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        基于Matlab的受試者操作特征曲線分析

        2012-11-19 03:39:32邵毅邵慧妍陳卉
        中國(guó)醫(yī)療設(shè)備 2012年4期
        關(guān)鍵詞:分界點(diǎn)面積軟件

        邵毅,邵慧妍,陳卉

        首都醫(yī)科大學(xué) 生物醫(yī)學(xué)工程學(xué)院,北京 100069

        0 前言

        診斷試驗(yàn)是指為受試者做出診斷所應(yīng)用的各種實(shí)驗(yàn)室檢查、影像設(shè)備檢查、醫(yī)生的主觀診斷以及其他診斷方法,如數(shù)學(xué)模型、計(jì)算機(jī)輔助診斷程序等。準(zhǔn)確的診斷試驗(yàn)?zāi)軌蚴够颊叩玫礁皶r(shí)、更準(zhǔn)確的治療。因此,正確而客觀地評(píng)價(jià)診斷試驗(yàn)具有重要的臨床意義。評(píng)價(jià)診斷試驗(yàn)的傳統(tǒng)方法是使用靈敏度、特異度、準(zhǔn)確率等指標(biāo)。由于這些指標(biāo)受主觀選定的診斷分界點(diǎn)的影響,所以難以全面反映診斷試驗(yàn)的優(yōu)劣。

        受試者操作特征(Receiver Operating Characteristic,ROC)曲線與診斷分界點(diǎn)無關(guān),能客觀、全面地反映診斷方法對(duì)疾病的鑒別能力,從而在診斷試驗(yàn)評(píng)價(jià)中得到越來越廣泛的使用[1-2],目前已成為國(guó)內(nèi)外公認(rèn)的標(biāo)準(zhǔn)臨床篩查與診斷評(píng)價(jià)統(tǒng)計(jì)學(xué)方法。生成ROC曲線的方法分為參數(shù)法和非參數(shù)法。參數(shù)法通過數(shù)學(xué)模型(雙正態(tài)模型[3]、累積Logit模型[4]、基于貝葉斯估計(jì)的ROC 曲線回歸模型[5]等)估計(jì)和建立ROC曲線,它要求診斷試驗(yàn)數(shù)據(jù)不應(yīng)明顯偏離正態(tài)分布。非參數(shù)法[6-8]則是通過試驗(yàn)數(shù)據(jù)直接產(chǎn)生ROC曲線,它對(duì)診斷試驗(yàn)數(shù)據(jù)沒有分布假設(shè),特別是對(duì)于連續(xù)型診斷試驗(yàn)數(shù)據(jù)能夠生成無偏的ROC曲線[9]。

        目前,國(guó)外較權(quán)威和常用的醫(yī)學(xué)統(tǒng)計(jì)軟件,如SAS和SPSS均提供了非參數(shù)法ROC曲線分析的功能,但它們無法對(duì)兩個(gè)診斷試驗(yàn)進(jìn)行ROC曲線下面積的比較??梢赃M(jìn)行ROC曲線下面積比較的軟件,如ROCKIT采用了雙正態(tài)參數(shù)法ROC曲線估計(jì),對(duì)于不符合條件的資料可能得到不正確的結(jié)果[10]。為此,我們利用Matlab軟件編制了非參數(shù)法ROC曲線分析軟件,它不僅能夠生成ROC曲線,還能對(duì)兩個(gè)診斷試驗(yàn)進(jìn)行比較,并能保存ROC曲線上操作點(diǎn)的坐標(biāo)以便其他程序調(diào)用,其性能優(yōu)于其他基于Matlab的ROC曲線繪制程序[11]。

        1 非參數(shù)法ROC曲線分析的基本思想

        ROC曲線非參數(shù)分析法目前應(yīng)用最廣泛的是Hanley和McNeil法。雖然也有人提出了其他非參數(shù)法,但因?yàn)槠溆?jì)算復(fù)雜,很少有人使用。而Hanley和McNeil法計(jì)算相對(duì)簡(jiǎn)單,容易理解,適用于一般的有序分類資料與連續(xù)型資料,其基本原理如下。

        1.1 靈敏度和特異度

        選定某一診斷分解點(diǎn)后,將診斷試驗(yàn)結(jié)果與金標(biāo)準(zhǔn)結(jié)果比較,可以得到以下診斷試驗(yàn)評(píng)價(jià)四格表(表1),從而方便地計(jì)算靈敏度和特異度指標(biāo)[10]。

        表1 診斷試驗(yàn)評(píng)價(jià)的四格表

        1.2 ROC曲線

        將診斷分界點(diǎn)遍歷所有可能的值,則得到由原始試驗(yàn)數(shù)據(jù)對(duì)應(yīng)的一系列靈敏度與特異度。以每一診斷分界點(diǎn)下的1-特異度和靈敏度為橫縱坐標(biāo)生成一個(gè)點(diǎn),稱之為操作點(diǎn)。依次連接所有操作點(diǎn)即得到ROC曲線。

        1.3 ROC曲線下面積

        ROC曲線下面積(Area Under The Curve,AUC)用于定量的評(píng)價(jià)和比較診斷試驗(yàn)。假設(shè)正常組有n例試驗(yàn)數(shù)據(jù)xni(i=1, 2, …,n),異常組有 m 例試驗(yàn)數(shù)據(jù) xmj(j=1, 2, …,m)。根據(jù)Wilcoxon Mann-Whitney統(tǒng)計(jì)量,AUC等于異常組每個(gè)試驗(yàn)數(shù)據(jù)>正常組每個(gè)試驗(yàn)數(shù)據(jù)的概率[4],即:

        AUC的標(biāo)準(zhǔn)為:

        其中,Q1是任意隨機(jī)選擇兩個(gè)異常組的試驗(yàn)數(shù)據(jù)都將大于任意隨機(jī)選擇的一個(gè)正常組的試驗(yàn)數(shù)據(jù)的概率,Q2是任意隨機(jī)選擇一個(gè)異常組的試驗(yàn)數(shù)據(jù)都將大于任意隨機(jī)選擇的兩個(gè)正常組的試驗(yàn)數(shù)據(jù)的概率。

        當(dāng)有兩個(gè)針對(duì)同一組對(duì)象的診斷試驗(yàn)時(shí),可以對(duì)兩個(gè)診斷試驗(yàn)的AUC進(jìn)行u檢驗(yàn),從而確定兩個(gè)診斷試驗(yàn)差異的統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。u檢驗(yàn)的計(jì)算公式為[7]:

        其中,r為兩個(gè)診斷試驗(yàn)得到的AUC的相關(guān)系數(shù),通過查表2得到。

        在文獻(xiàn)[7]中,兩個(gè)診斷試驗(yàn)ROC曲線下面積的相關(guān)系數(shù)表中并不包含表2中陰影部分的數(shù)字,即原文對(duì)于異常組和正常組診斷結(jié)果的平均相關(guān)系數(shù)最大為0.90。而在實(shí)際應(yīng)用時(shí),有可能出現(xiàn)平均相關(guān)系數(shù)>0.90的情況。因此,我們對(duì)原文中某一平均面積下診斷結(jié)果平均相關(guān)系數(shù)與AUC的相關(guān)系數(shù)進(jìn)行二次擬合(擬合方程的決定系數(shù)R2>0.999),并推算診斷結(jié)果平均相關(guān)系數(shù)為0.92~1.00時(shí)對(duì)應(yīng)的AUC相關(guān)系數(shù),即得到表2中陰影部分的數(shù)字。

        2 基于Matlab的ROC曲線分析軟件

        根據(jù)上述原理,我們利用Matlab軟件編寫程序,并設(shè)計(jì)出圖形用戶界面。

        2.1 軟件功能

        2.1.1 數(shù)據(jù)輸入

        軟件提供了兩種輸入診斷評(píng)價(jià)數(shù)據(jù)的方法。用戶既可以直接從鍵盤錄入數(shù)據(jù),也可以導(dǎo)入事先保存好的Excel數(shù)據(jù)文件。需要注意的是輸入和讀入的數(shù)據(jù)一定要與選擇的診斷試驗(yàn)個(gè)數(shù)一致。數(shù)據(jù)的類型可以是有序分類型數(shù)據(jù)(等級(jí)資料),也可以是連續(xù)型數(shù)據(jù)。

        2.1.2 ROC曲線分析

        對(duì)單個(gè)診斷試驗(yàn),使用原始數(shù)據(jù)繪制ROC曲線,并利用非參數(shù)方法計(jì)算ROC曲線的AUC及該AUC與毫無診斷能力的AUC=0.5進(jìn)行比較P值。

        對(duì)于兩個(gè)配對(duì)設(shè)計(jì)的診斷試驗(yàn),使用原始數(shù)據(jù)繪制兩條ROC曲線,并利用非參數(shù)方法計(jì)算AUC并比較,給出AUC的值和檢驗(yàn)統(tǒng)計(jì)量u及P值。

        2.1.3 保存結(jié)果

        軟件給出了ROC曲線中每個(gè)操作點(diǎn)的坐標(biāo)值,即1-特異度和靈敏度。這些數(shù)據(jù)可以導(dǎo)出為Excel工作簿文件,供其他軟件調(diào)用和分析,如繪制更美觀的ROC曲線,計(jì)算最佳診斷分界點(diǎn)等。

        表2 兩個(gè)ROC曲線下面積的相關(guān)系數(shù)[7]

        2.2 軟件驗(yàn)證

        我們以文獻(xiàn)[6,8]的數(shù)據(jù)為例,分別用本軟件、SPSS以及Analyse-it(Analyse-it Software Ltd., http://www.analyse-it.com/)進(jìn)行單個(gè)及兩個(gè)診斷試驗(yàn)的非參數(shù)法ROC曲線分析,結(jié)果見表3~4。

        表3 對(duì)文獻(xiàn)[6]中數(shù)據(jù)的分析結(jié)果

        表4 對(duì)文獻(xiàn)[8]中數(shù)據(jù)的分析結(jié)果(AUC±SEAUC)

        3 應(yīng)用實(shí)例

        現(xiàn)用A、B兩種技術(shù)檢測(cè)45例患者(其中21例確診患有洛磯山斑疹熱洛磯山斑疹熱(RMSF),24例為普通發(fā)熱)的血清鈉水平,想了解血清鈉水平對(duì)RMSF是否有診斷作用,以及哪種檢測(cè)技術(shù)更準(zhǔn)確。數(shù)據(jù)來源于GehlBach(1988年),數(shù)據(jù)散點(diǎn)圖,見圖1。

        從圖1可以看出,兩種技術(shù)檢測(cè)得到的血清鈉水平都不能將RMSF患者與普通發(fā)熱患者完全分開,且兩種檢測(cè)結(jié)果的區(qū)分度不同,方法1稍好于方法2。將原始數(shù)據(jù)保存為.xls格式文檔,在本軟件中導(dǎo)入數(shù)據(jù)后的結(jié)果,見圖2。

        圖1 實(shí)例數(shù)據(jù)的分布散點(diǎn)圖

        圖2 軟件運(yùn)行實(shí)例的結(jié)果

        圖2左下方為導(dǎo)入的原始數(shù)據(jù),右上方為兩種技術(shù)檢測(cè)血清鈉水平對(duì)RMSF進(jìn)行診斷對(duì)應(yīng)的ROC曲線。兩種方法檢測(cè)結(jié)果診斷的ROC曲線下面積分別為0.8750±0.0507和0.8080±0.0644,均在0.7~0.9的范圍內(nèi),說明血清鈉水平對(duì)RMSF具有中等程度的診斷作用。

        對(duì)兩條曲線下面積進(jìn)行比較,u=3.183,P=0.0015,說明兩種檢測(cè)技術(shù)診斷RMSF的準(zhǔn)確度確有差異,實(shí)線ROC曲線對(duì)應(yīng)的方法1更準(zhǔn)確。該結(jié)果與圖1的直觀反映完全吻合。

        4 討論

        傳統(tǒng)的診斷試驗(yàn)評(píng)價(jià)指標(biāo)包括正確率、靈敏度、特異度、約登指數(shù)、陽性/陰性預(yù)測(cè)值等。這些評(píng)價(jià)指標(biāo)的共同不足是評(píng)價(jià)結(jié)果隨著診斷分界點(diǎn)選取的不同而改變,且易受到發(fā)病率的影響。ROC曲線綜合了特異度和靈敏度兩個(gè)指標(biāo),擺脫了患病率對(duì)評(píng)價(jià)結(jié)果的影響,特別是考慮到了所有可能的診斷分界點(diǎn),曲線下面積還能夠用來對(duì)診斷試驗(yàn)進(jìn)行定量的評(píng)價(jià)和比較,從而成為公認(rèn)的最佳診斷試驗(yàn)評(píng)價(jià)工具。在本文的應(yīng)用實(shí)例中,兩種血清鈉水平檢測(cè)方法所得結(jié)果的ROC曲線下面積分別為0.875和0.808,說明兩種方法測(cè)得的血清鈉水平均具有一定的診斷能力。對(duì)兩種檢測(cè)結(jié)果的診斷價(jià)值進(jìn)行比較,得出P<0.05,即兩條曲線的曲線下面積之差為0.067,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,方法1檢測(cè)得到的血清鈉水平診RMSF的準(zhǔn)確性更高。

        ROC曲線分析分為參數(shù)法和非參數(shù)法。一般認(rèn)為非參數(shù)法因其沒有條件限制,所以可以應(yīng)用于所有診斷試驗(yàn)的準(zhǔn)確度評(píng)價(jià),但計(jì)算的ROC曲線下面積往往偏??;而參數(shù)法可較準(zhǔn)確地估計(jì)ROC曲線下面積,但在樣本量較小或資料遠(yuǎn)遠(yuǎn)偏離其應(yīng)用條件(服從雙正態(tài)分布)時(shí),估計(jì)的結(jié)果可能嚴(yán)重偏離真實(shí)值;在樣本量較大且相同值較少時(shí),參數(shù)法和非參數(shù)法估計(jì)的ROC曲線下面積則近似相等。因此,在實(shí)踐中,樣本量大時(shí)可選擇參數(shù)法或非參數(shù)法估計(jì)ROC曲線下面積,樣本量較小時(shí)選擇非參數(shù)法[13]。

        由于目前較為權(quán)威的醫(yī)學(xué)統(tǒng)計(jì)軟件SPSS和SAS都只提供了非參數(shù)法計(jì)算ROC曲線下面積的功能,而不能對(duì)曲線下面積進(jìn)行比較,為此,我們利用Matlab的圖形用戶界面編寫了具有導(dǎo)入、保存、圖形展示等功能的非參數(shù)法ROC曲線分析軟件,并補(bǔ)充了經(jīng)典文獻(xiàn)提供的ROC曲線下面積相關(guān)系數(shù)表。本軟件具有計(jì)算準(zhǔn)確、通用性強(qiáng)、界面友好、操作簡(jiǎn)便、結(jié)果簡(jiǎn)潔等特點(diǎn),在實(shí)際工作中具有一定的實(shí)用價(jià)值。

        [1]王忠周,張經(jīng)建,王新怡,等.應(yīng)用ROC曲線對(duì)比研究數(shù)字乳腺機(jī)不同靶面/濾過組合的輻射劑量及圖像質(zhì)量[J].醫(yī)學(xué)影像學(xué)雜志,2011,21(3):429-432.

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