基中,22℃搖床上以110 r/min的轉(zhuǎn)速培養(yǎng)21 d,發(fā)酵結(jié)束后將發(fā)酵物用乙醇超聲30min后浸泡抽提1 d,旋蒸后的浸膏用乙酸乙酯萃取1 d,用2 mL甲醇將旋蒸干后的粗提物0.5 g溶解,配成0.25 g/mL的濃縮液[13]。
1.2.2.5 內(nèi)生真菌代謝物抗細(xì)菌、抗真菌活性檢測
采用濾紙片法進(jìn)行抗菌活性檢測:活化后的細(xì)菌培養(yǎng)液用無菌水稀釋成105 cfu/mL的菌懸液[14],取0.1mL菌懸液涂布于LB平板上。將無菌小濾紙片(直徑為6 mm,高溫蒸汽殺菌后烘干)浸泡在濃度為10mg/mL粗提液中約30min,瀝干貼于含菌平板上,以浸有0.1 mg/mL氨芐青霉素的濾紙片為陽性對照,以浸有甲醇的濾紙片為陰性對照,37℃培養(yǎng)24 h,觀察抑菌圈的大小及有無。吸取200 μL白色念珠菌的稀釋液(105cfu/mL)涂布于PDA平板上,28℃培養(yǎng)48 h,其余均與細(xì)菌相同,并用空白濾紙片吸取甲醇溶液作為陰性對照;用浸泡過鹽酸四環(huán)素的濾紙片晾干后貼于平板上作為陽性對照,用十字交叉法測量抑菌圈直徑,設(shè)置3個重復(fù)。
對獲得的ITS序列和28S序列通過GenBank數(shù)據(jù)庫搜索,ClastalX 2.11多重序列比對以及MEGA 5.0最小進(jìn)化法(ME)構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹,得到所有菌株的分類學(xué)地位如下:3個綱:即 Dothideomycetes、Tremellomycetes、Elaphocordyceps;6 個目:Pleosporales、Hypocreales、Chaetothyriales 、Myriangiales、Dothideales、Capnodiales;10 個 科:Nectriaceae、Herpotrichiellaceae、Teratosphaeriaceae、Massarinaceae、Pleosporaceae、Capnodiaceae、Montagnulaceae、Bionectriaceae、Xylariaceae、Dothideomycetes。
受試菌株中有4株抗白色念珠菌的活性很強(qiáng),抑菌圈的最大直徑達(dá)到3.0 cm,另外還有5株具較好的抗細(xì)菌活性,抑菌圈直徑達(dá)到2.0 cm左右,菌株4734a的抗細(xì)菌和白色念珠菌活性都較強(qiáng)(見圖1)。所有菌株對金黃色葡萄球菌均無明顯抑制作用,抑菌活性較好的菌株數(shù)共8株,占總菌株的14.55%。8株地衣內(nèi)生菌的抑菌活性照片見圖1~3,抑菌效果見表1。
表1 8株地衣內(nèi)生菌次生代謝產(chǎn)物的抑菌效果Table 1 Antimicrobial effect of secondary metabolites of eight endolichenic fungi
通過GenBank的相似性搜索和系統(tǒng)發(fā)育分析,確定了浙江省清涼峰該實驗樣方內(nèi)地衣內(nèi)生菌均屬于子囊菌門。Hartmann等[15]的研究表明,利用多樣性指數(shù)分析復(fù)雜微生物群落結(jié)構(gòu)是非常有利的。本文采用Shannon-Weiner指數(shù) (H′)=來描述地衣內(nèi)生菌的物種多樣性,得出該樣方總的內(nèi)生菌群落生物多樣性指數(shù)為1.44,均勻度為0.25。數(shù)據(jù)分析顯示,該實驗樣方內(nèi)的地衣內(nèi)生菌群落顯示出了較豐富的生物多樣性(1.44),且通過GenBank的相似性搜索得知該內(nèi)生菌菌群多為未知菌群,充分地顯示了該地衣內(nèi)生菌是一個非常獨(dú)特的微生物新類群,對該地區(qū)生態(tài)系統(tǒng)的群落研究具有一定的價值和意義。
抗菌活性研究結(jié)果顯示,該樣方內(nèi)地衣內(nèi)生菌的抗菌活性菌株占總菌株數(shù)的14.55%,且抗菌活性較強(qiáng)。本實驗只是初步定性地研究了清涼峰的地衣內(nèi)生菌次生代謝產(chǎn)物的抗細(xì)菌、真菌活性,對其抗菌活性的定量研究需要做進(jìn)一步的分析,同時也應(yīng)該研究其抵抗植物病原菌、抗腫瘤、抗病毒以及抗氧化能力,并通過化學(xué)的方法將活性較強(qiáng)的單體化合物分離提取出來[16]。總之,作為一種新型的植物研究資源,地衣內(nèi)生菌的深入研究對新藥的開發(fā)具有潛在的應(yīng)用價值,為人們尋找各種具有較強(qiáng)生物活性的先導(dǎo)化合物開辟了新途徑,從而可以使某些珍稀但瀕臨滅絕的高等藥用植物得到進(jìn)一步的保護(hù)。
[1]YAMAMOTO Y,MIZUGUCHI R,YAMADA Y.Tissue cultures of Usnea rubescens and Tamalina yasudae and production of usnic acid in their cultures[J].AgricBiol Chem,1985,49(11):3347 -3348.
[2]邱振魯,王海英,趙遵田.地衣共生菌分離培養(yǎng)的新方法[J].山東科學(xué),2011,24(2):14-20.
[3]李銘,王海英,趙遵田.石耳目地衣內(nèi)生菌的系統(tǒng)發(fā)育學(xué)分析[J].山東科學(xué),2011,24(1):33-35.
[4]PETRINIA O,F(xiàn)ISHER P J.A comparative study of fungal endophytes in xylem and whole stem of Pinus sylvestris and Fagus sylvatica[J].British Mycological society,1988,91(2):233 -238.
[5]張佳,王瑩,張峰,等.濾紙片法測定黃花蒿提取物對霉菌的抑制活性[J].湖北農(nóng)業(yè)科學(xué),2009,48(5):1153-1154.
[6]邱觀榮.紫杉醇植物內(nèi)生真菌來源及其生物多樣性[J].國外醫(yī)藥:抗生素分冊,1998,19(4):265-266.
[7]GUO L D,HUANG G R,WANG Y,et al.Molecular identification of white morphotype strains of endophytic fungi from Pinus tabulaeformi[J].Mycological Research,2003,107(6):680 -688.
[8]黃貴修,TAKAYAMA Y,KELEMU S.臂形草內(nèi)生菌特異DNA片段的克隆及其分子鑒定[J].熱帶作物學(xué)報,2002,23(4):58-61.
[9]苗翠蘋,胡娟,翟英哲,等.滇牡丹內(nèi)生真菌PR20的鑒定及次生代謝產(chǎn)物的研究[J].天然產(chǎn)物研究與開發(fā),2012,24(10):1339-1342.
[10]郭建新,張光宇,張榮,等.銀杏內(nèi)生真菌抗真菌活性菌株的分離和篩選[J].西北農(nóng)業(yè)學(xué)報,2005,14(4):14-17.
[11]鄭毅,陳有為,張傳會,等.木本曼陀羅內(nèi)生真菌抗菌活性的研究[J].菌物研究,2007,6(2):101-108.
[12]杜希萍,趙保兵,鄭忠輝,等.紅樹內(nèi)生真菌BYY-1中的一個酚類化合物的分離鑒定與抗腫瘤活性[J].集美大學(xué)學(xué)報,2011,16(6):424 -428.
[13]劉新利,鞠培殿,婁紅祥.粘球菌產(chǎn)生的活性天然產(chǎn)物[J].國際藥學(xué)研究雜志,2010,37(2):98-104.
[14]張秀娟,陳彤彤,宋曉研,等.絨毛白蠟果實提取物的抑菌作用研究[J].西北植物學(xué)報,2009,29(4):0824-0829.
[15]HARTMANN M,WINDMER F.Community structure analyses are more sensitive to differences in soil bacterial communities than anonymous diversity indices[J].Appl Environ Microbiol,2006,72(12):7804 -7812.
[16]YUAN C,ZHANG X J,DU Y D,et al.Antibacterial compounds and other constituents of Evernia divaricata(L.)Ach[J].J Chem Soc Pak,2010,32(2)189-193.