1 引言

基于質(zhì)譜的蛋白質(zhì)組學(xué)的快速進(jìn)展不僅體現(xiàn)在各種技術(shù)和分析軟件的進(jìn)步，也反映在其不斷地參與解決深層次的生物學(xué)問題，例如蛋白質(zhì)的絕對(duì)和相對(duì)定量、蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)和在整體水平上參與研究各種分子生物學(xué)解毒機(jī)制中的相關(guān)蛋白等＼[1～6＼]。盡管如此，蛋白質(zhì)的鑒定仍是上述研究的基礎(chǔ)，生物信息學(xué)仍然是組學(xué)研究中的瓶頸問題之一＼[7，8＼]。隨著大規(guī)?；蚪M測(cè)序技術(shù)的出現(xiàn)，越來越多生物的基因組被測(cè)序，因此，數(shù)據(jù)庫搜索，即利用串聯(lián)質(zhì)譜數(shù)據(jù)匹配現(xiàn)有的蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫并依據(jù)結(jié)果打分是目前最主要的蛋白質(zhì)鑒定方式，而從頭測(cè)序算法則是直接利用串聯(lián)質(zhì)譜數(shù)據(jù)推導(dǎo)肽段和蛋白結(jié)構(gòu)，適用于分析新物種或者基因組未測(cè)序生物。