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        轉(zhuǎn)基因檢測技術(shù):從一片空白到國際立足
        ——記上海交通大學(xué)、上海出入境檢驗檢疫局聯(lián)合團隊的十年攻關(guān)

        2013-04-11 03:25:22
        世界科學(xué) 2013年9期
        關(guān)鍵詞:項目組轉(zhuǎn)基因標準

        本刊記者/李 輝

        轉(zhuǎn)基因檢測技術(shù):從一片空白到國際立足
        ——記上海交通大學(xué)、上海出入境檢驗檢疫局聯(lián)合團隊的十年攻關(guān)

        本刊記者/李 輝

        本期項目:水稻、玉米、油菜轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品內(nèi)標準檢測方法及標準化

        所獲獎項:2012年度上海市科技進步獎一等獎

        完成單位:上海交通大學(xué)、上海出入境檢驗檢疫局

        近些年來,公眾對于轉(zhuǎn)基因食品安全的關(guān)注度日益增高。作為種植和進口轉(zhuǎn)基因農(nóng)產(chǎn)品的大國,如何更好地從技術(shù)層面對該類產(chǎn)品進行把關(guān),是我們國家必須直面和應(yīng)對的問題。

        上海交通大學(xué)張大兵教授與上海出入境檢驗檢疫局潘良文研究員的聯(lián)合團隊,經(jīng)過十余年的持續(xù)攻關(guān),建立了一套針對水稻、玉米、油菜等轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品的內(nèi)標準基因檢測方法,這套方法被國際標準化組織(ISO)采納從而上升為國際標準。他們還建立了其他一系列轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品檢測的新方法,建立了國際上首個轉(zhuǎn)基因生物安全檢測數(shù)據(jù)庫。這些工作,為我國的轉(zhuǎn)基因檢測實踐奠定了堅實的基礎(chǔ)。也正是這些工作,為他們贏得了上海市2012年度科技進步獎一等獎的榮譽。

        十多年前,國內(nèi)轉(zhuǎn)基因檢測幾乎空白

        張大兵教授與潘良文研究員團隊的工作,要從十余年前說起,當時轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品受關(guān)注的程度還不是很高。直接推動我們國家開始重視轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品檢測工作的事件,是113個國家于2000年1月在加拿大簽署了聯(lián)合國《生物安全協(xié)定書》。協(xié)定書中明確規(guī)定,消費者對轉(zhuǎn)基因食品擁有知情權(quán)。

        中國是簽署國之一。加拿大會議之后,國務(wù)院有關(guān)領(lǐng)導(dǎo)十分重視,要求科研工作者加強對轉(zhuǎn)基因生物技術(shù)標準的研究。在上海,市科委迅速做出了響應(yīng),向社會發(fā)布了轉(zhuǎn)基因檢測技術(shù)的項目申請指南。

        張大兵與潘良文兩支團隊的合作,即從這一次的項目聯(lián)合申請開始。在此之前,他們兩人只是因為共同的轉(zhuǎn)基因研究興趣,在一次學(xué)術(shù)會議上認識并互相欣賞。

        當時,國內(nèi)還沒有成熟的針對轉(zhuǎn)基因農(nóng)產(chǎn)品的定性、定量檢測技術(shù),更沒有相關(guān)國家或行業(yè)技術(shù)標準。在基本空白的基礎(chǔ)上,經(jīng)過三年的研究,他們?nèi)〉昧艘幌盗械拈_創(chuàng)性成果,并且獲得了2004年度上海市科技進步獎一等獎的認可。

        在此之后,他們的合作團隊針對轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品的檢測更加深入,從針對幾種產(chǎn)品延展為針對更廣范圍的產(chǎn)品,從初步的定性定量方法走向了更成熟全面、上升為國家標準乃至國際標準的方法。

        是不是?有多少?

        轉(zhuǎn)基因檢測事實上主要圍繞定性和定量這兩個“知情權(quán)”的核心問題展開。“定性”——是不是轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品,“定量”——含什么成分的轉(zhuǎn)基因以及含量多少。由于各個國家對轉(zhuǎn)基因的態(tài)度不同,對定性和定量的定義也有所不同。

        比如對轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品一直持開放態(tài)度的美國,就不要求商家對轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品必須標識。而歐洲和亞洲一些國家,則持不同程度的謹慎態(tài)度。

        歐洲議會于1997年通過的 《新食品規(guī)程》決議,規(guī)定歐盟成員國上市的任何轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品必須貼上轉(zhuǎn)基因標簽。2001年11月,歐盟修改了轉(zhuǎn)基因食品法規(guī),規(guī)定凡含有0.9%以上轉(zhuǎn)基因DNA或蛋白質(zhì)的農(nóng)作物或食品必須進行標識。

        在亞洲,韓國政府從2001年開始,以3%為界限實施標簽制度。日本在2001年實行1%標簽制度。中國政府則規(guī)定只要含有轉(zhuǎn)基因成分,一律需要標識。

        內(nèi)標準基因檢測方法,從提出到完善

        張大兵和潘良文團隊這次獲獎的內(nèi)容,集中于他們針對水稻、玉米、油菜轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品的內(nèi)標準基因檢測方法的研究成果。

        轉(zhuǎn)基因的檢測方法其實可以從轉(zhuǎn)基因的基本原理說起。如所周知,所謂“轉(zhuǎn)”基因,是將人工分離和修飾過的基因?qū)氲缴矬w基因組中。那么也就是說,對一種產(chǎn)品是否是轉(zhuǎn)基因的檢測,關(guān)鍵在于在它的成分中有否檢出外源基因。

        人們對轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品中轉(zhuǎn)基因成分的檢測,主要分兩個步驟:提取出產(chǎn)品的DNA,然后再用一種生物化學(xué)反應(yīng)來檢測其中的轉(zhuǎn)基因成分。在第二個步驟中,現(xiàn)在檢驗部門一般采用的是聚合酶鏈式反應(yīng)(PCR)。

        但在提取產(chǎn)品DNA的過程中,如果提取被檢測產(chǎn)品的DNA沒有成功,或者是提取DNA中有PCR反應(yīng)的抑制物質(zhì),那么在PCR檢測時,就檢測不出轉(zhuǎn)基因成分。顯然,這并不能說明被檢產(chǎn)品中沒有轉(zhuǎn)基因成分。

        一定要規(guī)避這種情況的出現(xiàn)。這也正是內(nèi)標準基因檢測法的一個特點所在。

        所謂內(nèi)標準基因,是指具有物種特異性、拷貝數(shù)恒定、不顯示等位基因變化的保守DNA序列。也就是說,內(nèi)標準基因是物種間區(qū)別的遺傳標志——某一物種內(nèi)的不同品種均含有該內(nèi)標準基因的特異性片段,但其他物種卻不含有該片段。再簡單來說,如果從一個樣品的DNA中檢測到了水稻的內(nèi)標準基因,那么這一樣品必然含有水稻的DNA。

        有了內(nèi)標準基因?qū)NA的檢測,對外源基因PCR檢測的準確性就有了保證。但難點在于,迄今為止雖然許多物種已開發(fā)出內(nèi)標準基因,但是水稻、番茄、油菜、番木瓜等常見產(chǎn)品的內(nèi)標準基因開發(fā)工作之前做的并不多。

        在過去的十余年研究中,項目組通過大量研究,系統(tǒng)地建立了適合于主要轉(zhuǎn)基因作物的內(nèi)標準基因檢測系統(tǒng),如水稻SPS、油菜HMGI/Y、棉花SadI、番茄LAT52和番木瓜Chy基因等。項目組依據(jù)這些內(nèi)標準基因,建立了結(jié)合PCR技術(shù)的一整套轉(zhuǎn)基因檢測體系。

        這些工作,是項目組獲得上海市2012年度科學(xué)技術(shù)進步獎一等獎的重要組成部分。值得祝賀的是,在2012年到2013年這段時間里,他們的工作又進一步獲得了ISO的認可。

        2013年,ISO正式公布了新版的ISO21569和ISO21570標準,分別增加了用于轉(zhuǎn)基因水稻和番茄內(nèi)標準基因的定性和定量檢測的普通PCR檢測方法和實時熒光PCR檢測方法。這些檢測方法正是由上海交通大學(xué)和上海出入境檢驗檢疫局的聯(lián)合團隊完成的。

        “轉(zhuǎn)基因檢測的國際標準,國內(nèi)之前沒有人搞過的,十年前在國際上也是一個新興領(lǐng)域?!迸肆嘉恼f,在國家質(zhì)檢部門工作的他,對標準有著天然的敏感性?!按蟾?004年的時候,我就想著是否我們也可以參與制定一些國際的轉(zhuǎn)基因檢測標準?!?004年,在經(jīng)得國家標委的推薦后,潘良文、張大兵先后加入了ISO轉(zhuǎn)基因標準制定工作組。

        一項國際標準的提案要成為國際標準,必須進行國際協(xié)同實驗驗證。在項目組內(nèi)部進行過多次比對試驗的基礎(chǔ)上,2004-2006年,項目組邀請了來自德國、加拿大、荷蘭、阿根廷、斯洛文尼亞等多個國家的國際知名檢測實驗室參加協(xié)同實驗驗證,并取得圓滿成功。這表明,上海團隊建立的內(nèi)標準基因檢測方法是可行的。

        2009年以來,上海項目組所提交的檢測方法順利通過了ISO組織的委員會內(nèi)部草案、委員會草案和國際標準草案的階段投票,最終在2013年由ISO宣布成為國際轉(zhuǎn)基因檢測標準方法。這標志著由我國在轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品領(lǐng)域所制定的檢測方法首次上升為ISO國際標準。

        方法標準化為什么重要

        每個國家對于轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品的種植和進口都有相應(yīng)的法規(guī)進行管理。

        但是爭議在所難免。同樣的產(chǎn)品在一家單位檢測有轉(zhuǎn)基因成分,在另外一個地方卻可能檢測沒有,或者檢測出的成分含量不一致。不同的檢測結(jié)果,除了各單位技術(shù)能力不同的原因,也與使用的方法不同有關(guān)。

        為了使不同國家、不同實驗室的檢測結(jié)果保持一致,保證轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品進出口貿(mào)易的安全有序,各方制定和使用的檢測方法就需要一致。這也正是標準方法的意義所在。

        2000年,歐盟成立了轉(zhuǎn)基因生物檢測網(wǎng)絡(luò)實驗室,專門負責(zé)農(nóng)業(yè)轉(zhuǎn)基因生物檢測方法的國際標準化工作。目前它由70多個執(zhí)行實驗室組成,分布在歐盟各成員國內(nèi)。

        2004年,張大兵教授作為發(fā)展中國家的第一位學(xué)者,應(yīng)邀參加歐盟轉(zhuǎn)基因生物檢測網(wǎng)絡(luò)實驗室的年會并作專題發(fā)言;2013年,歐盟轉(zhuǎn)基因生物檢測網(wǎng)絡(luò)實驗室又正式邀請張大兵教授代表中國,作為合作伙伴參與其技術(shù)網(wǎng)絡(luò)。

        方法的創(chuàng)新與數(shù)據(jù)的積累

        上海交通大學(xué)與上海出入境檢驗檢疫局是兩家不同性質(zhì)的單位。相對而言,后者更關(guān)注方法的標準化,而前者則更關(guān)注方法的創(chuàng)新。

        2010-2013年,上海交通大學(xué)課題組在經(jīng)過系統(tǒng)分析轉(zhuǎn)基因成分檢測的各個技術(shù)環(huán)節(jié)的基礎(chǔ)上,提出了一種加快檢測速度的可視化等溫檢測新方法。

        這種方法的優(yōu)點,是可以在1個小時之內(nèi),完成對轉(zhuǎn)基因玉米和大豆的DNA提取以及轉(zhuǎn)基因成分檢測。而按照過去的方法,這一過程要在實驗室經(jīng)歷一系列的耗時過程。這種方法的應(yīng)用,使針對轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品的現(xiàn)場測試、田間測試成為可能。

        由于轉(zhuǎn)基因的產(chǎn)品種類越來越多,對應(yīng)的檢測方法也趨于多樣化。所以,建設(shè)一個公共的平臺,對所有已知方法進行收集整理,也成為了項目組在開發(fā)新方法之外的追求目標。

        2008年,項目組開發(fā)了轉(zhuǎn)基因生物安全檢測數(shù)據(jù)庫(GMDD,gmdd.shgmo.org),將目前主要商業(yè)化應(yīng)用的轉(zhuǎn)基因生物進行了整理和收集,特別是涵蓋了外源基因序列和檢測方法兩方面重要的數(shù)據(jù)。

        這兩種數(shù)據(jù)都是檢測所必需的,但由于國外研發(fā)者一般不愿意公開其開發(fā)的轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品的外源基因序列和檢測方法,不同檢測單位往往不得不做同樣的檢測方法研究。有了公共平臺將這些成果呈現(xiàn)出來,重復(fù)性的研究工作就可以減少或者避免了。

        目前,項目組開發(fā)的數(shù)據(jù)庫一共涵蓋了180多個轉(zhuǎn)基因生物的轉(zhuǎn)基因信息,外源基因序列140多條,對應(yīng)的檢測方法500多套,標準物質(zhì)產(chǎn)品信息60多條。該數(shù)據(jù)的開發(fā)和開放得到了國際同行和多個期刊綜述的高度評價?!皵?shù)據(jù)庫自開放以來,每年的訪問量超過百萬次,訪問者主要是來自歐、美等國家的同行專家和實驗室?!表椖拷M的骨干成員楊立桃博士如是說。

        “隨著新的轉(zhuǎn)基因植物的出現(xiàn),將會有越來越多的不同植物的基因被選擇作為應(yīng)用于轉(zhuǎn)基因生物遺傳改良。這也需要不斷研究新的檢測方法,以滿足消費者對于轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品的知情權(quán)和選擇權(quán)?!睆埓蟊淌谠谝淮谓邮懿稍L時這樣說。很顯然,還有更多的工作在等待項目組完成。

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