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        基于PCR技術(shù)的現(xiàn)代分子生物學(xué)操作在中藥鑒定中的應(yīng)用

        2013-02-01 15:56:14詹立平劉志梅
        中國醫(yī)藥導(dǎo)報(bào) 2013年7期
        關(guān)鍵詞:分子生物學(xué)藥用植物多態(tài)性

        詹立平 趙 鑫 劉志梅

        1.遼寧衛(wèi)生職業(yè)技術(shù)學(xué)院藥學(xué)系,遼寧沈陽 110101;2.遼寧林業(yè)職業(yè)技術(shù)學(xué)院高職教育研究所,遼寧沈陽 110101

        我國勞動人民幾千年來在與疾病作斗爭的過程中,通過實(shí)踐,逐漸積累了豐富的醫(yī)藥知識。千百年來,中藥在維系國人的身體健康方面發(fā)揮了不可替代的作用。中藥包括植物藥、動物藥和礦物藥,品種繁多,加之各地的用藥品種和用藥習(xí)慣不盡相同,同名異物和同物異名現(xiàn)象屢見不鮮。為規(guī)范藥材市場、鑒定中藥真?zhèn)蝺?yōu)劣,確保中藥的質(zhì)量與療效,建立一套準(zhǔn)確、簡捷、迅速的鑒定方法迫在眉睫。

        近年來分子生物學(xué)的發(fā)展突飛猛進(jìn),特別是聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)技術(shù)的問世,推動分子生物學(xué)的各個(gè)領(lǐng)域向縱深發(fā)展[1]。基于PCR技術(shù)的現(xiàn)代分子生物學(xué)操作在中藥鑒定中得到應(yīng)用,以其獨(dú)具的準(zhǔn)確性和可靠性,彌補(bǔ)了傳統(tǒng)中藥鑒定中的許多不足,展現(xiàn)出其他方法難以比擬的優(yōu)勢。

        本文以PCR技術(shù)為切入點(diǎn),著重介紹目前在中藥鑒定中運(yùn)用較多的幾種分子生物學(xué)操作技術(shù),希望能夠拋磚引玉,合眾人之力增加中藥鑒定中的現(xiàn)代元素,推動中藥鑒定方法的改進(jìn)與革新。

        1 PCR技術(shù)概述

        PCR技術(shù)由美國Karray等學(xué)者于1985年首創(chuàng), 并由美國Cetus公司開發(fā)研制。PCR技術(shù)原理是根據(jù)已知DNA片段序列,人工合成與該DNA 兩條鏈末端互補(bǔ)的寡核苷酸引物,在酶促作用下將待檢DNA 序列進(jìn)行體外擴(kuò)增。

        PCR 反應(yīng)體系基本成分包括模板DNA(待擴(kuò)增DNA)、引物、4 種脫氧核苷酸(dNTPs)、DNA 聚合酶和適宜的緩沖液。類似于DNA的體內(nèi)復(fù)制過程,PCR 反應(yīng)的特異性依賴于與靶序列兩端互補(bǔ)的寡核苷酸引物。

        PCR 由變性-退火-延伸三個(gè)基本反應(yīng)步驟構(gòu)成:①變性:模板DNA 經(jīng)加熱至93℃左右一定時(shí)間后,雙鏈DNA解離為單鏈;②退火:模板DNA 經(jīng)加熱變性成單鏈后,溫度降至55℃左右,引物與模板DNA 單鏈的互補(bǔ)序列配對結(jié)合;③延伸:DNA 模板與引物的結(jié)合物在TaqDNA 聚合酶的作用下,以dNTP 為反應(yīng)原料,靶序列為模板,按堿基配對原則,合成一條新的與模板DNA 鏈互補(bǔ)的半保留復(fù)制鏈。重復(fù)上述反應(yīng)步驟,就可獲得更多的“半保留復(fù)制鏈”,而且這種新鏈又可成為下次循環(huán)的模板。如此循環(huán)往復(fù),在短短的幾個(gè)小時(shí)的時(shí)間里,模版DNA 鏈便可被擴(kuò)增幾百萬倍。

        PCR技術(shù)使人們能夠在體外進(jìn)行DNA的復(fù)制,它的意義在于DNA是遺傳密碼的載體,具有相對的遺傳穩(wěn)定性,每種生物都有其固定的遺傳密碼。只要得到某種物質(zhì)的微量細(xì)胞并將其細(xì)胞內(nèi)的遺傳物質(zhì)提取出來,再通過PCR技術(shù)將其擴(kuò)增,就會準(zhǔn)確無誤地判斷該物質(zhì),進(jìn)而判斷該物種。PCR技術(shù)以其獨(dú)具的可靠性和準(zhǔn)確性,在中藥材基原鑒定和真?zhèn)舞b別方面擁有廣闊的應(yīng)用空間。

        2 基于PCR技術(shù)的現(xiàn)代分子生物學(xué)技術(shù)

        PCR技術(shù)是現(xiàn)代分子生物學(xué)的基石,該項(xiàng)技術(shù)的問世具有劃時(shí)代的意義。以PCR技術(shù)為基礎(chǔ),分子生物學(xué)領(lǐng)域衍生出多種新的實(shí)驗(yàn)操作技術(shù),在生命科學(xué)的各個(gè)領(lǐng)域均得到廣泛的應(yīng)用。本文僅對應(yīng)用于中藥鑒定過程的幾種操作技術(shù)進(jìn)行介紹。

        2.1 RAPD 技術(shù)

        RAPD 即隨機(jī)擴(kuò)增多態(tài)性DNA,該技術(shù)建立在PCR技術(shù)基礎(chǔ)之上,可對整個(gè)未知序列的基因進(jìn)行多態(tài)性分析操作。RAPD 技術(shù)以基因組DNA 為模板,以單個(gè)人工合成的隨機(jī)多態(tài)核苷酸序列為引物,在熱穩(wěn)定的DNA 聚合酶(Taq 酶)作用下,進(jìn)行PCR 擴(kuò)增。擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)電泳、染色后,在紫外透視儀上檢測多態(tài)性。擴(kuò)增產(chǎn)物的多態(tài)性反映了基因組的多態(tài)性。

        目前,RAPD 技術(shù)已應(yīng)用于中藥材的種質(zhì)鑒定及偽品鑒別等方面。徐鵬等[2]運(yùn)用RAPD 技術(shù)對廣西鉤藤屬藥用植物進(jìn)行遺傳多態(tài)性分析,獲得多態(tài)性條帶231 條,多態(tài)率達(dá)到88.9%。結(jié)果表明,3 種廣西鉤藤屬藥用植物的聚類結(jié)果與其地理分布一致,所得RAPD 標(biāo)記可用于鉤藤屬藥用植物的多態(tài)性研究;李雄英等[3]運(yùn)用RAPD 技術(shù)對絞股藍(lán)及其偽品進(jìn)行DNA 指紋圖譜的鑒別研究,實(shí)驗(yàn)結(jié)果證實(shí)該技術(shù)可有效地鑒別絞股藍(lán)及其偽品烏蘞莓。

        2.2 ISSR-PCR技術(shù)

        簡單序列重復(fù)區(qū)間(inter-simple sequence repeats,ISSR)是近年來發(fā)展起來的一類新型的分子標(biāo)記技術(shù),具有多態(tài)性高和重復(fù)性好等優(yōu)點(diǎn),已廣泛用于藥用植物的鑒定和遺傳多樣性研究[4]。柴素芬等[5]以象頭山蕓香科植物為研究對象,從DNA 提取、退火溫度、循環(huán)次數(shù)、引物篩選等方面研究ISSR 反應(yīng)及優(yōu)化條件,建立和優(yōu)化蕓香科藥用植物的ISSR 反應(yīng)體系。結(jié)果表明,ISSR 技術(shù)適合于蕓香科藥用植物的品種鑒定,同時(shí)可為蕓香科藥用植物的資源評價(jià)提供依據(jù)。

        2.3 PCR 擴(kuò)增的特定片段的限制性位點(diǎn)分析

        限制性片段長度多態(tài)性 (restriction fragment length polymorphism,RFLP)利用放射性標(biāo)記的探針,通過雜交顯示特定的基因組DNA 酶切片段,從而構(gòu)建多態(tài)性的DNA圖譜。它代表的是基因組DNA 在限制性內(nèi)切酶消化后產(chǎn)生的片段在長度上的差異。

        PCR-RFLP 技術(shù)綜合RFLP 技術(shù)與PCR技術(shù)二者的優(yōu)勢,用特異性的引物先對模板DNA 進(jìn)行擴(kuò)增,獲得特異性的擴(kuò)增產(chǎn)物,之后利用多種不同的限制性內(nèi)切酶對擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行酶解,構(gòu)建物理圖譜,分析限制性位點(diǎn)在分類群中的差異。該方法準(zhǔn)確可靠,重復(fù)性好,在中藥鑒定研究中有一定的應(yīng)用報(bào)道。吳平等[6]從5 種海馬干標(biāo)本中提取DNA,利用PCR技術(shù)擴(kuò)增12SrRNA 和細(xì)胞色素b 基因片段,對擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行RFLP分析。實(shí)驗(yàn)結(jié)果證實(shí),采用PCR-RFLP技術(shù)可鑒別出其中的兩種海馬。

        2.4 mRNA 差異顯示技術(shù)

        mRNA 差異顯示技術(shù)通過將總RNA 反轉(zhuǎn)錄成單鏈cDNA,然后進(jìn)行PCR 擴(kuò)增,由此分離出不同分子大小的DNA,選擇有差異表達(dá)的基因進(jìn)行序列分析。該技術(shù)具有快速、多功能、所需RNA 量少和重復(fù)性高等優(yōu)點(diǎn)而被廣泛用于分離克隆真核生物差異表達(dá)的基因[7]。目前,該技術(shù)在藥學(xué)領(lǐng)域中的應(yīng)用僅處于起步狀態(tài),借助該技術(shù)可以將栽培品種與野生種、道地藥材與普通藥材之間的差異鑒別出來。因此,mRNA 差異顯示技術(shù)在中藥材的質(zhì)量鑒定方面將擁有廣闊的應(yīng)用空間。

        2.5 基因測序

        基因測序是對藥材特定的基因片段進(jìn)行精確的DNA序列分析,并加以比較,從而達(dá)到鑒別藥材的目的。常用的基因片段包括線粒體細(xì)胞色素基因和rRNA 基因等。用于基因測序的基因在種內(nèi)高度保守,而在種間序列的差異較大,適用于中藥材種間的鑒定。

        徐麗等[8]從冬蟲夏草與其他品系蟲草及其混淆品蟲草中提取DNA,對核糖體基因(rDNA)進(jìn)行測序,設(shè)計(jì)18S 基因特異性引物進(jìn)行擴(kuò)增,擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)純化后,直接測序。結(jié)果表明,冬蟲夏草與西藏白草、西藏黑草、無頭草、默勒草的18 S 序列相似度為100%;與亞香棒、北蟲草的18S 序列相似度分別為91.37%和91.74%。由此可見,18S 序列可有效地鑒別冬蟲夏草及其混淆品北蟲草和亞香棒蟲草。此外,基因測序技術(shù)也被報(bào)道應(yīng)用于三七[9]及其偽品的遺傳背景差異分析、巴戟天[10]道地性研究及半夏[11]的基原鑒別。

        2.6 基因芯片

        基因芯片又稱DNA 芯片,是專門用于核酸檢測的生物芯片?;蛐酒闹饕夹g(shù)流程為:芯片的制備→樣品的制備→雜交反應(yīng)→芯片信號的檢測與分析→芯片數(shù)據(jù)的統(tǒng)計(jì)分析和生物學(xué)分析。即在固相載體上按照特定的排列方式固定大量序列已知的DNA 片段,將樣品基因組DNA 或RNA 經(jīng)過PCR 或RT-PCR 擴(kuò)增等技術(shù)摻入標(biāo)記分子后,與已知序列雜交,通過熒光檢測系統(tǒng)對芯片進(jìn)行掃描,檢測雜交信號強(qiáng)度,利用計(jì)算機(jī)軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)分析后,即可獲得樣品中大量的基因序列特征或基因表達(dá)特征信息?;蛐酒夹g(shù)可為植物種屬的驗(yàn)證與質(zhì)量控制提供一種快速、高質(zhì)量的檢測工具。楊忠等[12]利用基因芯片技術(shù)對多種貝母根莖的基因組DNA 進(jìn)行操作,結(jié)果顯示不同貝母種屬可在芯片不同位置檢測到熒光信號,從而提供了一種快速高效的集基因分型與中藥鑒別于一體的方法。

        3 展望

        與傳統(tǒng)的中藥鑒別方法相比,基于PCR技術(shù)的分子生物學(xué)鑒定技術(shù)具有準(zhǔn)確性高、重現(xiàn)性好、穩(wěn)定、可靠的優(yōu)點(diǎn)。利用現(xiàn)代化分析技術(shù)可準(zhǔn)確鑒別中藥的真?zhèn)?,從而完善中藥質(zhì)量評價(jià)體系,保證中藥安全、有效、可控。目前,最重要的是要充分了解各項(xiàng)技術(shù)的優(yōu)勢,以便取長補(bǔ)短、綜合利用,滿足市場對藥材準(zhǔn)確鑒定的需求。

        [1]金宇良.PCR技術(shù)的研究進(jìn)展[J].現(xiàn)代農(nóng)業(yè)科技,2012,10:47-48.

        [2]徐鵬,吳耀生,黃瑞松,等.3 種廣西鉤藤屬藥用植物的RAPD多態(tài)性分析[J].時(shí)珍國醫(yī)國藥,2012,23(3):702-705.

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        [4]關(guān)萍,馬丹煒,王貴俠,等.利用ISSR 標(biāo)記對天麻的貴州種群遺傳多樣性分析[J].北京林業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào),2007,29(6):35-40.

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