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        基于C-V 主動(dòng)輪廓模型的“陡峭”邊界的微藻圖像分割

        2013-02-15 08:01:00張麗梅張紅羅鐘鉉董云影
        關(guān)鍵詞:微藻輪廓邊界

        張麗梅,張紅,羅鐘鉉,董云影

        (1.大連海洋大學(xué) 理學(xué)院,遼寧 大連116023;2.遼寧省海洋生物資源恢復(fù)與生境修復(fù)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,遼寧 大連116023;3.大連理工大學(xué) 軟件學(xué)院,遼寧 大連116620)

        將圖像處理技術(shù)應(yīng)用到漁業(yè)資源研究中是漁業(yè)資源信息處理的重要技術(shù)手段之一,如郭常有等[1]、郭顯久等[2]分別用圖像處理技術(shù)進(jìn)行了扇貝尺寸和海洋微藻計(jì)數(shù)的研究。海洋中大量繁殖的藻類(lèi)生物,不僅具有重要的經(jīng)濟(jì)價(jià)值,也是影響海洋環(huán)境的重要因素,由于其種類(lèi)多、數(shù)量大、單體體積小、形狀復(fù)雜又大量聚集,即使采用現(xiàn)代技術(shù)手段也難以辨識(shí)。在顯微鏡下,海洋微藻圖像呈現(xiàn)出明暗相間、邊界模糊的現(xiàn)象,再加上不可避免的水滴影響,利用通常使用的圖像邊界獲取方法容易導(dǎo)致邊界不連貫、紋理過(guò)增的現(xiàn)象。而通常的邊界獲取方法保留了太多圖像中個(gè)體的獨(dú)立特征且不封閉,也難以突出重點(diǎn)。為了得到簡(jiǎn)單而清晰的微藻主要邊界輪廓,作者曾嘗試使用幾何造型中的細(xì)分方法獲得圖像的邊界并取得了一定的成效[3-4]。細(xì)分方法是運(yùn)用曲線(xiàn)細(xì)分原理,對(duì)通過(guò)一定規(guī)則獲得的初始邊界點(diǎn)進(jìn)行有序連接形成初始邊界輪廓,將一定的細(xì)分規(guī)則作用于初始邊界輪廓,使產(chǎn)生的新的微藻邊界輪廓不斷細(xì)化,進(jìn)而得到光滑的主要圖像邊界。用這種方法可以只獲取需要的那部分圖像的封閉邊界輪廓,忽略不必要的細(xì)節(jié)信息,但由于細(xì)分方法自身的局限性,所獲得的邊界雖簡(jiǎn)潔但精準(zhǔn)度有欠缺,僅適用于粗線(xiàn)條的圖像分割。

        近年來(lái),基于偏微分方程的主動(dòng)輪廓模型在圖像處理中得到了廣泛的應(yīng)用[5-10],主動(dòng)輪廓模型的基本思路是把演化曲線(xiàn)(主動(dòng)輪廓)隱含地表示為一個(gè)更高一維的函數(shù)(水平集函數(shù))的零水平集,根據(jù)分割要求建立合適的偏微分方程,水平集在該偏微分方程(演化方程)的控制下進(jìn)行演化,直到零水平集演化到圖像的目標(biāo)邊界為止[10]。Chan等[11]提出一種簡(jiǎn)化的基于Mumford -Shah 模型的區(qū)域最優(yōu)化主動(dòng)輪廓模型(C -V 主動(dòng)輪廓模型),因其能較好地處理模糊邊界、目標(biāo)離散、紋理較多的圖像邊界而被廣泛應(yīng)用。本研究中,作者利用這種方法對(duì)微藻圖像進(jìn)行分割,并針對(duì)具有“陡峭”邊界的微藻圖像分割過(guò)程中所遇到的邊界難以獲取的問(wèn)題,對(duì)C- V 主動(dòng)輪廓模型進(jìn)行了改進(jìn),即以邊界曲線(xiàn)的變化趨勢(shì)為基準(zhǔn)構(gòu)造初始水平集,并通過(guò)符號(hào)函數(shù)區(qū)分初始的內(nèi)部、外部以及邊界,再按照原C -V 主動(dòng)輪廓模型的思路與方法進(jìn)行邊界搜索,快速、準(zhǔn)確地獲取圖像的“陡峭”邊界。將用兩種方法獲取典型的海洋微藻圖像邊界的過(guò)程進(jìn)行對(duì)比可知,改進(jìn)的C -V 主動(dòng)輪廓模型方法不僅提高了邊界獲取的效率,而且在初始邊界設(shè)定時(shí),使得操作員的主動(dòng)參與程度大大增強(qiáng),這為C-V 主動(dòng)輪廓模型的實(shí)際應(yīng)用提供了技術(shù)支撐。

        1 C-V 主動(dòng)輪廓模型[6]

        設(shè)定義域Ω 上的圖像u0(x,y)被閉合輪廓C 劃分為內(nèi)部和外部?jī)蓚€(gè)同質(zhì)區(qū)域,各區(qū)域的平均灰度分別為c1和c2。假定L(C)為輪廓C 的長(zhǎng)度,S(C)為C 所包圍區(qū)域的面積,各能量項(xiàng)的權(quán)重系數(shù)μ、ν、λ1、λ2滿(mǎn)足條件μ ≥0,ν ≥0,λ1、λ2>0。構(gòu)造如下能量函數(shù):該能量函數(shù)只有當(dāng)閉合曲線(xiàn)C 位于兩同質(zhì)區(qū)域的邊界時(shí)取得極小值。這種圖像邊界獲取方法利用了圖像的全局信息,故可以得到全局最優(yōu)分割。

        假定φ是根據(jù)閉合曲線(xiàn)C 構(gòu)造的水平集函數(shù),即滿(mǎn)足下式的函數(shù):

        Chan等[11]根據(jù)歐拉-拉格朗日方法推導(dǎo)出使式(1)極小化的水平集函數(shù)φ 應(yīng)滿(mǎn)足如下微分方程:

        在實(shí)際計(jì)算時(shí),Heaciside 函數(shù)和Dirac 函數(shù)分別取為

        其中,ε 為常數(shù)。

        在實(shí)際運(yùn)算時(shí),φ 需初始化為符號(hào)距離函數(shù),為了保持?jǐn)?shù)值的穩(wěn)定,每次更新后都要重新初始化,為此采用如下迭代方程:

        重新初始化可能導(dǎo)致零水平集位置發(fā)生偏轉(zhuǎn),因此,需保證對(duì)圖像區(qū)域內(nèi)的每一點(diǎn)用式(6)進(jìn)行的迭代結(jié)果都收斂。

        2 微藻圖像分割

        圖1 為實(shí)驗(yàn)室獲得的帶有雜質(zhì)的甲藻、夜光藻、底頂角藻、伏恩海毛藻、針形曲舟藻、舟形藻6種微藻顯微圖像。在使用C-V 主動(dòng)輪廓模型時(shí),將初始零水平集均設(shè)為靠近圖像中央部分的圓周,按照上節(jié)提出的方案進(jìn)行邊界收索,主要參數(shù)設(shè)置:δ=0.1,ε=2。執(zhí)行效果如下:圖1(a)、(b)在采用C-V 主動(dòng)輪廓模型收索邊界時(shí)速度較快,效果較好,結(jié)果見(jiàn)圖2。圖2(a)、(c)分別為甲藻和夜光藻圖像及其初始零水平集,圖2(b)、(d)分別為甲藻和夜光藻圖像及其按C -V主動(dòng)輪廓模型收索到的邊界。因?yàn)閳D像主要邊界呈圓形,曲率穩(wěn)定,所以獲得邊界的效果均較好。

        將上述方法用于圖像邊界曲率變化較大的微藻圖像時(shí),獲得邊界的時(shí)間驟增。圖3 為按照C -V主動(dòng)輪廓模型收索圖1(c)底頂角藻邊界的過(guò)程,每循環(huán)50次取一次圖像,每次循環(huán)的時(shí)間按遞進(jìn)增長(zhǎng),循環(huán)次數(shù)越多,反應(yīng)越慢,總耗時(shí)約1 min(在聯(lián)想PC 機(jī)上運(yùn)行)。圖4 為按C -V 主動(dòng)輪廓模型收索圖1(d)伏恩海毛藻邊界的過(guò)程,經(jīng)過(guò)近5 000次循環(huán)收索,幾乎無(wú)法獲得邊界。分析上述問(wèn)題得出如下規(guī)律:當(dāng)微藻圖像的主要邊界接近圓形時(shí),即邊界曲率接近常數(shù)時(shí),采用通常使用的C-V 主動(dòng)輪廓模型比較容易獲得邊界;反之,當(dāng)微藻圖像邊界曲率變化較大,屬于“陡峭”邊界時(shí),初始水平集設(shè)定為圓周的C -V 主動(dòng)輪廓模型方法難以獲得邊界(圖4),即使可獲得邊界,也需要較長(zhǎng)的時(shí)間(圖3)。

        圖1 帶有雜質(zhì)的微藻顯微圖像Fig.1 Microscopic images of micro algae with some impurities

        圖2 用C-V 主動(dòng)輪廓模型獲取甲藻(a)和夜光藻(c)的邊界Fig.2 The boundaries of the microalgae Pyrrophyta(a)and Noctiluca scintillans(c)acted by CV active contour model

        從圖2 ~圖4 的邊界獲取過(guò)程圖不難看出,當(dāng)采用C-V 主動(dòng)輪廓模型獲取邊界曲率穩(wěn)定的圖像邊界時(shí),將初始水平集設(shè)定為貼近邊界的圓周,獲取的圖像邊界連接性、簡(jiǎn)潔性均好(圖2);當(dāng)采用C-V 主動(dòng)輪廓模型對(duì)帶有“陡峭”邊界的微藻圖像進(jìn)行分割時(shí),邊界獲取速度慢(圖3),甚至難以獲得邊界(圖4)。分析原因,主要是初始水平集設(shè)定為圓周(或其他圖形)時(shí)未考慮到微藻圖像個(gè)體的邊界特點(diǎn),不能照顧到圖像邊界的個(gè)體差異性。為了克服C-V 主動(dòng)輪廓模型在遇到復(fù)雜微藻圖像時(shí)邊界獲取時(shí)間過(guò)長(zhǎng)甚至難以獲取到復(fù)雜邊界的問(wèn)題,本研究中提出了改進(jìn)的C -V 主動(dòng)輪廓模型。

        圖3 用C-V 主動(dòng)輪廓模型獲取底頂角藻邊界的過(guò)程圖(從左向右)Fig.3 The processing images after Ceratium humile acted by C-V active contour model(from the left to the right)

        圖4 用C-V 主動(dòng)輪廓模型獲取伏恩海毛藻邊界的過(guò)程圖(從左向右)Fig.4 The processing images after Thalassiothrix longissima acted by C-V active contour model(from the left to the right)

        3 改進(jìn)的C-V 主動(dòng)輪廓模型

        C-V 主動(dòng)輪廓模型屬于全局最優(yōu)算法,在設(shè)定初始閉合曲線(xiàn)時(shí)通常采用圖像區(qū)域內(nèi)的圓周,這樣會(huì)帶來(lái)一些問(wèn)題:1)當(dāng)初始閉合曲線(xiàn)設(shè)定為靠近邊界的圓周時(shí),對(duì)于邊界接近圓周的圖像能夠較快獲得邊界,但對(duì)邊界復(fù)雜如有較大“凹坑”或邊界曲率變化較大時(shí),獲取最終邊界的時(shí)間較長(zhǎng),原因主要是在遇到曲率變化較大的邊界時(shí)收縮到邊界的速度較為緩慢;2)Dirac 函數(shù)δε(z)狹窄的定義范圍,限制了該算法檢測(cè)圖像邊緣的全局性,對(duì)遠(yuǎn)離閉合曲線(xiàn)的“厚”目標(biāo)邊緣不能穩(wěn)定檢測(cè)[5];3)對(duì)于實(shí)際圖像邊緣檢測(cè),由于所監(jiān)測(cè)的圖像千差萬(wàn)別,簡(jiǎn)單設(shè)定初始閉合曲線(xiàn)為某圓周或其他圖形顯然是不合理的。如果能夠針對(duì)每一幅圖像的特點(diǎn)加入操作員自身的判斷,將更有利于對(duì)各種圖像進(jìn)行精確判斷,為此本研究中提出一種“所見(jiàn)即所得”的初始閉合曲線(xiàn)獲取方法。

        該方法的思路是,操作員用畫(huà)筆粗略描繪出所需精確給出的圖像邊緣輪廓,該邊緣輪廓信息被程序讀取后形成封閉曲線(xiàn)并視其為初始閉合曲線(xiàn)C。

        在這樣給定的初始閉合曲線(xiàn)C 上構(gòu)造滿(mǎn)足式(2)的水平集函數(shù)φ是比較困難的事情,在實(shí)際操作中可以將初始閉合曲線(xiàn)C 的內(nèi)外能量參數(shù)定義為符號(hào)函數(shù),即

        其中:p是圖像上的點(diǎn)。這樣定義的初始水平集函數(shù)在使用式(6)進(jìn)行迭代時(shí)加快了迭代的速度。

        算法的具體實(shí)現(xiàn)過(guò)程如下:

        1)讀入圖像,手動(dòng)取得確定的初始圖像邊界輪廓點(diǎn),程序順序連接這些圖像邊界輪廓點(diǎn)形成初始閉合曲線(xiàn)C;

        2)構(gòu)造水平集函數(shù)φ,使之滿(mǎn)足式(7);

        3)主要參數(shù)與改進(jìn)前相同,即在δ=0.1,ε=2 的條件下運(yùn)行改進(jìn)的C-V 主動(dòng)輪廓模型。

        4 改進(jìn)模型的實(shí)驗(yàn)結(jié)果

        采用改進(jìn)的C-V 主動(dòng)輪廓模型獲取微藻圖像邊界的實(shí)驗(yàn)過(guò)程如圖5 ~圖7。圖5(a)為手工按序點(diǎn)擊的底頂角藻邊界點(diǎn)連接成的初始邊界(初始零水平集),圖5(b)為圖5(a)經(jīng)過(guò)式(7)作用后的效果圖,圖5(c)為演化后得到的邊界曲線(xiàn),顯示速度快于圖3 中使用的方法,而且獲得的信息量大。

        伏恩海毛藻圖像邊界模糊,手工獲得邊界粗略圖也十分困難,為此擴(kuò)大了圖像邊界的初始設(shè)定區(qū)域。圖6(a)為手工按序點(diǎn)擊的邊界點(diǎn)連接成的初始邊界(初始零水平集),圖6(b)為圖6(a)經(jīng)過(guò)式(7)作用后的效果圖,圖6(c)~(f)為演化后得到的邊界過(guò)程圖,這個(gè)操作過(guò)程比圖5 獲取邊界的速度略慢,但得到的邊界效果很好。

        圖5 用改進(jìn)的C-V 主動(dòng)輪廓模型獲取底頂角藻邊界的過(guò)程圖Fig.5 The processing images after Ceratium humile acted by modified C-V active contour model

        圖6 用改進(jìn)的C-V 主動(dòng)輪廓模型獲取伏恩海毛藻邊界的過(guò)程圖Fig.6 The processing images after Thalassiothrix longissima acted by modified C-V active contour model

        為驗(yàn)證改進(jìn)的C -V 主動(dòng)輪廓模型的適用性,對(duì)針形曲舟藻和邊界雜亂的舟形藻分別進(jìn)行了邊界收索,同樣獲得較好的效果,結(jié)果見(jiàn)圖7。

        圖7 用改進(jìn)的C-V 主動(dòng)輪廓模型獲取針形曲舟藻和舟形藻邊界的過(guò)程圖Fig.7 The processing images after Pleursigma sp.acted and Navicula sp.by modified C-V active contour model

        采用改進(jìn)的C -V 主動(dòng)輪廓模型獲取邊界時(shí),只需先通過(guò)手動(dòng)獲得粗略邊界,粗略邊界盡量包含且貼近所關(guān)注區(qū)域的主輪廓,如圖5(a)、圖6(a)、圖7(a)。這樣做將使得最終邊界的獲得速度更快,效果更好,如圖5(c)、圖6(f)和圖7(c)所示。本實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,改進(jìn)的C-V 主動(dòng)輪廓模型算法增強(qiáng)了主動(dòng)獲取圖像邊界的能力,速度快,適用性強(qiáng)。

        致謝:本研究中使用的微藻圖像均由大連海洋大學(xué)劉海映教授的研究團(tuán)隊(duì)提供,在此表示感謝!

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