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        胰腺癌細(xì)胞中Runx3基因表達(dá)及甲基化的研究

        2012-11-23 09:13:30邱志東范琳峰雷長江繆輝來
        關(guān)鍵詞:失活細(xì)胞株條帶

        邱志東,范琳峰,雷長江,繆輝來

        (廣東醫(yī)學(xué)院附屬醫(yī)院 肝膽外科,廣東 湛江524001)

        胰腺癌是一種惡性程度高,進(jìn)展迅速,手術(shù)切除率低,預(yù)后極差的惡性腫瘤,本文從表觀遺傳學(xué)的角度研究Runx3基因在胰腺癌細(xì)胞中失表達(dá)的機(jī)制,以期為胰腺癌的早期診斷及新的治療方案提供理論依據(jù)。

        1 材料與方法

        1.1 材料

        (1)細(xì)胞株:Panc-1、BxPC-3、AsPC-1三種胰腺癌細(xì)胞株(中國科學(xué)院上海生命科學(xué)研究院細(xì)胞資源中心);(2)主要試劑:DMEM 培養(yǎng)基、RPMI 1640培養(yǎng)基(美國Gibco公司),TRIZOL總RNA提取試劑盒、PrimeScript OneStep RT-PCR Kit Ver.2(大連寶生物公司)、One step sybr primescripttmrtpcr kitⅡ(大連寶生物公司),EZ DNA甲基化試劑盒-direct、Zymo Taqtm PreMix(美國 ZYMO RESEARCH公司),引物、內(nèi)參(上海生物工程公司、大連寶生物公司),Western封閉液、一抗稀釋液、二抗稀釋液、一抗二抗去除液、鼠抗人GADPH抗體(碧云天生物技術(shù)研究所),小鼠抗人Runx3單克隆抗體(Santa Cruz Biotechnology)。

        1.2 方法

        (1)細(xì)胞培養(yǎng)。(2)RT-PCR檢測 Runx3基因的表達(dá):①癌細(xì)胞株及胰腺組織中RNA的抽提;②引物序列及產(chǎn)物長度:Runx3上游引物為5′-AGGCATTGCGCAGCTCAGCGGAGT-3′,Runx3 下游 引 物 為 5′-AGGCATTGCGCAGCTCAGCGGAGTA-3′,擴(kuò)增長度為152bp,β-actin上游引物為 5′-TGGCACCCAGCACAATGAA-3′,β-actin下游引物 為 5′-CT AAGTCATAG TCCGCCTAGAAGCA-3′,擴(kuò)增長度為186bp,引物均由上海生工合成,引物離心后用0.1%DEPC處理水稀釋至所需濃度,-20℃保存;③參照TaKaRa公司的onestep RT-PCR Kit使用說明書進(jìn)行RT-PCR;④瓊脂糖凝膠電泳和圖象分析。(3)Westren blotting:①樣品制備;②蛋白定量;③SDS-PAGE電泳;④轉(zhuǎn)膜;⑤封閉及抗原抗體反應(yīng);⑥化學(xué)發(fā)光顯影、定影及圖像分析。(4)甲基化特異PCR:①細(xì)胞計(jì)數(shù);②貼壁細(xì)胞DNA提?。虎壅R认俳M織中提取DNA;④引物設(shè)計(jì)及擴(kuò)增長度,Runx3基因的甲基化特異性PCR引物用Methprimer軟件設(shè)計(jì),甲基化引 物 (M)上 游 為:5′-CGTCGGGTTAGCGAGGTTTC-3′,下游為:5′-GCCGCTACCG CGAAAAACGA-3′,擴(kuò)增長度120bp;非甲基化引物(U)上游為:5′– GTGGGTGG TTGTTGGGTTAGT-3′,下游 引 物 為:5′-TCCTCAACCACCACTA CCACA-3′,擴(kuò)增長度為138bp,引物均由上海生工合成。⑤甲基化特異性PCR;⑦瓊脂糖凝膠電泳實(shí)驗(yàn)。

        1.3 統(tǒng)計(jì)學(xué)處理

        實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)用均數(shù)±標(biāo)準(zhǔn)差(±s)表示,所有實(shí)驗(yàn)至少重復(fù)3次。

        2 結(jié)果

        2.1 Runx3基因mRNA表達(dá) RT-PCR檢測結(jié)果顯示在Panc-1、BxPC-3、AsPC-1 3種胰腺癌細(xì)胞株中Runx3基因的mRNA電泳未見亮條帶,而在正常胰腺組織中Runx3基因的mRNA電泳有亮條帶出現(xiàn)(見圖2.1);用Quantity One軟件測量條帶灰度值,以目的基因與β-actin內(nèi)參條帶的光密度積分值之比進(jìn)行相對(duì)定量分析,結(jié)果顯示正常胰腺組織的值為1.3594±0.0059,而Panc-1、BxPC-3、AsPC-1未測得相對(duì)定量值,說明在正常胰腺組織中Runx3基因的mRNA有表達(dá),而在3種胰腺癌細(xì)胞株中沒有表達(dá)。

        圖2.1 RT-PCR凝膠電泳

        2.2 Runx3基因蛋白表達(dá) Western blotting法未能檢測到 Panc-1、BxPC-3、AsPC-1的 Runx3蛋白表達(dá)(圖2.2)

        2.3 Runx3基因啟動(dòng)子區(qū)CpG島的甲基化 利用MSP檢測法顯示在 Panc-1、BxPC-3、AsPC-1胰腺癌細(xì)胞株中,Runx3基因甲基化引物均擴(kuò)增出產(chǎn)物,電泳可見120bp處有亮條帶,非甲基化引物未擴(kuò)增出產(chǎn)物;而在正常胰腺組織中Runx3基因非甲基化引物擴(kuò)增出產(chǎn)物,而甲基化引物則未擴(kuò)增出引物。

        圖2.2 Panc-1、BxPC-3、AsPC-1細(xì)胞 Runx3蛋白表達(dá)水平

        圖2.3 正常胰腺組織與各癌細(xì)胞株Runx3基因的甲基化情況

        3 討論

        胰腺癌的發(fā)生與很多因素有關(guān),包括基因水平上的改變和后生修飾的累積效應(yīng),如癌基因的激活或抑癌基因的失活。DNA甲基化在基因沉默、基因組印記、X染色體失活和腫瘤形成過程中發(fā)揮重要作用。近期研究提示許多抑癌基因啟動(dòng)子區(qū)的高甲基化是腫瘤發(fā)生過程中基因失活的重要原因,在某些情況下甚至是抑癌基因失活的唯一機(jī)制[1,2]。最近的研究表明Runx3可能是一新的抑瘤基因,其在宮頸癌、前列腺癌、胃癌、結(jié)直腸癌、膽管癌、胰癌和肺癌等多種腫瘤中有不同程度表達(dá)缺失或者下調(diào)[3-8]。Wada等用 Northern blotting和 RT-PCR研究顯示75%的胰腺癌細(xì)胞株Runx3mRNA及蛋白沒有發(fā)生表達(dá)(9/12)[9],但是其原因未明。本研究也未能檢測到 Panc-1、BxPC-3、AsPC-1中 Runx3基因mRNA及蛋白表達(dá),而正常胰腺組織可檢測到Runx3基因mRNA表達(dá);同時(shí)我們通過MSP方法檢測了正常胰腺組織和人胰腺癌細(xì)胞株,發(fā)現(xiàn)Panc-1、BxPC-3、AsPC-1癌細(xì)胞中均檢測到Runx3基因啟動(dòng)子CpG島發(fā)生甲基化,而正常胰腺組織中Runx3基因啟動(dòng)子CpG島沒有出現(xiàn)甲基化現(xiàn)象,由此我們大膽推測,Runx3基因在胰腺癌細(xì)胞中的失表達(dá)可能與Runx3基因啟動(dòng)子CpG島發(fā)生甲基化有關(guān)。

        眾所周知,胰腺癌惡性程度高,易轉(zhuǎn)移且預(yù)后較差,手術(shù)切除是治療胰腺癌的主要手段,但很多胰腺癌患者在確診后就喪失了根治性切除的機(jī)會(huì),而作為晚期胰腺癌的一線化療藥物吉西他濱,接受其單藥治療患者的中位生存期僅為6個(gè)月左右,并且吉西他濱與其他化療藥物聯(lián)合應(yīng)用并不能延長患者的生存期[10]。改變基因表觀遺傳學(xué)是目前一種新的臨床治療癌癥的方法,本研究發(fā)現(xiàn)Runx3基因在胰腺癌細(xì)胞中的失表達(dá)可能與Runx3基因啟動(dòng)子CpG島發(fā)生甲基化有關(guān),那么如果能夠使Runx3基因啟動(dòng)子CpG島發(fā)生去甲基化,是否就能使Runx3基因重新表達(dá),從而起到治療腫瘤的作用?這是進(jìn)一步研究的重點(diǎn)。

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