亚洲免费av电影一区二区三区,日韩爱爱视频,51精品视频一区二区三区,91视频爱爱,日韩欧美在线播放视频,中文字幕少妇AV,亚洲电影中文字幕,久久久久亚洲av成人网址,久久综合视频网站,国产在线不卡免费播放

        ?

        仙臺(tái)病毒RT-PCR檢測(cè)方法的建立及灰倉鼠中流行情況調(diào)查

        2012-11-27 05:27:12李曉波馮育芳岳秉飛賀爭鳴
        中國比較醫(yī)學(xué)雜志 2012年12期
        關(guān)鍵詞:倉鼠測(cè)序引物

        李曉波,付 瑞,王 吉,衛(wèi) 禮,邢 進(jìn),馮育芳,岳秉飛,賀爭鳴

        (中國食品藥品檢定研究院實(shí)驗(yàn)動(dòng)物資源研究所,北京 100050)

        仙臺(tái)病毒屬于副粘病毒科,副粘病毒屬,核酸型為單股負(fù)鏈 RNA,基因組全長 15 384 bp[1],編碼6 個(gè)結(jié)構(gòu)蛋白(L,P,NP,HN,F(xiàn),M)和一個(gè)非結(jié)構(gòu)蛋白C,其基因排序次序?yàn)?3'-Leader-NP-P+C-M-FHN-L-Leader-5'[2]。仙臺(tái)病毒傳染性強(qiáng),容易擴(kuò)散,是嚙齒類實(shí)驗(yàn)動(dòng)物最難控制的病毒之一。嚙齒類實(shí)驗(yàn)動(dòng)物感染SeV會(huì)對(duì)其免疫系統(tǒng)、致瘤作用及繁殖等產(chǎn)生影響,從而影響實(shí)驗(yàn)結(jié)果[3],動(dòng)物一旦感染很難清除,嚴(yán)重影響幼鼠生長發(fā)育并降低成年鼠的繁殖率[4]。

        現(xiàn)有的實(shí)驗(yàn)動(dòng)物種屬和品系已越來越不能滿足科學(xué)快速發(fā)展的要求,迫切需要開發(fā)更多適應(yīng)不同要求的新型實(shí)驗(yàn)動(dòng)物,灰倉鼠(Cricetulus migratorius)就是在包蟲病研究中篩選出來的一種鼠類?;覀}鼠屬于嚙齒目,倉鼠科,倉鼠亞科,倉鼠屬。廣泛分布于中亞地區(qū),棲息生境從荒漠平原至海拔3 000 m以上的高山草甸均有分布。已查明該鼠在自然界參與土拉倫、森林腦炎、鼠疫等多種自然疫源性疾病傳播[5,6],并且對(duì)仙臺(tái)病毒易感。目前我國還沒有關(guān)于灰倉鼠仙臺(tái)病毒感染的報(bào)道,也沒有可用于灰倉鼠SV的檢測(cè)方法。我們針對(duì)仙臺(tái)病毒L基因設(shè)計(jì)引物,建立了仙臺(tái)病毒 RT-PCR檢測(cè)方法,并對(duì)60只采自我國新疆地區(qū)的灰倉鼠,進(jìn)行SV感染的檢測(cè)。

        1 材料

        1.1 試劑

        AMV逆轉(zhuǎn)錄酶、隨機(jī)引物購自 Promega公司;RNA酶抑制劑購自莊盟公司;Taq Hs DNA酶、dNTP、100 bp DNA marker購自寶生物工程(大連)有限公司,RNA提取試劑盒購自Qiagen公司。

        1.2 病毒毒株及疫苗

        仙臺(tái)病毒、猴副流感病毒(SV5)、犬瘟熱病毒、小鼠肺炎病毒、呼腸孤病毒III型均為本實(shí)驗(yàn)室保存。腮腺炎病毒減毒活疫苗來自本院病毒一室。SPF雞胚購自北京梅里亞維通實(shí)驗(yàn)動(dòng)物技術(shù)有限公司。

        1.3 灰倉鼠

        由新疆地方病防治研究所提供。普通級(jí)環(huán)境飼養(yǎng),60只,成年,體重在(40~50)g之間,雌雄各半。

        2 方法

        2.1 病毒的培養(yǎng)

        用8~13日齡的雞胚,SeV毒種接種絨毛尿囊腔,接種后第4天收獲尿囊液,凍-70℃?zhèn)溆谩?/p>

        2.2 RNA的提取

        取0.5 mL上述上清液按試劑盒的操作說明提取RNA,最后用40 μL去RNA酶的無菌水溶解。

        2.3 RT-PCR方法建立

        2.3.1 逆轉(zhuǎn)錄:25 μL反應(yīng)體系中含5×RT buffer 5 μL,d NTP(2.5 mmol/L)4 μL,隨機(jī)引物(500 μg/mL)1 μL,AMV(10 U/μL)0.5 μL,RNA 酶抑制劑(40 U/μL)0.5 μL,病毒 RNA 8 μL,反應(yīng)條件:37℃90 min,72℃ 15 min,4℃ 5 min。

        2.3.2 PCR引物設(shè)計(jì):參照NCBI發(fā)表的仙臺(tái)病毒(gi:9627219)基因組序列設(shè)計(jì)引物,引物信息見表1,由生工生物工程(上海)有限公司合成,使用時(shí)用滅菌超純水稀釋為10 μM,PCR產(chǎn)物長度為197 bp。

        表1 SeV RT-PCR引物Tab.1 Primers for the SeV RT-PCR

        2.3.3 PCR擴(kuò)增:反應(yīng)體系包括,10×PCR buffer 2.5 μL,dNTP(2.5 mmol/L)2 μL,引物(10 μmol/L)各 1μL,cDNA 2 μL,Taq Hs酶(5 U/μL)0.5 μL,滅菌 dH2O 16 μL。反應(yīng)條件:94℃ 變性 45 s,56℃ 退火45 s,72℃延伸30 s,共35個(gè)循環(huán),最后72℃延伸7 min。

        2.4 RT-PCR方法的驗(yàn)證

        2.4.1 敏感性:紫外分光法測(cè)定SV cDNA濃度,將cDNA10倍系列稀釋后進(jìn)行PCR擴(kuò)增,測(cè)定方法的最大檢出限。

        2.4.2 特異性:分別提取小鼠肺炎病毒、呼腸孤病毒III型、猴副流感病毒、腮腺炎病毒、犬瘟熱病毒、正常雞胚尿囊液及小鼠肺臟組織 RNA,用建立的RT-PCR法進(jìn)行檢測(cè),測(cè)定方法的特異性。

        2.5 灰倉鼠的檢測(cè)

        每一份樣本按以下方法處理:取灰倉鼠肺臟約100 mg,加入900 μL 滅菌 PBS,勻漿后12 000 r/min 離心10 min,上清液用0.2 μm 濾膜過濾,取400 μL 過濾后的上清,用Qiagen公司的RNA提取試劑盒提取RNA。

        3 結(jié)果

        3.1 RT-PCR結(jié)果及測(cè)序

        3.1.1 RT-PCR結(jié)果:SeV毒株提取RNA后經(jīng)RTPCR擴(kuò)增,2%瓊脂糖電泳,可見在197 bp處有預(yù)期的目標(biāo)條帶(圖1)。

        3.1.2 RT-PCR產(chǎn)物測(cè)序:PCR產(chǎn)物直接送上海生工公司測(cè)序,測(cè)序結(jié)果與NCBI數(shù)據(jù)庫比對(duì),與SeV(dbj∣ AB275416.1∣)相應(yīng)序列符合率達(dá)98%(圖 2)。

        3.2 靈敏性測(cè)定

        紫外分光光度法測(cè)得SeV cDNA的濃度為968.6 μg/mL,將 cDNA 進(jìn)行 10-1~10-6稀釋,隨后進(jìn)行PCR擴(kuò)增,由圖3可見,在10-4稀釋的時(shí)候仍可見目的條帶,說明本研究建立的PCR技術(shù)方法能檢測(cè)的SV cDNA最低濃度是96.8 ng/mL。

        圖1 SeV毒種RT-PCR擴(kuò)增Fig.1 RT-PCR amplification for SeV.

        圖2 SeV毒種RT-PCR產(chǎn)物測(cè)序比對(duì)結(jié)果Fig.2 The BLAST results of sequencing of SeV RT-PCR products.

        3.3 特異性測(cè)定

        分別以小鼠肺炎病毒、呼腸孤病毒III型、猴副流感病毒、腮腺炎病毒、犬瘟熱病毒及正常的雞胚尿囊液和小鼠肺臟組織為對(duì)照,用建立的PCR方法進(jìn)行擴(kuò)增。電泳結(jié)果表明:僅有SV毒株有197 bp的目的條帶,而其他對(duì)照均沒有任何條帶(圖4),說明本方法有較好的特異性。

        3.4 灰倉鼠中SV的檢測(cè)

        3.4.1 取灰倉鼠肺組織,提取總 RNA,采用 RTPCR方法進(jìn)行檢測(cè),結(jié)果檢測(cè)到2份樣本陽性(圖5只顯示部分結(jié)果),陽性率為3.33%(2/60)。

        3.4.2 SeV陽性樣本測(cè)序:陽性樣本的 PCR產(chǎn)物送上海生工測(cè)序,測(cè)序結(jié)果與NCBI發(fā)表的SeV(gb∣DQ219803.1∣)基因組相應(yīng)序列的符合率為98%,證實(shí)為仙臺(tái)病毒感染(圖6)。

        圖3 敏感性試驗(yàn)結(jié)果1:DNA marker 2~7:SeV cDNA 分別 10-1~10-6稀釋 8:陰性對(duì)照Fig.3 The results of sensitivity test of the RT-PCR products.Lane 1:DNA marker;2~7:10-1~10-6 dilution of SeV cDNA;8:Negative control

        圖4 特異性試驗(yàn)結(jié)果Fig.4 Results of specificity test of the detection technique for Sendai virus.

        圖5 60份灰倉鼠樣本部分檢測(cè)結(jié)果1:仙臺(tái)陽性對(duì)照 2~11:樣本12:陰性對(duì)照 M:DNA markerFig.5 Some results of RT-PCR assay for sixty Cricetulus migratorius samples.Lane 1:SeV positive control;2~11:Samples;12:Negative control;M:DNA marker

        4 討論

        圖6 灰倉鼠SeV陽性樣本測(cè)序比對(duì)結(jié)果Fig.6 The BLAST results of RT-PCR products sequencing of SeV-positive samples of Cricetulus migratorius.

        本實(shí)驗(yàn)的灰倉鼠來自新疆地方病防治研究所,廖立夫教授等早在上世紀(jì)90年代就開始從事野生灰倉鼠的馴化繁殖工作,現(xiàn)在已經(jīng)成功繁育出具有一定規(guī)模的動(dòng)物種群[7],雖然目前已有灰倉鼠用于各種實(shí)驗(yàn)研究的報(bào)道,但作為一種實(shí)驗(yàn)動(dòng)物,其標(biāo)準(zhǔn)化程度還較低。

        實(shí)驗(yàn)嚙齒類動(dòng)物是SV的自然宿主,自然條件下SV能感染小鼠、大鼠、倉鼠和豚鼠?;覀}鼠作為新的實(shí)驗(yàn)動(dòng)物品種,迫切需要對(duì)其微生物攜帶情況進(jìn)行調(diào)查,灰倉鼠與實(shí)驗(yàn)常用的地鼠同屬倉鼠科,倉鼠屬,實(shí)驗(yàn)動(dòng)物國標(biāo)將SV列為SPF地鼠的必檢項(xiàng)目[8],因此,我們對(duì)灰倉鼠中攜帶 SeV的情況進(jìn)行了調(diào)查。

        血清學(xué)調(diào)查顯示仙臺(tái)病毒在小鼠等嚙齒類實(shí)驗(yàn)動(dòng)物中感染率較高,但國內(nèi)外還沒有灰倉鼠中SV感染率調(diào)查的相關(guān)報(bào)道。病毒的分離鑒定是仙臺(tái)病毒診斷的金標(biāo)準(zhǔn),除雞胚外,SV也可在BHK21或Vero細(xì)胞上進(jìn)行增殖[3],但病毒分離鑒定周期較長,費(fèi)時(shí)費(fèi)力;目前,國內(nèi)主要采用ELISA方法檢測(cè)動(dòng)物血清中的SV抗體,ELISA雖然具有較高的敏感性,但需要純度很高的純化檢測(cè)抗原,并不適用于檢測(cè)乳鼠和免疫缺陷動(dòng)物,同時(shí)對(duì)抗體的檢測(cè)不能反應(yīng)當(dāng)前病毒的感染情況。PCR技術(shù)作為分子生物學(xué)檢測(cè)的重要方法,具有快速、敏感、簡便等優(yōu)點(diǎn),國內(nèi)外已有 SV RT-PCR檢測(cè)方法的相關(guān)報(bào)道[9-11]。與之相比,我們建立的 SV RT-PCR 檢測(cè)方法具有更好的特異性和敏感性(結(jié)果未顯示),適用于對(duì)動(dòng)物當(dāng)前的病毒感染情況進(jìn)行調(diào)查。

        雖然本次檢出的灰倉鼠SV感染率較低,陽性動(dòng)物也無明顯臨床癥狀,但是該病毒可通過直接接觸和空氣傳播的方式擴(kuò)散,給整個(gè)種群SV感染的控制帶來很大困難,需要引起我們的重視。本實(shí)驗(yàn)建立的SV RT-PCR檢測(cè)方法,也為今后制定灰倉鼠質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)提供了一定的基礎(chǔ)數(shù)據(jù)。

        致謝:感謝新疆地方病防治研究所廖立夫教授等對(duì)本課題的大力支持!

        [1] Itoh M,Isegawa Y,Hotta H,et al.Isolation of an avirulent mutant of Sendai virus with two amino acid mutations from a highly virulent field strain through adaptation to LLC-MK2 cells[J].J Gen Virol,1997,78:3207 -3215.

        [2] 范文平.仙臺(tái)病毒的分子生物學(xué)研究進(jìn)展[J].中國實(shí)驗(yàn)動(dòng)物學(xué)雜志,1999,2:115-119.

        [3] 田克恭.實(shí)驗(yàn)動(dòng)物病毒性疾?。跰].北京:農(nóng)業(yè)出版社.1991:57- 64.

        [4] 吳惠英,衛(wèi)禮,賀爭鳴,等.不同方法檢測(cè)鼠群Sendai抗體的研究[J].北京實(shí)驗(yàn)動(dòng)物科學(xué),1989,6(1):12-16.

        [5] 廖立夫.灰倉鼠實(shí)驗(yàn)動(dòng)物化研究[J].中國實(shí)驗(yàn)動(dòng)物學(xué)雜志,2002,12(3):183-185.

        [6] 王思博,楊贛源.新疆嚙齒動(dòng)物志[M].烏魯木齊:新疆衛(wèi)生出版社.1982.165.

        [7] 廖立夫,黎唯.灰倉鼠的室內(nèi)繁殖研究[J].中國實(shí)驗(yàn)動(dòng)物學(xué)報(bào),1998,6(2):33-35.

        [8] 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物國家標(biāo)準(zhǔn)[S].GB/T14926.23-2001

        [9] Hayase Y,Tobita K,Kii M,at al.Detection of nucleoprotein gene of Sendai virus in the lungs of rats by touchdown nested reverse transcriptase ploymerase chain reaction[J].Exp Anim,1997,46(4):307-310.

        [10] Bootz F, Sieber I, Popovic D, etal. Comparison ofthe sensitivity of in vivo antibody production tests with in vitro PCR-based methods to detect infectious contamination of biological materials[J].Lab Animals,2003,37(4):341- 351.

        [11] 王宗耀,謝建云,邵偉娟,等.仙臺(tái)病毒 RT-PCR檢測(cè)方法的建立與應(yīng)用[J].中國比較醫(yī)學(xué)雜志,2008,18(1):49-53.

        猜你喜歡
        倉鼠測(cè)序引物
        DNA引物合成起始的分子基礎(chǔ)
        高中生物學(xué)PCR技術(shù)中“引物”相關(guān)問題歸類分析
        杰 Sir 帶你認(rèn)識(shí)宏基因二代測(cè)序(mNGS)
        新民周刊(2022年27期)2022-08-01 07:04:49
        SSR-based hybrid identification, genetic analyses and fingerprint development of hybridization progenies from sympodial bamboo (Bambusoideae, Poaceae)
        二代測(cè)序協(xié)助診斷AIDS合并馬爾尼菲籃狀菌腦膜炎1例
        傳染病信息(2021年6期)2021-02-12 01:52:58
        當(dāng)倉鼠遇上小新
        童話世界(2020年32期)2020-12-25 02:59:12
        萌翻你的倉鼠君來了!
        倉鼠小黑
        轉(zhuǎn)快點(diǎn)兒,小倉鼠
        火炬松SSR-PCR反應(yīng)體系的建立及引物篩選
        黄色视频免费在线观看| 日本午夜剧场日本东京热| 久久久精品午夜免费不卡| 国产精品午夜爆乳美女视频| 亚洲成a人片在线看| 亚洲精品久久久中文字| 亚洲一区二区刺激的视频| 色欲人妻综合aaaaa网| 国产激情з∠视频一区二区| 亚洲无码激情视频在线观看| 中文字幕一区二区黄色| 台湾佬中文娱乐网22| 久久精品夜夜夜夜夜久久| 久久久精品2019免费观看| 午夜视频一区二区三区播放| 影视av久久久噜噜噜噜噜三级| 蜜臀av免费一区二区三区| 国产精品自在在线午夜出白浆| 蜜桃免费一区二区三区| 国模无码一区二区三区不卡| 国产欧美精品在线一区二区三区| 国产精品久久久精品三级18| 国产一区二区三区在线观看完整版 | 99re6在线视频精品免费| 国产色秀视频在线播放| 中文乱码字幕高清在线观看| 亚洲97成人精品久久久| 午夜免费电影| 亚洲精品无码av片| 日本一区二区三区看片| 东北女人一级内射黄片| 色先锋av资源中文字幕| 久久精品国产亚洲综合色| 免费观看一区二区三区视频| 成人试看120秒体验区| 一卡二卡三卡视频| 亚洲天堂av社区久久| 日本最新一区二区三区视频观看 | 亚洲av无码成人精品国产| 日本高清www无色夜在线视频| 国产精品久久久久久久y|