梅竹 楊予濤 徐志卿
(首都醫(yī)科大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院,北京 100069)
轉(zhuǎn)化生長因子-β(TGF-β),是一種具有多種生物學(xué)活性的多肽類細胞因子,由多種組織細胞合成,調(diào)控細胞周期,影響細胞的增殖、分化、黏附、轉(zhuǎn)移和凋亡,與腫瘤的發(fā)生、發(fā)展和轉(zhuǎn)歸密切相關(guān)[13]。TGF-β信號通路主要由TGF-β與其相應(yīng)的受體和細胞內(nèi)信號轉(zhuǎn)導(dǎo)分子組成。TGF-β信號通路的胞內(nèi)轉(zhuǎn)導(dǎo)分子主要由Smads蛋白構(gòu)成。Smads蛋白主要由受體激活的Smads(R-Smad)、通用型Smads(Co-Smad)和抑制型Smads(I-Smad)構(gòu)成。受體激活的Smads主要包括Smad2和Smad3,通用型Smads只包括Smad4,抑制型Smads包括Smad6和Smad7。
Smad4基因共有11個外顯子,10個內(nèi)含子,其轉(zhuǎn)錄子長2 680 bp,編碼由552個氨基酸組成的蛋白質(zhì),主要由MH1結(jié)構(gòu)域、MH2結(jié)構(gòu)域和連接區(qū)所組成。MH1結(jié)構(gòu)域具有序列特異的DNA結(jié)合能力,MH2結(jié)構(gòu)域是形成同/異源聚合物的結(jié)合位,同時還具有轉(zhuǎn)錄激活和核定位功能[3]。Smad4作為一種抑癌基因,是TGF-β信號通路的重要調(diào)節(jié)因子,廣泛參與細胞分化、增殖、遷移和凋亡等多種生物學(xué)過程[4]。
當細胞被TGF-β激活后,引起R-Smads(Smad2和Smad3)的磷酸化,而磷酸化的R-Smads從受體復(fù)合物上解離,迅速與Smad4形成異源復(fù)合物,然后被轉(zhuǎn)運進細胞后,與Smad結(jié)合元件(SBE)結(jié)合,并在其它輔助因子的協(xié)同下,調(diào)節(jié)靶基因的表達[5]。因此,在TGF-β信號通路中,Smad4處于中樞地位。鑒于Smad4在TGF-β信號通路中處于的關(guān)鍵地位,本研究擬在體外表達并純化Smad4蛋白,旨在分離和鑒定與Smad4相互作用的蛋白,從而進一步豐富TGF-β信號通路的組成。
pGEX-4T-1質(zhì)粒、大腸桿菌DH5α、大腸桿菌BL21(DE3)均為本實驗室保存;高保真Taq聚合酶購于Roche公司;質(zhì)粒提取試劑盒、膠回收試劑盒、PCR純化試劑盒購于MN公司;反轉(zhuǎn)錄試劑盒購于Invitrogen 公司;各種限制性內(nèi)切酶購于NEB公司;Smad4抗體購于Milipore公司;MagneGST particles購于Promega公司;異丙基-β-D-硫代半乳糖(IPTG)、考馬斯亮藍R-250購于北京普利萊公司;預(yù)染分子量標準蛋白marker購于Fermentas公司;引物合成與DNA測序由北京三博遠志生物技術(shù)有限公司進行。
1.2.1 HaCaT細胞總RNA的提取 將長滿培養(yǎng)瓶的HaCaT細胞用PBS洗兩遍,加入1 mL的Trizol(Invitrogen),等細胞充分裂解后,將裂解液轉(zhuǎn)移至無RNase的離心管中。加入0.2 mL的氯仿,震蕩混勻,室溫放置3 min。4℃,12 000×g離心10 min,將上層水相轉(zhuǎn)移至無RNase的離心管中。加入0.5 mL的異丙醇,室溫靜置20 min。4℃,12 000×g離心10 min,并用75%的乙醇洗滌RNA沉淀,等沉淀干燥后,加入50 μL無RNase的水,用槍頭洗打,使沉淀充分溶解。利用紫外分光光度計測定總RNA的濃度,用甲醛變性膠檢測總RNA的質(zhì)量。
1.2.2 HaCaT細胞總RNA的反轉(zhuǎn)錄 在一個無RN-ase的離心管中加入5 μg的總RNA,1 μL的OligodT,并用無RNase的水調(diào)節(jié)體積到12 μL。70℃水浴變性5 min后,將離心管迅速放置在冰上。加入4 μL的 5×reaction buffer,1 μL 的 RNase inhibitor,2 μL 10 mmol/L dNTP 和 1 μL 的 SuperScript?III Reverse Transcriptase,42℃水浴 60 min。加入 1 μL RNase H,37℃溫浴10 min。將RT產(chǎn)物稀釋到200 μL,-20℃保存。
1.2.3 質(zhì)粒的構(gòu)建 構(gòu)建pGEX-4T-1-Smad4載體的上游引物5'-TACTCGGATCCATGGACAATATGTCTA TTACG-3'(下劃線處為BamH I酶切位點),下游引物5'-ATCACGTCGACCAGTCTAAAGGTTGTGGGTCT-3'(下劃線處為SalI酶切位點)。以HaCaT細胞的cDNA為模板,利用上述引物,進行PCR擴增。擴增條件為:94℃預(yù)變性2 min; 94℃ 30 s,50℃ 30 s,72℃ 1 min 30 s;30個循環(huán)。將擴增到的PCR產(chǎn)物和pGEX-4T-1載體分別用SalI內(nèi)切酶和BamH I內(nèi)切酶進行雙酶切,并將酶切后的PCR片段與剩余載體片段用T4 DNA連接酶連接,轉(zhuǎn)化大腸桿菌DH5α,菌落PCR驗證陽性克隆,并將陽性克隆送往北京三博遠志生物技術(shù)有限公司進行測序。
1.2.4 GST-Smad4融合蛋白的誘導(dǎo)表達 將構(gòu)建成功的pGEX-4T-1-Smad4載體轉(zhuǎn)化大腸桿菌BL21(DE3)表達菌中,37℃培養(yǎng)至OD600=0.6時,分別加入 1 mol/L的IPTG,至終濃度分別為0.2、0.4、0.6、0.8、1.0 mmol/L。30℃誘導(dǎo)4-5 h,同時設(shè)未經(jīng)IPTG誘導(dǎo)的菌液做對照。取1 mL誘導(dǎo)后的菌液,10 000 r/min 離心2 min,收集菌體,然后加入40 μL的1×SDS上樣緩沖液,沸水煮5 min,然后10 000 r/min離心2 min,取上清用于SDS-PAGE凝膠電泳和考馬斯亮藍染色,檢測GST-Smad4融合蛋白的表達情況。
1.2.5 GST-Smad4融合蛋白的純化 收集1 mL誘導(dǎo)后的細菌,加入200 μL的裂解液,槍頭混勻,室溫搖動30 min。同時,在另一個離心管中加入20 μL的MagneGST particles,利用磁架,將上清吸去,再加入250 μL Binding/Washing buffer,懸浮磁粉,利用磁架,吸去上清,平衡磁粉。將平衡好的MagneGST particles加 入 100 μL 的 Binding/Washing buffer, 再加入100 μL的細菌裂解液,室溫搖動30 min。利用磁架,吸去上清,加入250 μL的Binding/Washing buffer洗滌3次,吸取上清。用30 μL的0.1 mol/L谷胱甘肽洗脫融合蛋白,并在洗脫液中加入8 μL 的5×SDS上樣緩沖液,沸水煮5 min,10 000 r/min 離心2 min,利用SDS-PAGE凝膠電泳檢測融合蛋白的純化效果。
1.2.6 GST-Smad4融合蛋白的鑒定 將純化后GSTSmad4融合蛋白和HaCaT細胞總蛋白經(jīng)SDS-PAGE凝膠電泳后,電轉(zhuǎn)至PVDF膜上。用5%的脫脂牛奶封閉2 h,按1∶1 000的比例加入Smad4單克隆抗體,孵育3 h后,洗去一抗,再加入辣根過氧化物酶標記的羊抗兔IgG二抗,孵育40 min后,洗去二抗,再利用ECL顯色發(fā)光試劑盒并結(jié)合膠片顯影觀察試驗結(jié)果。
提取HaCaT細胞總RNA,電泳檢測RNA完整性良好,可用于反轉(zhuǎn)錄試驗。以HaCaT細胞的cDNA為模板進行PCR擴增。擴增產(chǎn)物用1%的瓊脂糖凝膠電泳檢測,觀察到1 700 bp左右的擴增產(chǎn)物,與Smad4基因的預(yù)期大小一致(圖1)。
圖1 Smad4基因的PCR擴增結(jié)果
將擴增的Smad4基因片段和pGEX-4T-1載體分別用SalI內(nèi)切酶和BamH I內(nèi)切酶進行雙酶切,電泳并回收酶切后的Smad4基因片段和pGEX-4T-1載體的大片段,通過T4 DNA連接酶將Smad4基因定向插入到pGEX-4T-1載體的多克隆位點中。將菌落PCR鑒定為陽性的2個重組子再進行酶切鑒定,2個重組子經(jīng)酶切鑒定后均得到兩條目的帶,大約為1 700 bp和4 900 bp(圖2),初步證明重組載體構(gòu)建正確。將2個重組子進行測序。經(jīng)過與GenBank的序列對比后,證明Smad4基因已經(jīng)成功插入pGEX-4T-1載體,pGEX-4T-1-Smad4構(gòu)建成功。
圖2 重組質(zhì)粒pGEX-4T-1-Smad4的鑒定
將重組載體pGEX-4T-1-Smad4轉(zhuǎn)化大腸桿菌BL21(DE3),收集細菌進行SDS-PAGE凝膠電泳,并用考馬斯亮藍染色。試驗結(jié)果(圖3)顯示,5個GST-Smad4誘導(dǎo)組在80 kD處均出現(xiàn)明顯條帶,與預(yù)期結(jié)果相符,而未誘導(dǎo)的GST-Smad4表達菌在相應(yīng)位置無蛋白條帶出現(xiàn),說明融合基因在大腸桿菌中得到有效的表達。但是,隨著IPTG濃度的增高,融合蛋白的表達量并未增強。同時,將0.2 mmol/L的IPTG誘導(dǎo)下的GST-Smad4表達菌裂解,收集上清和沉淀,再利用SDS-PAGE凝膠電泳檢測其可溶性。從圖4中可以看出,GST-Smad4的融合蛋白主要在上清中表達,說明在30℃培養(yǎng)下,0.2 mmol/L IPTG誘導(dǎo)的GST-Smad4融合蛋白主要以可溶性的形式存在。
圖3 不同濃度IPTG誘導(dǎo)下GST-Smad4 融合蛋白的表達分析
圖4 0.2 mmol/L IPTG誘導(dǎo)下GST-Smad4 融合蛋白在上清和沉淀中的對比
將0.2 mmol/L IPTG誘導(dǎo)的GST-Smad4表達菌在-80℃放置1 h,將其融化,加入裂解液,超聲破碎后,收集上清,加入MagneGST particles,通過結(jié)合、洗滌等步驟后,用0.1 mmol/L的谷胱甘肽洗脫GSTSmad4融合蛋白,并將純化的GST-Smad4融合蛋白進行SDS-PAGE電泳,然后考馬斯亮藍染色。如圖5所示,GST-Smad4融合蛋白得到較好的純化,純度較高。
圖5 GST-Smad4 融合蛋白的純化
分別將HaCaT細胞總蛋白和純化的GST-Smad4融合蛋白進行SDS-PAGE凝膠電泳,再將其轉(zhuǎn)移到PVDF膜上,通過Western blot,檢測融合蛋白能否被Smad4抗體特異識別。由于GST-Smad4蛋白比Smad4蛋白多了一個GST標簽(約20 kD),其分子量預(yù)計在80 kd左右。如圖6所示,GST-Smad4融合蛋白的條帶出現(xiàn)在預(yù)期位置,說明Smad4的特異性抗體可以識別GST-Smad4融合蛋白,暗示GSTSmad4融合蛋白可用于后續(xù)的研究。
圖6 GST-Smad4 融合蛋白的鑒定
Smad4是Smads基因家族的成員,最早被稱為DCP4,位于人類染色體18q21.1上[6]。Smad4作為一種抑癌基因,主要通過與其它Smads蛋白的相互作用而參與TGF-β的信號轉(zhuǎn)導(dǎo)。如果Smad4發(fā)生缺失或突變,則TGF-β信號轉(zhuǎn)導(dǎo)網(wǎng)絡(luò)就會被破壞,TGF-β信號途徑在腫瘤發(fā)展中的抑制效應(yīng)就會失[7]。
Smad4除了參與腫瘤的發(fā)生和發(fā)展外,還具有其它的生物學(xué)功能。研究發(fā)現(xiàn),乙肝病毒編碼的癌蛋白pX通過促進Smads蛋白的核轉(zhuǎn)運和穩(wěn)定Smad4蛋白的復(fù)合體而增強TGF-β信號通路,從而參與肝臟的纖維化[8]。同時,Smad4還參與睪丸、小腦、心瓣膜和早期胚胎的發(fā)育過程[9-12]。 因此,Smad4在生命過程中起到十分重要的調(diào)節(jié)作用。
鑒于Smad4在TGF-β信號途徑中的中樞地位,發(fā)現(xiàn)和鑒定Smad4的共調(diào)節(jié)因子具有重要的意義。目前,已經(jīng)發(fā)現(xiàn)了幾個Smad4的共調(diào)節(jié)因子,如Bcl6,v-ErbA。Bcl6主要通過直接與Smad4的相互作用來抑制Smad4的轉(zhuǎn)錄活性,從而使B淋巴瘤細胞產(chǎn)生 TGF-β抗性[13]。v-ErbA通過與Smad4相互作用而干擾Smad4復(fù)合體向細胞核的轉(zhuǎn)移,從而抑制了TGF-β信號通路的正常功能,進而使HD3B紅白血病細胞產(chǎn)生TGF-β抗性[14]。因此,進一步的鑒定和發(fā)現(xiàn)Smad4的共調(diào)節(jié)因子對完善復(fù)雜的TGF-β信號網(wǎng)絡(luò)具有重要的意義。
Biacore是一種基于表面等離子共振(SPR)的新型技術(shù),利用該技術(shù)可以實時跟蹤生物分子間的相互作用,分離與目的蛋白相互作用的蛋白,我們實驗室擬利用這種技術(shù)分離與Smad4相互作用的蛋白。在Biacore試驗中,獲得Smad4蛋白是試驗順利進行的關(guān)鍵。為此,將Smad4基因克隆到原核表達載體pGEX-4T-1載體,通過IPTG誘導(dǎo),得到帶有GST標簽的Smad4融合蛋白,再通過親和層析純化,得到了GST-Smad4融合蛋白,本研究為Biacore試驗奠定了基礎(chǔ)。
以往的研究發(fā)現(xiàn),IPTG的濃度對外源蛋白的表達有著重要的影響,但是過高濃度的IPTG往往對細胞產(chǎn)生毒性,同時也影響蛋白的表達量和蛋白表達的形式。本試驗探索了不同濃度的IPTG對GSTSmad4融合蛋白表達的影響。研究發(fā)現(xiàn),隨著IPTG濃度的增加,GST-Smad4融合蛋白表達幾乎沒有變化。因此,選擇0.2 mmol/L為IPTG誘導(dǎo)的濃度。同時,分別檢測了在0.2 mmol/L IPTG誘導(dǎo)下,GSTSmad4融合蛋白在BL2(DE3)表達菌裂解液的上清和沉淀的分布發(fā)現(xiàn),低濃度的IPTG誘導(dǎo)下,GSTSmad4融合蛋白主要以可溶性的形式存在,主要分布在上清,而在沉淀中的分布很低。
本研究成功構(gòu)建了pGEX-4T-1-Smad4原核表達載體,摸索了GST-Smad4融合蛋白誘導(dǎo)表達的適宜條件,并獲得了具有Smad4免疫活性的GST-Smad4融合蛋白。
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